13647: Use cluster config instead of custom keepstore config.
[arvados.git] / build / run-tests.sh
1 #!/bin/bash
2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
3 #
4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
5
6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin.sh
7
8 COLUMNS=80
9 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
10
11 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
12 $(basename $0): Install and test Arvados components.
13
14 Exit non-zero if any tests fail.
15
16 Syntax:
17         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
18
19 Options:
20
21 --skip FOO     Do not test the FOO component.
22 --skip sanity  Skip initial dev environment sanity checks.
23 --skip install Do not run any install steps. Just run tests.
24                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
25                from a previous invocation if you use this option.
26 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
27 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
28                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
29 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
30                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
31                subsequent invocations.
32 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
33 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
34 --only-install Run specific install step
35 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
36 --interactive  Set up, then prompt for test/install steps to perform.
37 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
38 CONFIGSRC=path Dir with config.yml file containing PostgreSQL section for use by tests. (required)
39 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
40                Restrict apiserver tests to the given file
41 sdk/python_test="--test-suite tests.test_keep_locator"
42                Restrict Python SDK tests to the given class
43 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
44                Restrict Workbench tests to the given file
45 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
46                Show all log messages, even when tests pass (also works
47                with services/keepstore_test etc.)
48 ARVADOS_DEBUG=1
49                Print more debug messages
50 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
51                *_test, and other examples shown above.
52
53 Assuming "--skip install" is not given, all components are installed
54 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
55 test suites depend on other components being installed, and installing
56 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
57
58 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
59 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
60
61 More information and background:
62
63 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
64
65 Available tests:
66
67 apps/workbench (*)
68 apps/workbench_units (*)
69 apps/workbench_functionals (*)
70 apps/workbench_integration (*)
71 apps/workbench_benchmark
72 apps/workbench_profile
73 cmd/arvados-client
74 cmd/arvados-server
75 doc
76 lib/cli
77 lib/cmd
78 lib/controller
79 lib/controller/federation
80 lib/controller/railsproxy
81 lib/controller/router
82 lib/controller/rpc
83 lib/crunchstat
84 lib/cloud
85 lib/cloud/azure
86 lib/cloud/cloudtest
87 lib/dispatchcloud
88 lib/dispatchcloud/container
89 lib/dispatchcloud/scheduler
90 lib/dispatchcloud/ssh_executor
91 lib/dispatchcloud/worker
92 lib/service
93 services/api
94 services/arv-git-httpd
95 services/crunchstat
96 services/dockercleaner
97 services/fuse
98 services/fuse:py3
99 services/health
100 services/keep-web
101 services/keepproxy
102 services/keepstore
103 services/keep-balance
104 services/login-sync
105 services/nodemanager
106 services/nodemanager_integration
107 services/crunch-run
108 services/crunch-dispatch-local
109 services/crunch-dispatch-slurm
110 services/ws
111 sdk/cli
112 sdk/pam
113 sdk/pam:py3
114 sdk/python
115 sdk/python:py3
116 sdk/ruby
117 sdk/go/arvados
118 sdk/go/arvadosclient
119 sdk/go/auth
120 sdk/go/dispatch
121 sdk/go/keepclient
122 sdk/go/health
123 sdk/go/httpserver
124 sdk/go/manifest
125 sdk/go/blockdigest
126 sdk/go/asyncbuf
127 sdk/go/stats
128 sdk/go/crunchrunner
129 sdk/cwl
130 sdk/R
131 sdk/java-v2
132 tools/sync-groups
133 tools/crunchstat-summary
134 tools/crunchstat-summary:py3
135 tools/keep-exercise
136 tools/keep-rsync
137 tools/keep-block-check
138
139 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
140     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
141
142 EOF
143
144 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
145 # environment that could interfere with the tests.
146 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
147
148 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
149 # accident.
