build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
   5
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin.sh
   7
   8 COLUMNS=80
   9 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
  10
  11 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
  12 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  13
  14 Exit non-zero if any tests fail.
  15
  16 Syntax:
  17         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  18
  19 Options:
  20
  21 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  22 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  23 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  24                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  25 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  26                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  27                subsequent invocations.
  28 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  29 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  30 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
  31                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  32                from a previous invocation if you use this option.
  33 --only-install Run specific install step
  34 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  35 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  36 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  37                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  38 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  39                Restrict apiserver tests to the given file
  40 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
  41                Restrict Python SDK tests to the given class
  42 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  43                Restrict Workbench tests to the given file
  44 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  45                Show all log messages, even when tests pass (also works
  46                with services/keepstore_test etc.)
  47 ARVADOS_DEBUG=1
  48                Print more debug messages
  49 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  50                *_test, and other examples shown above.
  51
  52 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
  53 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  54 test suites depend on other components being installed, and installing
  55 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  56
  57 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  58 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  59
  60 More information and background:
  61
  62 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  63
  64 Available tests:
  65
  66 apps/workbench (*)
  67 apps/workbench_units (*)
  68 apps/workbench_functionals (*)
  69 apps/workbench_integration (*)
  70 apps/workbench_benchmark
  71 apps/workbench_profile
  72 doc
  73 services/api
  74 services/arv-git-httpd
  75 services/crunchstat
  76 services/dockercleaner
  77 services/fuse
  78 services/keep-web
  79 services/keepproxy
  80 services/keepstore
  81 services/keep-balance
  82 services/login-sync
  83 services/nodemanager
  84 services/nodemanager_integration
  85 services/crunch-run
  86 services/crunch-dispatch-local
  87 services/crunch-dispatch-slurm
  88 services/ws
  89 sdk/cli
  90 sdk/pam
  91 sdk/python
  92 sdk/python:py3
  93 sdk/ruby
  94 sdk/go/arvados
  95 sdk/go/arvadosclient
  96 sdk/go/dispatch
  97 sdk/go/keepclient
  98 sdk/go/health
  99 sdk/go/httpserver
 100 sdk/go/manifest
 101 sdk/go/blockdigest
 102 sdk/go/streamer
 103 sdk/go/stats
 104 sdk/go/crunchrunner
 105 sdk/cwl
 106 tools/crunchstat-summary
 107 tools/keep-exercise
 108 tools/keep-rsync
 109 tools/keep-block-check
 110
 111 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 112     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 113
 114 EOF
 115
 116 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 117 # environment that could interfere with the tests.
 118 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 119
 120 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 121 # accident.
 122 GITDIR=
 123 GOPATH=
 124 VENVDIR=
 125 VENV3DIR=
 126 PYTHONPATH=
 127 GEMHOME=
 128 PERLINSTALLBASE=
 129
 130 short=
 131 only_install=
 132 temp=
 133 temp_preserve=
 134
 135 clear_temp() {
 136     if [[ -z "$temp" ]]; then
 137         # we didn't even get as far as making a temp dir
 138         :
 139     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 140         rm -rf "$temp"
 141     else
 142         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 143     fi
 144 }
 145
 146 fatal() {
 147     clear_temp
 148     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 149     exit 1
 150 }
 151
 152 exit_cleanly() {
 153     trap - INT
 154     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 155     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 156     stop_services
 157     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 158     report_outcomes
 159     clear_temp
 160     exit ${#failures}
 161 }
 162
 163 sanity_checks() {
 164     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 165         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 166     echo Checking dependencies:
 167     echo -n 'virtualenv: '
 168     virtualenv --version \
 169         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 170     echo -n 'ruby: '
 171     ruby -v \
 172         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 173     echo -n 'go: '
 174     go version \
 175         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 176     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 8 ]] \
 177         || fatal "Go >= 1.8 required. See http://golang.org/doc/install"
 178     echo -n 'gcc: '
 179     gcc --version | egrep ^gcc \
 180         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 181     echo -n 'fuse.h: '
 182     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 183         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 184     echo -n 'gnutls.h: '
 185     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 186         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 187     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
 188     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 189         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
 190     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 191     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 192         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 193     echo -n 'nginx: '
 194     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 195         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 196     echo -n 'perl: '
