assets/answers/ep8/Dockerfile.multi-stage

   1 # Build the base image.  This is the starting point for both the build
   2 # stage and the final stage.
   3 # the "AS base" names the image within the Dockerfile
   4 FROM debian:10-slim AS base
   5 MAINTAINER Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>
   6
   7 # Install libz, because the bwa binary will depend on it.
   8 # As it happens, this already included in the base Debian distribution
   9 # because lots of things use libz specifically, but it is good practice
  10 # to explicitly declare that we need it.
  11 RUN apt-get update -qy
  12 RUN apt-get install -qy zlib1g
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  15 # This is the builder image.  It has the commands to install the
  16 # prerequisites and then build the bwa binary.
  17 FROM base as builder
  18 RUN apt-get install -qy build-essential wget unzip zlib1g-dev
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  20 # Install BWA 07.7.17
  21 RUN wget https://github.com/lh3/bwa/archive/v0.7.17.zip
  22 RUN unzip v0.7.17
  23 RUN cd bwa-0.7.17 && \
  24     make && \
  25     cp bwa /usr/bin
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  28 # Build the final image.  It starts from base (where we ensured that
  29 # libz was installed) and then copies the bwa binary from the builder
  30 # image.  The result is the final image only has the compiled bwa
  31 # binary, but not the clutter from build-essentials or from compiling
  32 # the program.
  33 FROM base AS final
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  35 # This is the key command, we use the COPY command described earlier,
  36 # but instead of copying from the host, the --from option copies from
  37 # the builder image.
  38 COPY --from=builder /usr/bin/bwa /usr/bin/bwa