build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
   5
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin.sh
   7
   8 COLUMNS=80
   9 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
  10
  11 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
  12 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  13
  14 Exit non-zero if any tests fail.
  15
  16 Syntax:
  17         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  18
  19 Options:
  20
  21 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  22 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  23 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  24                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  25 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  26                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  27                subsequent invocations.
  28 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  29 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  30 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
  31                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  32                from a previous invocation if you use this option.
  33 --only-install Run specific install step
  34 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  35 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  36 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  37                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  38 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  39                Restrict apiserver tests to the given file
  40 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
  41                Restrict Python SDK tests to the given class
  42 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  43                Restrict Workbench tests to the given file
  44 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  45                Show all log messages, even when tests pass (also works
  46                with services/keepstore_test etc.)
  47 ARVADOS_DEBUG=1
  48                Print more debug messages
  49 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  50                *_test, and other examples shown above.
  51
  52 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
  53 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  54 test suites depend on other components being installed, and installing
  55 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  56
  57 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  58 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  59
  60 More information and background:
  61
  62 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  63
  64 Available tests:
  65
  66 apps/workbench (*)
  67 apps/workbench_units (*)
  68 apps/workbench_functionals (*)
  69 apps/workbench_integration (*)
  70 apps/workbench_benchmark
  71 apps/workbench_profile
  72 doc
  73 services/api
  74 services/arv-git-httpd
  75 services/crunchstat
  76 services/dockercleaner
  77 services/fuse
  78 services/health
  79 services/keep-web
  80 services/keepproxy
  81 services/keepstore
  82 services/keep-balance
  83 services/login-sync
  84 services/nodemanager
  85 services/nodemanager_integration
  86 services/crunch-run
  87 services/crunch-dispatch-local
  88 services/crunch-dispatch-slurm
  89 services/ws
  90 sdk/cli
  91 sdk/pam
  92 sdk/python
  93 sdk/python:py3
  94 sdk/ruby
  95 sdk/go/arvados
  96 sdk/go/arvadosclient
  97 sdk/go/dispatch
  98 sdk/go/keepclient
  99 sdk/go/health
 100 sdk/go/httpserver
 101 sdk/go/manifest
 102 sdk/go/blockdigest
 103 sdk/go/streamer
 104 sdk/go/stats
 105 sdk/go/crunchrunner
 106 sdk/cwl
 107 tools/arv-sync-groups
 108 tools/crunchstat-summary
 109 tools/keep-exercise
 110 tools/keep-rsync
 111 tools/keep-block-check
 112
 113 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 114     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 115
 116 EOF
 117
 118 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 119 # environment that could interfere with the tests.
 120 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 121
 122 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 123 # accident.
 124 GITDIR=
 125 GOPATH=
 126 VENVDIR=
 127 VENV3DIR=
 128 PYTHONPATH=
 129 GEMHOME=
 130 PERLINSTALLBASE=
 131
 132 short=
 133 only_install=
 134 temp=
 135 temp_preserve=
 136
 137 clear_temp() {
 138     if [[ -z "$temp" ]]; then
 139         # we didn't even get as far as making a temp dir
 140         :
 141     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 142         rm -rf "$temp"
 143     else
 144         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 145     fi
 146 }
 147
 148 fatal() {
 149     clear_temp
 150     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 151     exit 1
 152 }
 153
 154 exit_cleanly() {
 155     trap - INT
 156     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 157     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 158     stop_services
 159     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 160     report_outcomes
 161     clear_temp
 162     exit ${#failures}
 163 }
 164
 165 sanity_checks() {
 166     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 167         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 168     echo Checking dependencies:
 169     echo -n 'virtualenv: '
 170     virtualenv --version \
 171         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 172     echo -n 'ruby: '
 173     ruby -v \
 174         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 175     echo -n 'go: '
 176     go version \
 177         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 178     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 8 ]] \
 179         || fatal "Go >= 1.8 required. See http://golang.org/doc/install"
 180     echo -n 'gcc: '
 181     gcc --version | egrep ^gcc \
 182         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 183     echo -n 'fuse.h: '
 184     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 185         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 186     echo -n 'gnutls.h: '
 187     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 188         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 189     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
 190     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 191         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
 192     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 193     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 194         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 195     echo -n 'nginx: '
 196     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 197         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 198     echo -n 'perl: '
 199     perl -v | grep version \
 200         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 201     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 202         echo -n "perl $mod: "
