lesson5/answers/subdirs.cwl

   1 cwlVersion: v1.2
   2 class: ExpressionTool
   3 requirements:
   4   InlineJavascriptRequirement: {}
   5 inputs:
   6   fq: File[]
   7   bams: File[]
   8   qc: File[]
   9 outputs:
  10   dirs: Directory[]
  11 expression: |-
  12   ${
  13   var dirs = [];
  14   for (var i = 0; i < inputs.bams.length; i++) {
  15     dirs.push({
  16       "class": "Directory",
  17       "basename": inputs.fq[i].nameroot,
  18       "listing": [inputs.bams[i], inputs.qc[i]]
  19     });
  20   }
  21   return {"dirs": dirs};
  22   }