tools/salt-install/tests/run-test.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
   5
   6 export ARVADOS_API_TOKEN=changemesystemroottoken
   7 export ARVADOS_API_HOST=__CLUSTER__.__DOMAIN__:__HOST_SSL_PORT__
   8 export ARVADOS_API_HOST_INSECURE=true
   9
  10
  11 # https://doc.arvados.org/v2.0/install/install-jobs-image.html
  12 echo "Creating Arvados Standard Docker Images project"
  13 uuid_prefix=$(arv --format=uuid user current | cut -d- -f1)
  14 project_uuid=$(arv --format=uuid group list --filters '[["name", "=", "Arvados Standard Docker Images"]]')
  15
  16 if [ "x${project_uuid}" = "x" ]; then
  17   project_uuid=$(arv --format=uuid group create --group "{\"owner_uuid\": \"${uuid_prefix}-tpzed-000000000000000\", \"group_class\":\"project\", \"name\":\"Arvados Standard Docker Images\"}")
  18
  19   read -rd $'\000' newlink <<EOF; arv link create --link "${newlink}"
  20 {
  21   "tail_uuid":"${uuid_prefix}-j7d0g-fffffffffffffff",
  22   "head_uuid":"${project_uuid}",
  23   "link_class":"permission",
  24   "name":"can_read"
  25 }
  26 EOF
  27 fi
  28
  29 echo "Arvados project uuid is '${project_uuid}'"
  30
  31 echo "Uploading arvados/jobs' docker image to the project"
  32 VERSION="2.1.1"
  33 arv-keepdocker --pull arvados/jobs "${VERSION}" --project-uuid "${project_uuid}"
  34
  35 # Create the initial user
  36 echo "Creating initial user '__INITIAL_USER__'"
  37 user_uuid=$(arv --format=uuid user list --filters '[["email", "=", "__INITIAL_USER_EMAIL__"], ["username", "=", "__INITIAL_USER__"]]')
  38
  39 if [ "x${user_uuid}" = "x" ]; then
  40   user_uuid=$(arv --format=uuid user create --user '{"email": "__INITIAL_USER_EMAIL__", "username": "__INITIAL_USER__"}')
  41   echo "Setting up user '__INITIAL_USER__'"
  42   arv user setup --uuid "${user_uuid}"
  43 fi
  44
  45 echo "Activating user '__INITIAL_USER__'"
  46 arv user update --uuid "${user_uuid}" --user '{"is_active": true}'
  47
  48 echo "Getting the user API TOKEN"
  49 user_api_token=$(arv api_client_authorization list --filters "[[\"owner_uuid\", \"=\", \"${user_uuid}\"],[\"kind\", \"==\", \"arvados#apiClientAuthorization\"]]" --limit=1 |jq -r .items[].api_token)
  50
  51 if [ "x${user_api_token}" = "x" ]; then
  52   user_api_token=$(arv api_client_authorization create --api-client-authorization "{\"owner_uuid\": \"${user_uuid}\"}" | jq -r .api_token)
  53 fi
  54
  55 # Change to the user's token and run the workflow
  56 export ARVADOS_API_TOKEN="${user_api_token}"
  57
  58 echo "Running test CWL workflow"
  59 cwl-runner hasher-workflow.cwl hasher-workflow-job.yml