gob.go

   1 package main
   2
   3 import (
   4         "encoding/gob"
   5         "io"
   6         _ "net/http/pprof"
   7
   8         "golang.org/x/crypto/blake2b"
   9 )
  10
  11 type CompactGenome struct {
  12         Name     string
  13         Variants []tileVariantID
  14 }
  15
  16 type TileVariant struct {
  17         Tag      tagID
  18         Blake2b  [blake2b.Size256]byte
  19         Sequence []byte
  20 }
  21
  22 type LibraryEntry struct {
  23         TagSet         [][]byte
  24         CompactGenomes []CompactGenome
  25         TileVariants   []TileVariant
  26 }
  27
  28 func ReadCompactGenomes(rdr io.Reader) ([]CompactGenome, error) {
  29         dec := gob.NewDecoder(rdr)
  30         var ret []CompactGenome
  31         for {
  32                 var ent LibraryEntry
  33                 err := dec.Decode(&ent)
  34                 if err == io.EOF {
  35                         return ret, nil
  36                 } else if err != nil {
  37                         return nil, err
  38                 }
  39                 ret = append(ret, ent.CompactGenomes...)
  40         }
  41 }