 203         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 204             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 205     done
 206     echo -n 'gitolite: '
 207     which gitolite \
 208         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 209     echo -n 'npm: '
 210     npm --version \
 211         || fatal "No npm. Try: wget -O- https://nodejs.org/dist/v6.11.2/node-v6.11.2-linux-x64.tar.xz | sudo tar -C /usr/local -xJf - && sudo ln -s ../node-v6.11.2-linux-x64/bin/{node,npm} /usr/local/bin/"
 212     echo -n 'cadaver: '
 213     cadaver --version | grep -w cadaver \
 214           || fatal "No cadaver. Try: apt-get install cadaver"
 215 }
 216
 217 rotate_logfile() {
 218   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 219   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 220   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 221     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 222     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 223     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 224   fi
 225 }
 226
 227 declare -a failures
 228 declare -A skip
 229 declare -A testargs
 230 skip[apps/workbench_profile]=1
 231
 232 while [[ -n "$1" ]]
 233 do
 234     arg="$1"; shift
 235     case "$arg" in
 236         --help)
 237             echo >&2 "$helpmessage"
 238             echo >&2
 239             exit 1
 240             ;;
 241         --skip)
 242             skip[$1]=1; shift
 243             ;;
 244         --only)
 245             only="$1"; skip[$1]=""; shift
 246             ;;
 247         --short)
 248             short=1
 249             ;;
 250         --skip-install)
 251             only_install=nothing
 252             ;;
 253         --only-install)
 254             only_install="$1"; shift
 255             ;;
 256         --temp)
 257             temp="$1"; shift
 258             temp_preserve=1
 259             ;;
 260         --leave-temp)
 261             temp_preserve=1
 262             ;;
 263         --repeat)
 264             repeat=$((${1}+0)); shift
 265             ;;
 266         --retry)
 267             retry=1
 268             ;;
 269         *_test=*)
 270             suite="${arg%%_test=*}"
 271             args="${arg#*=}"
 272             testargs["$suite"]="$args"
 273             ;;
 274         *=*)
 275             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 276             ;;
 277         *)
 278             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 279             exit 1
 280             ;;
 281     esac
 282 done
 283
 284 start_api() {
 285     echo 'Starting API server...'
 286     cd "$WORKSPACE" \
 287         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 288         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 289         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 290         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 291         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 292         && (env | egrep ^ARVADOS)
 293 }
 294
 295 start_nginx_proxy_services() {
 296     echo 'Starting keepproxy, keep-web, ws, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
 297     cd "$WORKSPACE" \
 298         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 299         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 300         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 301         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 302         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 303         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1
 304 }
 305
 306 stop_services() {
 307     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES" ]]; then
 308         unset ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 309         cd "$WORKSPACE" \
 310             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 311             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 312             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 313             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 314             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy
 315     fi
 316     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 317         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 318         cd "$WORKSPACE" \
 319             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 320             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 321             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
 322     fi
 323 }
 324
 325 interrupt() {
 326     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 327     exit_cleanly
 328 }
 329 trap interrupt INT
 330
 331 sanity_checks
 332
 333 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 334
 335 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 336     # Jenkins expects us to use this by default.
 337     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 338 fi
 339
 340 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 341 cd "$WORKSPACE"
 342 find -name '*.pyc' -delete
 343
 344 if [[ -z "$temp" ]]; then
 345     temp="$(mktemp -d)"
 346 fi
 347
 348 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 349 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
 350 do
 351     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 352         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 353     fi
 354     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 355         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 356     fi
 357 done
 358
 359 setup_ruby_environment() {
 360     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 361         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 362         using_rvm=true
 363     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 364         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 365         using_rvm=true
 366     else
 367         using_rvm=false
 368     fi
 369
 370     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 371         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 372         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 373         # the environment to the "current gemset", which would lose
 374         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 375         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 376         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 377         # rvm gemset and use it for everything.
 378
 379         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 380             || fatal 'rvm check'
 381
 382         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 383         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 384         # complaint about not being in first place already.
 385         rvm use @default 2>/dev/null
 386
 387         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 388         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 389         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 390         # ruby to the caller.
