build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
   5
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin.sh
   7
   8 COLUMNS=80
   9 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
  10
  11 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
  12 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  13
  14 Exit non-zero if any tests fail.
  15
  16 Syntax:
  17         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  18
  19 Options:
  20
  21 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  22 --skip sanity  Skip initial dev environment sanity checks.
  23 --skip install Do not run any install steps. Just run tests.
  24                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  25                from a previous invocation if you use this option.
  26 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  27 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  28                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  29 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  30                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  31                subsequent invocations.
  32 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  33 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  34 --only-install Run specific install step
  35 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  36 --interactive  Set up, then prompt for test/install steps to perform.
  37 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  38 CONFIGSRC=path Dir with config.yml file containing PostgreSQL section for use by tests. (required)
  39 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  40                Restrict apiserver tests to the given file
  41 sdk/python_test="--test-suite tests.test_keep_locator"
  42                Restrict Python SDK tests to the given class
  43 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  44                Restrict Workbench tests to the given file
  45 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  46                Show all log messages, even when tests pass (also works
  47                with services/keepstore_test etc.)
  48 ARVADOS_DEBUG=1
  49                Print more debug messages
  50 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  51                *_test, and other examples shown above.
  52
  53 Assuming "--skip install" is not given, all components are installed
  54 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  55 test suites depend on other components being installed, and installing
  56 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  57
  58 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  59 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  60
  61 More information and background:
  62
  63 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  64
  65 Available tests:
  66
  67 apps/workbench (*)
  68 apps/workbench_units (*)
  69 apps/workbench_functionals (*)
  70 apps/workbench_integration (*)
  71 apps/workbench_benchmark
  72 apps/workbench_profile
  73 cmd/arvados-client
  74 cmd/arvados-server
  75 doc
  76 lib/cli
  77 lib/cmd
  78 lib/controller
  79 lib/controller/federation
  80 lib/controller/railsproxy
  81 lib/controller/router
  82 lib/controller/rpc
  83 lib/crunchstat
  84 lib/cloud
  85 lib/cloud/azure
  86 lib/cloud/cloudtest
  87 lib/dispatchcloud
  88 lib/dispatchcloud/container
  89 lib/dispatchcloud/scheduler
  90 lib/dispatchcloud/ssh_executor
  91 lib/dispatchcloud/worker
  92 lib/service
  93 services/api
  94 services/arv-git-httpd
  95 services/crunchstat
  96 services/dockercleaner
  97 services/fuse
  98 services/fuse:py3
  99 services/health
 100 services/keep-web
 101 services/keepproxy
 102 services/keepstore
 103 services/keep-balance
 104 services/login-sync
 105 services/nodemanager
 106 services/nodemanager_integration
 107 services/crunch-run
 108 services/crunch-dispatch-local
 109 services/crunch-dispatch-slurm
 110 services/ws
 111 sdk/cli
 112 sdk/pam
 113 sdk/pam:py3
 114 sdk/python
 115 sdk/python:py3
 116 sdk/ruby
 117 sdk/go/arvados
 118 sdk/go/arvadosclient
 119 sdk/go/auth
 120 sdk/go/dispatch
 121 sdk/go/keepclient
 122 sdk/go/health
 123 sdk/go/httpserver
 124 sdk/go/manifest
 125 sdk/go/blockdigest
 126 sdk/go/asyncbuf
 127 sdk/go/stats
 128 sdk/go/crunchrunner
 129 sdk/cwl
 130 sdk/R
 131 sdk/java-v2
 132 tools/sync-groups
 133 tools/crunchstat-summary
 134 tools/crunchstat-summary:py3
 135 tools/keep-exercise
 136 tools/keep-rsync
 137 tools/keep-block-check
 138
 139 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 140     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 141
 142 EOF
 143
 144 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 145 # environment that could interfere with the tests.
 146 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 147
 148 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 149 # accident.
