build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
   5
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin.sh
   7
   8 COLUMNS=80
   9 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
  10
  11 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
  12 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  13
  14 Exit non-zero if any tests fail.
  15
  16 Syntax:
  17         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  18
  19 Options:
  20
  21 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  22 --skip sanity  Skip initial dev environment sanity checks.
  23 --skip install Do not run any install steps. Just run tests.
  24                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  25                from a previous invocation if you use this option.
  26 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  27 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  28                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  29 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  30                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  31                subsequent invocations.
  32 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  33 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  34 --only-install Run specific install step
  35 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  36 --interactive  Set up, then prompt for test/install steps to perform.
  37 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  38 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  39                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  40 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  41                Restrict apiserver tests to the given file
  42 sdk/python_test="--test-suite tests.test_keep_locator"
  43                Restrict Python SDK tests to the given class
  44 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  45                Restrict Workbench tests to the given file
  46 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  47                Show all log messages, even when tests pass (also works
  48                with services/keepstore_test etc.)
  49 ARVADOS_DEBUG=1
  50                Print more debug messages
  51 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  52                *_test, and other examples shown above.
  53
  54 Assuming "--skip install" is not given, all components are installed
  55 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  56 test suites depend on other components being installed, and installing
  57 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  58
  59 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  60 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  61
  62 More information and background:
  63
  64 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  65
  66 Available tests:
  67
  68 apps/workbench (*)
  69 apps/workbench_units (*)
  70 apps/workbench_functionals (*)
  71 apps/workbench_integration (*)
  72 apps/workbench_benchmark
  73 apps/workbench_profile
  74 cmd/arvados-client
  75 cmd/arvados-server
  76 doc
  77 lib/cli
  78 lib/cmd
  79 lib/controller
  80 lib/crunchstat
  81 lib/cloud
  82 lib/cloud/azure
  83 lib/dispatchcloud
  84 lib/dispatchcloud/container
  85 lib/dispatchcloud/scheduler
  86 lib/dispatchcloud/ssh_executor
  87 lib/dispatchcloud/worker
  88 lib/service
  89 services/api
  90 services/arv-git-httpd
  91 services/crunchstat
  92 services/dockercleaner
  93 services/fuse
  94 services/fuse:py3
  95 services/health
  96 services/keep-web
  97 services/keepproxy
  98 services/keepstore
  99 services/keep-balance
 100 services/login-sync
 101 services/nodemanager
 102 services/nodemanager_integration
 103 services/crunch-run
 104 services/crunch-dispatch-local
 105 services/crunch-dispatch-slurm
 106 services/ws
 107 sdk/cli
 108 sdk/pam
 109 sdk/pam:py3
 110 sdk/python
 111 sdk/python:py3
 112 sdk/ruby
 113 sdk/go/arvados
 114 sdk/go/arvadosclient
 115 sdk/go/auth
 116 sdk/go/dispatch
 117 sdk/go/keepclient
 118 sdk/go/health
 119 sdk/go/httpserver
 120 sdk/go/manifest
 121 sdk/go/blockdigest
 122 sdk/go/asyncbuf
 123 sdk/go/stats
 124 sdk/go/crunchrunner
 125 sdk/cwl
 126 sdk/R
 127 sdk/java-v2
 128 tools/sync-groups
 129 tools/crunchstat-summary
 130 tools/crunchstat-summary:py3
 131 tools/keep-exercise
 132 tools/keep-rsync
 133 tools/keep-block-check
 134
 135 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 136     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 137
 138 EOF
 139
 140 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 141 # environment that could interfere with the tests.
 142 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 143
 144 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 145 # accident.
