build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2
   3 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin
   4
   5 COLUMNS=80
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
   7
   8 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
   9 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  10
  11 Exit non-zero if any tests fail.
  12
  13 Syntax:
  14         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  15
  16 Options:
  17
  18 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  19 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  20 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  21                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  22 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  23                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  24                subsequent invocations.
  25 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
  26                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  27                from a previous invocation if you use this option.
  28 --only-install Run specific install step
  29 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  30 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  31 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  32                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  33 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  34                Restrict apiserver tests to the given file
  35 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
  36                Restrict Python SDK tests to the given class
  37 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  38                Restrict Workbench tests to the given file
  39 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  40                Show all log messages, even when tests pass (also works
  41                with services/keepstore_test etc.)
  42 ARVADOS_DEBUG=1
  43                Print more debug messages
  44 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  45                *_test, and other examples shown above.
  46
  47 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
  48 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  49 test suites depend on other components being installed, and installing
  50 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  51
  52 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  53 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  54
  55 More information and background:
  56
  57 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  58
  59 Available tests:
  60
  61 apps/workbench (*)
  62 apps/workbench_units (*)
  63 apps/workbench_functionals (*)
  64 apps/workbench_integration (*)
  65 apps/workbench_benchmark
  66 apps/workbench_profile
  67 doc
  68 services/api
  69 services/arv-git-httpd
  70 services/crunchstat
  71 services/dockercleaner
  72 services/fuse
  73 services/keep-web
  74 services/keepproxy
  75 services/keepstore
  76 services/keep-balance
  77 services/login-sync
  78 services/nodemanager
  79 services/crunch-run
  80 services/crunch-dispatch-local
  81 services/crunch-dispatch-slurm
  82 services/ws
  83 sdk/cli
  84 sdk/pam
  85 sdk/python
  86 sdk/ruby
  87 sdk/go/arvados
  88 sdk/go/arvadosclient
  89 sdk/go/keepclient
  90 sdk/go/httpserver
  91 sdk/go/manifest
  92 sdk/go/blockdigest
  93 sdk/go/streamer
  94 sdk/go/crunchrunner
  95 sdk/cwl
  96 tools/crunchstat-summary
  97 tools/keep-exercise
  98 tools/keep-rsync
  99 tools/keep-block-check
 100
 101 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 102     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 103
 104 EOF
 105
 106 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 107 # environment that could interfere with the tests.
 108 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 109
 110 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 111 # accident.
 112 GITDIR=
 113 GOPATH=
 114 VENVDIR=
 115 VENV3DIR=
 116 PYTHONPATH=
 117 GEMHOME=
 118 PERLINSTALLBASE=
 119
 120 short=
 121 skip_install=
 122 temp=
 123 temp_preserve=
 124
 125 clear_temp() {
 126     if [[ -z "$temp" ]]; then
 127         # we didn't even get as far as making a temp dir
 128         :
 129     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 130         rm -rf "$temp"
 131     else
 132         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 133     fi
 134 }
 135
 136 fatal() {
 137     clear_temp
 138     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 139     exit 1
 140 }
 141
 142 exit_cleanly() {
 143     trap - INT
 144     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 145     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 146     stop_services
 147     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 148     report_outcomes
 149     clear_temp
 150     exit ${#failures}
 151 }
 152
 153 sanity_checks() {
 154     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 155         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 156     echo Checking dependencies:
 157     echo -n 'virtualenv: '
 158     virtualenv --version \
 159         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 160     echo -n 'go: '
 161     go version \
 162         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 163     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 7 ]] \
 164         || fatal "Go >= 1.7 required. See http://golang.org/doc/install"
 165     echo -n 'gcc: '
 166     gcc --version | egrep ^gcc \
 167         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 168     echo -n 'fuse.h: '
 169     find /usr/include -wholename '*fuse/fuse.h' \
 170         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 171     echo -n 'pyconfig.h: '
 172     find /usr/include -name pyconfig.h | egrep --max-count=1 . \
 173         || fatal "No pyconfig.h. Try: apt-get install python-dev"
 174     echo -n 'nginx: '
 175     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 176         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 177     echo -n 'perl: '
 178     perl -v | grep version \
 179         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 180     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 181         echo -n "perl $mod: "
 182         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 183             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 184     done
 185     echo -n 'gitolite: '
 186     which gitolite \
 187         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 188 }
 189
 190 rotate_logfile() {