 150 GITDIR=
 151 GOPATH=
 152 VENVDIR=
 153 VENV3DIR=
 154 PYTHONPATH=
 155 GEMHOME=
 156 PERLINSTALLBASE=
 157 R_LIBS=
 158 export LANG=en_US.UTF-8
 159
 160 short=
 161 only_install=
 162 temp=
 163 temp_preserve=
 164
 165 clear_temp() {
 166     if [[ -z "$temp" ]]; then
 167         # we didn't even get as far as making a temp dir
 168         :
 169     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 170         rm -rf "$temp"
 171     else
 172         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 173     fi
 174 }
 175
 176 fatal() {
 177     clear_temp
 178     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 179     exit 1
 180 }
 181
 182 exit_cleanly() {
 183     trap - INT
 184     if which create-plot-data-from-log.sh >/dev/null; then
 185         create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 186     fi
 187     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 188     stop_services
 189     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 190     report_outcomes
 191     clear_temp
 192     exit ${#failures}
 193 }
 194
 195 sanity_checks() {
 196     [[ -n "${skip[sanity]}" ]] && return 0
 197     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 198         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 199     ( [[ -n "$CONFIGSRC" ]] && [[ -s "$CONFIGSRC/config.yml" ]] ) \
 200         || fatal "CONFIGSRC environment variable not set to a config file (see: $0 --help)"
 201     echo Checking dependencies:
 202     echo "locale: ${LANG}"
 203     [[ "$(locale charmap)" = "UTF-8" ]] \
 204         || fatal "Locale '${LANG}' is broken/missing. Try: echo ${LANG} | sudo tee -a /etc/locale.gen && sudo locale-gen"
 205     echo -n 'virtualenv: '
 206     virtualenv --version \
 207         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 208     echo -n 'ruby: '
 209     ruby -v \
 210         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 211     echo -n 'go: '
 212     go version \
 213         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 214     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 12 ]] \
 215         || fatal "Go >= 1.12 required. See http://golang.org/doc/install"
 216     echo -n 'gcc: '
 217     gcc --version | egrep ^gcc \
 218         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 219     echo -n 'fuse.h: '
 220     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 221         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 222     echo -n 'gnutls.h: '
 223     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 224         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 225     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
 226     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 227         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
 228     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 229     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 230         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 231     which netstat \
 232         || fatal "No netstat. Try: apt-get install net-tools"
 233     echo -n 'nginx: '
 234     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 235         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 236     echo -n 'perl: '
 237     perl -v | grep version \
 238         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 239     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 240         echo -n "perl $mod: "
 241         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 242             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 243     done
 244     echo -n 'gitolite: '
 245     which gitolite \
 246         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 247     echo -n 'npm: '
 248     npm --version \
 249         || fatal "No npm. Try: wget -O- https://nodejs.org/dist/v6.11.2/node-v6.11.2-linux-x64.tar.xz | sudo tar -C /usr/local -xJf - && sudo ln -s ../node-v6.11.2-linux-x64/bin/{node,npm} /usr/local/bin/"
 250     echo -n 'cadaver: '
 251     cadaver --version | grep -w cadaver \
 252           || fatal "No cadaver. Try: apt-get install cadaver"
 253     echo -n 'libattr1 xattr.h: '
 254     find /usr/include -path '*/attr/xattr.h' | egrep --max-count=1 . \
 255         || fatal "No libattr1 xattr.h. Try: apt-get install libattr1-dev"
 256     echo -n 'libcurl curl.h: '
 257     find /usr/include -path '*/curl/curl.h' | egrep --max-count=1 . \
 258         || fatal "No libcurl curl.h. Try: apt-get install libcurl4-gnutls-dev"
 259     echo -n 'libpq libpq-fe.h: '
 260     find /usr/include -path '*/postgresql/libpq-fe.h' | egrep --max-count=1 . \
 261         || fatal "No libpq libpq-fe.h. Try: apt-get install libpq-dev"
 262     echo -n 'postgresql: '
 263     psql --version || fatal "No postgresql. Try: apt-get install postgresql postgresql-client-common"
 264     echo -n 'phantomjs: '
 265     phantomjs --version || fatal "No phantomjs. Try: apt-get install phantomjs"
 266     echo -n 'xvfb: '
 267     which Xvfb || fatal "No xvfb. Try: apt-get install xvfb"
 268     echo -n 'graphviz: '
 269     dot -V || fatal "No graphviz. Try: apt-get install graphviz"
 270     echo -n 'geckodriver: '
 271     geckodriver --version | grep ^geckodriver || echo "No geckodriver. Try: wget -O- https://github.com/mozilla/geckodriver/releases/download/v0.23.0/geckodriver-v0.23.0-linux64.tar.gz | sudo tar -C /usr/local/bin -xzf - geckodriver"
 272
 273     if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 274       # R SDK stuff
 275       echo -n 'R: '
 276       which Rscript || fatal "No Rscript. Try: apt-get install r-base"
 277       echo -n 'testthat: '
 278       Rscript -e "library('testthat')" || fatal "No testthat. Try: apt-get install r-cran-testthat"
 279       # needed for roxygen2, needed for devtools, needed for R sdk
 280       pkg-config --exists libxml-2.0 || fatal "No libxml2. Try: apt-get install libxml2-dev"
 281       # needed for pkgdown, builds R SDK doc pages
 282       which pandoc || fatal "No pandoc. Try: apt-get install pandoc"
 283     fi
 284 }
 285
 286 rotate_logfile() {
 287   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 288   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 289   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 290     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 291     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 292     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 293   fi
 294 }
 295
 296 declare -a failures
 297 declare -A skip
 298 declare -A only
 299 declare -A testargs
 300 skip[apps/workbench_profile]=1
 301 # nodemanager_integration tests are not reliable, see #12061.
