build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2
   3 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin
   4
   5 COLUMNS=80
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
   7
   8 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
   9 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  10
  11 Exit non-zero if any tests fail.
  12
  13 Syntax:
  14         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  15
  16 Options:
  17
  18 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  19 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  20 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  21                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  22 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  23                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  24                subsequent invocations.
  25 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
  26                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  27                from a previous invocation if you use this option.
  28 --only-install Run specific install step
  29 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  30 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  31 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  32                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  33 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  34                Restrict apiserver tests to the given file
  35 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
  36                Restrict Python SDK tests to the given class
  37 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  38                Restrict Workbench tests to the given file
  39 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  40                Show all log messages, even when tests pass (also works
  41                with services/keepstore_test etc.)
  42 ARVADOS_DEBUG=1
  43                Print more debug messages
  44 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  45                *_test, and other examples shown above.
  46
  47 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
  48 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  49 test suites depend on other components being installed, and installing
  50 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  51
  52 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  53 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  54
  55 More information and background:
  56
  57 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  58
  59 Available tests:
  60
  61 apps/workbench (*)
  62 apps/workbench_units (*)
  63 apps/workbench_functionals (*)
  64 apps/workbench_integration (*)
  65 apps/workbench_benchmark
  66 apps/workbench_profile
  67 doc
  68 services/api
  69 services/arv-git-httpd
  70 services/crunchstat
  71 services/dockercleaner
  72 services/fuse
  73 services/keep-web
  74 services/keepproxy
  75 services/keepstore
  76 services/keep-balance
  77 services/login-sync
  78 services/nodemanager
  79 services/crunch-run
  80 services/crunch-dispatch-local
  81 services/crunch-dispatch-slurm
  82 services/ws
  83 sdk/cli
  84 sdk/pam
  85 sdk/python
  86 sdk/ruby
  87 sdk/go/arvados
  88 sdk/go/arvadosclient
  89 sdk/go/keepclient
  90 sdk/go/httpserver
  91 sdk/go/manifest
  92 sdk/go/blockdigest
  93 sdk/go/streamer
  94 sdk/go/crunchrunner
  95 sdk/cwl
  96 tools/crunchstat-summary
  97 tools/keep-exercise
  98 tools/keep-rsync
  99 tools/keep-block-check
 100
 101 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 102     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 103
 104 EOF
 105
 106 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 107 # environment that could interfere with the tests.
 108 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 109
 110 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 111 # accident.
 112 GITDIR=
 113 GOPATH=
 114 VENVDIR=
 115 VENV3DIR=
 116 PYTHONPATH=
 117 GEMHOME=
 118 PERLINSTALLBASE=
 119
 120 short=
 121 skip_install=
 122 temp=
 123 temp_preserve=
 124
 125 clear_temp() {
 126     if [[ -z "$temp" ]]; then
 127         # we didn't even get as far as making a temp dir
 128         :
 129     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 130         rm -rf "$temp"
 131     else
 132         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 133     fi
 134 }
 135
 136 fatal() {
 137     clear_temp
 138     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 139     exit 1
 140 }
 141
 142 exit_cleanly() {
 143     trap - INT
 144     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 145     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 146     stop_services
 147     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 148     report_outcomes
 149     clear_temp
 150     exit ${#failures}
 151 }
 152
 153 sanity_checks() {
 154     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 155         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 156     echo Checking dependencies:
 157     echo -n 'virtualenv: '
 158     virtualenv --version \
 159         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 160     echo -n 'go: '
 161     go version \
 162         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 163     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 7 ]] \
 164         || fatal "Go >= 1.7 required. See http://golang.org/doc/install"
 165     echo -n 'gcc: '
 166     gcc --version | egrep ^gcc \
 167         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 168     echo -n 'fuse.h: '
 169     find /usr/include -wholename '*fuse/fuse.h' \
 170         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 171     echo -n 'pyconfig.h: '
 172     find /usr/include -name pyconfig.h | egrep --max-count=1 . \
 173         || fatal "No pyconfig.h. Try: apt-get install python-dev"
 174     echo -n 'nginx: '
 175     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 176         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 177     echo -n 'perl: '
 178     perl -v | grep version \
 179         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 180     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 181         echo -n "perl $mod: "
 182         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 183             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 184     done
 185     echo -n 'gitolite: '
 186     which gitolite \
 187         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 188 }
 189
 190 rotate_logfile() {
 191   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 192   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 193   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 194     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 195     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 196     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 197   fi
