adding helper directory for structure, may reorg later
[arvados-tutorial.git] / cwl / helper /
drwxr-xr-x   ..
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-rw-r--r-- 1142 bwa-gatk-wf.cwl
-rw-r--r-- 1122 bwamem-samtools-sort.cwl
-rw-r--r-- 1094 bwamem-samtools-view.cwl
-rw-r--r-- 649 calc-coverage.cwl
-rw-r--r-- 820 check-sam.cwl
-rw-r--r-- 544 fastqc.cwl
-rw-r--r-- 770 fix-groups.cwl
-rw-r--r-- 1098 gatk-applyBQSR.cwl
-rw-r--r-- 1251 gatk-applyBSQR-with-interval.cwl
-rw-r--r-- 1247 gatk-baserecalibrator-with-interval.cwl
-rw-r--r-- 1162 gatk-baserecalibrator.cwl
-rw-r--r-- 1228 gatk-haplotypecaller-with-interval.cwl
-rw-r--r-- 1207 gatk-haplotypecaller.cwl
-rw-r--r-- 1045 gatk-splitintervals.cwl
-rw-r--r-- 1134 gatk-wf-with-interval.cwl
-rw-r--r-- 537 generate-report.cwl
-rw-r--r-- 824 gvcf-to-vcf.cwl
-rw-r--r-- 806 mark-duplicates.cwl
drwxr-xr-x - old
-rw-r--r-- 719 report-wf.cwl
-rw-r--r-- 614 samtools-fixmate.cwl
-rw-r--r-- 561 samtools-index.cwl
-rw-r--r-- 742 samtools-sort.cwl
-rw-r--r-- 1035 scatter-gatk-wf-with-interval.cwl