 302 skip[services/nodemanager_integration]=1
 303
 304 while [[ -n "$1" ]]
 305 do
 306     arg="$1"; shift
 307     case "$arg" in
 308         --help)
 309             echo >&2 "$helpmessage"
 310             echo >&2
 311             exit 1
 312             ;;
 313         --skip)
 314             skip[$1]=1; shift
 315             ;;
 316         --only)
 317             only[$1]=1; skip[$1]=""; shift
 318             ;;
 319         --short)
 320             short=1
 321             ;;
 322         --interactive)
 323             interactive=1
 324             ;;
 325         --skip-install)
 326             skip[install]=1
 327             ;;
 328         --only-install)
 329             only_install="$1"; shift
 330             ;;
 331         --temp)
 332             temp="$1"; shift
 333             temp_preserve=1
 334             ;;
 335         --leave-temp)
 336             temp_preserve=1
 337             ;;
 338         --repeat)
 339             repeat=$((${1}+0)); shift
 340             ;;
 341         --retry)
 342             retry=1
 343             ;;
 344         *_test=*)
 345             suite="${arg%%_test=*}"
 346             args="${arg#*=}"
 347             testargs["$suite"]="$args"
 348             ;;
 349         *=*)
 350             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 351             ;;
 352         *)
 353             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 354             exit 1
 355             ;;
 356     esac
 357 done
 358
 359 # R SDK installation is very slow (~360s in a clean environment) and only
 360 # required when testing it. Skip that step if it is not needed.
 361 NEED_SDK_R=true
 362
 363 if [[ ${#only[@]} -ne 0 ]] &&
 364    [[ -z "${only['sdk/R']}" && -z "${only['doc']}" ]]; then
 365   NEED_SDK_R=false
 366 fi
 367
 368 if [[ ${skip["sdk/R"]} == 1 && ${skip["doc"]} == 1 ]]; then
 369   NEED_SDK_R=false
 370 fi
 371
 372 if [[ $NEED_SDK_R == false ]]; then
 373         echo "R SDK not needed, it will not be installed."
 374 fi
 375
 376 checkpidfile() {
 377     svc="$1"
 378     pid="$(cat "$WORKSPACE/tmp/${svc}.pid")"
 379     if [[ -z "$pid" ]] || ! kill -0 "$pid"; then
 380         tail $WORKSPACE/tmp/${1}*.log
 381         echo "${svc} pid ${pid} not running"
 382         return 1
 383     fi
 384     echo "${svc} pid ${pid} ok"
 385 }
 386
 387 checkhealth() {
 388     svc="$1"
 389     base=$(python -c "import yaml; print list(yaml.safe_load(file('$ARVADOS_CONFIG'))['Clusters']['zzzzz']['Services']['$1']['InternalURLs'].keys())[0]")
 390     url="$base/_health/ping"
 391     if ! curl -Ss -H "Authorization: Bearer e687950a23c3a9bceec28c6223a06c79" "${url}" | tee -a /dev/stderr | grep '"OK"'; then
 392         echo "${url} failed"
 393         return 1
 394     fi
 395 }
 396
 397 checkdiscoverydoc() {
 398     dd="https://${1}/discovery/v1/apis/arvados/v1/rest"
 399     if ! (set -o pipefail; curl -fsk "$dd" | grep -q ^{ ); then
 400         echo >&2 "ERROR: could not retrieve discovery doc from RailsAPI at $dd"
 401         tail -v $WORKSPACE/services/api/log/test.log
 402         return 1
 403     fi
 404     echo "${dd} ok"
 405 }
 406
 407 start_services() {
 408     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 409         return 0
 410     fi
 411     . "$VENVDIR/bin/activate"
 412     echo 'Starting API, controller, keepproxy, keep-web, arv-git-httpd, ws, and nginx ssl proxy...'