150 GITDIR=
151 GOPATH=
152 VENVDIR=
153 VENV3DIR=
154 PYTHONPATH=
155 GEMHOME=
156 PERLINSTALLBASE=
157 R_LIBS=
158 export LANG=en_US.UTF-8
159
160 short=
161 only_install=
162 temp=
163 temp_preserve=
164
165 clear_temp() {
166     if [[ -z "$temp" ]]; then
167         # we didn't even get as far as making a temp dir
168         :
169     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
170         rm -rf "$temp"
171     else
172         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
173     fi
174 }
175
176 fatal() {
177     clear_temp
178     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
179     exit 1
180 }
181
182 exit_cleanly() {
183     trap - INT
184     if which create-plot-data-from-log.sh >/dev/null; then
185         create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
186     fi
187     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
188     stop_services
189     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
190     report_outcomes
191     clear_temp
192     exit ${#failures}
193 }
194
195 sanity_checks() {
196     [[ -n "${skip[sanity]}" ]] && return 0
197     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
198         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
199     [[ -n "$CONFIGSRC" ]] \
200         || fatal "CONFIGSRC environment not set (see: $0 --help)"
201     [[ -s "$CONFIGSRC/config.yml" ]] \
202         || fatal "'$CONFIGSRC/config.yml' is empty or not found (see: $0 --help)"
203     echo Checking dependencies:
204     echo "locale: ${LANG}"
205     [[ "$(locale charmap)" = "UTF-8" ]] \
206         || fatal "Locale '${LANG}' is broken/missing. Try: echo ${LANG} | sudo tee -a /etc/locale.gen && sudo locale-gen"
207     echo -n 'virtualenv: '
208     virtualenv --version \
209         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
210     echo -n 'ruby: '
211     ruby -v \
212         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
213     echo -n 'go: '
214     go version \
215         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
216     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 12 ]] \
217         || fatal "Go >= 1.12 required. See http://golang.org/doc/install"
218     echo -n 'gcc: '
219     gcc --version | egrep ^gcc \
220         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
221     echo -n 'fuse.h: '
222     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
223         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
224     echo -n 'gnutls.h: '
225     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
226         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
227     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
228     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
229         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
230     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
231     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
232         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
233     which netstat \
234         || fatal "No netstat. Try: apt-get install net-tools"
235     echo -n 'nginx: '
236     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
237         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
238     echo -n 'perl: '
239     perl -v | grep version \
240         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
241     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
242         echo -n "perl $mod: "
243         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
244             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
245     done
246     echo -n 'gitolite: '
247     which gitolite \
248         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
249     echo -n 'npm: '
250     npm --version \
251         || fatal "No npm. Try: wget -O- https://nodejs.org/dist/v6.11.2/node-v6.11.2-linux-x64.tar.xz | sudo tar -C /usr/local -xJf - && sudo ln -s ../node-v6.11.2-linux-x64/bin/{node,npm} /usr/local/bin/"
252     echo -n 'cadaver: '
253     cadaver --version | grep -w cadaver \
254           || fatal "No cadaver. Try: apt-get install cadaver"
255     echo -n 'libattr1 xattr.h: '
256     find /usr/include -path '*/attr/xattr.h' | egrep --max-count=1 . \
257         || fatal "No libattr1 xattr.h. Try: apt-get install libattr1-dev"
258     echo -n 'libcurl curl.h: '
259     find /usr/include -path '*/curl/curl.h' | egrep --max-count=1 . \
260         || fatal "No libcurl curl.h. Try: apt-get install libcurl4-gnutls-dev"
261     echo -n 'libpq libpq-fe.h: '
262     find /usr/include -path '*/postgresql/libpq-fe.h' | egrep --max-count=1 . \
263         || fatal "No libpq libpq-fe.h. Try: apt-get install libpq-dev"
264     echo -n 'postgresql: '
265     psql --version || fatal "No postgresql. Try: apt-get install postgresql postgresql-client-common"
266     echo -n 'phantomjs: '
267     phantomjs --version || fatal "No phantomjs. Try: apt-get install phantomjs"
268     echo -n 'xvfb: '
269     which Xvfb || fatal "No xvfb. Try: apt-get install xvfb"
270     echo -n 'graphviz: '
271     dot -V || fatal "No graphviz. Try: apt-get install graphviz"
272     echo -n 'geckodriver: '
273     geckodriver --version | grep ^geckodriver || echo "No geckodriver. Try: wget -O- https://github.com/mozilla/geckodriver/releases/download/v0.23.0/geckodriver-v0.23.0-linux64.tar.gz | sudo tar -C /usr/local/bin -xzf - geckodriver"
274
275     if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
276       # R SDK stuff
277       echo -n 'R: '
278       which Rscript || fatal "No Rscript. Try: apt-get install r-base"
279       echo -n 'testthat: '
280       Rscript -e "library('testthat')" || fatal "No testthat. Try: apt-get install r-cran-testthat"
281       # needed for roxygen2, needed for devtools, needed for R sdk
282       pkg-config --exists libxml-2.0 || fatal "No libxml2. Try: apt-get install libxml2-dev"
283       # needed for pkgdown, builds R SDK doc pages
284       which pandoc || fatal "No pandoc. Try: apt-get install pandoc"
285     fi
286 }
287
288 rotate_logfile() {
289   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
290   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
291   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
292     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
293     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
294     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
295   fi
296 }
297
298 declare -a failures
299 declare -A skip
300 declare -A only
301 declare -A testargs
302 skip[apps/workbench_profile]=1
303 # nodemanager_integration tests are not reliable, see #12061.
