bin/chunk-options.R

   1 # These settings control the behavior of all chunks in the novice R materials.
   2 # For example, to generate the lessons with all the output hidden, simply change
   3 # `results` from "markup" to "hide".
   4 # For more information on available chunk options, see
   5 # http://yihui.name/knitr/options#chunk_options
   6
   7 library("knitr")
   8
   9 fix_fig_path <- function(pth) file.path("..", pth)
  10
  11 ## We use the swc-rmd- prefix for the figures generated by the lssons
  12 ## so they can be easily identified and deleted by `make clean`.  The
  13 ## working directory when the lessons are generated is the root so the
  14 ## figures need to be saved in fig/, but when the site is generated,
  15 ## the episodes will be one level down. We fix the path using the
  16 ## `fig.process` option.
  17 opts_chunk$set(tidy = FALSE, results = "markup", comment = NA,
  18                fig.align = "center", fig.path = "fig/swc-rmd-",
  19                fig.process = fix_fig_path)
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  21 # The hooks below add html tags to the code chunks and their output so that they
  22 # are properly formatted when the site is built.
  23 hook_in <- function(x, options) {
  24   stringr::str_c("\n\n~~~{.r}\n",
  25                  paste0(x, collapse="\n"),
  26                  "\n~~~\n{: .source}\n\n")
  27 }
  28
  29 hook_out <- function(x, options) {
  30   stringr::str_c("\n\n~~~\n",
  31                    paste0(x, collapse="\n"),
  32                  "\n~~~\n{: .output}\n\n")
  33 }
  34
  35 hook_error <- function(x, options) {
  36   stringr::str_c("\n\n~~~\n",
  37                  paste0(x, collapse="\n"),
  38                  "\n~~~\n{: .error}\n\n")
  39 }
  40
  41 knit_hooks$set(source = hook_in, output = hook_out, warning = hook_error,
  42                error = hook_error, message = hook_out)