 413     if [[ ! -d "$WORKSPACE/services/api/log" ]]; then
 414         mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/log"
 415     fi
 416     # Remove empty api.pid file if it exists
 417     if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid" && ! -s "$WORKSPACE/tmp/api.pid" ]]; then
 418         rm -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid"
 419     fi
 420     all_services_stopped=
 421     fail=1
 422     eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py setup_config)
 423     cd "$WORKSPACE" \
 424         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 425         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 426         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 427         && checkpidfile api \
 428         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 429         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx) \
 430         && checkpidfile nginx \
 431         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_controller \
 432         && checkpidfile controller \
 433         && checkhealth Controller \
 434         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 435         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 436         && checkpidfile keepproxy \
 437         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 438         && checkpidfile keep-web \
 439         && checkhealth WebDAV \
 440         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 441         && checkpidfile arv-git-httpd \
 442         && checkhealth GitHTTP \
 443         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 444         && checkpidfile ws \
 445         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1 \
 446         && (env | egrep ^ARVADOS) \
 447         && fail=0
 448     deactivate
 449     if [[ $fail != 0 ]]; then
 450         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 451     fi
 452     return $fail
 453 }
 454
 455 stop_services() {
 456     if [[ -n "$all_services_stopped" ]]; then
 457         return
 458     fi
 459     unset ARVADOS_TEST_API_HOST ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 460     . "$VENVDIR/bin/activate" || return
 461     cd "$WORKSPACE" \
 462         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 463         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 464         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 465         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 466         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy \
 467         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_controller \
 468         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop \
 469         && all_services_stopped=1
 470     deactivate
 471 }
 472
 473 interrupt() {
 474     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 475     exit_cleanly
 476 }
 477 trap interrupt INT
 478
 479 setup_ruby_environment() {
 480     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 481         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 482         using_rvm=true
 483     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 484         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 485         using_rvm=true
 486     else
 487         using_rvm=false
 488     fi
 489
 490     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 491         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 492         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 493         # the environment to the "current gemset", which would lose
 494         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 495         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 496         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 497         # rvm gemset and use it for everything.
 498
 499         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 500             || fatal 'rvm check'
 501
 502         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 503         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 504         # complaint about not being in first place already.
 505         rvm use @default 2>/dev/null
 506
 507         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 508         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 509         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 510         # ruby to the caller.
 511         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 512         rvm use "@${gemset}" --create \
 513             || fatal 'rvm gemset setup'
 514
 515         rvm env
 516     else
 517         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 518         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 519         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 520         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 521         # should be installed, and we should leave it alone.)
 522
 523         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 524             user_gempath="$(gem env gempath)"
 525             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 526         fi
 527         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 528
 529         # When we build and install our own gems, we install them in our
 530         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 531         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 532         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 533
 534         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 535         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 536         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
 537
 538         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 539         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 540         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 541     fi
 542     bundle config || gem install bundler \
 543         || fatal 'install bundler'
 544 }
 545
 546 with_test_gemset() {
 547     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 548         "$@"
 549     else
 550         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 551     fi
 552 }
 553
 554 gem_uninstall_if_exists() {
 555     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 556         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 557     fi
 558 }
 559
 560 setup_virtualenv() {
 561     local venvdest="$1"; shift
 562     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 563         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 564     elif [[ -n "$short" ]]; then
 565         return
 566     fi
 567     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 568         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 569         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 570     else
 571         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 572     fi
 573 }
 574
 575 initialize() {
 576     sanity_checks
 577
 578     echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 579
 580     # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 581     cd "$WORKSPACE"
 582     find -name '*.pyc' -delete
 583
 584     if [[ -z "$temp" ]]; then
 585         temp="$(mktemp -d)"
 586     fi
 587
 588     # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 589     for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE R_LIBS
 590     do
 591         if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 592             eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 593         fi
 594         if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 595             mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 596         fi
 597     done
 598
 599     rm -vf "${WORKSPACE}/tmp/*.log"
 600
 601     export PERLINSTALLBASE
 602     export PERL5LIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5${PERL5LIB:+:$PERL5LIB}"
 603
 604     export R_LIBS
 605
 606     export GOPATH
 607     # Make sure our compiled binaries under test override anything
 608     # else that might be in the environment.
 609     export PATH=$GOPATH/bin:$PATH
 610
 611     # Jenkins config requires that glob tmp/*.log match something. Ensure
 612     # that happens even if we don't end up running services that set up
 613     # logging.
 614     mkdir -p "${WORKSPACE}/tmp/" || fatal "could not mkdir ${WORKSPACE}/tmp"
 615     touch "${WORKSPACE}/tmp/controller.log" || fatal "could not touch ${WORKSPACE}/tmp/controller.log"
 616
 617     unset http_proxy https_proxy no_proxy
 618
 619     # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 620     # whine a lot.
 621     setup_ruby_environment
 622
 623     echo "PATH is $PATH"
 624 }
 625
 626 install_env() {
 627     (
 628         set -e
 629         mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 630         if [[ ! -h "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" ]]; then
 631             for d in \
 632                 "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/tmp/GOPATH" \
 633                     "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/tmp" \
 634                     "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"; do
 635                 [[ -d "$d" ]] && rmdir "$d"
 636             done
 637         fi
 638         for d in \
 639             "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/arvados" \
 640                 "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"; do
 641             [[ -h "$d" ]] && rm "$d"
 642         done
 643         ln -vsfT "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
 644         go get -v github.com/kardianos/govendor
 645         cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
 646         go get -v -d ...