 391         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 392         rvm use "@${gemset}" --create \
 393             || fatal 'rvm gemset setup'
 394
 395         rvm env
 396     else
 397         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 398         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 399         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 400         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 401         # should be installed, and we should leave it alone.)
 402
 403         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 404             user_gempath="$(gem env gempath)"
 405             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 406         fi
 407         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 408
 409         # When we build and install our own gems, we install them in our
 410         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 411         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 412         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 413
 414         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 415         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 416         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
 417
 418         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 419         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 420         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 421     fi
 422     bundle config || gem install bundler \
 423         || fatal 'install bundler'
 424 }
 425
 426 with_test_gemset() {
 427     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 428         "$@"
 429     else
 430         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 431     fi
 432 }
 433
 434 gem_uninstall_if_exists() {
 435     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 436         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 437     fi
 438 }
 439
 440 setup_virtualenv() {
 441     local venvdest="$1"; shift
 442     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 443         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 444     fi
 445     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 446         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 447         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 448     else
 449         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 450     fi
 451     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 452     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 453 }
 454
 455 export PERLINSTALLBASE
 456 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
 457
 458 export GOPATH
 459 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 460 ln -sfT "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
 461     || fatal "symlink failed"
 462 go get -v github.com/kardianos/govendor \
 463     || fatal "govendor install failed"
 464
 465 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 466 . "$VENVDIR/bin/activate"
 467
 468 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 469 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
 470     || pip install PyYAML >/dev/null \
 471     || fatal "pip install PyYAML failed"
 472
 473 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
 474 # won't pick it up by default.
 475 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 476     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
 477     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 478
 479 # We need an unreleased (as of 2017-08-17) llfuse bugfix, otherwise our fuse test suite deadlocks.
 480 pip freeze | grep -x llfuse==1.2.0 || (
 481     set -e
 482     yes | pip uninstall llfuse || true
 483     cython --version || fatal "no cython; try sudo apt-get install cython"
 484     cd "$temp"
 485     (cd python-llfuse 2>/dev/null || git clone https://github.com/curoverse/python-llfuse)
 486     cd python-llfuse
 487     git checkout 620722fd990ea642ddb8e7412676af482c090c0c
 488     git checkout setup.py
 489     sed -i -e "s:'1\\.2':'1.2.0':" setup.py
 490     python setup.py build_cython
 491     python setup.py install --force
 492 ) || fatal "llfuse fork failed"
 493 pip freeze | grep -x llfuse==1.2.0 || fatal "error: installed llfuse 1.2.0 but '$(pip freeze | grep llfuse)' ???"
 494
 495 # Deactivate Python 2 virtualenv
 496 deactivate
 497
 498 declare -a pythonstuff
 499 pythonstuff=(
 500     sdk/pam
 501     sdk/python
 502     sdk/python:py3
 503     sdk/cwl
 504     services/dockercleaner:py3
 505     services/fuse
 506     services/nodemanager
 507     tools/crunchstat-summary
 508     )
 509
 510 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 511 # Otherwise, skip dependent tests.
 512 PYTHON3=$(which python3)
 513 if [[ ${?} = 0 ]]; then
 514     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 515 else
 516     PYTHON3=
 517     cat >&2 <<EOF
 518
 519 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
 520
 521 EOF
 522 fi
 523
 524 # Reactivate Python 2 virtualenv
 525 . "$VENVDIR/bin/activate"
 526
 527 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 528 # whine a lot.
 529 setup_ruby_environment
 530
 531 echo "PATH is $PATH"
 532
 533 if ! which bundler >/dev/null
 534 then
 535     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 536 fi
 537
 538 retry() {
 539     remain="${repeat}"
 540     while :
 541     do
 542         if ${@}; then
 543             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 544                 remain=$((${remain}-1))
 545                 title "Repeating ${remain} more times"
 546             else
 547                 break
 548             fi
 549         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 550             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 551             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 552             then
 553                 break
 554             fi
 555         else
 556             break
 557         fi
 558     done
 559 }
 560
 561 do_test() {
 562     case "${1}" in
 563         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 564             suite=apps/workbench
 565             ;;
 566         services/nodemanager | services/nodemanager_integration)
 567             suite=services/nodemanager_suite
 568             ;;
 569         *)
 570             suite="${1}"
 571             ;;
 572     esac
 573     if [[ -z "${skip[$suite]}" && -z "${skip[$1]}" && \
 574                 (-z "${only}" || "${only}" == "${suite}" || \
 575                  "${only}" == "${1}") ]]; then
 576         retry do_test_once ${@}
 577     else
 578         title "Skipping ${1} tests"
 579     fi
 580 }
 581
 582 do_test_once() {
 583     unset result
 584
 585     title "Running $1 tests"
 586     timer_reset
 587     if [[ "$2" == "go" ]]
 588     then
 589         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 590         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 591         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 592         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 593         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 594         # compilation errors.