304 skip[services/nodemanager_integration]=1
305
306 while [[ -n "$1" ]]
307 do
308     arg="$1"; shift
309     case "$arg" in
310         --help)
311             echo >&2 "$helpmessage"
312             echo >&2
313             exit 1
314             ;;
315         --skip)
316             skip[$1]=1; shift
317             ;;
318         --only)
319             only[$1]=1; skip[$1]=""; shift
320             ;;
321         --short)
322             short=1
323             ;;
324         --interactive)
325             interactive=1
326             ;;
327         --skip-install)
328             skip[install]=1
329             ;;
330         --only-install)
331             only_install="$1"; shift
332             ;;
333         --temp)
334             temp="$1"; shift
335             temp_preserve=1
336             ;;
337         --leave-temp)
338             temp_preserve=1
339             ;;
340         --repeat)
341             repeat=$((${1}+0)); shift
342             ;;
343         --retry)
344             retry=1
345             ;;
346         *_test=*)
347             suite="${arg%%_test=*}"
348             args="${arg#*=}"
349             testargs["$suite"]="$args"
350             ;;
351         *=*)
352             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
353             ;;
354         *)
355             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
356             exit 1
357             ;;
358     esac
359 done
360
361 # R SDK installation is very slow (~360s in a clean environment) and only
362 # required when testing it. Skip that step if it is not needed.
363 NEED_SDK_R=true
364
365 if [[ ${#only[@]} -ne 0 ]] &&
366    [[ -z "${only['sdk/R']}" && -z "${only['doc']}" ]]; then
367   NEED_SDK_R=false
368 fi
369
370 if [[ ${skip["sdk/R"]} == 1 && ${skip["doc"]} == 1 ]]; then
371   NEED_SDK_R=false
372 fi
373
374 if [[ $NEED_SDK_R == false ]]; then
375         echo "R SDK not needed, it will not be installed."
376 fi
377
378 checkpidfile() {
379     svc="$1"
380     pid="$(cat "$WORKSPACE/tmp/${svc}.pid")"
381     if [[ -z "$pid" ]] || ! kill -0 "$pid"; then
382         tail $WORKSPACE/tmp/${1}*.log
383         echo "${svc} pid ${pid} not running"
384         return 1
385     fi
386     echo "${svc} pid ${pid} ok"
387 }
388
389 checkhealth() {
390     svc="$1"
391     base=$(python -c "import yaml; print list(yaml.safe_load(file('$ARVADOS_CONFIG'))['Clusters']['zzzzz']['Services']['$1']['InternalURLs'].keys())[0]")
392     url="$base/_health/ping"
393     if ! curl -Ss -H "Authorization: Bearer e687950a23c3a9bceec28c6223a06c79" "${url}" | tee -a /dev/stderr | grep '"OK"'; then
394         echo "${url} failed"
395         return 1
396     fi
397 }
398
399 checkdiscoverydoc() {
400     dd="https://${1}/discovery/v1/apis/arvados/v1/rest"
401     if ! (set -o pipefail; curl -fsk "$dd" | grep -q ^{ ); then
402         echo >&2 "ERROR: could not retrieve discovery doc from RailsAPI at $dd"
403         tail -v $WORKSPACE/services/api/log/test.log
404         return 1
405     fi
406     echo "${dd} ok"
407 }
408
409 start_services() {
410     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
411         return 0
412     fi
413     . "$VENVDIR/bin/activate"
414     echo 'Starting API, controller, keepproxy, keep-web, arv-git-httpd, ws, and nginx ssl proxy...'
415     if [[ ! -d "$WORKSPACE/services/api/log" ]]; then
416         mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/log"
417     fi
418     # Remove empty api.pid file if it exists
419     if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid" && ! -s "$WORKSPACE/tmp/api.pid" ]]; then
420         rm -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid"
421     fi
422     all_services_stopped=
423     fail=1
424
425     cd "$WORKSPACE" \
426         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
427         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
428         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
429         && checkpidfile api \
430         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
431         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx) \
432         && checkpidfile nginx \
433         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_controller \
434         && checkpidfile controller \
435         && checkhealth Controller \
436         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
437         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
438         && checkpidfile keepproxy \
439         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
440         && checkpidfile keep-web \
441         && checkhealth WebDAV \
442         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
443         && checkpidfile arv-git-httpd \
444         && checkhealth GitHTTP \
445         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
446         && checkpidfile ws \
447         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1 \
448         && (env | egrep ^ARVADOS) \
449         && fail=0
450     deactivate
451     if [[ $fail != 0 ]]; then
452         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
453     fi
454     return $fail
455 }
456
457 stop_services() {
458     if [[ -n "$all_services_stopped" ]]; then
459         return
460     fi
461     unset ARVADOS_TEST_API_HOST ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
462     . "$VENVDIR/bin/activate" || return
463     cd "$WORKSPACE" \
464         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
465         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
466         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
467         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
468         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy \
469         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_controller \
470         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop \
471         && all_services_stopped=1
472     deactivate
473     unset ARVADOS_CONFIG
474 }
475
476 interrupt() {
477     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
478     exit_cleanly
479 }
480 trap interrupt INT
481
482 setup_ruby_environment() {
483     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
484         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
485         using_rvm=true
486     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
487         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
488         using_rvm=true
489     else
490         using_rvm=false
491     fi
492
493     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
494         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
495         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
496         # the environment to the "current gemset", which would lose
497         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
498         # programs (for example, the Workbench test suite could not
499         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
500         # rvm gemset and use it for everything.
