Updating readme and reorganization
[arvados-tutorial.git] / WGS-processing / yml /
drwxr-xr-x   ..
-rw-r--r-- 213 annotate-vcf.yml
-rw-r--r-- 855 bwa-gatk-report-wf-UK.yml
-rw-r--r-- 288 bwa-gatk-wf-WGC071838D.yml
-rw-r--r-- 288 bwa-gatk-wf-WGC074701D.yml
-rw-r--r-- 347 bwa-gatk-wf-chr19.yml
-rw-r--r-- 672 bwa-gatk-wf-report.yml
-rw-r--r-- 358 bwa-gatk-wf.yml
-rw-r--r-- 347 bwamem-samtools-sort.yml
-rw-r--r-- 347 bwamem-samtools-view.yml
-rw-r--r-- 187 check-sam.yml
-rw-r--r-- 191 gather-vcf.yml
-rw-r--r-- 315 gather-vcf2.yml
-rw-r--r-- 327 gatk-applyBQSR.yml
-rw-r--r-- 345 gatk-baserecalibrator.yml
-rw-r--r-- 327 gatk-haplotypecaller-with-interval.yml
-rw-r--r-- 176 gatk-haplotypecaller.yml
-rw-r--r-- 204 gatk-selectvariants.yml
-rw-r--r-- 128 gatk-splitintervals.yml
-rw-r--r-- 453 gatk-wf-with-interval.yml
-rw-r--r-- 374 generate-report.yml
-rw-r--r-- 88 getfastq.yml
-rw-r--r-- 84 getgvcfs.yml
-rw-r--r-- 142 gvcf-to-vcf.yml
-rw-r--r-- 90 mark-duplicates.yml
-rw-r--r-- 502 report-wf.yml
-rw-r--r-- 87 samtools-index.yml
-rw-r--r-- 98 samtools-sort-WGC069888D.yml
-rw-r--r-- 361 scatter-gatk-wf-with-interval.yml
-rw-r--r-- 646 wgs-processing-wf.yml