doc/install/crunch2-cloud/install-dispatch-cloud.html.textile.liquid

   1 ---
   2 layout: default
   3 navsection: installguide
   4 title: Install the cloud dispatcher
   5 ...
   6 {% comment %}
   7 Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   8
   9 SPDX-License-Identifier: CC-BY-SA-3.0
  10 {% endcomment %}
  11
  12 {% include 'notebox_begin_warning' %}
  13 @arvados-dispatch-cloud@ is only relevant for cloud installations. Skip this section if you are installing an on premises cluster that will spool jobs to Slurm or LSF.
  14 {% include 'notebox_end' %}
  15
  16 # "Introduction":#introduction
  17 # "Create compute node VM image":#create-image
  18 # "Update config.yml":#update-config
  19 # "Install arvados-dispatch-cloud":#install-packages
  20 # "Start the service":#start-service
  21 # "Restart the API server and controller":#restart-api
  22 # "Confirm working installation":#confirm-working
  23
  24 h2(#introduction). Introduction
  25
  26 The cloud dispatch service is for running containers on cloud VMs. It works with Microsoft Azure and Amazon EC2; future versions will also support Google Compute Engine.
  27
  28 The cloud dispatch service can run on any node that can connect to the Arvados API service, the cloud provider's API, and the SSH service on cloud VMs.  It is not resource-intensive, so you can run it on the API server node.
  29
  30 More detail about the internal operation of the dispatcher can be found in the "architecture section":{{site.baseurl}}/architecture/dispatchcloud.html.
  31
  32 h2(#update-config). Update config.yml
  33
  34 h3. Configure CloudVMs
  35
  36 Add or update the following portions of your cluster configuration file, @config.yml@. Refer to "config.defaults.yml":{{site.baseurl}}/admin/config.html for information about additional configuration options. The @DispatchPrivateKey@ should be the *private* key generated in "the previous section":install-compute-node.html#sshkeypair.
  37
  38 <notextile>
  39 <pre><code>    Services:
  40       DispatchCloud:
  41         InternalURLs:
  42           "http://localhost:9006": {}
  43     Containers:
  44       CloudVMs:
  45         # BootProbeCommand is a shell command that succeeds when an instance is ready for service
  46         BootProbeCommand: "sudo systemctl status docker"
  47
  48         <b># --- driver-specific configuration goes here --- see Amazon and Azure examples below ---</b>
  49
  50       DispatchPrivateKey: |
  51         -----BEGIN RSA PRIVATE KEY-----
  52         MIIEpQIBAAKCAQEAqXoCzcOBkFQ7w4dvXf9B++1ctgZRqEbgRYL3SstuMV4oawks
  53         ttUuxJycDdsPmeYcHsKo8vsEZpN6iYsX6ZZzhkO5nEayUTU8sBjmg1ZCTo4QqKXr
  54         FJ+amZ7oYMDof6QEdwl6KNDfIddL+NfBCLQTVInOAaNss7GRrxLTuTV7HcRaIUUI
  55         jYg0Ibg8ZZTzQxCvFXXnjseTgmOcTv7CuuGdt91OVdoq8czG/w8TwOhymEb7mQlt
  56         lXuucwQvYgfoUgcnTgpJr7j+hafp75g2wlPozp8gJ6WQ2yBWcfqL2aw7m7Ll88Nd
  57         [...]
  58         oFyAjVoexx0RBcH6BveTfQtJKbktP1qBO4mXo2dP0cacuZEtlAqW9Eb06Pvaw/D9
  59         foktmqOY8MyctzFgXBpGTxPliGjqo8OkrOyQP2g+FL7v+Km31Xs61P8=
  60         -----END RSA PRIVATE KEY-----
  61     InstanceTypes:
  62       x1md:
  63         ProviderType: x1.medium
  64         VCPUs: 8
  65         RAM: 64GiB
  66         IncludedScratch: 64GB
  67         Price: 0.62
  68       x1lg:
  69         ProviderType: x1.large
  70         VCPUs: 16
  71         RAM: 128GiB
  72         IncludedScratch: 128GB
  73         Price: 1.23
  74 </code></pre>
  75 </notextile>
  76
  77 h4. NVIDIA GPU support
  78
  79 To specify instance types with NVIDIA GPUs, you must include an additional @CUDA@ section:
  80
  81 <notextile>
  82 <pre><code>    InstanceTypes:
  83       g4dn:
  84         ProviderType: g4dn.xlarge
  85         VCPUs: 4
  86         RAM: 16GiB
  87         IncludedScratch: 125GB
  88         Price: 0.56
  89         CUDA:
  90           DriverVersion: "11.4"
  91           HardwareCapability: "7.5"
  92           DeviceCount: 1
  93 </code></pre>
  94 </notextile>
  95
  96 The @DriverVersion@ is the version of the CUDA toolkit installed in your compute image (in X.Y format, do not include the patchlevel).  The @HardwareCapability@ is the CUDA compute capability of the GPUs available for this instance type.  The @DeviceCount@ is the number of GPU cores available for this instance type.