 198 }
 199
 200 declare -a failures
 201 declare -A skip
 202 declare -A testargs
 203 skip[apps/workbench_profile]=1
 204
 205 while [[ -n "$1" ]]
 206 do
 207     arg="$1"; shift
 208     case "$arg" in
 209         --help)
 210             echo >&2 "$helpmessage"
 211             echo >&2
 212             exit 1
 213             ;;
 214         --skip)
 215             skipwhat="$1"; shift
 216             if [[ "$skipwhat" == "apps/workbench" ]]; then
 217               skip["apps/workbench_units"]=1
 218               skip["apps/workbench_functionals"]=1
 219               skip["apps/workbench_integration"]=1
 220             else
 221               skip[$skipwhat]=1
 222             fi
 223             ;;
 224         --only)
 225             only="$1"; skip[$1]=""; shift
 226             ;;
 227         --short)
 228             short=1
 229             ;;
 230         --skip-install)
 231             skip_install=1
 232             ;;
 233         --only-install)
 234             skip_install=1
 235             only_install="$1"; shift
 236             ;;
 237         --temp)
 238             temp="$1"; shift
 239             temp_preserve=1
 240             ;;
 241         --leave-temp)
 242             temp_preserve=1
 243             ;;
 244         --retry)
 245             retry=1
 246             ;;
 247         *_test=*)
 248             suite="${arg%%_test=*}"
 249             args="${arg#*=}"
 250             testargs["$suite"]="$args"
 251             ;;
 252         *=*)
 253             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 254             ;;
 255         *)
 256             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 257             exit 1
 258             ;;
 259     esac
 260 done
 261
 262 start_api() {
 263     echo 'Starting API server...'
 264     cd "$WORKSPACE" \
 265         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 266         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 267         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 268         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 269         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 270         && (env | egrep ^ARVADOS)
 271 }
 272
 273 start_nginx_proxy_services() {
 274     echo 'Starting keepproxy, keep-web, ws, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
 275     cd "$WORKSPACE" \
 276         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 277         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 278         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 279         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 280         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 281         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1
 282 }
 283
 284 stop_services() {
 285     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES" ]]; then
 286         unset ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 287         cd "$WORKSPACE" \
 288             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 289             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 290             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 291             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 292             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy
 293     fi
 294     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 295         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 296         cd "$WORKSPACE" \
 297             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
 298     fi
 299 }
 300
 301 interrupt() {
 302     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 303     exit_cleanly
 304 }
 305 trap interrupt INT
 306
 307 sanity_checks
 308
 309 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 310
 311 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 312     # Jenkins expects us to use this by default.
 313     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 314 fi
 315
 316 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 317 cd "$WORKSPACE"
 318 find -name '*.pyc' -delete
 319
 320 if [[ -z "$temp" ]]; then
 321     temp="$(mktemp -d)"
 322 fi
 323
 324 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 325 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
 326 do
 327     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 328         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 329     fi
 330     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 331         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 332     fi
 333 done
 334
 335 setup_ruby_environment() {
 336     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 337       source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 338       using_rvm=true
 339     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 340       source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 341       using_rvm=true
 342     else
 343       using_rvm=false
 344     fi
 345
 346     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 347         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 348         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 349         # the environment to the "current gemset", which would lose
 350         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 351         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 352         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 353         # rvm gemset and use it for everything.
 354
 355         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 356             || fatal 'rvm check'
 357
 358         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 359         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 360         # complaint about not being in first place already.
 361         rvm use @default 2>/dev/null
 362
 363         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 364         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 365         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 366         # ruby to the caller.
 367         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 368         rvm use "@${gemset}" --create \
 369             || fatal 'rvm gemset setup'
 370
 371         rvm env
 372     else
 373         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 374         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 375         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 376         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 377         # should be installed, and we should leave it alone.)