 197     perl -v | grep version \
 198         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 199     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 200         echo -n "perl $mod: "
 201         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 202             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 203     done
 204     echo -n 'gitolite: '
 205     which gitolite \
 206         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 207     which npm \
 208           || fatal "No npm. Try: wget -O- https://nodejs.org/dist/v6.11.2/node-v6.11.2-linux-x64.tar.xz | sudo tar -C /usr/local xJf - && sudo ln -s ../node-v6.11.2-linux-x64/bin/{node,npm} /usr/local/bin/"
 209 }
 210
 211 rotate_logfile() {
 212   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 213   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 214   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 215     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 216     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 217     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 218   fi
 219 }
 220
 221 declare -a failures
 222 declare -A skip
 223 declare -A testargs
 224 skip[apps/workbench_profile]=1
 225
 226 while [[ -n "$1" ]]
 227 do
 228     arg="$1"; shift
 229     case "$arg" in
 230         --help)
 231             echo >&2 "$helpmessage"
 232             echo >&2
 233             exit 1
 234             ;;
 235         --skip)
 236             skip[$1]=1; shift
 237             ;;
 238         --only)
 239             only="$1"; skip[$1]=""; shift
 240             ;;
 241         --short)
 242             short=1
 243             ;;
 244         --skip-install)
 245             only_install=nothing
 246             ;;
 247         --only-install)
 248             only_install="$1"; shift
 249             ;;
 250         --temp)
 251             temp="$1"; shift
 252             temp_preserve=1
 253             ;;
 254         --leave-temp)
 255             temp_preserve=1
 256             ;;
 257         --repeat)
 258             repeat=$((${1}+0)); shift
 259             ;;
 260         --retry)
 261             retry=1
 262             ;;
 263         *_test=*)
 264             suite="${arg%%_test=*}"
 265             args="${arg#*=}"
 266             testargs["$suite"]="$args"
 267             ;;
 268         *=*)
 269             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 270             ;;
 271         *)
 272             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 273             exit 1
 274             ;;
 275     esac
 276 done
 277
 278 start_api() {
 279     echo 'Starting API server...'
 280     cd "$WORKSPACE" \
 281         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 282         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 283         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 284         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 285         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 286         && (env | egrep ^ARVADOS)
 287 }
 288
 289 start_nginx_proxy_services() {
 290     echo 'Starting keepproxy, keep-web, ws, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
 291     cd "$WORKSPACE" \
 292         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 293         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 294         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 295         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 296         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 297         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1
 298 }
 299
 300 stop_services() {
 301     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES" ]]; then
 302         unset ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 303         cd "$WORKSPACE" \
 304             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 305             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 306             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 307             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 308             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy
 309     fi
 310     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 311         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 312         cd "$WORKSPACE" \
 313             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 314             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 315             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
 316     fi
 317 }
 318
 319 interrupt() {
 320     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 321     exit_cleanly
 322 }
 323 trap interrupt INT
 324
 325 sanity_checks
 326
 327 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 328
 329 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 330     # Jenkins expects us to use this by default.
 331     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 332 fi
 333
 334 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 335 cd "$WORKSPACE"
 336 find -name '*.pyc' -delete
 337
 338 if [[ -z "$temp" ]]; then
 339     temp="$(mktemp -d)"
 340 fi
 341
 342 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 343 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
 344 do
 345     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 346         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 347     fi
 348     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 349         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 350     fi
 351 done
 352
 353 setup_ruby_environment() {
 354     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 355         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 356         using_rvm=true
 357     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 358         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 359         using_rvm=true
 360     else
 361         using_rvm=false
 362     fi
 363
 364     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 365         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 366         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 367         # the environment to the "current gemset", which would lose
 368         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 369         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 370         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 371         # rvm gemset and use it for everything.
 372
 373         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 374             || fatal 'rvm check'
 375
 376         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 377         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 378         # complaint about not being in first place already.
