apps/workbench/app/views/collections/show.html.erb

   1 <%= content_for :css do %>
   2 <%# https://github.com/mbostock/d3/wiki/Ordinal-Scales %>
   3 <% n=-1; %w(#1f77b4 #ff7f0e #2ca02c #d62728 #9467bd #8c564b #e377c2 #7f7f7f #bcbd22 #17becf).each do |color| %>
   4 .colorseries-10-<%= n += 1 %>, .btn.colorseries-10-<%= n %>:hover, .label.colorseries-10-<%= n %>:hover {
   5   *background-color: <%= color %>;
   6   background-color: <%= color %>;
   7   background-image: none;
   8 }
   9 <% end %>
  10 .colorseries-nil { }
  11 .label a {
  12   color: inherit;
  13 }
  14 #provenance_graph {
  15  padding-left: 3px;
  16  overflow:auto;
  17  border:solid;
  18  border-width:1px;
  19  border-color: gray;
  20  position: absolute;
  21  left: 1px;
  22 }
  23 <% end %>
  24
  25 <%#= render :partial => 'nav' %>
  26
  27 <div class="tabbable">
  28 <ul class="nav nav-tabs">
  29   <li class="active"><a href="#files" data-toggle="tab">Files (<%= @object.files ? @object.files.size : 0 %>)</a></li>
  30   <li><a href="#provenance" data-toggle="tab">Provenance (<%= @provenance.size %>)</a></li>
  31   <li><a href="#jobs" data-toggle="tab">Jobs (<%= @provenance.size %>)</a></li>
  32   <li><a href="#sourcedata" data-toggle="tab">Source data (<%= @sourcedata.size %>)</a></li>
  33   <li><a href="#owner-groups-resources" data-toggle="tab">Owner, groups, resources</a></li>
  34   <li><a href="#provenance2" data-toggle="tab" id="prov-tab">Provenance graph</a></li>
  35   <li><a href="#used-by" data-toggle="tab">Used by</a></li>
  36 </ul>
  37
  38 <div class="tab-content">
  39   <div id="files" class="tab-pane fade in active">
  40     <table class="table table-bordered" style="table-layout: fixed">
  41       <thead>
  42         <tr>
  43           <th>path</th>
  44           <th>file</th>
  45           <th style="width:1.5em">d/l</th>
  46           <th style="width: 7em; text-align:right">size</th>
  47         </tr>
  48       </thead><tbody>
  49         <% if @object then @object.files.sort_by{|f|f[1]}.each do |file| %>
  50         <% file_path = "#{file[0]}/#{file[1]}" %>
  51         <tr>
  52           <td>
  53             <%= file[0] %>
  54           </td>
  55
  56           <td>
  57             <%= link_to file[1], {controller: 'collections', action: 'show_file', uuid: @object.uuid, file: file_path, size: file[2], disposition: 'inline'}, {title: 'View in browser'} %>
  58           </td>
  59
  60           <td>
  61             <div style="display:inline-block">
  62             <%= link_to raw('<i class="icon-download"></i>'), {controller: 'collections', action: 'show_file', uuid: @object.uuid, file: file_path, size: file[2], disposition: 'attachment'}, {class: 'label label-info', title: 'Download'} %>
  63             </div>
  64           </td>
  65
  66           <td style="text-align:right">
  67             <%= raw(human_readable_bytes_html(file[2])) %>
  68           </td>
  69
  70         </tr>
  71         <% end; end %>
  72       </tbody>
  73     </table>
  74   </div>
  75   <div id="provenance" class="tab-pane fade">
  76     <table class="topalign table table-bordered">
  77       <thead>
  78       </thead>
  79       <tbody>
  80
  81         <% @provenance.reverse.each do |p| %>
  82         <% j = p[:job] %>
  83
  84         <% if j %>
  85
  86         <tr class="job">
  87           <td style="padding-bottom: 3em">
  88             <table class="table" style="margin-bottom: 0; background: #f0f0ff">
  89               <% j.script_parameters.each do |k,v| %>
  90               <tr>
  91                 <td style="width: 20%">
  92                   <%= k.to_s %>
  93                 </td><td style="width: 60%">
  94                   <% if v and @output2job.has_key? v %>
  95                   <tt class="label colorseries-10-<%= @output2colorindex[v] %>"><%= link_to_if_arvados_object v %></tt>