  97
  98 h4. Minimal configuration example for Amazon EC2
  99
 100 The <span class="userinput">ImageID</span> value is the compute node image that was built in "the previous section":install-compute-node.html#aws.
 101
 102 <notextile>
 103 <pre><code>    Containers:
 104       CloudVMs:
 105         ImageID: <span class="userinput">ami-01234567890abcdef</span>
 106         Driver: ec2
 107         DriverParameters:
 108           # If you are not using an IAM role for authentication, specify access
 109           # credentials here. Otherwise, omit or set AccessKeyID and
 110           # SecretAccessKey to an empty value.
 111           AccessKeyID: XXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
 112           SecretAccessKey: YYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYY
 113
 114           SecurityGroupIDs:
 115           - sg-0123abcd
 116           SubnetID: subnet-0123abcd
 117           Region: us-east-1
 118           EBSVolumeType: gp2
 119           AdminUsername: arvados
 120 </code></pre>
 121 </notextile>
 122
 123 Example policy for the IAM role used by the cloud dispatcher:
 124
 125 <notextile>
 126 <pre>
 127 {
 128     "Version": "2012-10-17",
 129     "Id": "arvados-dispatch-cloud policy",
 130     "Statement": [
 131         {
 132             "Effect": "Allow",
 133             "Action": [
 134                 "iam:PassRole",
 135                 "ec2:DescribeKeyPairs",
 136                 "ec2:ImportKeyPair",
 137                 "ec2:RunInstances",
 138                 "ec2:DescribeInstances",
 139                 "ec2:CreateTags",
 140                 "ec2:TerminateInstances"
 141             ],
 142             "Resource": "*"
 143         }
 144     ]
 145 }
 146 </pre>
 147 </notextile>
 148
 149 h4. Minimal configuration example for Azure
 150
 151 Using managed disks:
 152
 153 The <span class="userinput">ImageID</span> value is the compute node image that was built in "the previous section":install-compute-node.html#azure.
 154
 155 <notextile>
 156 <pre><code>    Containers:
 157       CloudVMs:
 158         ImageID: <span class="userinput">"zzzzz-compute-v1597349873"</span>
 159         Driver: azure
 160         # (azure) managed disks: set MaxConcurrentInstanceCreateOps to 20 to avoid timeouts, cf
 161         # https://docs.microsoft.com/en-us/azure/virtual-machines/linux/capture-image
 162         MaxConcurrentInstanceCreateOps: 20
 163         DriverParameters:
 164           # Credentials.
 165           SubscriptionID: XXXXXXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXXXXXXXXXX
 166           ClientID: XXXXXXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXXXXXXXXXX
 167           ClientSecret: XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
 168           TenantID: XXXXXXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXXXXXXXXXX
 169
 170           # Data center where VMs will be allocated
 171           Location: centralus
 172
 173           # The resource group where the VM and virtual NIC will be
 174           # created.
 175           ResourceGroup: zzzzz
 176           NetworkResourceGroup: yyyyy   # only if different from ResourceGroup
 177           Network: xxxxx
 178           Subnet: xxxxx-subnet-private
 179
 180           # The resource group where the disk image is stored, only needs to
 181           # be specified if it is different from ResourceGroup
 182           ImageResourceGroup: aaaaa
 183
 184 </code></pre>
 185 </notextile>
 186
 187 Azure recommends using managed images. If you plan to start more than 20 VMs simultaneously, Azure recommends using a shared image gallery instead to avoid slowdowns and timeouts during the creation of the VMs.
 188
 189 Using an image from a shared image gallery:
 190
 191 <notextile>
 192 <pre><code>    Containers:
 193       CloudVMs:
 194         ImageID: <span class="userinput">"shared_image_gallery_image_definition_name"</span>
 195         Driver: azure
 196         DriverParameters:
 197           # Credentials.