 146 GITDIR=
 147 GOPATH=
 148 VENVDIR=
 149 VENV3DIR=
 150 PYTHONPATH=
 151 GEMHOME=
 152 PERLINSTALLBASE=
 153 R_LIBS=
 154 export LANG=en_US.UTF-8
 155
 156 short=
 157 only_install=
 158 temp=
 159 temp_preserve=
 160
 161 clear_temp() {
 162     if [[ -z "$temp" ]]; then
 163         # we didn't even get as far as making a temp dir
 164         :
 165     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 166         rm -rf "$temp"
 167     else
 168         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 169     fi
 170 }
 171
 172 fatal() {
 173     clear_temp
 174     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 175     exit 1
 176 }
 177
 178 exit_cleanly() {
 179     trap - INT
 180     if which create-plot-data-from-log.sh >/dev/null; then
 181         create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 182     fi
 183     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 184     stop_services
 185     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 186     report_outcomes
 187     clear_temp
 188     exit ${#failures}
 189 }
 190
 191 sanity_checks() {
 192     [[ -n "${skip[sanity]}" ]] && return 0
 193     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 194         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 195     echo Checking dependencies:
 196     echo "locale: ${LANG}"
 197     [[ "$(locale charmap)" = "UTF-8" ]] \
 198         || fatal "Locale '${LANG}' is broken/missing. Try: echo ${LANG} | sudo tee -a /etc/locale.gen && sudo locale-gen"
 199     echo -n 'virtualenv: '
 200     virtualenv --version \
 201         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 202     echo -n 'ruby: '
 203     ruby -v \
 204         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 205     echo -n 'go: '
 206     go version \
 207         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 208     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 10 ]] \
 209         || fatal "Go >= 1.10 required. See http://golang.org/doc/install"
 210     echo -n 'gcc: '
 211     gcc --version | egrep ^gcc \
 212         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 213     echo -n 'fuse.h: '
 214     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 215         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 216     echo -n 'gnutls.h: '
 217     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 218         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 219     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
 220     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 221         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
 222     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 223     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 224         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 225     echo -n 'nginx: '
 226     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 227         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 228     echo -n 'perl: '
 229     perl -v | grep version \
 230         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 231     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 232         echo -n "perl $mod: "
 233         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 234             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 235     done
 236     echo -n 'gitolite: '
 237     which gitolite \
 238         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 239     echo -n 'npm: '
 240     npm --version \
 241         || fatal "No npm. Try: wget -O- https://nodejs.org/dist/v6.11.2/node-v6.11.2-linux-x64.tar.xz | sudo tar -C /usr/local -xJf - && sudo ln -s ../node-v6.11.2-linux-x64/bin/{node,npm} /usr/local/bin/"
 242     echo -n 'cadaver: '
 243     cadaver --version | grep -w cadaver \
 244           || fatal "No cadaver. Try: apt-get install cadaver"
 245     echo -n 'libattr1 xattr.h: '
 246     find /usr/include -path '*/attr/xattr.h' | egrep --max-count=1 . \
 247         || fatal "No libattr1 xattr.h. Try: apt-get install libattr1-dev"
 248     echo -n 'libcurl curl.h: '
 249     find /usr/include -path '*/curl/curl.h' | egrep --max-count=1 . \
 250         || fatal "No libcurl curl.h. Try: apt-get install libcurl4-gnutls-dev"
 251     echo -n 'libpq libpq-fe.h: '
 252     find /usr/include -path '*/postgresql/libpq-fe.h' | egrep --max-count=1 . \
 253         || fatal "No libpq libpq-fe.h. Try: apt-get install libpq-dev"
 254     echo -n 'services/api/config/database.yml: '
 255     if [[ ! -f "$WORKSPACE/services/api/config/database.yml" ]]; then
 256             fatal "Please provide a database.yml file for the test suite"
 257     else
 258             echo "OK"
 259     fi
 260     echo -n 'postgresql: '
 261     psql --version || fatal "No postgresql. Try: apt-get install postgresql postgresql-client-common"
 262     echo -n 'phantomjs: '
 263     phantomjs --version || fatal "No phantomjs. Try: apt-get install phantomjs"
 264     echo -n 'xvfb: '
 265     which Xvfb || fatal "No xvfb. Try: apt-get install xvfb"
 266     echo -n 'graphviz: '
 267     dot -V || fatal "No graphviz. Try: apt-get install graphviz"
 268     echo -n 'geckodriver: '
 269     geckodriver --version | grep ^geckodriver || echo "No geckodriver. Try: wget -O- https://github.com/mozilla/geckodriver/releases/download/v0.23.0/geckodriver-v0.23.0-linux64.tar.gz | sudo tar -C /usr/local/bin -xzf - geckodriver"
 270
 271     if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 272       # R SDK stuff
 273       echo -n 'R: '
 274       which Rscript || fatal "No Rscript. Try: apt-get install r-base"
 275       echo -n 'testthat: '
 276       Rscript -e "library('testthat')" || fatal "No testthat. Try: apt-get install r-cran-testthat"
 277       # needed for roxygen2, needed for devtools, needed for R sdk
 278       pkg-config --exists libxml-2.0 || fatal "No libxml2. Try: apt-get install libxml2-dev"
 279       # needed for pkgdown, builds R SDK doc pages
 280       which pandoc || fatal "No pandoc. Try: apt-get install pandoc"
 281     fi
 282 }
 283
 284 rotate_logfile() {
 285   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 286   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 287   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 288     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 289     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 290     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 291   fi
 292 }
 293
 294 declare -a failures
 295 declare -A skip
 296 declare -A only
 297 declare -A testargs
 298 skip[apps/workbench_profile]=1
 299 # nodemanager_integration tests are not reliable, see #12061.
