build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
   5
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin.sh
   7
   8 COLUMNS=80
   9 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
  10
  11 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
  12 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  13
  14 Exit non-zero if any tests fail.
  15
  16 Syntax:
  17         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  18
  19 Options:
  20
  21 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  22 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  23 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  24                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  25 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  26                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  27                subsequent invocations.
  28 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  29 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  30 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
  31                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  32                from a previous invocation if you use this option.
  33 --only-install Run specific install step
  34 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  35 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  36 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  37                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  38 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  39                Restrict apiserver tests to the given file
  40 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
  41                Restrict Python SDK tests to the given class
  42 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  43                Restrict Workbench tests to the given file
  44 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  45                Show all log messages, even when tests pass (also works
  46                with services/keepstore_test etc.)
  47 ARVADOS_DEBUG=1
  48                Print more debug messages
  49 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  50                *_test, and other examples shown above.
  51
  52 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
  53 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  54 test suites depend on other components being installed, and installing
  55 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  56
  57 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  58 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  59
  60 More information and background:
  61
  62 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  63
  64 Available tests:
  65
  66 apps/workbench (*)
  67 apps/workbench_units (*)
  68 apps/workbench_functionals (*)
  69 apps/workbench_integration (*)
  70 apps/workbench_benchmark
  71 apps/workbench_profile
  72 doc
  73 services/api
  74 services/arv-git-httpd
  75 services/crunchstat
  76 services/dockercleaner
  77 services/fuse
  78 services/health
  79 services/keep-web
  80 services/keepproxy
  81 services/keepstore
  82 services/keep-balance
  83 services/login-sync
  84 services/nodemanager
  85 services/nodemanager_integration
  86 services/crunch-run
  87 services/crunch-dispatch-local
  88 services/crunch-dispatch-slurm
  89 services/ws
  90 sdk/cli
  91 sdk/pam
  92 sdk/python
  93 sdk/python:py3
  94 sdk/ruby
  95 sdk/go/arvados
  96 sdk/go/arvadosclient
  97 sdk/go/dispatch
  98 sdk/go/keepclient
  99 sdk/go/health
 100 sdk/go/httpserver
 101 sdk/go/manifest
 102 sdk/go/blockdigest
 103 sdk/go/asyncbuf
 104 sdk/go/stats
 105 sdk/go/crunchrunner
 106 sdk/cwl
 107 tools/sync-groups
 108 tools/crunchstat-summary
 109 tools/keep-exercise
 110 tools/keep-rsync
 111 tools/keep-block-check
 112
 113 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 114     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 115
 116 EOF
 117
 118 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 119 # environment that could interfere with the tests.
 120 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 121
 122 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 123 # accident.
 124 GITDIR=
 125 GOPATH=
 126 VENVDIR=
 127 VENV3DIR=
 128 PYTHONPATH=
 129 GEMHOME=
 130 PERLINSTALLBASE=
 131
 132 short=
 133 only_install=
 134 temp=
 135 temp_preserve=
 136
 137 clear_temp() {
 138     if [[ -z "$temp" ]]; then
 139         # we didn't even get as far as making a temp dir
 140         :
 141     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 142         rm -rf "$temp"
 143     else
 144         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 145     fi
 146 }
 147
 148 fatal() {
 149     clear_temp
 150     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 151     exit 1
 152 }
 153
 154 exit_cleanly() {
 155     trap - INT
 156     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 157     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 158     stop_services
 159     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 160     report_outcomes
 161     clear_temp
 162     exit ${#failures}
 163 }
 164
 165 sanity_checks() {
 166     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 167         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 168     echo Checking dependencies:
 169     echo -n 'virtualenv: '
 170     virtualenv --version \
 171         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 172     echo -n 'ruby: '
 173     ruby -v \
 174         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 175     echo -n 'go: '
 176     go version \
 177         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 178     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 8 ]] \
 179         || fatal "Go >= 1.8 required. See http://golang.org/doc/install"
 180     echo -n 'gcc: '
 181     gcc --version | egrep ^gcc \
 182         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 183     echo -n 'fuse.h: '
 184     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 185         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 186     echo -n 'gnutls.h: '
 187     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 188         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 189     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
 190     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 191         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
