Migrating to carpentries WIP
[rnaseq-cwl-training.git] / README.md.old
diff --git a/README.md.old b/README.md.old
new file mode 100644 (file)
index 0000000..510d494
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,27 @@
+# Lessons
+
+These lessons go walk through the development of a CWL workflow for
+rnaseq.
+
+| Lesson   | Description |
+|----------|-------------|
+| [Lesson 1](lesson1/lesson1.md) | Turning a shell script into a workflow by composing existing tools  |
+| [Lesson 2](lesson2/lesson2.md) | Running and debugging a workflow  |
+| [Lesson 3](lesson3/lesson3.md) | Writing a tool wrapper  |
+| [Lesson 4](lesson4/lesson4.md) | Analyzing multiple samples  |
+| [Lesson 5](lesson5/lesson5.md) | Dynamic Workflow behavior with expressions  |
+| [Lesson 6](lesson6/lesson6.md) | Resources for further learning |
+
+# Acknowledgements
+
+These CWL lessons are based on "Introduction to RNA-seq using
+high-performance computing (HPC)" lessons developed by members of the
+teaching team at the Harvard Chan Bioinformatics Core (HBC) and
+obtained from
+
+https://github.com/hbctraining/Intro-to-rnaseq-hpc-O2
+
+The original lessons are open access materials distributed under the
+terms of the Creative Commons Attribution license (CC BY 4.0), which
+permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any
+medium, provided the original author and source are credited.