sdk/cwl/tests/federation/arvboxcwl/start.cwl

   1 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   2 #
   3 # SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
   4
   5 cwlVersion: v1.1
   6 class: CommandLineTool
   7 $namespaces:
   8   arv: "http://arvados.org/cwl#"
   9   cwltool: "http://commonwl.org/cwltool#"
  10 inputs:
  11   container_name: string
  12   arvbox_data: Directory
  13   arvbox_bin: File
  14   branch:
  15     type: string
  16     default: master
  17   arvbox_mode:
  18     type: string?
  19     default: "dev"
  20 outputs:
  21   cluster_id:
  22     type: string
  23     outputBinding:
  24       glob: status.txt
  25       loadContents: true
  26       outputEval: |
  27         ${
  28         var sp = self[0].contents.split("\n");
  29         for (var i = 0; i < sp.length; i++) {
  30           if (sp[i].startsWith("Cluster id: ")) {
  31             return sp[i].substr(12);
  32           }
  33         }
  34         }
  35   container_host:
  36     type: string
  37     outputBinding:
  38       glob: status.txt
  39       loadContents: true
  40       outputEval: |
  41         ${
  42         var sp = self[0].contents.split("\n");
  43         for (var i = 0; i < sp.length; i++) {
  44           if (sp[i].startsWith("Container IP: ")) {
  45             return sp[i].substr(14)+":8000";
  46           }
  47         }
  48         }
  49   superuser_token:
  50     type: string
  51     outputBinding:
  52       glob: superuser_token.txt
  53       loadContents: true
  54       outputEval: $(self[0].contents.trim())
  55   arvbox_data_out:
  56     type: Directory
  57     outputBinding:
  58       outputEval: $(inputs.arvbox_data)
  59 requirements:
  60   EnvVarRequirement:
  61     envDef:
  62       ARVBOX_CONTAINER: $(inputs.container_name)
  63       ARVBOX_DATA: $(inputs.arvbox_data.path)
  64   ShellCommandRequirement: {}
  65   InitialWorkDirRequirement:
  66     listing:
  67       - entry: $(inputs.arvbox_data)
  68         entryname: $(inputs.container_name)
  69         writable: true
  70   InplaceUpdateRequirement:
  71     inplaceUpdate: true
  72   InlineJavascriptRequirement: {}
  73 arguments:
  74   - shellQuote: false
  75     valueFrom: |
  76       set -ex
  77       if test $(inputs.arvbox_mode) = dev ; then
  78         mkdir -p $ARVBOX_DATA
  79         if ! test -d $ARVBOX_DATA/arvados ; then
  80           cd $ARVBOX_DATA
  81           git clone https://git.arvados.org/arvados.git
  82         fi
  83         cd $ARVBOX_DATA/arvados
  84         gitver=`git rev-parse HEAD`
  85         git fetch
  86         git checkout -f $(inputs.branch)
  87         git pull
  88         pulled=`git rev-parse HEAD`
  89         git --no-pager log -n1 $pulled
  90       else
  91         export ARVBOX_BASE=$(runtime.tmpdir)
  92         unset ARVBOX_DATA
  93       fi
  94       cd $(runtime.outdir)
  95       if test "$gitver" = "$pulled" ; then
  96         $(inputs.arvbox_bin.path) start $(inputs.arvbox_mode)
  97       else
  98         $(inputs.arvbox_bin.path) restart $(inputs.arvbox_mode)
  99       fi
 100       $(inputs.arvbox_bin.path) status > status.txt
 101       $(inputs.arvbox_bin.path) cat /var/lib/arvados-arvbox/superuser_token > superuser_token.txt