  96                   <% else %>
  97                   <span class="deemphasize"><%= link_to_if_arvados_object v %></span>
  98                   <% end %>
  99                 </td><td style="text-align: center; width: 20%">
 100                   <% if v
 101                        if @protected[v]
 102                          labelclass = 'success'
 103                          labeltext = 'keep'
 104                        else
 105                          labelclass = @output2job.has_key?(v) ? 'warning' : 'danger'
 106                          labeltext = 'cache'
 107                        end %>
 108
 109                   <tt class="label label-<%= labelclass %>"><%= labeltext %></tt>
 110                   <% end %>
 111                 </td>
 112               </tr>
 113               <% end %>
 114             </table>
 115             <div style="text-align: center">
 116               &darr;
 117               <br />
 118               <span class="label"><%= j.script %><br /><tt><%= link_to_if j.script_version.match(/[0-9a-f]{40}/), j.script_version, "https://arvados.org/projects/arvados/repository/revisions/#{j.script_version}/entry/crunch_scripts/#{j.script}" if j.script_version %></tt></span>
 119               <br />
 120               &darr;
 121               <br />
 122               <tt class="label colorseries-10-<%= @output2colorindex[p[:output]] %>"><%= link_to_if_arvados_object p[:output] %></tt>
 123             </div>
 124           </td>
 125           <td>
 126             <tt><span class="deemphasize">job:</span><br /><%= link_to_if_arvados_object j %><br /><span class="deemphasize"><%= j.submit_id %></span></tt>
 127           </td>
 128         </tr>
 129
 130         <% else %>
 131         <tr>
 132           <td>
 133             <span class="label label-danger">lookup fail</span>
 134             <br />
 135             <tt class="deemphasize"><%= p[:target] %></tt>
 136           </td><td colspan="5">
 137           </td>
 138         </tr>
 139         <% end %>
 140
 141         <% end %>
 142
 143       </tbody>
 144     </table>
 145   </div>
 146   <div id="provenance2" class="tab-pane fade">
 147   <script>
 148     function provenance_sizing_fixup() {
 149       var a = document.getElementById("provenance_graph");
 150       a.style.height = String(window.innerHeight - (a.getBoundingClientRect().top + window.scrollY) - 2) + "px";
 151       a.style.width = String(window.innerWidth - 10) + "px";
 152     }
 153     $(window).resize(provenance_sizing_fixup);
 154
 155     function graph_zoom(scale) {
 156       var pg = document.getElementById("provenance_graph");
 157       vcenter = (pg.scrollTop + (pg.scrollHeight - pg.scrollTopMax)/2.0) / pg.scrollHeight;
 158       hcenter = (pg.scrollLeft + (pg.scrollWidth - pg.scrollLeftMax)/2.0) / pg.scrollWidth;
 159       var g = document.getElementById("graph1").parentNode;
 160       g.setAttribute("height", parseFloat(g.getAttribute("height")) * scale);
 161       g.setAttribute("width", parseFloat(g.getAttribute("width")) * scale);
 162       pg.scrollTop = (vcenter * pg.scrollHeight) - (pg.scrollHeight - pg.scrollTopMax)/2.0;
 163       pg.scrollLeft = (hcenter * pg.scrollWidth) - (pg.scrollWidth - pg.scrollLeftMax)/2.0;
 164     }
 165
 166     $(function() {
 167       $('#prov-tab').on('shown', provenance_sizing_fixup);
 168     })
 169   </script>
 170   <div style="text-align: right">
 171   <a href="#"><span class="icon-zoom-out" onclick="graph_zoom(.9)"></span></a>
 172   <a href="#"><span class="icon-zoom-in" onclick="graph_zoom(1./.9)"></span></a>
 173   </div>
 174
 175   <div id="provenance_graph">
 176       <%= raw(@prov_svg) %>
 177   </div>
 178   </div>
 179   <div id="jobs" class="tab-pane fade">