501
502         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
503             || fatal 'rvm check'
504
505         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
506         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
507         # complaint about not being in first place already.
508         rvm use @default 2>/dev/null
509
510         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
511         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
512         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
513         # ruby to the caller.
514         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
515         rvm use "@${gemset}" --create \
516             || fatal 'rvm gemset setup'
517
518         rvm env
519     else
520         # When our "bundle install"s need to install new gems to
521         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
522         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
523         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
524         # should be installed, and we should leave it alone.)
525
526         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
527             user_gempath="$(gem env gempath)"
528             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
529         fi
530         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
531
532         # When we build and install our own gems, we install them in our
533         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
534         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
535         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
536
537         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
538         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
539         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
540
541         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
542         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
543         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
544     fi
545     bundle config || gem install bundler \
546         || fatal 'install bundler'
547 }
548
549 with_test_gemset() {
550     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
551         "$@"
552     else
553         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
554     fi
555 }
556
557 gem_uninstall_if_exists() {
558     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
559         gem uninstall --force --all --executables "$1"
560     fi
561 }
562
563 setup_virtualenv() {
564     local venvdest="$1"; shift
565     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
566         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
567     elif [[ -n "$short" ]]; then
568         return
569     fi
570     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
571         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
572         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
573     else
574         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
575     fi
576 }
577
578 initialize() {
579     sanity_checks
580
581     echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
582
583     # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
584     cd "$WORKSPACE"
585     find -name '*.pyc' -delete
586
587     if [[ -z "$temp" ]]; then
588         temp="$(mktemp -d)"
589     fi
590
591     # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
592     for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE R_LIBS
593     do
594         if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
595             eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
596         fi
597         if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
598             mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
599         fi
600     done
601
602     rm -vf "${WORKSPACE}/tmp/*.log"
603
604     export PERLINSTALLBASE
605     export PERL5LIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5${PERL5LIB:+:$PERL5LIB}"
606
607     export R_LIBS
608
609     export GOPATH
610     # Make sure our compiled binaries under test override anything
611     # else that might be in the environment.
612     export PATH=$GOPATH/bin:$PATH
613
614     # Jenkins config requires that glob tmp/*.log match something. Ensure
615     # that happens even if we don't end up running services that set up
616     # logging.
617     mkdir -p "${WORKSPACE}/tmp/" || fatal "could not mkdir ${WORKSPACE}/tmp"
618     touch "${WORKSPACE}/tmp/controller.log" || fatal "could not touch ${WORKSPACE}/tmp/controller.log"
619
620     unset http_proxy https_proxy no_proxy
621
622     # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
623     # whine a lot.
624     setup_ruby_environment
625
626     echo "PATH is $PATH"
627 }
628
629 install_env() {
630     (
631         set -e
632         mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
633         if [[ ! -h "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" ]]; then
634             for d in \
635                 "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/tmp/GOPATH" \
636                     "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/tmp" \
637                     "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/arvados" \
638                     "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"; do
639                 [[ -h "$d" ]] && rm "$d"
640                 [[ -d "$d" ]] && rmdir "$d"
641             done
642         fi
643         ln -vsfT "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
644         go get -v github.com/kardianos/govendor
645         cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
646         go get -v -d ...
647         "$GOPATH/bin/govendor" sync
648         which goimports >/dev/null || go get golang.org/x/tools/cmd/goimports
649     ) || fatal "Go setup failed"
650
651     setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
652     . "$VENVDIR/bin/activate"
653
654     # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
655     pip install --no-cache-dir PyYAML future \
656         || fatal "pip install PyYAML failed"
657
658     # Preinstall libcloud if using a fork; otherwise nodemanager "pip
659     # install" won't pick it up by default.
660     if [[ -n "$LIBCLOUD_PIN_SRC" ]]; then
661         pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
662             || pip install --pre --ignore-installed --no-cache-dir "$LIBCLOUD_PIN_SRC" >/dev/null \
663             || fatal "pip install apache-libcloud failed"
664     fi
665
666     # Deactivate Python 2 virtualenv
667     deactivate
668
669     # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
670     # Otherwise, skip dependent tests.
