Remove software carpentries logo
[rnaseq-cwl-training.git] / _includes / sc / syllabus.html
1 <div class="row">
2   <div class="col-md-6">
3     <h3 id="syllabus-shell">The Unix Shell</h3>
4     <ul>
5       <li>Files and directories</li>
6       <li>History and tab completion</li>
7       <li>Pipes and redirection</li>
8       <li>Looping over files</li>
9       <li>Creating and running shell scripts</li>
10       <li>Finding things</li>
11       <li><a href="{{site.swc_pages}}/shell-novice/reference/">Reference...</a></li>
12     </ul>
13   </div>
14   <div class="col-md-6">
15     <h3 id="syllabus-python">Programming in Python</h3>
16     <ul>
17       <li>Using libraries</li>
18       <li>Working with arrays</li>
19       <li>Reading and plotting data</li>
20       <li>Creating and using functions</li>
21       <li>Loops and conditionals</li>
22       <li>Defensive programming</li>
23       <li>Using Python from the command line</li>
24       <li><a href="{{site.swc_pages}}/python-novice-inflammation/reference/">Reference...</a></li>
25     </ul>
26   </div>
27   <!--
28   <div class="col-md-6">
29     <h3 id="syllabus-r">Programming in R</h3>
30     <ul>
31       <li>Working with vectors and data frames</li>
32       <li>Reading and plotting data</li>
33       <li>Creating and using functions</li>
34       <li>Loops and conditionals</li>
35       <li>Using R from the command line</li>
36       <li><a href="{{site.swc_pages}}/r-novice-inflammation/reference/">Reference...</a></li>
37     </ul>
38   </div>
39   -->
40   <!--
41   <div class="col-md-6">
42     <h3 id="syllabus-matlab">Programming in MATLAB</h3>
43     <ul>
44       <li>Working with arrays</li>
45       <li>Reading and plotting data</li>
46       <li>Creating and using functions</li>
47       <li>Loops and conditionals</li>
48       <li>Defensive programming</li>
49       <li><a href="{{site.swc_pages}}/matlab-novice-inflammation/reference/">Reference...</a></li>
50      </ul>
51    </div>
52    -->
53 </div>
54
55 <div class="row">
56   <div class="col-md-6">
57     <h3 id="syllabus-git">Version Control with Git</h3>
58     <ul>
59       <li>Creating a repository</li>
60       <li>Recording changes to files: <code>add</code>, <code>commit</code>, ...</li>
61       <li>Viewing changes: <code>status</code>, <code>diff</code>, ...</li>
62       <li>Ignoring files</li>
63       <li>Working on the web: <code>clone</code>, <code>pull</code>, <code>push</code>, ...</li>
64       <li>Resolving conflicts</li>
65       <li>Open licenses</li>
66       <li>Where to host work, and why</li>
67       <li><a href="{{site.swc_pages}}/git-novice/reference/">Reference...</a></li>
68     </ul>
69   </div>
70   <!--
71   <div class="col-md-6">
72     <h3 id="syllabus-sql">Managing Data with SQL</h3>
73     <ul>
74       <li>Reading and sorting data</li>
75       <li>Filtering with <code>where</code></li>
76       <li>Calculating new values on the fly</li>
77       <li>Handling missing values</li>
78       <li>Combining values using aggregation</li>
79       <li>Combining information from multiple tables using <code>join</code></li>
80       <li>Creating, modifying, and deleting data</li>
81       <li>Programming with databases</li>
82       <li><a href="{{site.swc_pages}}/sql-novice-survey/reference/">Reference...</a></li>
83     </ul>
84   </div>
85    -->
86   <div class="col-md-6">
87     <h3 id="syllabus-r">Open Refine</h3>
88     <ul>
89       <li>Introduction to OpenRefine</li>
90       <li>Importing data</li>
91       <li>Basic functions</li>
92       <li>Advanced Functions</li>
93       <li><a href="{{site.lc_pages}}library-openrefine/reference">Reference...</a></li>
94     </ul>
95   </div>
96 </div>