 300 skip[services/nodemanager_integration]=1
 301
 302 while [[ -n "$1" ]]
 303 do
 304     arg="$1"; shift
 305     case "$arg" in
 306         --help)
 307             echo >&2 "$helpmessage"
 308             echo >&2
 309             exit 1
 310             ;;
 311         --skip)
 312             skip[$1]=1; shift
 313             ;;
 314         --only)
 315             only[$1]=1; skip[$1]=""; shift
 316             ;;
 317         --short)
 318             short=1
 319             ;;
 320         --interactive)
 321             interactive=1
 322             ;;
 323         --skip-install)
 324             skip[install]=1
 325             ;;
 326         --only-install)
 327             only_install="$1"; shift
 328             ;;
 329         --temp)
 330             temp="$1"; shift
 331             temp_preserve=1
 332             ;;
 333         --leave-temp)
 334             temp_preserve=1
 335             ;;
 336         --repeat)
 337             repeat=$((${1}+0)); shift
 338             ;;
 339         --retry)
 340             retry=1
 341             ;;
 342         *_test=*)
 343             suite="${arg%%_test=*}"
 344             args="${arg#*=}"
 345             testargs["$suite"]="$args"
 346             ;;
 347         *=*)
 348             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 349             ;;
 350         *)
 351             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 352             exit 1
 353             ;;
 354     esac
 355 done
 356
 357 # R SDK installation is very slow (~360s in a clean environment) and only
 358 # required when testing it. Skip that step if it is not needed.
 359 NEED_SDK_R=true
 360
 361 if [[ ${#only[@]} -ne 0 ]] &&
 362    [[ -z "${only['sdk/R']}" && -z "${only['doc']}" ]]; then
 363   NEED_SDK_R=false
 364 fi
 365
 366 if [[ ${skip["sdk/R"]} == 1 && ${skip["doc"]} == 1 ]]; then
 367   NEED_SDK_R=false
 368 fi
 369
 370 if [[ $NEED_SDK_R == false ]]; then
 371         echo "R SDK not needed, it will not be installed."
 372 fi
 373
 374 checkpidfile() {
 375     svc="$1"
 376     pid="$(cat "$WORKSPACE/tmp/${svc}.pid")"
 377     if [[ -z "$pid" ]] || ! kill -0 "$pid"; then
 378         tail $WORKSPACE/tmp/${1}*.log
 379         echo "${svc} pid ${pid} not running"
 380         return 1
 381     fi
 382     echo "${svc} pid ${pid} ok"
 383 }
 384
 385 checkhealth() {
 386     svc="$1"
 387     port="$(cat "$WORKSPACE/tmp/${svc}.port")"
 388     scheme=http
 389     if [[ ${svc} =~ -ssl$ || ${svc} = wss ]]; then
 390         scheme=https
 391     fi
 392     url="$scheme://localhost:${port}/_health/ping"
 393     if ! curl -Ss -H "Authorization: Bearer e687950a23c3a9bceec28c6223a06c79" "${url}" | tee -a /dev/stderr | grep '"OK"'; then
 394         echo "${url} failed"
 395         return 1
 396     fi
 397 }
 398
 399 checkdiscoverydoc() {
 400     dd="https://${1}/discovery/v1/apis/arvados/v1/rest"
 401     if ! (set -o pipefail; curl -fsk "$dd" | grep -q ^{ ); then
 402         echo >&2 "ERROR: could not retrieve discovery doc from RailsAPI at $dd"
 403         tail -v $WORKSPACE/services/api/log/test.log
 404         return 1
 405     fi
 406     echo "${dd} ok"
 407 }
 408
 409 start_services() {
 410     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 411         return 0
 412     fi
 413     . "$VENVDIR/bin/activate"
 414     echo 'Starting API, controller, keepproxy, keep-web, arv-git-httpd, ws, and nginx ssl proxy...'