 198           SubscriptionID: XXXXXXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXXXXXXXXXX
 199           ClientID: XXXXXXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXXXXXXXXXX
 200           ClientSecret: XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
 201           TenantID: XXXXXXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXXXXXXXXXX
 202
 203           # Data center where VMs will be allocated
 204           Location: centralus
 205
 206           # The resource group where the VM and virtual NIC will be
 207           # created.
 208           ResourceGroup: zzzzz
 209           NetworkResourceGroup: yyyyy   # only if different from ResourceGroup
 210           Network: xxxxx
 211           Subnet: xxxxx-subnet-private
 212
 213           # The resource group where the disk image is stored, only needs to
 214           # be specified if it is different from ResourceGroup
 215           ImageResourceGroup: aaaaa
 216
 217           # (azure) shared image gallery: the name of the gallery
 218           SharedImageGalleryName: "shared_image_gallery_1"
 219           # (azure) shared image gallery: the version of the image definition
 220           SharedImageGalleryImageVersion: "0.0.1"
 221
 222 </code></pre>
 223 </notextile>
 224
 225 Using unmanaged disks (deprecated):
 226
 227 The <span class="userinput">ImageID</span> value is the compute node image that was built in "the previous section":install-compute-node.html#azure.
 228
 229 <notextile>
 230 <pre><code>    Containers:
 231       CloudVMs:
 232         ImageID: <span class="userinput">"https://zzzzzzzz.blob.core.windows.net/system/Microsoft.Compute/Images/images/zzzzz-compute-osDisk.55555555-5555-5555-5555-555555555555.vhd"</span>
 233         Driver: azure
 234         DriverParameters:
 235           # Credentials.
 236           SubscriptionID: XXXXXXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXXXXXXXXXX
 237           ClientID: XXXXXXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXXXXXXXXXX
 238           ClientSecret: XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
 239           TenantID: XXXXXXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXXXXXXXXXX
 240
 241           # Data center where VMs will be allocated
 242           Location: centralus
 243
 244           # The resource group where the VM and virtual NIC will be
 245           # created.
 246           ResourceGroup: zzzzz
 247           NetworkResourceGroup: yyyyy   # only if different from ResourceGroup
 248           Network: xxxxx
 249           Subnet: xxxxx-subnet-private
 250
 251           # Where to store the VM VHD blobs
 252           StorageAccount: example
 253           BlobContainer: vhds
 254
 255 </code></pre>
 256 </notextile>
 257
 258 Get the @SubscriptionID@ and @TenantID@:
 259
 260 <pre>
 261 $ az account list
 262 [
 263   {
 264     "cloudName": "AzureCloud",
 265     "id": "XXXXXXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXXXXXX",
 266     "isDefault": true,
 267     "name": "Your Subscription",
 268     "state": "Enabled",
 269     "tenantId": "YYYYYYYY-YYYY-YYYY-YYYYYYYY",
 270     "user": {
 271       "name": "you@example.com",
 272       "type": "user"
 273     }
 274   }
 275 ]
 276 </pre>
 277
 278 You will need to create a "service principal" to use as a delegated authority for API access.
 279
 280 <notextile><pre><code>$ az ad app create --display-name "Arvados Dispatch Cloud (<span class="userinput">ClusterID</span>)" --homepage "https://arvados.org" --identifier-uris "https://<span class="userinput">ClusterID.example.com</span>" --end-date 2299-12-31 --password <span class="userinput">Your_Password</span>
 281 $ az ad sp create "<span class="userinput">appId</span>"
 282 (appId is part of the response of the previous command)
 283 $ az role assignment create --assignee "<span class="userinput">objectId</span>" --role Owner --scope /subscriptions/{subscriptionId}/
 284 (objectId is part of the response of the previous command)
 285 </code></pre></notextile>
 286
 287 Now update your @config.yml@ file:
 288
 289 @ClientID@ is the 'appId' value.
 290
 291 @ClientSecret@ is what was provided as <span class="userinput">Your_Password</span>.
 292
 293 h3. Test your configuration
 294
 295 Run the @cloudtest@ tool to verify that your configuration works. This creates a new cloud VM, confirms that it boots correctly and accepts your configured SSH private key, and shuts it down.