671     PYTHON3=$(which python3)
672     if [[ ${?} = 0 ]]; then
673         setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
674     else
675         PYTHON3=
676         cat >&2 <<EOF
677
678 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
679
680 EOF
681     fi
682
683     if ! which bundler >/dev/null
684     then
685         gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
686     fi
687 }
688
689 retry() {
690     remain="${repeat}"
691     while :
692     do
693         if ${@}; then
694             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
695                 remain=$((${remain}-1))
696                 title "(repeating ${remain} more times)"
697             else
698                 break
699             fi
700         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
701             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
702             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
703             then
704                 break
705             fi
706         else
707             break
708         fi
709     done
710 }
711
712 do_test() {
713     case "${1}" in
714         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
715             suite=apps/workbench
716             ;;
717         services/nodemanager | services/nodemanager_integration)
718             suite=services/nodemanager_suite
719             ;;
720         *)
721             suite="${1}"
722             ;;
723     esac
724     if [[ -n "${skip[$suite]}" || \
725               -n "${skip[$1]}" || \
726               (${#only[@]} -ne 0 && ${only[$suite]} -eq 0 && ${only[$1]} -eq 0) ]]; then
727         return 0
728     fi
729     case "${1}" in
730         services/api)
731             stop_services
732             check_arvados_config "$1"
733             ;;
734         gofmt | govendor | doc | lib/cli | lib/cloud/azure | lib/cloud/ec2 | lib/cloud/cloudtest | lib/cmd | lib/dispatchcloud/ssh_executor | lib/dispatchcloud/worker)
735             check_arvados_config "$1"
736             # don't care whether services are running
737             ;;
738         *)
739             check_arvados_config "$1"
740             if ! start_services; then
741                 title "test $1 -- failed to start services"
742                 return 1
743             fi
744             ;;
745     esac
746     retry do_test_once ${@}
747 }
748
749 do_test_once() {
750     unset result
751
752     title "test $1"
753     timer_reset
754
755     result=
756     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
757     if ! . "$VENVDIR/bin/activate"
758     then
759         result=1
760     elif [[ "$2" == "go" ]]
761     then
762         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
763         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
764         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
765         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
766         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
767         # compilation errors.
768         go get -ldflags "-X git.curoverse.com/arvados.git/lib/cmd.version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}" -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
769             cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
770             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
771         then
772             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
773             # does:
774             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
775         else
776             # The above form gets verbose even when testargs is
777             # empty, so use this form in such cases:
778             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
779         fi
780         result=${result:-$?}
781         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
782         then
783             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
784             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
785         fi
786         [[ $result = 0 ]] && gofmt -e -d *.go
787     elif [[ "$2" == "pip" ]]
788     then
789         tries=0
790         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
791         do
792             tries=$((${tries}+1))
793             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
794             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
795             if [[ -e "${3}activate" ]]; then
796                 . "${3}activate"
797             fi
798             python setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
799             result=$?
800             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
801             then
802                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
803                 continue
804             else
805                 break
806             fi
807         done
808     elif [[ "$2" != "" ]]
809     then
810         "test_$2"
811     else
812         "test_$1"
813     fi
814     result=${result:-$?}
815     checkexit $result "$1 tests"
816     title "test $1 -- `timer`"
817     return $result
818 }
819
820 check_arvados_config() {
821     if [[ "$1" = "env" ]] ; then
822         return
823     fi
824     if [[ -z "$ARVADOS_CONFIG" ]] ; then
825         # Create config file.  The run_test_server script requires PyYAML,
826         # so virtualenv needs to be active.  Downstream steps like
827         # workbench install which require a valid config.yml.
828         if [[ ! -s "$VENVDIR/bin/activate" ]] ; then
829             install_env
830         fi
831         . "$VENVDIR/bin/activate"
832         cd "$WORKSPACE"
833         eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py setup_config)
834         deactivate
835     fi
836 }
837
838 do_install() {
839     if [[ -n "${skip[install]}" || ( -n "${only_install}" && "${only_install}" != "${1}" && "${only_install}" != "${2}" ) ]]; then
840         return 0
841     fi
842     check_arvados_config "$1"
843     retry do_install_once ${@}
844 }
845
846 do_install_once() {
847     title "install $1"
848     timer_reset
849
850     result=
851     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
852     if [[ "$1" != "env" ]] && ! . "$VENVDIR/bin/activate"; then
853         result=1
854     elif [[ "$2" == "go" ]]
855     then
856         go get -ldflags "-X git.curoverse.com/arvados.git/lib/cmd.version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}" -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
857     elif [[ "$2" == "pip" ]]
858     then
859         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
860         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
861
862         # Need to change to a different directory after creating
863         # the source dist package to avoid a pip bug.