 191   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 192   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 193   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 194     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 195     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 196     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 197   fi
 198 }
 199
 200 declare -a failures
 201 declare -A skip
 202 declare -A testargs
 203 skip[apps/workbench_profile]=1
 204
 205 while [[ -n "$1" ]]
 206 do
 207     arg="$1"; shift
 208     case "$arg" in
 209         --help)
 210             echo >&2 "$helpmessage"
 211             echo >&2
 212             exit 1
 213             ;;
 214         --skip)
 215             skipwhat="$1"; shift
 216             if [[ "$skipwhat" == "apps/workbench" ]]; then
 217               skip["apps/workbench_units"]=1
 218               skip["apps/workbench_functionals"]=1
 219               skip["apps/workbench_integration"]=1
 220             else
 221               skip[$skipwhat]=1
 222             fi
 223             ;;
 224         --only)
 225             only="$1"; skip[$1]=""; shift
 226             ;;
 227         --short)
 228             short=1
 229             ;;
 230         --skip-install)
 231             skip_install=1
 232             ;;
 233         --only-install)
 234             skip_install=1
 235             only_install="$1"; shift
 236             ;;
 237         --temp)
 238             temp="$1"; shift
 239             temp_preserve=1
 240             ;;
 241         --leave-temp)
 242             temp_preserve=1
 243             ;;
 244         --retry)
 245             retry=1
 246             ;;
 247         *_test=*)
 248             suite="${arg%%_test=*}"
 249             args="${arg#*=}"
 250             testargs["$suite"]="$args"
 251             ;;
 252         *=*)
 253             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 254             ;;
 255         *)
 256             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 257             exit 1
 258             ;;
 259     esac
 260 done
 261
 262 start_api() {
 263     echo 'Starting API server...'
 264     cd "$WORKSPACE" \
 265         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 266         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 267         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 268         && (env | egrep ^ARVADOS)
 269 }
 270
 271 start_nginx_proxy_services() {
 272     echo 'Starting keepproxy, keep-web, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
 273     cd "$WORKSPACE" \
 274         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 275         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 276         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 277         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 278         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1
 279 }
 280
 281 stop_services() {
 282     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES" ]]; then
 283         unset ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 284         cd "$WORKSPACE" \
 285             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 286             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 287             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 288             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy
 289     fi
 290     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 291         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 292         cd "$WORKSPACE" \
 293             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
 294     fi
 295 }
 296
 297 interrupt() {
 298     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 299     exit_cleanly
 300 }
 301 trap interrupt INT
 302
 303 sanity_checks
 304
 305 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 306
 307 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 308     # Jenkins expects us to use this by default.
 309     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 310 fi
 311
 312 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 313 cd "$WORKSPACE"
 314 find -name '*.pyc' -delete
 315
 316 if [[ -z "$temp" ]]; then
 317     temp="$(mktemp -d)"
 318 fi
 319
 320 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 321 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
 322 do
 323     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 324         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 325     fi
 326     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 327         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 328     fi
 329 done
 330
 331 setup_ruby_environment() {
 332     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 333       source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 334       using_rvm=true
 335     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 336       source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 337       using_rvm=true
 338     else
 339       using_rvm=false
 340     fi
 341
 342     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 343         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 344         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 345         # the environment to the "current gemset", which would lose
 346         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 347         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 348         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 349         # rvm gemset and use it for everything.
 350
 351         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 352             || fatal 'rvm check'
 353
 354         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 355         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 356         # complaint about not being in first place already.
 357         rvm use @default 2>/dev/null
 358
 359         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 360         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 361         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 362         # ruby to the caller.
 363         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 364         rvm use "@${gemset}" --create \
 365             || fatal 'rvm gemset setup'
 366
 367         rvm env
 368     else
 369         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 370         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 371         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 372         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 373         # should be installed, and we should leave it alone.)