 647         "$GOPATH/bin/govendor" sync
 648         which goimports >/dev/null || go get golang.org/x/tools/cmd/goimports
 649     ) || fatal "Go setup failed"
 650
 651     setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 652     . "$VENVDIR/bin/activate"
 653
 654     # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 655     pip install --no-cache-dir PyYAML \
 656         || fatal "pip install PyYAML failed"
 657
 658     # Preinstall libcloud if using a fork; otherwise nodemanager "pip
 659     # install" won't pick it up by default.
 660     if [[ -n "$LIBCLOUD_PIN_SRC" ]]; then
 661         pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 662             || pip install --pre --ignore-installed --no-cache-dir "$LIBCLOUD_PIN_SRC" >/dev/null \
 663             || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 664     fi
 665
 666     # Deactivate Python 2 virtualenv
 667     deactivate
 668
 669     # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 670     # Otherwise, skip dependent tests.
 671     PYTHON3=$(which python3)
 672     if [[ ${?} = 0 ]]; then
 673         setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 674     else
 675         PYTHON3=
 676         cat >&2 <<EOF
 677
 678 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
 679
 680 EOF
 681     fi
 682
 683     if ! which bundler >/dev/null
 684     then
 685         gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 686     fi
 687 }
 688
 689 retry() {
 690     remain="${repeat}"
 691     while :
 692     do
 693         if ${@}; then
 694             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 695                 remain=$((${remain}-1))
 696                 title "(repeating ${remain} more times)"
 697             else
 698                 break
 699             fi
 700         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 701             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 702             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 703             then
 704                 break
 705             fi
 706         else
 707             break
 708         fi
 709     done
 710 }
 711
 712 do_test() {
 713     case "${1}" in
 714         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 715             suite=apps/workbench
 716             ;;
 717         services/nodemanager | services/nodemanager_integration)
 718             suite=services/nodemanager_suite
 719             ;;
 720         *)
 721             suite="${1}"
 722             ;;
 723     esac
 724     if [[ -n "${skip[$suite]}" || \
 725               -n "${skip[$1]}" || \
 726               (${#only[@]} -ne 0 && ${only[$suite]} -eq 0 && ${only[$1]} -eq 0) ]]; then
 727         return 0
 728     fi
 729     case "${1}" in
 730         services/api)
 731             stop_services
 732             ;;
 733         gofmt | govendor | doc | lib/cli | lib/cloud/azure | lib/cloud/ec2 | lib/cloud/cloudtest | lib/cmd | lib/dispatchcloud/ssh_executor | lib/dispatchcloud/worker)
 734             # don't care whether services are running
 735             ;;
 736         *)
 737             if ! start_services; then
 738                 title "test $1 -- failed to start services"
 739                 return 1
 740             fi
 741             ;;
 742     esac
 743     retry do_test_once ${@}
 744 }
 745
 746 do_test_once() {
 747     unset result
 748
 749     title "test $1"
 750     timer_reset
 751
 752     result=
 753     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 754     if ! . "$VENVDIR/bin/activate"
 755     then
 756         result=1
 757     elif [[ "$2" == "go" ]]
 758     then
 759         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 760         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 761         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 762         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 763         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 764         # compilation errors.
 765         go get -ldflags "-X git.curoverse.com/arvados.git/lib/cmd.version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}" -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 766             cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 767             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 768         then
 769             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 770             # does:
 771             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 772         else
 773             # The above form gets verbose even when testargs is
 774             # empty, so use this form in such cases:
 775             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 776         fi
 777         result=${result:-$?}
 778         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 779         then
 780             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 781             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 782         fi
 783         [[ $result = 0 ]] && gofmt -e -d *.go
 784     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 785     then
 786         tries=0
 787         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 788         do
 789             tries=$((${tries}+1))
 790             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 791             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 792             if [[ -e "${3}activate" ]]; then
 793                 . "${3}activate"
 794             fi
 795             python setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 796             result=$?
 797             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 798             then
 799                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 800                 continue
 801             else
 802                 break
 803             fi
 804         done
 805     elif [[ "$2" != "" ]]
 806     then
 807         "test_$2"
 808     else
 809         "test_$1"
 810     fi
 811     result=${result:-$?}
 812     checkexit $result "$1 tests"
 813     title "test $1 -- `timer`"
 814     return $result
 815 }
 816
 817 do_install() {
 818     if [[ -n "${skip[install]}" || ( -n "${only_install}" && "${only_install}" != "${1}" && "${only_install}" != "${2}" ) ]]; then
 819         return 0
 820     fi
 821     retry do_install_once ${@}
 822 }
 823
 824 do_install_once() {
 825     title "install $1"
 826     timer_reset
 827
 828     result=
 829     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 830     if [[ "$1" != "env" ]] && ! . "$VENVDIR/bin/activate"; then
 831         result=1
 832     elif [[ "$2" == "go" ]]
 833     then
 834         go get -ldflags "-X git.curoverse.com/arvados.git/lib/cmd.version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}" -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 835     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 836     then
 837         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 838         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 839
 840         # Need to change to a different directory after creating
 841         # the source dist package to avoid a pip bug.
