No O_EXCL.
authorTom Clegg <tom@tomclegg.ca>
Wed, 11 Mar 2020 13:52:49 +0000 (09:52 -0400)
committerTom Clegg <tom@tomclegg.ca>
Wed, 11 Mar 2020 13:52:49 +0000 (09:52 -0400)
Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Tom Clegg <tom@tomclegg.ca>

vcf2fasta.go

index 78e773ace081477cbb9b81ff77b4328514855277..7b198d4f71ec11fa648ffa1cef35c657b5d4001c 100644 (file)
@@ -201,7 +201,7 @@ func maybeInDocker(args, mountfiles []string) []string {
 func (cmd *vcf2fasta) vcf2fasta(infile string, phase int) error {
        _, basename := filepath.Split(infile)
        outfile := filepath.Join(cmd.outputDir, fmt.Sprintf("%s.%d.fasta.gz", basename, phase))
-       outf, err := os.OpenFile(outfile, os.O_CREATE|os.O_WRONLY|os.O_EXCL, 0777)
+       outf, err := os.OpenFile(outfile, os.O_CREATE|os.O_WRONLY, 0777)
        if err != nil {
                return fmt.Errorf("error opening output file: %s", err)
        }