 374
 375         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 376             user_gempath="$(gem env gempath)"
 377             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 378         fi
 379         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 380
 381         # When we build and install our own gems, we install them in our
 382         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 383         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 384         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 385
 386         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 387         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 388         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home:$(gem env gempath)"
 389
 390         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 391         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 392         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 393     fi
 394 }
 395
 396 with_test_gemset() {
 397     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 398         "$@"
 399     else
 400         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 401     fi
 402 }
 403
 404 gem_uninstall_if_exists() {
 405     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 406         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 407     fi
 408 }
 409
 410 setup_virtualenv() {
 411     local venvdest="$1"; shift
 412     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 413         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 414     fi
 415     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 416         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 417         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 418     else
 419         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 420     fi
 421     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 422     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 423 }
 424
 425 export PERLINSTALLBASE
 426 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
 427
 428 export GOPATH
 429 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 430 ln -sfn "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
 431     || fatal "symlink failed"
 432
 433 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 434 . "$VENVDIR/bin/activate"
 435
 436 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 437 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
 438     || pip install PyYAML >/dev/null \
 439     || fatal "pip install PyYAML failed"
 440
 441 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
 442 # won't pick it up by default.
 443 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 444     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
 445     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 446
 447 # This will help people who reuse --temp dirs when we upgrade to llfuse 0.42
 448 if egrep -q 'llfuse.*>= *0\.42' "$WORKSPACE/services/fuse/setup.py"; then
 449     # Uninstall old llfuse, because services/fuse "pip install" won't
 450     # upgrade it by default.
 451     if pip freeze | egrep '^llfuse==0\.41\.'; then
 452         yes | pip uninstall 'llfuse<0.42'
 453     fi
 454 fi
 455
 456 # Deactivate Python 2 virtualenv
 457 deactivate
 458
 459 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 460 # Otherwise, skip dependent tests.
 461 PYTHON3=$(which python3)
 462 if [ "0" = "$?" ]; then
 463     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 464 else
 465     PYTHON3=
 466     skip[services/dockercleaner]=1
 467     cat >&2 <<EOF
 468
 469 Warning: python3 could not be found
 470 services/dockercleaner install and tests will be skipped
 471
 472 EOF
 473 fi
 474
 475 # Reactivate Python 2 virtualenv
 476 . "$VENVDIR/bin/activate"
 477
 478 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 479 # whine a lot.
 480 setup_ruby_environment
 481
 482 echo "PATH is $PATH"
 483
 484 if ! which bundler >/dev/null
 485 then
 486     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 487 fi
 488
 489 retry() {
 490     while ! ${@} && [[ "$retry" == 1 ]]
 491     do
 492         read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 493         if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 494         then
 495             break
 496         fi
 497     done
 498 }
 499
 500 do_test() {
 501     retry do_test_once ${@}
 502 }
 503
 504 do_test_once() {
 505     unset result
 506     to_test=$1
 507     if (( [[ "$only" == "apps/workbench" ]] ) &&
 508        ( [[ "$to_test" == "apps/workbench_units" ]] || [[ "$to_test" == "apps/workbench_functionals" ]] ||
 509          [[ "$to_test" == "apps/workbench_integration" ]])); then
 510       to_test="apps/workbench"
 511     fi
 512     if [[ -z "${skip[$1]}" ]] && ( [[ -z "$only" ]] || [[ "$only" == "$to_test" ]] )
 513     then
 514         title "Running $1 tests"
 515         timer_reset
 516         if [[ "$2" == "go" ]]
 517         then
 518             covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 519             coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 520             # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 521             # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 522             # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 523             # compilation errors.
 524             go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" || return 1
 525             cd "$WORKSPACE/$1" || return 1
 526             gofmt -e -d . | egrep . && result=1
 527             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 528             then
 529                 # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 530                 # does:
 531                 cd "$WORKSPACE/$1" && go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 532             else
 533                 # The above form gets verbose even when testargs is
 534                 # empty, so use this form in such cases:
 535                 go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 536             fi
 537             result=${result:-$?}
 538             if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 539             then
 540                 go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 541                 rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 542             fi
 543         elif [[ "$2" == "pip" ]]
 544         then
 545             tries=0
 546             cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 547             do
 548                 tries=$((${tries}+1))
 549                 # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 550                 # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 551                 "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 552                 result=$?