864         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
865
866         # Also need to install twice, because if it believes the package is
867         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
868         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
869         # install" ensures that we've actually installed the local package
870         # we just built.
871         cd "$WORKSPACE/$1" \
872             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
873             && cd "$WORKSPACE" \
874             && "${3}pip" install --no-cache-dir --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
875             && "${3}pip" install --no-cache-dir --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
876     elif [[ "$2" != "" ]]
877     then
878         "install_$2"
879     else
880         "install_$1"
881     fi
882     result=${result:-$?}
883     checkexit $result "$1 install"
884     title "install $1 -- `timer`"
885     return $result
886 }
887
888 bundle_install_trylocal() {
889     (
890         set -e
891         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
892         if ! bundle install --local --no-deployment; then
893             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
894             bundle install --no-deployment
895         fi
896         bundle package --all
897     )
898 }
899
900 install_doc() {
901     cd "$WORKSPACE/doc" \
902         && bundle_install_trylocal \
903         && rm -rf .site
904 }
905
906 install_gem() {
907     gemname=$1
908     srcpath=$2
909     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
910         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
911         && bundle_install_trylocal \
912         && gem build "$gemname.gemspec" \
913         && with_test_gemset gem install --no-document $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
914 }
915
916 install_sdk/ruby() {
917     install_gem arvados sdk/ruby
918 }
919
920 install_sdk/R() {
921   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
922     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
923        && Rscript --vanilla install_deps.R
924   fi
925 }
926
927 install_sdk/perl() {
928     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
929         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
930         && make install INSTALLDIRS=perl
931 }
932
933 install_sdk/cli() {
934     install_gem arvados-cli sdk/cli
935 }
936
937 install_services/login-sync() {
938     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
939 }
940
941 install_services/api() {
942     stop_services
943     cd "$WORKSPACE/services/api" \
944         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
945
946     rm -f config/environments/test.rb
947     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
948
949     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
950     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
951     # is a postgresql superuser.
952     cd "$WORKSPACE/services/api" \
953         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.safe_load(file('$ARVADOS_CONFIG'))['Clusters']['zzzzz']['PostgreSQL']['Connection']['dbname']") \
954         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.pid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
955
956     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
957
958     cert="$WORKSPACE/services/api/tmp/self-signed"
959     if [[ ! -e "$cert.pem" || "$(date -r "$cert.pem" +%s)" -lt 1512659226 ]]; then
960         (
961             dir="$WORKSPACE/services/api/tmp"
962             set -ex
963             openssl req -newkey rsa:2048 -nodes -subj '/C=US/ST=State/L=City/CN=localhost' -out "$cert.csr" -keyout "$cert.key" </dev/null
964             openssl x509 -req -in "$cert.csr" -signkey "$cert.key" -out "$cert.pem" -days 3650 -extfile <(printf 'subjectAltName=DNS:localhost,DNS:::1,DNS:0.0.0.0,DNS:127.0.0.1,IP:::1,IP:0.0.0.0,IP:127.0.0.1')
965         ) || return 1
966     fi
967
968     cd "$WORKSPACE/services/api" \
969         && rm -rf tmp/git \
970         && mkdir -p tmp/git \
971         && cd tmp/git \
972         && tar xf ../../test/test.git.tar \
973         && mkdir -p internal.git \
974         && git --git-dir internal.git init \
975             || return 1
976
977
978     (cd "$WORKSPACE/services/api"
979      export RAILS_ENV=test
980      if bundle exec rails db:environment:set ; then
981         bundle exec rake db:drop
982      fi
983      bundle exec rake db:setup \
984          && bundle exec rake db:fixtures:load
985     )
986 }
987
988 declare -a pythonstuff
989 pythonstuff=(
990     sdk/pam
991     sdk/python
992     sdk/python:py3
993     sdk/cwl
994     sdk/cwl:py3
995     services/dockercleaner:py3
996     services/fuse
997     services/fuse:py3
998     services/nodemanager
999     tools/crunchstat-summary
1000     tools/crunchstat-summary:py3
1001 )
1002
1003 declare -a gostuff
1004 gostuff=($(cd "$WORKSPACE" && git grep -lw func | grep \\.go | sed -e 's/\/[^\/]*$//' | sort -u))
1005
1006 install_apps/workbench() {
1007     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1008         && mkdir -p tmp/cache \
1009         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
1010         && RAILS_ENV=test RAILS_GROUPS=assets bundle exec rake npm:install
1011 }
1012
1013 test_doc() {
1014     (
1015         set -e
1016         cd "$WORKSPACE/doc"
1017         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
1018         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
1019         # do much good!