 180     <table class="topalign table table-bordered">
 181       <thead>
 182         <tr class="contain-align-left">
 183           <th>
 184             job
 185           </th><th>
 186             version
 187           </th><th>
 188             status
 189           </th><th>
 190             start
 191           </th><th>
 192             finish
 193           </th><th>
 194             clock time
 195           </th>
 196         </tr>
 197       </thead>
 198       <tbody>
 199
 200         <% @provenance.reverse.each do |p| %>
 201         <% j = p[:job] %>
 202
 203         <% if j %>
 204
 205         <tr class="job">
 206           <td>
 207             <tt><%= j.uuid %></tt>
 208             <br />
 209             <tt class="deemphasize"><%= j.submit_id %></tt>
 210           </td><td>
 211             <%= j.script_version %>
 212           </td><td>
 213             <span class="label <%= if j.success then 'label-success'; elsif j.running then 'label-primary'; else 'label-warning'; end %>">
 214               <%= j.success || j.running ? 'ok' : 'failed' %>
 215             </span>
 216           </td><td>
 217             <%= j.started_at %>
 218           </td><td>
 219             <%= j.finished_at %>
 220           </td><td>
 221             <% if j.started_at and j.finished_at %>
 222             <%= raw(distance_of_time_in_words(j.started_at, j.finished_at).sub('about ','~').sub(' ','&nbsp;')) %>
 223             <% elsif j.started_at and j.running %>
 224             <%= raw(distance_of_time_in_words(j.started_at, Time.now).sub('about ','~').sub(' ','&nbsp;')) %> (running)
 225             <% end %>
 226           </td>
 227         </tr>
 228
 229         <% else %>
 230         <tr>
 231           <td>
 232             <span class="label label-danger">lookup fail</span>
 233             <br />
 234             <tt class="deemphasize"><%= p[:target] %></tt>
 235           </td><td colspan="4">
 236           </td>
 237         </tr>
 238         <% end %>
 239
 240         <% end %>
 241
 242       </tbody>
 243     </table>
 244   </div>
 245   <div id="sourcedata" class="tab-pane fade">
 246     <table class="table table-bordered table-striped">
 247       <thead>
 248         <tr class="contain-align-left">
 249           <th>
 250             collection
 251           </th><th class="data-size">
 252             data size
 253           </th><th>
 254             storage
 255           </th><th>
 256             origin
 257           </th>
 258         </tr>
 259       </thead>
 260       <tbody>
 261
 262         <% @sourcedata.values.each do |sourcedata| %>
 263
 264         <tr class="collection">
 265           <td>
 266             <tt class="label"><%= sourcedata[:uuid] %></tt>
 267           </td><td class="data-size">
 268             <%= raw(human_readable_bytes_html(sourcedata[:collection].data_size)) if sourcedata[:collection] and sourcedata[:collection].data_size %>
 269           </td><td>
 270             <% if @protected[sourcedata[:uuid]] %>
 271             <span class="label label-success">keep</span>
 272             <% else %>
 273             <span class="label label-danger">cache</span>
 274             <% end %>
 275           </td><td>
 276             <% if sourcedata[:data_origins] %>
 277             <% sourcedata[:data_origins].each do |data_origin| %>
 278             <span class="deemphasize"><%= data_origin[0] %></span>
 279             <%= data_origin[2] %>
 280             <br />
 281             <% end %>
 282             <% end %>
 283           </td>
 284         </tr>
 285
 286         <% end %>
 287
 288       </tbody>
 289     </table>
 290   </div>
 291   <div id="owner-groups-resources" class="tab-pane fade">
 292     <%= render :partial => 'application/arvados_object' %>
 293   </div>
 294 </div>
 295 </div>