 379         rvm use @default 2>/dev/null
 380
 381         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 382         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 383         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 384         # ruby to the caller.
 385         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 386         rvm use "@${gemset}" --create \
 387             || fatal 'rvm gemset setup'
 388
 389         rvm env
 390     else
 391         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 392         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 393         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 394         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 395         # should be installed, and we should leave it alone.)
 396
 397         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 398             user_gempath="$(gem env gempath)"
 399             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 400         fi
 401         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 402
 403         # When we build and install our own gems, we install them in our
 404         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 405         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 406         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 407
 408         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 409         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 410         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
 411
 412         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 413         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 414         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 415     fi
 416     bundle config || gem install bundler \
 417         || fatal 'install bundler'
 418 }
 419
 420 with_test_gemset() {
 421     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 422         "$@"
 423     else
 424         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 425     fi
 426 }
 427
 428 gem_uninstall_if_exists() {
 429     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 430         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 431     fi
 432 }
 433
 434 setup_virtualenv() {
 435     local venvdest="$1"; shift
 436     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 437         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 438     fi
 439     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 440         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 441         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 442     else
 443         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 444     fi
 445     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 446     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 447 }
 448
 449 export PERLINSTALLBASE
 450 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
 451
 452 export GOPATH
 453 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 454 ln -sfT "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
 455     || fatal "symlink failed"
 456 go get -v github.com/kardianos/govendor \
 457     || fatal "govendor install failed"
 458
 459 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 460 . "$VENVDIR/bin/activate"
 461
 462 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 463 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
 464     || pip install PyYAML >/dev/null \
 465     || fatal "pip install PyYAML failed"
 466
 467 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
 468 # won't pick it up by default.
 469 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 470     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
 471     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 472
 473 # Uninstall old llfuse (<1.0), because services/fuse "pip install"
 474 # won't upgrade it by default.
 475 if pip freeze | egrep '^llfuse==0'; then
 476     yes | pip uninstall 'llfuse<1.0'
 477 fi
 478
 479 # Deactivate Python 2 virtualenv
 480 deactivate
 481
 482 declare -a pythonstuff
 483 pythonstuff=(
 484     sdk/pam
 485     sdk/python
 486     sdk/python:py3
 487     sdk/cwl
 488     services/dockercleaner:py3
 489     services/fuse
 490     services/nodemanager
 491     tools/crunchstat-summary
 492     )
 493
 494 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 495 # Otherwise, skip dependent tests.
 496 PYTHON3=$(which python3)
 497 if [[ ${?} = 0 ]]; then
 498     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 499 else
 500     PYTHON3=
 501     cat >&2 <<EOF
 502
 503 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
 504
 505 EOF
 506 fi
 507
 508 # Reactivate Python 2 virtualenv
 509 . "$VENVDIR/bin/activate"
 510
 511 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 512 # whine a lot.
 513 setup_ruby_environment
 514
 515 echo "PATH is $PATH"
 516
 517 if ! which bundler >/dev/null
 518 then
 519     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 520 fi
 521
 522 retry() {
 523     remain="${repeat}"
 524     while :
 525     do
 526         if ${@}; then
 527             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 528                 remain=$((${remain}-1))
 529                 title "Repeating ${remain} more times"
 530             else
 531                 break
 532             fi
 533         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 534             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 535             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 536             then
 537                 break
 538             fi
 539         else
 540             break
 541         fi
 542     done
 543 }
 544
 545 do_test() {
 546     case "${1}" in
 547         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 548             suite=apps/workbench
 549             ;;
 550         services/nodemanager | services/nodemanager_integration)
 551             suite=services/nodemanager_suite
 552             ;;
 553         *)
 554             suite="${1}"
 555             ;;
 556     esac
 557     if [[ -z "${skip[$suite]}" && -z "${skip[$1]}" && \
 558                 (-z "${only}" || "${only}" == "${suite}" || \
 559                  "${only}" == "${1}") ]]; then
 560         retry do_test_once ${@}
 561     else
 562         title "Skipping ${1} tests"
 563     fi
 564 }
 565
 566 do_test_once() {
 567     unset result
 568
 569     title "Running $1 tests"
 570     timer_reset
 571     if [[ "$2" == "go" ]]
 572     then
 573         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 574         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 575         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 576         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 577         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 578         # compilation errors.