 378
 379         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 380             user_gempath="$(gem env gempath)"
 381             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 382         fi
 383         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 384
 385         # When we build and install our own gems, we install them in our
 386         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 387         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 388         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 389
 390         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 391         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 392         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home:$(gem env gempath)"
 393
 394         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 395         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 396         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 397     fi
 398 }
 399
 400 with_test_gemset() {
 401     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 402         "$@"
 403     else
 404         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 405     fi
 406 }
 407
 408 gem_uninstall_if_exists() {
 409     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 410         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 411     fi
 412 }
 413
 414 setup_virtualenv() {
 415     local venvdest="$1"; shift
 416     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 417         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 418     fi
 419     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 420         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 421         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 422     else
 423         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 424     fi
 425     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 426     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 427 }
 428
 429 export PERLINSTALLBASE
 430 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
 431
 432 export GOPATH
 433 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 434 ln -sfn "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
 435     || fatal "symlink failed"
 436
 437 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 438 . "$VENVDIR/bin/activate"
 439
 440 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 441 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
 442     || pip install PyYAML >/dev/null \
 443     || fatal "pip install PyYAML failed"
 444
 445 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
 446 # won't pick it up by default.
 447 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 448     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
 449     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 450
 451 # This will help people who reuse --temp dirs when we upgrade to llfuse 0.42
 452 if egrep -q 'llfuse.*>= *0\.42' "$WORKSPACE/services/fuse/setup.py"; then
 453     # Uninstall old llfuse, because services/fuse "pip install" won't
 454     # upgrade it by default.
 455     if pip freeze | egrep '^llfuse==0\.41\.'; then
 456         yes | pip uninstall 'llfuse<0.42'
 457     fi
 458 fi
 459
 460 # Deactivate Python 2 virtualenv
 461 deactivate
 462
 463 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 464 # Otherwise, skip dependent tests.
 465 PYTHON3=$(which python3)
 466 if [ "0" = "$?" ]; then
 467     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 468 else
 469     PYTHON3=
 470     skip[services/dockercleaner]=1
 471     cat >&2 <<EOF
 472
 473 Warning: python3 could not be found
 474 services/dockercleaner install and tests will be skipped
 475
 476 EOF
 477 fi
 478
 479 # Reactivate Python 2 virtualenv
 480 . "$VENVDIR/bin/activate"
 481
 482 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 483 # whine a lot.
 484 setup_ruby_environment
 485
 486 echo "PATH is $PATH"
 487
 488 if ! which bundler >/dev/null
 489 then
 490     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 491 fi
 492
 493 retry() {
 494     while ! ${@} && [[ "$retry" == 1 ]]
 495     do
 496         read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 497         if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 498         then
 499             break
 500         fi
 501     done
 502 }
 503
 504 do_test() {
 505     retry do_test_once ${@}
 506 }
 507
 508 do_test_once() {
 509     unset result
 510     to_test=$1
 511     if (( [[ "$only" == "apps/workbench" ]] ) &&
 512        ( [[ "$to_test" == "apps/workbench_units" ]] || [[ "$to_test" == "apps/workbench_functionals" ]] ||
 513          [[ "$to_test" == "apps/workbench_integration" ]])); then
 514       to_test="apps/workbench"
 515     fi
 516     if [[ -z "${skip[$1]}" ]] && ( [[ -z "$only" ]] || [[ "$only" == "$to_test" ]] )
 517     then
 518         title "Running $1 tests"
 519         timer_reset
 520         if [[ "$2" == "go" ]]
 521         then
 522             covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 523             coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 524             # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 525             # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 526             # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 527             # compilation errors.
 528             go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" || return 1
 529             cd "$WORKSPACE/$1" || return 1
 530             gofmt -e -d . | egrep . && result=1
 531             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 532             then
 533                 # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 534                 # does:
 535                 cd "$WORKSPACE/$1" && go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 536             else
 537                 # The above form gets verbose even when testargs is
 538                 # empty, so use this form in such cases:
 539                 go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 540             fi
 541             result=${result:-$?}
 542             if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 543             then
 544                 go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 545                 rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 546             fi
 547         elif [[ "$2" == "pip" ]]
 548         then
 549             tries=0
 550             cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 551             do
 552                 tries=$((${tries}+1))
 553                 # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 554                 # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 555                 "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 556                 result=$?