 842         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 843
 844         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 845         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 846         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 847         # install" ensures that we've actually installed the local package
 848         # we just built.
 849         cd "$WORKSPACE/$1" \
 850             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 851             && cd "$WORKSPACE" \
 852             && "${3}pip" install --no-cache-dir --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 853             && "${3}pip" install --no-cache-dir --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 854     elif [[ "$2" != "" ]]
 855     then
 856         "install_$2"
 857     else
 858         "install_$1"
 859     fi
 860     result=${result:-$?}
 861     checkexit $result "$1 install"
 862     title "install $1 -- `timer`"
 863     return $result
 864 }
 865
 866 bundle_install_trylocal() {
 867     (
 868         set -e
 869         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 870         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 871             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 872             bundle install --no-deployment
 873         fi
 874         bundle package --all
 875     )
 876 }
 877
 878 install_doc() {
 879     cd "$WORKSPACE/doc" \
 880         && bundle_install_trylocal \
 881         && rm -rf .site
 882 }
 883
 884 install_gem() {
 885     gemname=$1
 886     srcpath=$2
 887     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 888         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 889         && bundle_install_trylocal \
 890         && gem build "$gemname.gemspec" \
 891         && with_test_gemset gem install --no-document $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 892 }
 893
 894 install_sdk/ruby() {
 895     install_gem arvados sdk/ruby
 896 }
 897
 898 install_sdk/R() {
 899   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 900     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
 901        && Rscript --vanilla install_deps.R
 902   fi
 903 }
 904
 905 install_sdk/perl() {
 906     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 907         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 908         && make install INSTALLDIRS=perl
 909 }
 910
 911 install_sdk/cli() {
 912     install_gem arvados-cli sdk/cli
 913 }
 914
 915 install_services/login-sync() {
 916     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 917 }
 918
 919 install_services/api() {
 920     stop_services
 921     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 922         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 923
 924     rm -f config/environments/test.rb
 925     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 926
 927     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 928     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 929     # is a postgresql superuser.
 930     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 931         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.safe_load(file('$ARVADOS_CONFIG'))['Clusters']['zzzzz']['PostgreSQL']['Connection']['dbname']") \
 932         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.pid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 933
 934     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 935
 936     cert="$WORKSPACE/services/api/tmp/self-signed"
 937     if [[ ! -e "$cert.pem" || "$(date -r "$cert.pem" +%s)" -lt 1512659226 ]]; then
 938         (
 939             dir="$WORKSPACE/services/api/tmp"
 940             set -ex
 941             openssl req -newkey rsa:2048 -nodes -subj '/C=US/ST=State/L=City/CN=localhost' -out "$cert.csr" -keyout "$cert.key" </dev/null
 942             openssl x509 -req -in "$cert.csr" -signkey "$cert.key" -out "$cert.pem" -days 3650 -extfile <(printf 'subjectAltName=DNS:localhost,DNS:::1,DNS:0.0.0.0,DNS:127.0.0.1,IP:::1,IP:0.0.0.0,IP:127.0.0.1')
 943         ) || return 1
 944     fi
 945
 946     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 947         && rm -rf tmp/git \
 948         && mkdir -p tmp/git \
 949         && cd tmp/git \
 950         && tar xf ../../test/test.git.tar \
 951         && mkdir -p internal.git \
 952         && git --git-dir internal.git init \
 953             || return 1
 954
 955     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 956         && RAILS_ENV=test bundle exec rails db:environment:set \
 957         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 958         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 959         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 960 }
 961
 962 declare -a pythonstuff
 963 pythonstuff=(
 964     sdk/pam
 965     sdk/python
 966     sdk/python:py3
 967     sdk/cwl
 968     sdk/cwl:py3
 969     services/dockercleaner:py3
 970     services/fuse
 971     services/fuse:py3
 972     services/nodemanager
 973     tools/crunchstat-summary
 974     tools/crunchstat-summary:py3
 975 )
 976
 977 declare -a gostuff
 978 gostuff=($(cd "$WORKSPACE" && git grep -lw func | grep \\.go | sed -e 's/\/[^\/]*$//' | sort -u))
 979
 980 install_apps/workbench() {
 981     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 982         && mkdir -p tmp/cache \
 983         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
 984         && RAILS_ENV=test RAILS_GROUPS=assets bundle exec rake npm:install
 985 }
 986
 987 test_doc() {
 988     (
 989         set -e
 990         cd "$WORKSPACE/doc"
 991         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
 992         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
 993         # do much good!
