docker/arvdock

   1 #!/bin/bash
   2
   3 DOCKER=`which docker.io`
   4
   5 if [[ "$DOCKER" == "" ]]; then
   6     DOCKER=`which docker`
   7 fi
   8
   9 CURL=`which curl`
  10
  11 COMPUTE_COUNTER=0
  12
  13 function usage {
  14     echo >&2
  15     echo >&2 "usage: $0 (start|stop|restart|reset|test) [options]"
  16     echo >&2
  17     echo >&2 "start    run new or restart stopped arvados containers"
  18     echo >&2 "stop     stop arvados containers"
  19     echo >&2 "restart  stop and then start arvados containers"
  20     echo >&2 "reset    stop and delete containers WARNING: this will delete the data inside Arvados!"
  21     echo >&2 "test     run tests"
  22     echo >&2
  23     echo >&2 "$0 options:"
  24     echo >&2 "  -d[port], --doc[=port]        Documentation server (default port 9898)"
  25     echo >&2 "  -w[port], --workbench[=port]  Workbench server (default port 9899)"
  26     echo >&2 "  -s[port], --sso[=port]        SSO server (default port 9901)"
  27     echo >&2 "  -a[port], --api[=port]        API server (default port 9900)"
  28     echo >&2 "  -c, --compute                 Compute nodes (starts 2)"
  29     echo >&2 "  -v, --vm                      Shell server"
  30     echo >&2 "  -n, --nameserver              Nameserver"
  31     echo >&2 "  -k, --keep                    Keep servers"
  32     echo >&2 "  -p, --keepproxy               Keepproxy server"
  33     echo >&2 "  -h, --help                    Display this help and exit"
  34     echo >&2
  35     echo >&2 "  If no options are given, the action is applied to all servers."
  36     echo >&2
  37     echo >&2 "$0 test [testname] [testname] ..."
  38     echo >&2 "  By default, all tests are run."
  39 }
  40
  41 function ip_address {
  42     local container=$1
  43     echo `$DOCKER inspect $container  |grep IPAddress |cut -f4 -d\"`
  44 }
  45
  46 function start_container {
  47     local args="-d -i -t"
  48     if [[ "$1" != '' ]]; then
  49       local port="$1"
  50       args="$args -p $port"
  51     fi
  52     if [[ "$2" != '' ]]; then
  53       local name="$2"
  54       if [[ "$name" == "api_server" ]]; then
  55         args="$args --dns=172.17.42.1 --dns-search=compute.dev.arvados --hostname api -P --name $name"
  56       elif [[ "$name" == "compute" ]]; then
  57         name=$name$COMPUTE_COUNTER
  58         # We need --privileged because we run docker-inside-docker on the compute nodes
  59         args="$args --dns=172.17.42.1 --dns-search=compute.dev.arvados --hostname compute$COMPUTE_COUNTER -P --privileged --name $name"
  60         let COMPUTE_COUNTER=$(($COMPUTE_COUNTER + 1))
  61       else
  62         args="$args --dns=172.17.42.1 --dns-search=dev.arvados --hostname ${name#_server} --name $name"
  63       fi
  64     fi
  65     if [[ "$3" != '' ]]; then
  66       local volume="$3"
  67       args="$args --volumes-from $volume"
  68     fi
  69     if [[ "$4" != '' ]]; then
  70       local link="$4"
  71       args="$args --link $link"
  72     fi
  73     local image=$5
  74
  75     `$DOCKER ps |grep -P "$name[^/]" -q`
  76     if [[ "$?" == "0" ]]; then
  77       echo "You have a running container with name $name -- skipping."
  78       return
  79     fi
  80
  81     echo "Starting container: $name"
  82     `$DOCKER ps --all |grep -P "$name[^/]" -q`
  83     if [[ "$?" == "0" ]]; then
  84         echo "  $DOCKER start $name"
  85         container=`$DOCKER start $name`
  86     else
  87         echo "  $DOCKER run $args $image"
  88         container=`$DOCKER run $args $image`
  89     fi
  90
  91     if [ "$?" != "0" -o "$container" = "" ]; then
  92       echo "Unable to start container"
  93       exit 1
  94     else
  95       echo "Started container: $container"
  96     fi
  97
  98 }
  99
 100 # Create a Docker data volume
 101 function make_keep_volumes () {
 102     `$DOCKER ps --all |grep -P "keep_data[^/]" -q`
 103     if [[ "$?" == "0" ]]; then
 104       return
 105     fi
 106     docker create -v /keep-data --name keep_data arvados/keep
 107 }
 108
 109 function do_start {
 110     local start_doc=false
 111     local start_sso=false
 112     local start_api=false
 113     local start_compute=false
 114     local start_workbench=false
 115     local start_vm=false
 116     local start_nameserver=false
 117     local start_keep=false
 118     local start_keepproxy=false
 119     local
 120
 121     # NOTE: This requires GNU getopt (part of the util-linux package on Debian-based distros).