 557                 if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 558                 then
 559                     printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 560                     continue
 561                 else
 562                     break
 563                 fi
 564             done
 565         elif [[ "$2" != "" ]]
 566         then
 567             "test_$2"
 568         else
 569             "test_$1"
 570         fi
 571         result=${result:-$?}
 572         checkexit $result "$1 tests"
 573         title "End of $1 tests (`timer`)"
 574         return $result
 575     else
 576         title "Skipping $1 tests"
 577     fi
 578 }
 579
 580 do_install() {
 581     retry do_install_once ${@}
 582 }
 583
 584 do_install_once() {
 585     if [[ -z "$skip_install" || (-n "$only_install" && "$only_install" == "$1") ]]
 586     then
 587         title "Running $1 install"
 588         timer_reset
 589         if [[ "$2" == "go" ]]
 590         then
 591             go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 592         elif [[ "$2" == "pip" ]]
 593         then
 594             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 595             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 596
 597             # Need to change to a different directory after creating
 598             # the source dist package to avoid a pip bug.
 599             # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 600
 601             # Also need to install twice, because if it believes the package is
 602             # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 603             # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 604             # install" ensures that we've actually installed the local package
 605             # we just built.
 606             cd "$WORKSPACE/$1" \
 607                 && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 608                 && cd "$WORKSPACE" \
 609                 && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 610                 && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 611         elif [[ "$2" != "" ]]
 612         then
 613             "install_$2"
 614         else
 615             "install_$1"
 616         fi
 617         result=$?
 618         checkexit $result "$1 install"
 619         title "End of $1 install (`timer`)"
 620         return $result
 621     else
 622         title "Skipping $1 install"
 623     fi
 624 }
 625
 626 bundle_install_trylocal() {
 627     (
 628         set -e
 629         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 630         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 631             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 632             bundle install --no-deployment
 633         fi
 634         bundle package --all
 635     )
 636 }
 637
 638 install_doc() {
 639     cd "$WORKSPACE/doc" \
 640         && bundle_install_trylocal \
 641         && rm -rf .site
 642 }
 643 do_install doc
 644
 645 install_gem() {
 646     gemname=$1
 647     srcpath=$2
 648     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 649         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 650         && bundle_install_trylocal \
 651         && gem build "$gemname.gemspec" \
 652         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 653 }
 654
 655 install_ruby_sdk() {
 656     install_gem arvados sdk/ruby
 657 }
 658 do_install sdk/ruby ruby_sdk
 659
 660 install_perl_sdk() {
 661     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 662         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 663         && make install INSTALLDIRS=perl
 664 }
 665 do_install sdk/perl perl_sdk
 666
 667 install_cli() {
 668     install_gem arvados-cli sdk/cli
 669 }
 670 do_install sdk/cli cli
 671
 672 install_login-sync() {
 673     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 674 }
 675 do_install services/login-sync login-sync
 676
 677 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
 678 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
 679 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
 680 # its own test suite brings up some of those other programs (like
 681 # keepproxy).
 682 declare -a pythonstuff
 683 pythonstuff=(
 684     sdk/pam
 685     sdk/python
 686     sdk/cwl
 687     services/fuse
 688     services/nodemanager
 689     tools/crunchstat-summary
 690     )
 691 for p in "${pythonstuff[@]}"
 692 do
 693     do_install "$p" pip
 694 done
 695 if [ -n "$PYTHON3" ]; then
 696     do_install services/dockercleaner pip "$VENV3DIR/bin/"
 697 fi
 698
 699 install_apiserver() {
 700     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 701         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 702
 703     rm -f config/environments/test.rb
 704     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 705
 706     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 707     then
 708         for f in database.yml application.yml
 709         do
 710             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 711         done
 712     fi
 713
 714     # Fill in a random secret_token and blob_signing_key for testing
 715     SECRET_TOKEN=`echo 'puts rand(2**512).to_s(36)' |ruby`
 716     BLOB_SIGNING_KEY=`echo 'puts rand(2**512).to_s(36)' |ruby`
 717
 718     sed -i'' -e "s:SECRET_TOKEN:$SECRET_TOKEN:" config/application.yml
 719     sed -i'' -e "s:BLOB_SIGNING_KEY:$BLOB_SIGNING_KEY:" config/application.yml
 720
 721     # Set up empty git repo (for git tests)
 722     GITDIR=$(mktemp -d)
 723     sed -i'' -e "s:/var/cache/git:$GITDIR:" config/application.default.yml
 724
 725     rm -rf $GITDIR
 726     mkdir -p $GITDIR/test
 727     cd $GITDIR/test \
 728         && git init \
 729         && git config user.email "jenkins@ci.curoverse.com" \
 730         && git config user.name "Jenkins, CI" \
 731         && touch tmp \
 732         && git add tmp \
 733         && git commit -m 'initial commit'
 734
 735     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 736     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 737     # is a postgresql superuser.