 994         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
 995     )
 996 }
 997
 998 test_gofmt() {
 999     cd "$WORKSPACE" || return 1
1000     dirs=$(ls -d */ | egrep -v 'vendor|tmp')
1001     [[ -z "$(gofmt -e -d $dirs | tee -a /dev/stderr)" ]]
1002 }
1003
1004 test_govendor() {
1005     (
1006         set -e
1007         cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
1008         # Remove cached source dirs in workdir. Otherwise, they will
1009         # not qualify as +missing or +external below, and we won't be
1010         # able to detect that they're missing from vendor/vendor.json.
1011         rm -rf vendor/*/
1012         go get -v -d ...
1013         "$GOPATH/bin/govendor" sync
1014         if [[ -n $("$GOPATH/bin/govendor" list +unused +missing +external | tee /dev/stderr) ]]; then
1015             echo >&2 "vendor/vendor.json has unused or missing dependencies -- try:
1016
1017 (export GOPATH=\"${GOPATH}\"; cd \$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git && \$GOPATH/bin/govendor add +missing +external && \$GOPATH/bin/govendor remove +unused)
1018
1019 "
1020             return 1
1021         fi
1022     )
1023 }
1024
1025 test_services/api() {
1026     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
1027     cd "$WORKSPACE/services/api" \
1028         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS='-v -d' ${testargs[services/api]}
1029 }
1030
1031 test_sdk/ruby() {
1032     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
1033         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
1034 }
1035
1036 test_sdk/R() {
1037   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
1038     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
1039         && Rscript --vanilla run_test.R
1040   fi
1041 }
1042
1043 test_sdk/cli() {
1044     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
1045         && mkdir -p /tmp/keep \
1046         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
1047 }
1048
1049 test_sdk/java-v2() {
1050     cd "$WORKSPACE/sdk/java-v2" && gradle test
1051 }
1052
1053 test_services/login-sync() {
1054     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
1055         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
1056 }
1057
1058 test_services/nodemanager_integration() {
1059     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
1060         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager_integration]}
1061 }
1062
1063 test_apps/workbench_units() {
1064     local TASK="test:units"
1065     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_units]}" ]]; then
1066         TASK="test"
1067     fi
1068     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1069         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} TESTOPTS='-v -d' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_units]}
1070 }
1071
1072 test_apps/workbench_functionals() {
1073     local TASK="test:functionals"
1074     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_functionals]}" ]]; then
1075         TASK="test"
1076     fi
1077     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1078         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} TESTOPTS='-v -d' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_functionals]}
1079 }
1080
1081 test_apps/workbench_integration() {
1082     local TASK="test:integration"
1083     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_integration]}" ]]; then
1084         TASK="test"
1085     fi
1086     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1087         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} TESTOPTS='-v -d' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_integration]}
1088 }
1089
1090 test_apps/workbench_benchmark() {
1091     local TASK="test:benchmark"
1092     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_benchmark]}" ]]; then
1093         TASK="test"
1094     fi
1095     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1096         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
1097 }
1098
1099 test_apps/workbench_profile() {
1100     local TASK="test:profile"
1101     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_profile]}" ]]; then
1102         TASK="test"
1103     fi
1104     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1105         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} ${testargs[apps/workbench_profile]}
1106 }
1107
1108 install_deps() {
1109     # Install parts needed by test suites
1110     do_install env
1111     do_install cmd/arvados-server go
1112     do_install sdk/cli
1113     do_install sdk/perl
1114     do_install sdk/python pip
1115     do_install sdk/ruby
1116     do_install services/api
1117     do_install services/arv-git-httpd go
1118     do_install services/keepproxy go
1119     do_install services/keepstore go
1120     do_install services/keep-web go
1121     do_install services/ws go
1122 }
1123
1124 install_all() {
1125     do_install env
1126     do_install doc
1127     do_install sdk/ruby
1128     do_install sdk/R
1129     do_install sdk/perl
1130     do_install sdk/cli
1131     do_install services/login-sync
1132     for p in "${pythonstuff[@]}"
1133     do
1134         dir=${p%:py3}
1135         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1136             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1137                 do_install ${dir} pip
1138             fi
1139         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1140             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1141                 do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1142             fi