 579         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 580             cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 581             [[ -z "$(gofmt -e -d . | tee /dev/stderr)" ]] && \
 582             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 583         then
 584             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 585             # does:
 586             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 587         else
 588             # The above form gets verbose even when testargs is
 589             # empty, so use this form in such cases:
 590             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 591         fi
 592         result=${result:-$?}
 593         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 594         then
 595             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 596             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 597         fi
 598     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 599     then
 600         tries=0
 601         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 602         do
 603             tries=$((${tries}+1))
 604             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 605             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 606             "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 607             result=$?
 608             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 609             then
 610                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 611                 continue
 612             else
 613                 break
 614             fi
 615         done
 616     elif [[ "$2" != "" ]]
 617     then
 618         "test_$2"
 619     else
 620         "test_$1"
 621     fi
 622     result=${result:-$?}
 623     checkexit $result "$1 tests"
 624     title "End of $1 tests (`timer`)"
 625     return $result
 626 }
 627
 628 do_install() {
 629     if [[ -z "${only_install}" || "${only_install}" == "${1}" ]]; then
 630         retry do_install_once ${@}
 631     else
 632         title "Skipping $1 install"
 633     fi
 634 }
 635
 636 do_install_once() {
 637     title "Running $1 install"
 638     timer_reset
 639     if [[ "$2" == "go" ]]
 640     then
 641         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 642     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 643     then
 644         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 645         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 646
 647         # Need to change to a different directory after creating
 648         # the source dist package to avoid a pip bug.
 649         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 650
 651         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 652         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 653         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 654         # install" ensures that we've actually installed the local package
 655         # we just built.
 656         cd "$WORKSPACE/$1" \
 657             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 658             && cd "$WORKSPACE" \
 659             && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 660             && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 661     elif [[ "$2" != "" ]]
 662     then
 663         "install_$2"
 664     else
 665         "install_$1"
 666     fi
 667     result=$?
 668     checkexit $result "$1 install"
 669     title "End of $1 install (`timer`)"
 670     return $result
 671 }
 672
 673 bundle_install_trylocal() {
 674     (
 675         set -e
 676         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 677         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 678             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 679             bundle install --no-deployment
 680         fi
 681         bundle package --all
 682     )
 683 }
 684
 685 install_doc() {
 686     cd "$WORKSPACE/doc" \
 687         && bundle_install_trylocal \
 688         && rm -rf .site
 689 }
 690 do_install doc
 691
 692 install_gem() {
 693     gemname=$1
 694     srcpath=$2
 695     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 696         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 697         && bundle_install_trylocal \
 698         && gem build "$gemname.gemspec" \
 699         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 700 }
 701
 702 install_ruby_sdk() {
 703     install_gem arvados sdk/ruby
 704 }
 705 do_install sdk/ruby ruby_sdk
 706
 707 install_perl_sdk() {
 708     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 709         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 710         && make install INSTALLDIRS=perl
 711 }
 712 do_install sdk/perl perl_sdk
 713
 714 install_cli() {
 715     install_gem arvados-cli sdk/cli
 716 }
 717 do_install sdk/cli cli
 718
 719 install_login-sync() {
 720     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 721 }
 722 do_install services/login-sync login-sync
 723
 724 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
 725 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
 726 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
 727 # its own test suite brings up some of those other programs (like
 728 # keepproxy).
 729 for p in "${pythonstuff[@]}"
 730 do
 731     dir=${p%:py3}
 732     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
 733         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
 734             do_install ${dir} pip
 735         fi
 736     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
 737         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
 738             do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
 739         fi
 740     fi
 741 done
 742
 743 install_apiserver() {
 744     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 745         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 746
 747     rm -f config/environments/test.rb
 748     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 749
 750     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 751     then
 752         for f in database.yml
 753         do
 754             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 755         done
 756     fi
 757
 758     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 759     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 760     # is a postgresql superuser.