 738     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 739         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 740         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 741
 742     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 743         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 744         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 745         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 746 }
 747 do_install services/api apiserver
 748
 749 declare -a gostuff
 750 gostuff=(
 751     sdk/go/arvados
 752     sdk/go/arvadosclient
 753     sdk/go/blockdigest
 754     sdk/go/httpserver
 755     sdk/go/manifest
 756     sdk/go/streamer
 757     sdk/go/crunchrunner
 758     lib/crunchstat
 759     services/arv-git-httpd
 760     services/crunchstat
 761     services/keep-web
 762     services/keepstore
 763     sdk/go/keepclient
 764     services/keep-balance
 765     services/keepproxy
 766     services/datamanager/summary
 767     services/datamanager/collection
 768     services/datamanager/keep
 769     services/datamanager
 770     services/crunch-dispatch-local
 771     services/crunch-dispatch-slurm
 772     services/crunch-run
 773     services/ws
 774     tools/keep-block-check
 775     tools/keep-exercise
 776     tools/keep-rsync
 777     )
 778 for g in "${gostuff[@]}"
 779 do
 780     do_install "$g" go
 781 done
 782
 783 install_workbench() {
 784     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 785         && mkdir -p tmp/cache \
 786         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 787 }
 788 do_install apps/workbench workbench
 789
 790 test_doclinkchecker() {
 791     (
 792         set -e
 793         cd "$WORKSPACE/doc"
 794         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
 795         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
 796         # do much good!
 797         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
 798     )
 799 }
 800 do_test doc doclinkchecker
 801
 802 stop_services
 803
 804 test_apiserver() {
 805     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
 806     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 807         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
 808 }
 809 do_test services/api apiserver
 810
 811 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
 812 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
 813 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
 814   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 815   exit_cleanly
 816 fi
 817
 818 start_api
 819
 820 test_ruby_sdk() {
 821     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
 822         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
 823 }
 824 do_test sdk/ruby ruby_sdk
 825
 826 test_cli() {
 827     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
 828         && mkdir -p /tmp/keep \
 829         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
 830 }
 831 do_test sdk/cli cli
 832
 833 test_login-sync() {
 834     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
 835         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
 836 }
 837 do_test services/login-sync login-sync
 838
 839 for p in "${pythonstuff[@]}"
 840 do
 841     do_test "$p" pip
 842 done
 843 do_test services/dockercleaner pip "$VENV3DIR/bin/"
 844
 845 for g in "${gostuff[@]}"
 846 do
 847     do_test "$g" go
 848 done
 849
 850 test_workbench_units() {
 851     start_nginx_proxy_services \
 852         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 853         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 854 }
 855 do_test apps/workbench_units workbench_units
 856
 857 test_workbench_functionals() {
 858     start_nginx_proxy_services \
 859         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 860         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 861 }
 862 do_test apps/workbench_functionals workbench_functionals
 863
 864 test_workbench_integration() {
 865     start_nginx_proxy_services \
 866         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 867         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 868 }
 869 do_test apps/workbench_integration workbench_integration
 870
 871
 872 test_workbench_benchmark() {
 873     start_nginx_proxy_services \
 874         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 875         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
 876 }
 877 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
 878
 879 test_workbench_profile() {
 880     start_nginx_proxy_services \
 881         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 882         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
 883 }
 884 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
 885
 886 exit_cleanly