 595         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 596             cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 597             [[ -z "$(gofmt -e -d . | tee /dev/stderr)" ]] && \
 598             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 599         then
 600             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 601             # does:
 602             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 603         else
 604             # The above form gets verbose even when testargs is
 605             # empty, so use this form in such cases:
 606             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 607         fi
 608         result=${result:-$?}
 609         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 610         then
 611             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 612             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 613         fi
 614     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 615     then
 616         tries=0
 617         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 618         do
 619             tries=$((${tries}+1))
 620             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 621             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 622             "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 623             result=$?
 624             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 625             then
 626                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 627                 continue
 628             else
 629                 break
 630             fi
 631         done
 632     elif [[ "$2" != "" ]]
 633     then
 634         "test_$2"
 635     else
 636         "test_$1"
 637     fi
 638     result=${result:-$?}
 639     checkexit $result "$1 tests"
 640     title "End of $1 tests (`timer`)"
 641     return $result
 642 }
 643
 644 do_install() {
 645     if [[ -z "${only_install}" || "${only_install}" == "${1}" ]]; then
 646         retry do_install_once ${@}
 647     else
 648         title "Skipping $1 install"
 649     fi
 650 }
 651
 652 do_install_once() {
 653     title "Running $1 install"
 654     timer_reset
 655     if [[ "$2" == "go" ]]
 656     then
 657         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 658     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 659     then
 660         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 661         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 662
 663         # Need to change to a different directory after creating
 664         # the source dist package to avoid a pip bug.
 665         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 666
 667         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 668         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 669         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 670         # install" ensures that we've actually installed the local package
 671         # we just built.
 672         cd "$WORKSPACE/$1" \
 673             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 674             && cd "$WORKSPACE" \
 675             && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 676             && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 677     elif [[ "$2" != "" ]]
 678     then
 679         "install_$2"
 680     else
 681         "install_$1"
 682     fi
 683     result=$?
 684     checkexit $result "$1 install"
 685     title "End of $1 install (`timer`)"
 686     return $result
 687 }
 688
 689 bundle_install_trylocal() {
 690     (
 691         set -e
 692         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 693         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 694             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 695             bundle install --no-deployment
 696         fi
 697         bundle package --all
 698     )
 699 }
 700
 701 install_doc() {
 702     cd "$WORKSPACE/doc" \
 703         && bundle_install_trylocal \
 704         && rm -rf .site
 705 }
 706 do_install doc
 707
 708 install_gem() {
 709     gemname=$1
 710     srcpath=$2
 711     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 712         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 713         && bundle_install_trylocal \
 714         && gem build "$gemname.gemspec" \
 715         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 716 }
 717
 718 install_ruby_sdk() {
 719     install_gem arvados sdk/ruby
 720 }
 721 do_install sdk/ruby ruby_sdk
 722
 723 install_perl_sdk() {
 724     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 725         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 726         && make install INSTALLDIRS=perl
 727 }
 728 do_install sdk/perl perl_sdk
 729
 730 install_cli() {
 731     install_gem arvados-cli sdk/cli
 732 }
 733 do_install sdk/cli cli
 734
 735 install_login-sync() {
 736     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 737 }
 738 do_install services/login-sync login-sync
 739
 740 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
 741 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
 742 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
 743 # its own test suite brings up some of those other programs (like
 744 # keepproxy).