 415     if [[ ! -d "$WORKSPACE/services/api/log" ]]; then
 416         mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/log"
 417     fi
 418     # Remove empty api.pid file if it exists
 419     if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid" && ! -s "$WORKSPACE/tmp/api.pid" ]]; then
 420         rm -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid"
 421     fi
 422     all_services_stopped=
 423     fail=1
 424     cd "$WORKSPACE" \
 425         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 426         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 427         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 428         && checkpidfile api \
 429         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 430         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_controller \
 431         && checkpidfile controller \
 432         && checkhealth controller \
 433         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 434         && checkpidfile keepproxy \
 435         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 436         && checkpidfile keep-web \
 437         && checkhealth keep-web \
 438         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 439         && checkpidfile arv-git-httpd \
 440         && checkhealth arv-git-httpd \
 441         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 442         && checkpidfile ws \
 443         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx) \
 444         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 445         && checkpidfile nginx \
 446         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1 \
 447         && (env | egrep ^ARVADOS) \
 448         && fail=0
 449     deactivate
 450     if [[ $fail != 0 ]]; then
 451         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 452     fi
 453     return $fail
 454 }
 455
 456 stop_services() {
 457     if [[ -n "$all_services_stopped" ]]; then
 458         return
 459     fi
 460     unset ARVADOS_TEST_API_HOST ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 461     . "$VENVDIR/bin/activate" || return
 462     cd "$WORKSPACE" \
 463         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 464         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 465         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 466         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 467         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy \
 468         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_controller \
 469         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop \
 470         && all_services_stopped=1
 471     deactivate
 472 }
 473
 474 interrupt() {
 475     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 476     exit_cleanly
 477 }
 478 trap interrupt INT
 479
 480 setup_ruby_environment() {
 481     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 482         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 483         using_rvm=true
 484     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 485         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 486         using_rvm=true
 487     else
 488         using_rvm=false
 489     fi
 490
 491     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 492         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 493         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 494         # the environment to the "current gemset", which would lose
 495         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 496         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 497         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 498         # rvm gemset and use it for everything.
 499
 500         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 501             || fatal 'rvm check'
 502
 503         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 504         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 505         # complaint about not being in first place already.
 506         rvm use @default 2>/dev/null
 507
 508         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 509         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 510         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 511         # ruby to the caller.
 512         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 513         rvm use "@${gemset}" --create \
 514             || fatal 'rvm gemset setup'
 515
 516         rvm env
 517     else
 518         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 519         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 520         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 521         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 522         # should be installed, and we should leave it alone.)
 523
 524         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 525             user_gempath="$(gem env gempath)"
 526             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 527         fi
 528         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 529
 530         # When we build and install our own gems, we install them in our
 531         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 532         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 533         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 534
 535         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 536         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 537         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
 538
 539         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 540         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 541         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 542     fi
 543     bundle config || gem install bundler \
 544         || fatal 'install bundler'
 545 }
 546
 547 with_test_gemset() {
 548     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 549         "$@"
 550     else
 551         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 552     fi
 553 }
 554
 555 gem_uninstall_if_exists() {
 556     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 557         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 558     fi
 559 }
 560
 561 setup_virtualenv() {
 562     local venvdest="$1"; shift
 563     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 564         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 565     elif [[ -n "$short" ]]; then
 566         return
 567     fi
 568     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 569         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 570         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 571     else
 572         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 573     fi
 574     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 575     "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 576 }
 577
 578 initialize() {
 579     sanity_checks
 580
 581     echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 582
 583     if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 584         # Jenkins expects us to use this by default.
 585         CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 586     fi
 587
 588     # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 589     cd "$WORKSPACE"
 590     find -name '*.pyc' -delete
 591
 592     if [[ -z "$temp" ]]; then
 593         temp="$(mktemp -d)"
 594     fi
 595
 596     # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 597     for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE R_LIBS
 598     do
 599         if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 600             eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 601         fi
 602         if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 603             mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 604         fi
 605     done
 606
 607     rm -vf "${WORKSPACE}/tmp/*.log"
 608
 609     export PERLINSTALLBASE
 610     export PERL5LIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5${PERL5LIB:+:$PERL5LIB}"
 611
 612     export R_LIBS
 613
 614     export GOPATH
 615
 616     # Jenkins config requires that glob tmp/*.log match something. Ensure
 617     # that happens even if we don't end up running services that set up
 618     # logging.
 619     mkdir -p "${WORKSPACE}/tmp/" || fatal "could not mkdir ${WORKSPACE}/tmp"
 620     touch "${WORKSPACE}/tmp/controller.log" || fatal "could not touch ${WORKSPACE}/tmp/controller.log"
 621
 622     unset http_proxy https_proxy no_proxy
 623
 624
 625     # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 626     # whine a lot.
 627     setup_ruby_environment
 628
 629     echo "PATH is $PATH"
 630 }
 631
 632 install_env() {
 633     (
 634         set -e
 635         mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 636         if [[ ! -h "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" ]]; then
 637             for d in \
 638                 "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/tmp/GOPATH" \
 639                     "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/tmp" \
 640                     "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"; do
 641                 [[ -d "$d" ]] && rmdir "$d"
 642             done
 643         fi
 644         for d in \
 645             "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/arvados" \
 646                 "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"; do
 647             [[ -h "$d" ]] && rm "$d"
 648         done
 649         ln -vsfT "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
 650         go get -v github.com/kardianos/govendor
 651         cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
 652         go get -v -d ...