1020         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
1021     )
1022 }
1023
1024 test_gofmt() {
1025     cd "$WORKSPACE" || return 1
1026     dirs=$(ls -d */ | egrep -v 'vendor|tmp')
1027     [[ -z "$(gofmt -e -d $dirs | tee -a /dev/stderr)" ]]
1028 }
1029
1030 test_govendor() {
1031     (
1032         set -e
1033         cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
1034         # Remove cached source dirs in workdir. Otherwise, they will
1035         # not qualify as +missing or +external below, and we won't be
1036         # able to detect that they're missing from vendor/vendor.json.
1037         rm -rf vendor/*/
1038         go get -v -d ...
1039         "$GOPATH/bin/govendor" sync
1040         if [[ -n $("$GOPATH/bin/govendor" list +unused +missing +external | tee /dev/stderr) ]]; then
1041             echo >&2 "vendor/vendor.json has unused or missing dependencies -- try:
1042
1043 (export GOPATH=\"${GOPATH}\"; cd \$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git && \$GOPATH/bin/govendor add +missing +external && \$GOPATH/bin/govendor remove +unused)
1044
1045 "
1046             return 1
1047         fi
1048     )
1049 }
1050
1051 test_services/api() {
1052     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
1053     cd "$WORKSPACE/services/api" \
1054         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS='-v -d' ${testargs[services/api]}
1055 }
1056
1057 test_sdk/ruby() {
1058     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
1059         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
1060 }
1061
1062 test_sdk/R() {
1063   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
1064     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
1065         && Rscript --vanilla run_test.R
1066   fi
1067 }
1068
1069 test_sdk/cli() {
1070     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
1071         && mkdir -p /tmp/keep \
1072         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
1073 }
1074
1075 test_sdk/java-v2() {
1076     cd "$WORKSPACE/sdk/java-v2" && gradle test
1077 }
1078
1079 test_services/login-sync() {
1080     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
1081         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
1082 }
1083
1084 test_services/nodemanager_integration() {
1085     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
1086         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager_integration]}
1087 }
1088
1089 test_apps/workbench_units() {
1090     local TASK="test:units"
1091     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_units]}" ]]; then
1092         TASK="test"
1093     fi
1094     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1095         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} TESTOPTS='-v -d' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_units]}
1096 }
1097
1098 test_apps/workbench_functionals() {
1099     local TASK="test:functionals"
1100     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_functionals]}" ]]; then
1101         TASK="test"
1102     fi
1103     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1104         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} TESTOPTS='-v -d' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_functionals]}
1105 }
1106
1107 test_apps/workbench_integration() {
1108     local TASK="test:integration"
1109     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_integration]}" ]]; then
1110         TASK="test"
1111     fi
1112     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1113         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} TESTOPTS='-v -d' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_integration]}
1114 }
1115
1116 test_apps/workbench_benchmark() {
1117     local TASK="test:benchmark"
1118     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_benchmark]}" ]]; then
1119         TASK="test"
1120     fi
1121     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1122         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
1123 }
1124
1125 test_apps/workbench_profile() {
1126     local TASK="test:profile"
1127     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_profile]}" ]]; then
1128         TASK="test"
1129     fi
1130     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1131         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} ${testargs[apps/workbench_profile]}
1132 }
1133
1134 install_deps() {
1135     # Install parts needed by test suites
1136     do_install env
1137     do_install cmd/arvados-server go
1138     do_install sdk/cli
1139     do_install sdk/perl
1140     do_install sdk/python pip
1141     do_install sdk/ruby
1142     do_install services/api
1143     do_install services/arv-git-httpd go
1144     do_install services/keepproxy go
1145     do_install services/keepstore go
1146     do_install services/keep-web go
1147     do_install services/ws go
1148 }
1149
1150 install_all() {
1151     do_install env
1152     do_install doc
1153     do_install sdk/ruby
1154     do_install sdk/R
1155     do_install sdk/perl
1156     do_install sdk/cli
1157     do_install services/login-sync
1158     for p in "${pythonstuff[@]}"
1159     do
1160         dir=${p%:py3}
1161         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1162             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1163                 do_install ${dir} pip
1164             fi
1165         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1166             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1167                 do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1168             fi