 296
 297 <notextile>
 298 <pre><code>~$ <span class="userinput">arvados-server cloudtest && echo "OK!"</span>
 299 </code></pre>
 300 </notextile>
 301
 302 Refer to the "cloudtest tool documentation":../../admin/cloudtest.html for more information.
 303
 304 {% assign arvados_component = 'arvados-dispatch-cloud' %}
 305
 306 {% include 'install_packages' %}
 307
 308 {% include 'start_service' %}
 309
 310 {% include 'restart_api' %}
 311
 312 h2(#confirm-working). Confirm working installation
 313
 314 On the dispatch node, start monitoring the arvados-dispatch-cloud logs:
 315
 316 <notextile>
 317 <pre><code>~$ <span class="userinput">sudo journalctl -o cat -fu arvados-dispatch-cloud.service</span>
 318 </code></pre>
 319 </notextile>
 320
 321 "Make sure to install the arvados/jobs image.":../install-jobs-image.html
 322
 323 Submit a simple container request:
 324
 325 <notextile>
 326 <pre><code>shell:~$ <span class="userinput">arv container_request create --container-request '{
 327   "name":            "test",
 328   "state":           "Committed",
 329   "priority":        1,
 330   "container_image": "arvados/jobs:latest",
 331   "command":         ["echo", "Hello, Crunch!"],
 332   "output_path":     "/out",
 333   "mounts": {
 334     "/out": {
 335       "kind":        "tmp",
 336       "capacity":    1000
 337     }
 338   },
 339   "runtime_constraints": {
 340     "vcpus": 1,
 341     "ram": 1048576
 342   }
 343 }'</span>
 344 </code></pre>
 345 </notextile>
 346
 347 This command should return a record with a @container_uuid@ field.  Once @arvados-dispatch-cloud@ polls the API server for new containers to run, you should see it dispatch that same container.
 348
 349 The @arvados-dispatch-cloud@ API provides a list of queued and running jobs and cloud instances. Use your @ManagementToken@ to test the dispatcher's endpoint. For example, when one container is running:
 350
 351 <notextile>
 352 <pre><code>~$ <span class="userinput">curl -sH "Authorization: Bearer $token" http://localhost:9006/arvados/v1/dispatch/containers</span>
 353 {
 354   "items": [
 355     {
 356       "container": {
 357         "uuid": "zzzzz-dz642-hdp2vpu9nq14tx0",
 358         ...
 359         "state": "Running",
 360         "scheduling_parameters": {
 361           "partitions": null,
 362           "preemptible": false,
 363           "max_run_time": 0
 364         },
 365         "exit_code": 0,
 366         "runtime_status": null,
 367         "started_at": null,
 368         "finished_at": null
 369       },
 370       "instance_type": {
 371         "Name": "Standard_D2s_v3",
 372         "ProviderType": "Standard_D2s_v3",
 373         "VCPUs": 2,
 374         "RAM": 8589934592,
 375         "Scratch": 16000000000,
 376         "IncludedScratch": 16000000000,
 377         "AddedScratch": 0,
 378         "Price": 0.11,
 379         "Preemptible": false
 380       }
 381     }
 382   ]
 383 }
 384 </code></pre>
 385 </notextile>
 386
 387 A similar request can be made to the @http://localhost:9006/arvados/v1/dispatch/instances@ endpoint.
 388
 389 When the container finishes, the dispatcher will log it.
 390
 391 After the container finishes, you can get the container record by UUID *from a shell server* to see its results:
 392
 393 <notextile>
 394 <pre><code>shell:~$ <span class="userinput">arv get <b>zzzzz-dz642-hdp2vpu9nq14tx0</b></span>
 395 {
 396  ...
 397  "exit_code":0,
 398  "log":"a01df2f7e5bc1c2ad59c60a837e90dc6+166",
 399  "output":"d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e+0",
 400  "state":"Complete",
 401  ...
 402 }
 403 </code></pre>
 404 </notextile>
 405
 406 You can use standard Keep tools to view the container's output and logs from their corresponding fields.  For example, to see the logs from the collection referenced in the @log@ field:
 407
 408 <notextile>
 409 <pre><code>~$ <span class="userinput">arv keep ls <b>a01df2f7e5bc1c2ad59c60a837e90dc6+166</b></span>
 410 ./crunch-run.txt
 411 ./stderr.txt
 412 ./stdout.txt
 413 ~$ <span class="userinput">arv-get <b>a01df2f7e5bc1c2ad59c60a837e90dc6+166</b>/stdout.txt</span>
 414 2016-08-05T13:53:06.201011Z Hello, Crunch!
 415 </code></pre>
 416 </notextile>
 417
 418 If the container does not dispatch successfully, refer to the @arvados-dispatch-cloud@ logs for information about why it failed.