 553                 if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 554                 then
 555                     printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 556                     continue
 557                 else
 558                     break
 559                 fi
 560             done
 561         elif [[ "$2" != "" ]]
 562         then
 563             "test_$2"
 564         else
 565             "test_$1"
 566         fi
 567         result=${result:-$?}
 568         checkexit $result "$1 tests"
 569         title "End of $1 tests (`timer`)"
 570         return $result
 571     else
 572         title "Skipping $1 tests"
 573     fi
 574 }
 575
 576 do_install() {
 577     retry do_install_once ${@}
 578 }
 579
 580 do_install_once() {
 581     if [[ -z "$skip_install" || (-n "$only_install" && "$only_install" == "$1") ]]
 582     then
 583         title "Running $1 install"
 584         timer_reset
 585         if [[ "$2" == "go" ]]
 586         then
 587             go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 588         elif [[ "$2" == "pip" ]]
 589         then
 590             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 591             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 592
 593             # Need to change to a different directory after creating
 594             # the source dist package to avoid a pip bug.
 595             # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 596
 597             # Also need to install twice, because if it believes the package is
 598             # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 599             # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 600             # install" ensures that we've actually installed the local package
 601             # we just built.
 602             cd "$WORKSPACE/$1" \
 603                 && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 604                 && cd "$WORKSPACE" \
 605                 && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 606                 && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 607         elif [[ "$2" != "" ]]
 608         then
 609             "install_$2"
 610         else
 611             "install_$1"
 612         fi
 613         result=$?
 614         checkexit $result "$1 install"
 615         title "End of $1 install (`timer`)"
 616         return $result
 617     else
 618         title "Skipping $1 install"
 619     fi
 620 }
 621
 622 bundle_install_trylocal() {
 623     (
 624         set -e
 625         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 626         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 627             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 628             bundle install --no-deployment
 629         fi
 630         bundle package --all
 631     )
 632 }
 633
 634 install_doc() {
 635     cd "$WORKSPACE/doc" \
 636         && bundle_install_trylocal \
 637         && rm -rf .site
 638 }
 639 do_install doc
 640
 641 install_gem() {
 642     gemname=$1
 643     srcpath=$2
 644     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 645         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 646         && bundle_install_trylocal \
 647         && gem build "$gemname.gemspec" \
 648         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 649 }
 650
 651 install_ruby_sdk() {
 652     install_gem arvados sdk/ruby
 653 }
 654 do_install sdk/ruby ruby_sdk
 655
 656 install_perl_sdk() {
 657     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 658         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 659         && make install INSTALLDIRS=perl
 660 }
 661 do_install sdk/perl perl_sdk
 662
 663 install_cli() {
 664     install_gem arvados-cli sdk/cli
 665 }
 666 do_install sdk/cli cli
 667
 668 install_login-sync() {
 669     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 670 }
 671 do_install services/login-sync login-sync
 672
 673 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
 674 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
 675 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
 676 # its own test suite brings up some of those other programs (like
 677 # keepproxy).
 678 declare -a pythonstuff
 679 pythonstuff=(
 680     sdk/pam
 681     sdk/python
 682     sdk/cwl
 683     services/fuse
 684     services/nodemanager
 685     tools/crunchstat-summary
 686     )
 687 for p in "${pythonstuff[@]}"
 688 do
 689     do_install "$p" pip
 690 done
 691 if [ -n "$PYTHON3" ]; then
 692     do_install services/dockercleaner pip "$VENV3DIR/bin/"
 693 fi
 694
 695 install_apiserver() {
 696     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 697         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 698
 699     rm -f config/environments/test.rb
 700     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 701
 702     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 703     then
 704         for f in database.yml application.yml
 705         do
 706             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 707         done
 708     fi
 709
 710     # Fill in a random secret_token and blob_signing_key for testing
 711     SECRET_TOKEN=`echo 'puts rand(2**512).to_s(36)' |ruby`
 712     BLOB_SIGNING_KEY=`echo 'puts rand(2**512).to_s(36)' |ruby`
 713
 714     sed -i'' -e "s:SECRET_TOKEN:$SECRET_TOKEN:" config/application.yml
 715     sed -i'' -e "s:BLOB_SIGNING_KEY:$BLOB_SIGNING_KEY:" config/application.yml
 716
 717     # Set up empty git repo (for git tests)
 718     GITDIR=$(mktemp -d)
 719     sed -i'' -e "s:/var/cache/git:$GITDIR:" config/application.default.yml
 720
 721     rm -rf $GITDIR
 722     mkdir -p $GITDIR/test
 723     cd $GITDIR/test \
 724         && git init \
 725         && git config user.email "jenkins@ci.curoverse.com" \
 726         && git config user.name "Jenkins, CI" \
 727         && touch tmp \
 728         && git add tmp \
 729         && git commit -m 'initial commit'
 730
 731     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 732     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 733     # is a postgresql superuser.