 761     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 762         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 763         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 764
 765     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 766
 767     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 768         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 769         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 770         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 771 }
 772 do_install services/api apiserver
 773
 774 cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" && \
 775     "$GOPATH/bin/govendor" sync -v || \
 776         fatal "govendor sync failed"
 777 declare -a gostuff
 778 gostuff=(
 779     sdk/go/arvados
 780     sdk/go/arvadosclient
 781     sdk/go/blockdigest
 782     sdk/go/dispatch
 783     sdk/go/health
 784     sdk/go/httpserver
 785     sdk/go/manifest
 786     sdk/go/streamer
 787     sdk/go/crunchrunner
 788     sdk/go/stats
 789     lib/crunchstat
 790     services/arv-git-httpd
 791     services/crunchstat
 792     services/keep-web
 793     services/keepstore
 794     sdk/go/keepclient
 795     services/keep-balance
 796     services/keepproxy
 797     services/crunch-dispatch-local
 798     services/crunch-dispatch-slurm
 799     services/crunch-run
 800     services/ws
 801     tools/keep-block-check
 802     tools/keep-exercise
 803     tools/keep-rsync
 804 )
 805 for g in "${gostuff[@]}"
 806 do
 807     do_install "$g" go
 808 done
 809
 810 install_workbench() {
 811     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 812         && mkdir -p tmp/cache \
 813         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
 814         && RAILS_ENV=test RAILS_GROUPS=assets bundle exec rake npm:install
 815 }
 816 do_install apps/workbench workbench
 817
 818 unset http_proxy https_proxy no_proxy
 819
 820 test_doclinkchecker() {
 821     (
 822         set -e
 823         cd "$WORKSPACE/doc"
 824         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
 825         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
 826         # do much good!
 827         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
 828     )
 829 }
 830 do_test doc doclinkchecker
 831
 832 stop_services
 833
 834 test_apiserver() {
 835     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
 836     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 837         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
 838 }
 839 do_test services/api apiserver
 840
 841 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
 842 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
 843 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
 844   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 845   exit_cleanly
 846 fi
 847
 848 start_api || { stop_services; fatal "start_api"; }
 849
 850 test_ruby_sdk() {
 851     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
 852         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
 853 }
 854 do_test sdk/ruby ruby_sdk
 855
 856 test_cli() {
 857     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
 858         && mkdir -p /tmp/keep \
 859         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
 860 }
 861 do_test sdk/cli cli
 862
 863 test_login-sync() {
 864     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
 865         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
 866 }
 867 do_test services/login-sync login-sync
 868
 869 test_nodemanager_integration() {
 870     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
 871         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager_integration]}
 872 }
 873 do_test services/nodemanager_integration nodemanager_integration
 874
 875 for p in "${pythonstuff[@]}"
 876 do
 877     dir=${p%:py3}
 878     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
 879         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
 880             do_test ${dir} pip
 881         fi
 882     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
 883         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
 884             do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
 885         fi
 886     fi
 887 done
 888
 889 for g in "${gostuff[@]}"
 890 do
 891     do_test "$g" go
 892 done
 893
 894 test_workbench_units() {
 895     start_nginx_proxy_services \
 896         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 897         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 898 }
 899 do_test apps/workbench_units workbench_units
 900
 901 test_workbench_functionals() {
 902     start_nginx_proxy_services \
 903         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 904         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 905 }
 906 do_test apps/workbench_functionals workbench_functionals
 907
 908 test_workbench_integration() {
 909     start_nginx_proxy_services \
 910         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 911         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 912 }
 913 do_test apps/workbench_integration workbench_integration
 914
 915
 916 test_workbench_benchmark() {
 917     start_nginx_proxy_services \
 918         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 919         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
 920 }
 921 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
 922
 923 test_workbench_profile() {
 924     start_nginx_proxy_services \
 925         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 926         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
 927 }
 928 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
 929
 930 exit_cleanly