 653         "$GOPATH/bin/govendor" sync
 654     ) || fatal "Go setup failed"
 655
 656     setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 657     . "$VENVDIR/bin/activate"
 658
 659     # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 660     pip install --no-cache-dir PyYAML \
 661         || fatal "pip install PyYAML failed"
 662
 663     # Preinstall libcloud if using a fork; otherwise nodemanager "pip
 664     # install" won't pick it up by default.
 665     if [[ -n "$LIBCLOUD_PIN_SRC" ]]; then
 666         pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 667             || pip install --pre --ignore-installed --no-cache-dir "$LIBCLOUD_PIN_SRC" >/dev/null \
 668             || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 669     fi
 670
 671     # Deactivate Python 2 virtualenv
 672     deactivate
 673
 674     # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 675     # Otherwise, skip dependent tests.
 676     PYTHON3=$(which python3)
 677     if [[ ${?} = 0 ]]; then
 678         setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 679     else
 680         PYTHON3=
 681         cat >&2 <<EOF
 682
 683 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
 684
 685 EOF
 686     fi
 687
 688     if ! which bundler >/dev/null
 689     then
 690         gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 691     fi
 692 }
 693
 694 retry() {
 695     remain="${repeat}"
 696     while :
 697     do
 698         if ${@}; then
 699             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 700                 remain=$((${remain}-1))
 701                 title "(repeating ${remain} more times)"
 702             else
 703                 break
 704             fi
 705         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 706             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 707             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 708             then
 709                 break
 710             fi
 711         else
 712             break
 713         fi
 714     done
 715 }
 716
 717 do_test() {
 718     case "${1}" in
 719         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 720             suite=apps/workbench
 721             ;;
 722         services/nodemanager | services/nodemanager_integration)
 723             suite=services/nodemanager_suite
 724             ;;
 725         *)
 726             suite="${1}"
 727             ;;
 728     esac
 729     if [[ -n "${skip[$suite]}" || \
 730               -n "${skip[$1]}" || \
 731               (${#only[@]} -ne 0 && ${only[$suite]} -eq 0 && ${only[$1]} -eq 0) ]]; then
 732         return 0
 733     fi
 734     case "${1}" in
 735         services/api)
 736             stop_services
 737             ;;
 738         gofmt | govendor | doc | lib/cli | lib/cloud/azure | lib/cloud/ec2 | lib/cmd | lib/dispatchcloud/ssh_executor | lib/dispatchcloud/worker)
 739             # don't care whether services are running
 740             ;;
 741         *)
 742             if ! start_services; then
 743                 title "test $1 -- failed to start services"
 744                 return 1
 745             fi
 746             ;;
 747     esac
 748     retry do_test_once ${@}
 749 }
 750
 751 do_test_once() {
 752     unset result
 753
 754     title "test $1"
 755     timer_reset
 756
 757     result=
 758     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 759     if ! . "$VENVDIR/bin/activate"
 760     then
 761         result=1
 762     elif [[ "$2" == "go" ]]
 763     then
 764         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 765         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 766         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 767         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 768         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 769         # compilation errors.
 770         go get -ldflags "-X main.version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}" -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 771             cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 772             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 773         then
 774             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 775             # does:
 776             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 777         else
 778             # The above form gets verbose even when testargs is
 779             # empty, so use this form in such cases:
 780             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 781         fi
 782         result=${result:-$?}
 783         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 784         then
 785             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 786             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 787         fi
 788         [[ $result = 0 ]] && gofmt -e -d *.go
 789     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 790     then
 791         tries=0
 792         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 793         do
 794             tries=$((${tries}+1))
 795             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 796             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 797             if [[ -e "${3}activate" ]]; then
 798                 . "${3}activate"
 799             fi
 800             python setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 801             result=$?
 802             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 803             then
 804                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 805                 continue
 806             else
 807                 break
 808             fi
 809         done
 810     elif [[ "$2" != "" ]]
 811     then
 812         "test_$2"
 813     else
 814         "test_$1"
 815     fi
 816     result=${result:-$?}
 817     checkexit $result "$1 tests"
 818     title "test $1 -- `timer`"
 819     return $result
 820 }
 821
 822 do_install() {
 823     if [[ -n "${skip[install]}" || ( -n "${only_install}" && "${only_install}" != "${1}" && "${only_install}" != "${2}" ) ]]; then
 824         return 0
 825     fi
 826     retry do_install_once ${@}
 827 }
 828
 829 do_install_once() {
 830     title "install $1"
 831     timer_reset
 832
 833     result=
 834     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 835     if [[ "$1" != "env" ]] && ! . "$VENVDIR/bin/activate"; then
 836         result=1
 837     elif [[ "$2" == "go" ]]
 838     then
 839         go get -ldflags "-X main.version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}" -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 840     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 841     then
 842         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 843         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 844
 845         # Need to change to a different directory after creating
 846         # the source dist package to avoid a pip bug.