 192     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 193     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 194         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 195     echo -n 'nginx: '
 196     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 197         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 198     echo -n 'perl: '
 199     perl -v | grep version \
 200         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 201     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 202         echo -n "perl $mod: "
 203         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 204             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 205     done
 206     echo -n 'gitolite: '
 207     which gitolite \
 208         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 209     echo -n 'npm: '
 210     npm --version \
 211         || fatal "No npm. Try: wget -O- https://nodejs.org/dist/v6.11.2/node-v6.11.2-linux-x64.tar.xz | sudo tar -C /usr/local -xJf - && sudo ln -s ../node-v6.11.2-linux-x64/bin/{node,npm} /usr/local/bin/"
 212     echo -n 'cadaver: '
 213     cadaver --version | grep -w cadaver \
 214           || fatal "No cadaver. Try: apt-get install cadaver"
 215     echo -n 'libattr1 xattr.h: '
 216     find /usr/include -path '*/attr/xattr.h' | egrep --max-count=1 . \
 217         || fatal "No libattr1 xattr.h. Try: apt-get install libattr1-dev"
 218     echo -n 'libcurl curl.h: '
 219     find /usr/include -path '*/curl/curl.h' | egrep --max-count=1 . \
 220         || fatal "No libcurl curl.h. Try: apt-get install libcurl4-gnutls-dev"
 221     echo -n 'libpq libpq-fe.h: '
 222     find /usr/include -path '*/postgresql/libpq-fe.h' | egrep --max-count=1 . \
 223         || fatal "No libpq libpq-fe.h. Try: apt-get install libpq-dev"
 224     echo -n 'services/api/config/database.yml: '
 225     if [[ ! -f "$WORKSPACE/services/api/config/database.yml" ]]; then
 226             fatal "Please provide a database.yml file for the test suite"
 227     else
 228             echo "OK"
 229     fi
 230     echo -n 'postgresql: '
 231     psql --version || fatal "No postgresql. Try: apt-get install postgresql postgresql-client-common"
 232     echo -n 'phantomjs: '
 233     phantomjs --version || fatal "No phantomjs. Try: apt-get install phantomjs"
 234     echo -n 'xvfb: '
 235     which Xvfb || fatal "No xvfb. Try: apt-get install xvfb"
 236     echo -n 'graphviz: '
 237     dot -V || fatal "No graphviz. Try: apt-get install graphviz"
 238 }
 239
 240 rotate_logfile() {
 241   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 242   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 243   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 244     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 245     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 246     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 247   fi
 248 }
 249
 250 declare -a failures
 251 declare -A skip
 252 declare -A testargs
 253 skip[apps/workbench_profile]=1
 254
 255 while [[ -n "$1" ]]
 256 do
 257     arg="$1"; shift
 258     case "$arg" in
 259         --help)
 260             echo >&2 "$helpmessage"
 261             echo >&2
 262             exit 1
 263             ;;
 264         --skip)
 265             skip[$1]=1; shift
 266             ;;
 267         --only)
 268             only="$1"; skip[$1]=""; shift
 269             ;;
 270         --short)
 271             short=1
 272             ;;
 273         --skip-install)
 274             only_install=nothing
 275             ;;
 276         --only-install)
 277             only_install="$1"; shift
 278             ;;
 279         --temp)
 280             temp="$1"; shift
 281             temp_preserve=1
 282             ;;
 283         --leave-temp)
 284             temp_preserve=1
 285             ;;
 286         --repeat)
 287             repeat=$((${1}+0)); shift
 288             ;;
 289         --retry)
 290             retry=1
 291             ;;
 292         *_test=*)
 293             suite="${arg%%_test=*}"
 294             args="${arg#*=}"
 295             testargs["$suite"]="$args"
 296             ;;
 297         *=*)
 298             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 299             ;;
 300         *)
 301             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 302             exit 1
 303             ;;
 304     esac
 305 done
 306
 307 start_services() {
 308     echo 'Starting API, keepproxy, keep-web, ws, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
 309     if [[ ! -d "$WORKSPACE/services/api/log" ]]; then
 310         mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/log"
 311     fi
 312     # Remove empty api.pid file if it exists
 313     if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid" && ! -s "$WORKSPACE/tmp/api.pid" ]]; then
 314         rm -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid"
 315     fi
 316     cd "$WORKSPACE" \
 317         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 318         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 319         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 320         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 321         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 322         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 323         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 324         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 325         && (env | egrep ^ARVADOS)
 326 }
 327
 328 stop_services() {
 329     if [[ -z "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 330         return
 331     fi
 332     unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 333     cd "$WORKSPACE" \
 334         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 335         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 336         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 337         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 338         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy \
 339         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
 340 }
 341
 342 interrupt() {
 343     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 344     exit_cleanly
 345 }
 346 trap interrupt INT
 347
 348 sanity_checks
 349
 350 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 351
 352 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 353     # Jenkins expects us to use this by default.