 122     local TEMP=`getopt -o d::s::a::cw::nkpvh \
 123                   --long doc::,sso::,api::,compute,workbench::,nameserver,keep,keepproxy,vm,help \
 124                   -n "$0" -- "$@"`
 125
 126     if [ $? != 0 ] ; then echo "Use -h for help"; exit 1 ; fi
 127
 128     # Note the quotes around `$TEMP': they are essential!
 129     eval set -- "$TEMP"
 130
 131     while [ $# -ge 1 ]
 132     do
 133         case $1 in
 134             -d | --doc)
 135                 case "$2" in
 136                     "") start_doc=9898; shift 2 ;;
 137                     *)  start_doc=$2; shift 2 ;;
 138                 esac
 139                 ;;
 140             -s | --sso)
 141                 case "$2" in
 142                     "") start_sso=9901; shift 2 ;;
 143                     *)  start_sso=$2; shift 2 ;;
 144                 esac
 145                 ;;
 146             -a | --api)
 147                 case "$2" in
 148                     "") start_api=9900; shift 2 ;;
 149                     *)  start_api=$2; shift 2 ;;
 150                 esac
 151                 ;;
 152             -c | --compute)
 153                 start_compute=2
 154                 shift
 155                 ;;
 156             -w | --workbench)
 157                 case "$2" in
 158                     "") start_workbench=9899; shift 2 ;;
 159                     *)  start_workbench=$2; shift 2 ;;
 160                 esac
 161                 ;;
 162             -v | --vm)
 163                 start_vm=true
 164                 shift
 165                 ;;
 166             -n | --nameserver)
 167                 start_nameserver=true
 168                 shift
 169                 ;;
 170             -k | --keep)
 171                 start_keep=true
 172                 shift
 173                 ;;
 174             -p | --keepproxy)
 175                 start_keepproxy=true
 176                 shift
 177                 ;;
 178             --)
 179                 shift
 180                 break
 181                 ;;
 182             *)
 183                 usage
 184                 exit 1
 185                 ;;
 186         esac
 187     done
 188
 189     # If no options were selected, then start all servers.
 190     if [[ $start_doc == false &&
 191           $start_sso == false &&
 192           $start_api == false &&
 193           $start_compute == false &&
 194           $start_workbench == false &&
 195           $start_vm == false &&
 196           $start_nameserver == false &&
 197           $start_keep == false &&
 198           $start_keepproxy == false ]]
 199     then
 200         start_doc=9898
 201         #the sso server is currently not used by default so don't start it unless explicitly requested
 202         #start_sso=9901
 203         start_api=9900
 204         start_compute=2
 205         start_workbench=9899
 206         start_vm=true
 207         start_nameserver=true
 208         start_keep=true
 209         start_keepproxy=true
 210     fi
 211
 212     if [[ $start_nameserver != false ]]
 213     then
 214       # We rely on skydock and skydns for dns discovery between the slurm controller and compute nodes,
 215       # so make sure they are running
 216       $DOCKER ps | grep skydns >/dev/null
 217       if [[ "$?" != "0" ]]; then
 218         echo "Starting crosbymichael/skydns container..."
 219         $DOCKER rm "skydns" 2>/dev/null
 220         echo $DOCKER run -d -p 172.17.42.1:53:53/udp --name skydns crosbymichael/skydns -nameserver 8.8.8.8:53 -domain arvados
 221         $DOCKER run -d -p 172.17.42.1:53:53/udp --name skydns crosbymichael/skydns -nameserver 8.8.8.8:53 -domain arvados
 222       fi
 223       $DOCKER ps | grep skydock >/dev/null
 224       if [[ "$?" != "0" ]]; then
 225         echo "Starting crosbymichael/skydock container..."
