18767: Move to 'list' section and mention ways to list files.
authorPeter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>
Mon, 21 Mar 2022 20:30:02 +0000 (16:30 -0400)
committerPeter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>
Mon, 21 Mar 2022 20:30:02 +0000 (16:30 -0400)
Arvados-DCO-1.1-Signed-off-by: Peter Amstutz <peter.amstutz@curii.com>

doc/api/methods/collections.html.textile.liquid

index cb206936032d1c7888198ca8d91c3280bfa4ed7e..a2a6a77e19f6350c1be3c770a1560f42c9cc6402 100644 (file)
@@ -55,36 +55,6 @@ Referenced blocks are protected from garbage collection in Keep.
 
 Data can be shared with other users via the Arvados permission model.
 
 
 Data can be shared with other users via the Arvados permission model.
 
-h3. Searching Collections for names of file or directories
-
-You can search collections for specific file or directory names (whole or part) using the following filter in a "list":../methods.html#index query.
-
-<pre>
-filters: [["file_names", "ilike", "%sample1234.fastq%"]]
-</pre>
-
-Note: @file_names@ is a hidden field used for indexing.  It is not returned by any API call.  On the client, to get the list of files, you will need to parse the @manifest_text@.
-
-As of this writing (Arvados 2.4), you can also search for directory paths, but _not_ complete file paths.
-
-In other words, this will work (when @dir3@ is a directory):
-
-<pre>
-filters: [["file_names", "ilike", "%dir1/dir2/dir3%"]]
-</pre>
-
-However, this will _not_ return the desired results (where @sample1234.fastq@ is a file):
-
-<pre>
-filters: [["file_names", "ilike", "%dir1/dir2/dir3/sample1234.fastq%"]]
-</pre>
-
-As a workaround, you can search for both the directory path and file name separately, and then filter on the client side.
-
-<pre>
-filters: [["file_names", "ilike", "%dir1/dir2/dir3%"], ["file_names", "ilike", "%sample1234.fastq%"]]
-</pre>
-
 h2. Methods
 
 See "Common resource methods":{{site.baseurl}}/api/methods.html for more information about @create@, @delete@, @get@, @list@, and @update@.
 h2. Methods
 
 See "Common resource methods":{{site.baseurl}}/api/methods.html for more information about @create@, @delete@, @get@, @list@, and @update@.
@@ -139,6 +109,36 @@ table(table table-bordered table-condensed).
 
 Note: Because adding access tokens to manifests can be computationally expensive, the @manifest_text@ field is not included in results by default.  If you need it, pass a @select@ parameter that includes @manifest_text@.
 
 
 Note: Because adding access tokens to manifests can be computationally expensive, the @manifest_text@ field is not included in results by default.  If you need it, pass a @select@ parameter that includes @manifest_text@.
 
+h4. Searching Collections for names of file or directories
+
+You can search collections for specific file or directory names (whole or part) using the following filter in a @list@ query.
+
+<pre>
+filters: [["file_names", "ilike", "%sample1234.fastq%"]]
+</pre>
+
+Note: @file_names@ is a hidden field used for indexing.  It is not returned by any API call.  On the client, you can programmatically enumerate all the files in a collection using @arv-ls@, the Python SDK @Collection@ class, Go SDK @FileSystem@ struct, the WebDAV API, or the S3-compatible API.
+
+As of this writing (Arvados 2.4), you can also search for directory paths, but _not_ complete file paths.
+
+In other words, this will work (when @dir3@ is a directory):
+
+<pre>
+filters: [["file_names", "ilike", "%dir1/dir2/dir3%"]]
+</pre>
+
+However, this will _not_ return the desired results (where @sample1234.fastq@ is a file):
+
+<pre>
+filters: [["file_names", "ilike", "%dir1/dir2/dir3/sample1234.fastq%"]]
+</pre>
+
+As a workaround, you can search for both the directory path and file name separately, and then filter on the client side.
+
+<pre>
+filters: [["file_names", "ilike", "%dir1/dir2/dir3%"], ["file_names", "ilike", "%sample1234.fastq%"]]
+</pre>
+
 h3. update
 
 Update attributes of an existing Collection.
 h3. update
 
 Update attributes of an existing Collection.