 734     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 735         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 736         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 737
 738     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 739         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 740         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 741         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 742 }
 743 do_install services/api apiserver
 744
 745 declare -a gostuff
 746 gostuff=(
 747     sdk/go/arvados
 748     sdk/go/arvadosclient
 749     sdk/go/blockdigest
 750     sdk/go/httpserver
 751     sdk/go/manifest
 752     sdk/go/streamer
 753     sdk/go/crunchrunner
 754     lib/crunchstat
 755     services/arv-git-httpd
 756     services/crunchstat
 757     services/keep-web
 758     services/keepstore
 759     sdk/go/keepclient
 760     services/keep-balance
 761     services/keepproxy
 762     services/datamanager/summary
 763     services/datamanager/collection
 764     services/datamanager/keep
 765     services/datamanager
 766     services/crunch-dispatch-local
 767     services/crunch-dispatch-slurm
 768     services/crunch-run
 769     services/ws
 770     tools/keep-block-check
 771     tools/keep-exercise
 772     tools/keep-rsync
 773     )
 774 for g in "${gostuff[@]}"
 775 do
 776     do_install "$g" go
 777 done
 778
 779 install_workbench() {
 780     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 781         && mkdir -p tmp/cache \
 782         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 783 }
 784 do_install apps/workbench workbench
 785
 786 test_doclinkchecker() {
 787     (
 788         set -e
 789         cd "$WORKSPACE/doc"
 790         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
 791         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
 792         # do much good!
 793         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
 794     )
 795 }
 796 do_test doc doclinkchecker
 797
 798 stop_services
 799
 800 test_apiserver() {
 801     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
 802     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 803         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
 804 }
 805 do_test services/api apiserver
 806
 807 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
 808 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
 809 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
 810   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 811   exit_cleanly
 812 fi
 813
 814 start_api
 815
 816 test_ruby_sdk() {
 817     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
 818         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
 819 }
 820 do_test sdk/ruby ruby_sdk
 821
 822 test_cli() {
 823     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
 824         && mkdir -p /tmp/keep \
 825         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
 826 }
 827 do_test sdk/cli cli
 828
 829 test_login-sync() {
 830     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
 831         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
 832 }
 833 do_test services/login-sync login-sync
 834
 835 for p in "${pythonstuff[@]}"
 836 do
 837     do_test "$p" pip
 838 done
 839 do_test services/dockercleaner pip "$VENV3DIR/bin/"
 840
 841 for g in "${gostuff[@]}"
 842 do
 843     do_test "$g" go
 844 done
 845
 846 test_workbench_units() {
 847     start_nginx_proxy_services \
 848         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 849         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 850 }
 851 do_test apps/workbench_units workbench_units
 852
 853 test_workbench_functionals() {
 854     start_nginx_proxy_services \
 855         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 856         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 857 }
 858 do_test apps/workbench_functionals workbench_functionals
 859
 860 test_workbench_integration() {
 861     start_nginx_proxy_services \
 862         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 863         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 864 }
 865 do_test apps/workbench_integration workbench_integration
 866
 867
 868 test_workbench_benchmark() {
 869     start_nginx_proxy_services \
 870         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 871         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
 872 }
 873 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
 874
 875 test_workbench_profile() {
 876     start_nginx_proxy_services \
 877         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 878         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
 879 }
 880 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
 881
 882 exit_cleanly