 226         $DOCKER rm "skydock" 2>/dev/null
 227         echo $DOCKER run -d -v /var/run/docker.sock:/docker.sock --name skydock crosbymichael/skydock -ttl 30 -environment dev -s /docker.sock -domain arvados -name skydns
 228         $DOCKER run -d -v /var/run/docker.sock:/docker.sock --name skydock crosbymichael/skydock -ttl 30 -environment dev -s /docker.sock -domain arvados -name skydns
 229       fi
 230     fi
 231
 232     if [[ $start_sso != false ]]
 233     then
 234         start_container "$start_sso:443" "sso_server" '' '' "arvados/sso"
 235     fi
 236
 237     if [[ $start_api != false ]]
 238     then
 239       if [[ $start_sso != false ]]; then
 240         start_container "$start_api:443" "api_server" '' "sso_server:sso" "arvados/api"
 241       else
 242         start_container "$start_api:443" "api_server" '' '' "arvados/api"
 243       fi
 244     fi
 245
 246     if [[ $start_compute != false ]]
 247     then
 248         for i in `seq 0 $(($start_compute - 1))`; do
 249           start_container "" "compute" '' "api_server:api" "arvados/compute"
 250         done
 251     fi
 252
 253     if [[ $start_keep != false ]]
 254     then
 255         # create `keep_volumes' array with a list of keep mount points
 256         # remove any stale metadata from those volumes before starting them
 257         make_keep_volumes
 258         start_container "25107:25107" "keep_server_0" \
 259             "keep_data" \
 260             "api_server:api" \
 261             "arvados/keep"
 262         start_container "25108:25107" "keep_server_1" \
 263             "keep_data" \
 264             "api_server:api" \
 265             "arvados/keep"
 266     fi
 267
 268     if [[ $start_keepproxy != false ]]
 269     then
 270         start_container "9902:9100" "keepproxy_server" '' \
 271             "api_server:api" \
 272             "arvados/keepproxy"
 273     fi
 274
 275     if [[ $start_doc != false ]]
 276     then
 277         start_container "$start_doc:80" "doc_server" '' '' "arvados/doc"
 278     fi
 279
 280     if [[ $start_vm != false ]]
 281     then
 282         start_container "" "shell" '' "api_server:api" "arvados/shell"
 283     fi
 284
 285     if [[ $start_workbench != false ]]
 286     then
 287         start_container "$start_workbench:80" "workbench_server" '' "api_server:api" "arvados/workbench"
 288     fi
 289
 290     if [[ $start_api != false ]]
 291     then
 292         if [[ -f "api/generated/superuser_token" ]]
 293         then
 294           if [ -d $HOME/.config/arvados ] || mkdir -p $HOME/.config/arvados
 295           then
 296             cat >$HOME/.config/arvados/settings.conf <<EOF
 297 ARVADOS_API_HOST=$(ip_address "api_server")
 298 ARVADOS_API_HOST_INSECURE=yes
 299 ARVADOS_API_TOKEN=$(cat api/generated/superuser_token)
 300 EOF
 301           fi
 302         fi
 303     fi
 304
 305     if [ "$(awk '($1 == "nameserver"){print $2; exit}' </etc/resolv.conf)" != "172.17.42.1" ]; then
 306         echo
 307         echo "******************************************************************"
 308         echo "To access Arvados you must add the Arvados nameserver to the top"
 309         echo "of your DNS configuration in /etc/resolv.conf:"
 310         echo "nameserver 172.17.42.1"
 311         echo
 312         echo "Then run '$0 start' again"
 313         echo "******************************************************************"
 314         echo
 315     else
 316         while ! $CURL -L -f http://workbench.dev.arvados >/dev/null 2>/dev/null ; do
 317             echo "Waiting for Arvados to be ready."
 318             sleep 1
 319         done
 320
 321         `$DOCKER ps |grep -P "doc_server[^/]" -q`
 322         if [[ "$?" == "0" ]]; then
 323             echo
 324             echo "******************************************************************"
 325             echo "You can access the Arvados documentation at http://doc.dev.arvados"
 326             echo "******************************************************************"
 327             echo
 328         fi
 329
 330         `$DOCKER ps |grep -P "workbench_server[^/]" -q`
 331         if [[ "$?" == "0" ]]; then
 332             echo
 333             echo "********************************************************************"
 334             echo "You can access the Arvados workbench at http://workbench.dev.arvados"
 335             echo "********************************************************************"
 336             echo
 337         fi
 338     fi
 339
 340 }
 341
 342 function do_stop {
 343     local stop_doc=""
 344     local stop_sso=""
 345     local stop_api=""
 346     local stop_compute=""
 347     local stop_workbench=""
 348     local stop_nameserver=""
 349     local stop_vm=""
 350     local stop_keep=""
 351     local stop_keepproxy=""
 352
 353     # NOTE: This requires GNU getopt (part of the util-linux package on Debian-based distros).
 354     local TEMP=`getopt -o dsacwnkpvh \
 355                   --long doc,sso,api,compute,workbench,nameserver,keep,keepproxy,vm,help \
 356                   -n "$0" -- "$@"`
 357
 358     if [ $? != 0 ] ; then echo "Use -h for help"; exit 1 ; fi
 359
 360     # Note the quotes around `$TEMP': they are essential!