 847         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 848
 849         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 850         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 851         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 852         # install" ensures that we've actually installed the local package
 853         # we just built.
 854         cd "$WORKSPACE/$1" \
 855             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 856             && cd "$WORKSPACE" \
 857             && "${3}pip" install --no-cache-dir --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 858             && "${3}pip" install --no-cache-dir --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 859     elif [[ "$2" != "" ]]
 860     then
 861         "install_$2"
 862     else
 863         "install_$1"
 864     fi
 865     result=${result:-$?}
 866     checkexit $result "$1 install"
 867     title "install $1 -- `timer`"
 868     return $result
 869 }
 870
 871 bundle_install_trylocal() {
 872     (
 873         set -e
 874         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 875         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 876             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 877             bundle install --no-deployment
 878         fi
 879         bundle package --all
 880     )
 881 }
 882
 883 install_doc() {
 884     cd "$WORKSPACE/doc" \
 885         && bundle_install_trylocal \
 886         && rm -rf .site
 887 }
 888
 889 install_gem() {
 890     gemname=$1
 891     srcpath=$2
 892     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 893         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 894         && bundle_install_trylocal \
 895         && gem build "$gemname.gemspec" \
 896         && with_test_gemset gem install --no-document $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 897 }
 898
 899 install_sdk/ruby() {
 900     install_gem arvados sdk/ruby
 901 }
 902
 903 install_sdk/R() {
 904   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 905     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
 906        && Rscript --vanilla install_deps.R
 907   fi
 908 }
 909
 910 install_sdk/perl() {
 911     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 912         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 913         && make install INSTALLDIRS=perl
 914 }
 915
 916 install_sdk/cli() {
 917     install_gem arvados-cli sdk/cli
 918 }
 919
 920 install_services/login-sync() {
 921     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 922 }
 923
 924 install_services/api() {
 925     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 926         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 927
 928     rm -f config/environments/test.rb
 929     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 930
 931     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 932     then
 933         for f in database.yml
 934         do
 935             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 936         done
 937     fi
 938
 939     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 940     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 941     # is a postgresql superuser.
 942     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 943         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.safe_load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 944         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.pid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 945
 946     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 947
 948     cert="$WORKSPACE/services/api/tmp/self-signed"
 949     if [[ ! -e "$cert.pem" || "$(date -r "$cert.pem" +%s)" -lt 1512659226 ]]; then
 950         (
 951             dir="$WORKSPACE/services/api/tmp"
 952             set -ex
 953             openssl req -newkey rsa:2048 -nodes -subj '/C=US/ST=State/L=City/CN=localhost' -out "$cert.csr" -keyout "$cert.key" </dev/null
 954             openssl x509 -req -in "$cert.csr" -signkey "$cert.key" -out "$cert.pem" -days 3650 -extfile <(printf 'subjectAltName=DNS:localhost,DNS:::1,DNS:0.0.0.0,DNS:127.0.0.1,IP:::1,IP:0.0.0.0,IP:127.0.0.1')
 955         ) || return 1
 956     fi
 957
 958     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 959         && rm -rf tmp/git \
 960         && mkdir -p tmp/git \
 961         && cd tmp/git \
 962         && tar xf ../../test/test.git.tar \
 963         && mkdir -p internal.git \
 964         && git --git-dir internal.git init \
 965             || return 1
 966
 967     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 968         && RAILS_ENV=test bundle exec rails db:environment:set \
 969         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 970         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 971         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 972 }
 973
 974 declare -a pythonstuff
 975 pythonstuff=(
 976     sdk/pam
 977     sdk/python
 978     sdk/python:py3
 979     sdk/cwl
 980     sdk/cwl:py3
 981     services/dockercleaner:py3
 982     services/fuse
 983     services/fuse:py3
 984     services/nodemanager
 985     tools/crunchstat-summary
 986     tools/crunchstat-summary:py3
 987 )
 988
 989 declare -a gostuff
 990 gostuff=(
 991     cmd/arvados-client
 992     cmd/arvados-server
 993     lib/cli
 994     lib/cmd
 995     lib/controller
 996     lib/crunchstat
 997     lib/cloud
 998     lib/cloud/azure
 999     lib/cloud/ec2
1000     lib/config
1001     lib/dispatchcloud
1002     lib/dispatchcloud/container
1003     lib/dispatchcloud/scheduler
1004     lib/dispatchcloud/ssh_executor
1005     lib/dispatchcloud/worker
1006     lib/service
1007     sdk/go/arvados
1008     sdk/go/arvadosclient
1009     sdk/go/auth
1010     sdk/go/blockdigest
1011     sdk/go/dispatch
1012     sdk/go/health
1013     sdk/go/httpserver
1014     sdk/go/manifest
1015     sdk/go/asyncbuf
1016     sdk/go/crunchrunner
1017     sdk/go/stats
1018     services/arv-git-httpd
1019     services/crunchstat
1020     services/health
1021     services/keep-web
1022     services/keepstore
1023     sdk/go/keepclient
1024     services/keep-balance
1025     services/keepproxy
1026     services/crunch-dispatch-local
1027     services/crunch-dispatch-slurm
1028     services/crunch-run
1029     services/ws
1030     tools/keep-block-check
1031     tools/keep-exercise
1032     tools/keep-rsync
1033     tools/sync-groups
1034 )
1035
1036 install_apps/workbench() {
1037     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1038         && mkdir -p tmp/cache \
1039         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
1040         && RAILS_ENV=test RAILS_GROUPS=assets bundle exec rake npm:install
1041 }
1042
1043 test_doc() {
1044     (
1045         set -e
1046         cd "$WORKSPACE/doc"
1047         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
1048         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
1049         # do much good!