1169         fi
1170     done
1171     for g in "${gostuff[@]}"
1172     do
1173         do_install "$g" go
1174     done
1175     do_install services/api
1176     do_install apps/workbench
1177 }
1178
1179 test_all() {
1180     stop_services
1181     do_test services/api
1182
1183     # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
1184     # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
1185     if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
1186         rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
1187         exit_cleanly
1188     fi
1189
1190     do_test gofmt
1191     do_test govendor
1192     do_test doc
1193     do_test sdk/ruby
1194     do_test sdk/R
1195     do_test sdk/cli
1196     do_test services/login-sync
1197     do_test sdk/java-v2
1198     do_test services/nodemanager_integration
1199     for p in "${pythonstuff[@]}"
1200     do
1201         dir=${p%:py3}
1202         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1203             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1204                 do_test ${dir} pip
1205             fi
1206         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1207             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1208                 do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1209             fi
1210         fi
1211     done
1212
1213     for g in "${gostuff[@]}"
1214     do
1215         do_test "$g" go
1216     done
1217     do_test apps/workbench_units
1218     do_test apps/workbench_functionals
1219     do_test apps/workbench_integration
1220     do_test apps/workbench_benchmark
1221     do_test apps/workbench_profile
1222 }
1223
1224 help_interactive() {
1225     echo "== Interactive commands:"
1226     echo "TARGET                 (short for 'test DIR')"
1227     echo "test TARGET"
1228     echo "test TARGET:py3        (test with python3)"
1229     echo "test TARGET -check.vv  (pass arguments to test)"
1230     echo "install TARGET"
1231     echo "install env            (go/python libs)"
1232     echo "install deps           (go/python libs + arvados components needed for integration tests)"
1233     echo "reset                  (...services used by integration tests)"
1234     echo "exit"
1235     echo "== Test targets:"
1236     echo "${!testfuncargs[@]}" | tr ' ' '\n' | sort | column
1237 }
1238
1239 initialize
1240
1241 declare -A testfuncargs=()
1242 for g in "${gostuff[@]}"; do
1243     testfuncargs[$g]="$g go"
1244 done
1245 for p in "${pythonstuff[@]}"; do
1246     dir=${p%:py3}
1247     testfuncargs[$dir]="$dir pip $VENVDIR/bin/"
1248     testfuncargs[$dir:py3]="$dir pip $VENV3DIR/bin/"
1249 done
1250
1251 testfuncargs["sdk/cli"]="sdk/cli"
1252 testfuncargs["sdk/R"]="sdk/R"
1253 testfuncargs["sdk/java-v2"]="sdk/java-v2"
1254 testfuncargs["apps/workbench_units"]="apps/workbench_units"
1255 testfuncargs["apps/workbench_functionals"]="apps/workbench_functionals"
1256 testfuncargs["apps/workbench_integration"]="apps/workbench_integration"
1257 testfuncargs["apps/workbench_benchmark"]="apps/workbench_benchmark"
1258 testfuncargs["apps/workbench_profile"]="apps/workbench_profile"
1259
1260 if [[ -z ${interactive} ]]; then
1261     install_all
1262     test_all
1263 else
1264     skip=()
1265     only=()
1266     only_install=()
1267     if [[ -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then stop_services; fi
1268     setnextcmd() {
1269         if [[ "$TERM" = dumb ]]; then
1270             # assume emacs, or something, is offering a history buffer
1271             # and pre-populating the command will only cause trouble
1272             nextcmd=
1273         elif [[ ! -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then
1274             nextcmd="install deps"
1275         else
1276             nextcmd=""
1277         fi
1278     }
1279     echo
1280     help_interactive
1281     nextcmd="install deps"
1282     setnextcmd
1283     HISTFILE="$WORKSPACE/tmp/.history"
1284     history -r
1285     while read -p 'What next? ' -e -i "$nextcmd" nextcmd; do
1286         history -s "$nextcmd"
1287         history -w
1288         read verb target opts <<<"${nextcmd}"
1289         target="${target%/}"
1290         target="${target/\/:/:}"
1291         case "${verb}" in
1292             "exit" | "quit")
1293                 exit_cleanly
1294                 ;;
1295             "reset")
1296                 stop_services
1297                 ;;
1298             "test" | "install")
1299                 case "$target" in
1300                     "")
1301                         help_interactive
1302                         ;;
1303                     all | deps)
1304                         ${verb}_${target}
1305                         ;;
1306                     *)
1307                         testargs["$target"]="${opts}"
1308                         tt="${testfuncargs[${target}]}"
1309                         tt="${tt:-$target}"
1310                         do_$verb $tt
1311                         ;;
1312                 esac
1313                 ;;
1314             "" | "help" | *)
1315                 help_interactive
1316                 ;;
1317         esac
1318         if [[ ${#successes[@]} -gt 0 || ${#failures[@]} -gt 0 ]]; then
1319             report_outcomes
1320             successes=()
1321             failures=()
1322         fi
1323         cd "$WORKSPACE"
1324         setnextcmd
1325     done
1326     echo
1327 fi
1328 exit_cleanly