 361     eval set -- "$TEMP"
 362
 363     while [ $# -ge 1 ]
 364     do
 365         case $1 in
 366             -d | --doc)
 367                 stop_doc=doc_server ; shift ;;
 368             -s | --sso)
 369                 stop_sso=sso_server ; shift ;;
 370             -a | --api)
 371                 stop_api=api_server ; shift ;;
 372             -c | --compute)
 373                 stop_compute=`$DOCKER ps |grep -P "compute\d+" |grep -v api_server |cut -f1 -d ' '` ; shift ;;
 374             -w | --workbench)
 375                 stop_workbench=workbench_server ; shift ;;
 376             -n | --nameserver )
 377                 stop_nameserver="skydock skydns" ; shift ;;
 378             -v | --vm )
 379                 stop_vm="shell" ; shift ;;
 380             -k | --keep )
 381                 stop_keep="keep_server_0 keep_server_1" ; shift ;;
 382             -p | --keepproxy )
 383                 stop_keep="keepproxy_server" ; shift ;;
 384             --)
 385                 shift
 386                 break
 387                 ;;
 388             *)
 389                 usage
 390                 exit 1
 391                 ;;
 392         esac
 393     done
 394
 395     # If no options were selected, then stop all servers.
 396     if [[ $stop_doc == "" &&
 397           $stop_sso == "" &&
 398           $stop_api == "" &&
 399           $stop_compute == "" &&
 400           $stop_workbench == "" &&
 401           $stop_vm == "" &&
 402           $stop_nameserver == "" &&
 403           $stop_keep == "" &&
 404           $stop_keepproxy == "" ]]
 405     then
 406         stop_doc=doc_server
 407         stop_sso=sso_server
 408         stop_api=api_server
 409         stop_compute=`$DOCKER ps |grep -P "compute\d+" |grep -v api_server |cut -f1 -d ' '`
 410         stop_workbench=workbench_server
 411         stop_vm=shell
 412         stop_nameserver="skydock skydns"
 413         stop_keep="keep_server_0 keep_server_1"
 414         stop_keepproxy="keepproxy_server"
 415     fi
 416
 417     $DOCKER stop $stop_doc $stop_sso $stop_api $stop_compute $stop_workbench $stop_nameserver $stop_keep $stop_keepproxy $stop_vm \
 418         2>/dev/null
 419 }
 420
 421 function do_test {
 422     local alltests
 423     if [ $# -lt 1 ]
 424     then
 425         alltests="python-sdk api"
 426     else
 427         alltests="$@"
 428     fi
 429
 430     for testname in $alltests
 431     do
 432         echo "testing $testname..."
 433         case $testname in
 434             python-sdk)
 435                 do_start --api --keep --sso
 436                 export ARVADOS_API_HOST=$(ip_address "api_server")
 437                 export ARVADOS_API_HOST_INSECURE=yes
 438                 export ARVADOS_API_TOKEN=$(cat api/generated/superuser_token)
 439                 python -m unittest discover ../sdk/python
 440                 ;;
 441             api)
 442                 $DOCKER run -t -i arvados/api \
 443                     /usr/src/arvados/services/api/script/rake_test.sh
 444                 ;;
 445             *)
 446                 echo >&2 "unknown test $testname"
 447                 ;;
 448         esac
 449     done
 450 }
 451
 452 function do_reset {
 453     for name in skydock skydns workbench_server shell doc_server keepproxy_server keep_server_0 keep_server_1 compute0 compute1 api_server keepproxy keep_data
 454     do
 455         `$DOCKER ps |grep -P "$name[^/]" -q`
 456         if [[ "$?" == "0" ]]; then
 457             echo "  $DOCKER stop $name"
 458             $DOCKER stop $name
 459         fi
 460         `$DOCKER ps --all |grep -P "$name[^/]" -q`
 461         if [[ "$?" == "0" ]]; then
 462             echo "  $DOCKER rm $name"
 463             $DOCKER rm $name
 464         fi
 465     done
 466 }
 467
 468 if [ "$DOCKER" == '' ]
 469 then
 470   echo "Docker not found. Please install it first."
 471   exit 2
 472 fi
 473
 474 if [ "$CURL" == '' ]
 475 then
 476   echo "Curl not found. Please install it first."
 477   exit 3
 478 fi
 479
 480 if [ $# -lt 1 ]
 481 then
 482   usage
 483   exit 1
 484 fi
 485
 486 case $1 in
 487     start)
 488         shift
 489         do_start $@
 490         ;;
 491     stop)
 492         shift
 493         do_stop $@
 494         ;;
 495     restart)
 496         shift
 497         do_stop $@
 498         do_start $@
 499         ;;
 500     test)
 501         shift
 502         do_test $@
 503         ;;
 504     reset)
 505         shift
 506         do_reset $@
 507         ;;
 508     *)
 509         usage
 510         exit 1
 511         ;;
 512 esac