1050         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
1051     )
1052 }
1053
1054 test_gofmt() {
1055     cd "$WORKSPACE" || return 1
1056     dirs=$(ls -d */ | egrep -v 'vendor|tmp')
1057     [[ -z "$(gofmt -e -d $dirs | tee -a /dev/stderr)" ]]
1058 }
1059
1060 test_govendor() {
1061     (
1062         set -e
1063         cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
1064         # Remove cached source dirs in workdir. Otherwise, they will
1065         # not qualify as +missing or +external below, and we won't be
1066         # able to detect that they're missing from vendor/vendor.json.
1067         rm -rf vendor/*/
1068         go get -v -d ...
1069         "$GOPATH/bin/govendor" sync
1070         if [[ -n $("$GOPATH/bin/govendor" list +unused +missing +external | tee /dev/stderr) ]]; then
1071             echo >&2 "vendor/vendor.json has unused or missing dependencies -- try:
1072
1073 (export GOPATH=\"${GOPATH}\"; cd \$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git && \$GOPATH/bin/govendor add +missing +external && \$GOPATH/bin/govendor remove +unused)
1074
1075 "
1076             return 1
1077         fi
1078     )
1079 }
1080
1081 test_services/api() {
1082     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
1083     cd "$WORKSPACE/services/api" \
1084         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS='-v -d' ${testargs[services/api]}
1085 }
1086
1087 test_sdk/ruby() {
1088     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
1089         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
1090 }
1091
1092 test_sdk/R() {
1093   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
1094     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
1095         && Rscript --vanilla run_test.R
1096   fi
1097 }
1098
1099 test_sdk/cli() {
1100     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
1101         && mkdir -p /tmp/keep \
1102         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
1103 }
1104
1105 test_sdk/java-v2() {
1106     cd "$WORKSPACE/sdk/java-v2" && gradle test
1107 }
1108
1109 test_services/login-sync() {
1110     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
1111         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
1112 }
1113
1114 test_services/nodemanager_integration() {
1115     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
1116         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager_integration]}
1117 }
1118
1119 test_apps/workbench_units() {
1120     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1121         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS='-v -d' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_units]}
1122 }
1123
1124 test_apps/workbench_functionals() {
1125     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1126         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS='-v -d' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_functionals]}
1127 }
1128
1129 test_apps/workbench_integration() {
1130     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1131         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS='-v -d' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_integration]}
1132 }
1133
1134 test_apps/workbench_benchmark() {
1135     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1136         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
1137 }
1138
1139 test_apps/workbench_profile() {
1140     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1141         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
1142 }
1143
1144 install_deps() {
1145     # Install parts needed by test suites
1146     do_install env
1147     do_install cmd/arvados-server go
1148     do_install sdk/cli
1149     do_install sdk/perl
1150     do_install sdk/python pip
1151     do_install sdk/ruby
1152     do_install services/api
1153     do_install services/arv-git-httpd go
1154     do_install services/keepproxy go
1155     do_install services/keepstore go
1156     do_install services/keep-web go
1157     do_install services/ws go
1158 }
1159
1160 install_all() {
1161     do_install env
1162     do_install doc
1163     do_install sdk/ruby
1164     do_install sdk/R
1165     do_install sdk/perl
1166     do_install sdk/cli
1167     do_install services/login-sync
1168     for p in "${pythonstuff[@]}"
1169     do
1170         dir=${p%:py3}
1171         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1172             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1173                 do_install ${dir} pip
1174             fi
1175         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1176             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1177                 do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1178             fi
1179         fi
1180     done
1181     do_install services/api
1182     for g in "${gostuff[@]}"