1143         fi
1144     done
1145     for g in "${gostuff[@]}"
1146     do
1147         do_install "$g" go
1148     done
1149     do_install services/api
1150     do_install apps/workbench
1151 }
1152
1153 test_all() {
1154     stop_services
1155     do_test services/api
1156
1157     # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
1158     # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
1159     if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
1160         rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
1161         exit_cleanly
1162     fi
1163
1164     do_test gofmt
1165     do_test govendor
1166     do_test doc
1167     do_test sdk/ruby
1168     do_test sdk/R
1169     do_test sdk/cli
1170     do_test services/login-sync
1171     do_test sdk/java-v2
1172     do_test services/nodemanager_integration
1173     for p in "${pythonstuff[@]}"
1174     do
1175         dir=${p%:py3}
1176         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1177             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1178                 do_test ${dir} pip
1179             fi
1180         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1181             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1182                 do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1183             fi
1184         fi
1185     done
1186
1187     for g in "${gostuff[@]}"
1188     do
1189         do_test "$g" go
1190     done
1191     do_test apps/workbench_units
1192     do_test apps/workbench_functionals
1193     do_test apps/workbench_integration
1194     do_test apps/workbench_benchmark
1195     do_test apps/workbench_profile
1196 }
1197
1198 help_interactive() {
1199     echo "== Interactive commands:"
1200     echo "TARGET                 (short for 'test DIR')"
1201     echo "test TARGET"
1202     echo "test TARGET:py3        (test with python3)"
1203     echo "test TARGET -check.vv  (pass arguments to test)"
1204     echo "install TARGET"
1205     echo "install env            (go/python libs)"
1206     echo "install deps           (go/python libs + arvados components needed for integration tests)"
1207     echo "reset                  (...services used by integration tests)"
1208     echo "exit"
1209     echo "== Test targets:"
1210     echo "${!testfuncargs[@]}" | tr ' ' '\n' | sort | column
1211 }
1212
1213 initialize
1214
1215 declare -A testfuncargs=()
1216 for g in "${gostuff[@]}"; do
1217     testfuncargs[$g]="$g go"
1218 done
1219 for p in "${pythonstuff[@]}"; do
1220     dir=${p%:py3}
1221     testfuncargs[$dir]="$dir pip $VENVDIR/bin/"
1222     testfuncargs[$dir:py3]="$dir pip $VENV3DIR/bin/"
1223 done
1224
1225 testfuncargs["sdk/cli"]="sdk/cli"
1226 testfuncargs["sdk/R"]="sdk/R"
1227 testfuncargs["sdk/java-v2"]="sdk/java-v2"
1228 testfuncargs["apps/workbench_units"]="apps/workbench_units"
1229 testfuncargs["apps/workbench_functionals"]="apps/workbench_functionals"
1230 testfuncargs["apps/workbench_integration"]="apps/workbench_integration"
1231 testfuncargs["apps/workbench_benchmark"]="apps/workbench_benchmark"
1232 testfuncargs["apps/workbench_profile"]="apps/workbench_profile"
1233
1234 if [[ -z ${interactive} ]]; then
1235     install_all
1236     test_all
1237 else
1238     skip=()
1239     only=()
1240     only_install=()
1241     if [[ -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then stop_services; fi
1242     setnextcmd() {
1243         if [[ "$TERM" = dumb ]]; then
1244             # assume emacs, or something, is offering a history buffer
1245             # and pre-populating the command will only cause trouble
1246             nextcmd=
1247         elif [[ ! -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then
1248             nextcmd="install deps"
1249         else
1250             nextcmd=""
1251         fi
1252     }
1253     echo
1254     help_interactive
1255     nextcmd="install deps"
1256     setnextcmd
1257     HISTFILE="$WORKSPACE/tmp/.history"
1258     history -r
1259     while read -p 'What next? ' -e -i "$nextcmd" nextcmd; do
1260         history -s "$nextcmd"
1261         history -w
1262         read verb target opts <<<"${nextcmd}"
1263         target="${target%/}"
1264         target="${target/\/:/:}"
1265         case "${verb}" in
1266             "exit" | "quit")
1267                 exit_cleanly
1268                 ;;
1269             "reset")
1270                 stop_services
1271                 ;;
1272             "test" | "install")
1273                 case "$target" in
1274                     "")
1275                         help_interactive
1276                         ;;
1277                     all | deps)
1278                         ${verb}_${target}
1279                         ;;
1280                     *)
1281                         testargs["$target"]="${opts}"
1282                         tt="${testfuncargs[${target}]}"
1283                         tt="${tt:-$target}"
1284                         do_$verb $tt
1285                         ;;
1286                 esac
1287                 ;;
1288             "" | "help" | *)
1289                 help_interactive
1290                 ;;
1291         esac
1292         if [[ ${#successes[@]} -gt 0 || ${#failures[@]} -gt 0 ]]; then
1293             report_outcomes
1294             successes=()
1295             failures=()
1296         fi
1297         cd "$WORKSPACE"
1298         setnextcmd
1299     done
1300     echo
1301 fi
1302 exit_cleanly