 745 for p in "${pythonstuff[@]}"
 746 do
 747     dir=${p%:py3}
 748     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
 749         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
 750             do_install ${dir} pip
 751         fi
 752     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
 753         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
 754             do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
 755         fi
 756     fi
 757 done
 758
 759 install_apiserver() {
 760     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 761         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 762
 763     rm -f config/environments/test.rb
 764     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 765
 766     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 767     then
 768         for f in database.yml
 769         do
 770             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 771         done
 772     fi
 773
 774     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 775     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 776     # is a postgresql superuser.
 777     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 778         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 779         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 780
 781     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 782
 783     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 784         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 785         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 786         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 787 }
 788 do_install services/api apiserver
 789
 790 cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" && \
 791     "$GOPATH/bin/govendor" sync -v || \
 792         fatal "govendor sync failed"
 793 declare -a gostuff
 794 gostuff=(
 795     sdk/go/arvados
 796     sdk/go/arvadosclient
 797     sdk/go/blockdigest
 798     sdk/go/dispatch
 799     sdk/go/health
 800     sdk/go/httpserver
 801     sdk/go/manifest
 802     sdk/go/streamer
 803     sdk/go/crunchrunner
 804     sdk/go/stats
 805     lib/crunchstat
 806     services/arv-git-httpd
 807     services/crunchstat
 808     services/health
 809     services/keep-web
 810     services/keepstore
 811     sdk/go/keepclient
 812     services/keep-balance
 813     services/keepproxy
 814     services/crunch-dispatch-local
 815     services/crunch-dispatch-slurm
 816     services/crunch-run
 817     services/ws
 818     tools/keep-block-check
 819     tools/keep-exercise
 820     tools/keep-rsync
 821     tools/arv-sync-groups
 822 )
 823 for g in "${gostuff[@]}"
 824 do
 825     do_install "$g" go
 826 done
 827
 828 install_workbench() {
 829     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 830         && mkdir -p tmp/cache \
 831         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
 832         && RAILS_ENV=test RAILS_GROUPS=assets bundle exec rake npm:install
 833 }
 834 do_install apps/workbench workbench
 835
 836 unset http_proxy https_proxy no_proxy
 837
 838 test_doclinkchecker() {
 839     (
 840         set -e
 841         cd "$WORKSPACE/doc"
 842         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
 843         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
 844         # do much good!
 845         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
 846     )
 847 }
 848 do_test doc doclinkchecker
 849
 850 stop_services
 851
 852 test_apiserver() {
 853     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
 854     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 855         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
 856 }
 857 do_test services/api apiserver
 858
 859 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
 860 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
 861 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
 862   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 863   exit_cleanly
 864 fi
 865
 866 start_api || { stop_services; fatal "start_api"; }
 867
 868 test_ruby_sdk() {
 869     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
 870         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
 871 }
 872 do_test sdk/ruby ruby_sdk
 873
 874 test_cli() {
 875     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
 876         && mkdir -p /tmp/keep \
 877         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
 878 }
 879 do_test sdk/cli cli
 880
 881 test_login-sync() {
 882     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
 883         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
 884 }
 885 do_test services/login-sync login-sync
 886
 887 test_nodemanager_integration() {
 888     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
 889         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager_integration]}
 890 }
 891 do_test services/nodemanager_integration nodemanager_integration
 892
 893 for p in "${pythonstuff[@]}"
 894 do
 895     dir=${p%:py3}
 896     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
 897         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
 898             do_test ${dir} pip
 899         fi
 900     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
 901         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
 902             do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
 903         fi
 904     fi
 905 done
 906
 907 for g in "${gostuff[@]}"
 908 do
 909     do_test "$g" go
 910 done
 911
 912 test_workbench_units() {
 913     start_nginx_proxy_services \
 914         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 915         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 916 }
 917 do_test apps/workbench_units workbench_units
 918
 919 test_workbench_functionals() {
 920     start_nginx_proxy_services \
 921         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 922         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 923 }
 924 do_test apps/workbench_functionals workbench_functionals
 925
 926 test_workbench_integration() {
 927     start_nginx_proxy_services \
 928         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 929         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 930 }
 931 do_test apps/workbench_integration workbench_integration
 932
 933
 934 test_workbench_benchmark() {
 935     start_nginx_proxy_services \
 936         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 937         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
 938 }
 939 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
 940
 941 test_workbench_profile() {
 942     start_nginx_proxy_services \
 943         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 944         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
 945 }
 946 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
 947
 948 exit_cleanly