1183     do
1184         do_install "$g" go
1185     done
1186     do_install apps/workbench
1187 }
1188
1189 test_all() {
1190     stop_services
1191     do_test services/api
1192
1193     # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
1194     # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
1195     if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
1196         rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
1197         exit_cleanly
1198     fi
1199
1200     do_test gofmt
1201     do_test govendor
1202     do_test doc
1203     do_test sdk/ruby
1204     do_test sdk/R
1205     do_test sdk/cli
1206     do_test services/login-sync
1207     do_test sdk/java-v2
1208     do_test services/nodemanager_integration
1209     for p in "${pythonstuff[@]}"
1210     do
1211         dir=${p%:py3}
1212         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1213             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1214                 do_test ${dir} pip
1215             fi
1216         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1217             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1218                 do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1219             fi
1220         fi
1221     done
1222
1223     for g in "${gostuff[@]}"
1224     do
1225         do_test "$g" go
1226     done
1227     do_test apps/workbench_units
1228     do_test apps/workbench_functionals
1229     do_test apps/workbench_integration
1230     do_test apps/workbench_benchmark
1231     do_test apps/workbench_profile
1232 }
1233
1234 help_interactive() {
1235     echo "== Interactive commands:"
1236     echo "TARGET                 (short for 'test DIR')"
1237     echo "test TARGET"
1238     echo "test TARGET:py3        (test with python3)"
1239     echo "test TARGET -check.vv  (pass arguments to test)"
1240     echo "install TARGET"
1241     echo "install env            (go/python libs)"
1242     echo "install deps           (go/python libs + arvados components needed for integration tests)"
1243     echo "reset                  (...services used by integration tests)"
1244     echo "exit"
1245     echo "== Test targets:"
1246     echo "${!testfuncargs[@]}" | tr ' ' '\n' | sort | column
1247 }
1248
1249 initialize
1250
1251 declare -A testfuncargs=()
1252 for g in "${gostuff[@]}"; do
1253     testfuncargs[$g]="$g go"
1254 done
1255 for p in "${pythonstuff[@]}"; do
1256     dir=${p%:py3}
1257     testfuncargs[$dir]="$dir pip $VENVDIR/bin/"
1258     testfuncargs[$dir:py3]="$dir pip $VENV3DIR/bin/"
1259 done
1260
1261 testfuncargs["sdk/cli"]="sdk/cli"
1262
1263 if [[ -z ${interactive} ]]; then
1264     install_all
1265     test_all
1266 else
1267     skip=()
1268     only=()
1269     only_install=()
1270     if [[ -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then stop_services; fi
1271     setnextcmd() {
1272         if [[ "$TERM" = dumb ]]; then
1273             # assume emacs, or something, is offering a history buffer
1274             # and pre-populating the command will only cause trouble
1275             nextcmd=
1276         elif [[ "$nextcmd" != "install deps" ]]; then
1277             :
1278         elif [[ -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then
1279             nextcmd="test lib/cmd"
1280         else
1281             nextcmd="install deps"
1282         fi
1283     }
1284     echo
1285     help_interactive
1286     nextcmd="install deps"
1287     setnextcmd
1288     while read -p 'What next? ' -e -i "${nextcmd}" nextcmd; do
1289         read verb target opts <<<"${nextcmd}"
1290         target="${target%/}"
1291         target="${target/\/:/:}"
1292         case "${verb}" in
1293             "exit" | "quit")
1294                 exit_cleanly
1295                 ;;
1296             "reset")
1297                 stop_services
1298                 ;;
1299             "test" | "install")
1300                 case "$target" in
1301                     "")
1302                         help_interactive
1303                         ;;
1304                     all | deps)
1305                         ${verb}_${target}
1306                         ;;
1307                     *)
1308                         testargs["$target"]="${opts}"
1309                         tt="${testfuncargs[${target}]}"
1310                         tt="${tt:-$target}"
1311                         do_$verb $tt
1312                         ;;
1313                 esac
1314                 ;;
1315             "" | "help" | *)
1316                 help_interactive
1317                 ;;
1318         esac
1319         if [[ ${#successes[@]} -gt 0 || ${#failures[@]} -gt 0 ]]; then
1320             report_outcomes
1321             successes=()
1322             failures=()
1323         fi
1324         cd "$WORKSPACE"
1325         setnextcmd
1326     done
1327     echo
1328 fi
1329 exit_cleanly