 354     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 355 fi
 356
 357 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 358 cd "$WORKSPACE"
 359 find -name '*.pyc' -delete
 360
 361 if [[ -z "$temp" ]]; then
 362     temp="$(mktemp -d)"
 363 fi
 364
 365 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 366 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
 367 do
 368     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 369         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 370     fi
 371     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 372         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 373     fi
 374 done
 375
 376 setup_ruby_environment() {
 377     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 378         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 379         using_rvm=true
 380     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 381         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 382         using_rvm=true
 383     else
 384         using_rvm=false
 385     fi
 386
 387     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 388         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 389         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 390         # the environment to the "current gemset", which would lose
 391         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 392         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 393         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 394         # rvm gemset and use it for everything.
 395
 396         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 397             || fatal 'rvm check'
 398
 399         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 400         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 401         # complaint about not being in first place already.
 402         rvm use @default 2>/dev/null
 403
 404         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 405         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 406         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 407         # ruby to the caller.
 408         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 409         rvm use "@${gemset}" --create \
 410             || fatal 'rvm gemset setup'
 411
 412         rvm env
 413     else
 414         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 415         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 416         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 417         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 418         # should be installed, and we should leave it alone.)
 419
 420         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 421             user_gempath="$(gem env gempath)"
 422             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 423         fi
 424         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 425
 426         # When we build and install our own gems, we install them in our
 427         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 428         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 429         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 430
 431         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 432         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 433         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
 434
 435         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 436         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 437         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 438     fi
 439     bundle config || gem install bundler \
 440         || fatal 'install bundler'
 441 }
 442
 443 with_test_gemset() {
 444     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 445         "$@"
 446     else
 447         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 448     fi
 449 }
 450
 451 gem_uninstall_if_exists() {
 452     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 453         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 454     fi
 455 }
 456
 457 setup_virtualenv() {
 458     local venvdest="$1"; shift
 459     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 460         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 461     fi
 462     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 463         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 464         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 465     else
 466         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 467     fi
 468     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 469     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 470 }
 471
 472 export PERLINSTALLBASE
 473 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
 474
 475 export GOPATH
 476 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 477 rmdir --parents "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/tmp/GOPATH"
 478 ln -sfT "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
 479     || fatal "symlink failed"
 480 go get -v github.com/kardianos/govendor \
 481     || fatal "govendor install failed"
 482
 483 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 484 . "$VENVDIR/bin/activate"
 485
 486 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 487 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
 488     || pip install PyYAML >/dev/null \
 489     || fatal "pip install PyYAML failed"
 490
 491 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
 492 # won't pick it up by default.
 493 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 494     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
 495     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 496
 497 # We need an unreleased (as of 2017-08-17) llfuse bugfix, otherwise our fuse test suite deadlocks.
 498 pip freeze | grep -x llfuse==1.2.0 || (
 499     set -e
 500     yes | pip uninstall llfuse || true
 501     cython --version || fatal "no cython; try sudo apt-get install cython"
 502     cd "$temp"
 503     (cd python-llfuse 2>/dev/null || git clone https://github.com/curoverse/python-llfuse)
 504     cd python-llfuse
 505     git checkout 620722fd990ea642ddb8e7412676af482c090c0c
 506     git checkout setup.py
 507     sed -i -e "s:'1\\.2':'1.2.0':" setup.py
 508     python setup.py build_cython
 509     python setup.py install --force
 510 ) || fatal "llfuse fork failed"
 511 pip freeze | grep -x llfuse==1.2.0 || fatal "error: installed llfuse 1.2.0 but '$(pip freeze | grep llfuse)' ???"
 512
 513 # Deactivate Python 2 virtualenv
 514 deactivate
 515
 516 declare -a pythonstuff
 517 pythonstuff=(
 518     sdk/pam
 519     sdk/python
 520     sdk/python:py3
 521     sdk/cwl
 522     services/dockercleaner:py3
 523     services/fuse
 524     services/nodemanager
 525     tools/crunchstat-summary
 526     )
 527
 528 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 529 # Otherwise, skip dependent tests.
 530 PYTHON3=$(which python3)
 531 if [[ ${?} = 0 ]]; then
 532     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 533 else
 534     PYTHON3=
 535     cat >&2 <<EOF
 536
 537 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
 538
 539 EOF
 540 fi
 541
 542 # Reactivate Python 2 virtualenv
 543 . "$VENVDIR/bin/activate"
 544
 545 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 546 # whine a lot.
 547 setup_ruby_environment
 548
 549 echo "PATH is $PATH"
 550
 551 if ! which bundler >/dev/null
 552 then
 553     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 554 fi
 555
 556 retry() {
 557     remain="${repeat}"
 558     while :
 559     do
 560         if ${@}; then
 561             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 562                 remain=$((${remain}-1))
 563                 title "Repeating ${remain} more times"
 564             else
 565                 break
 566             fi
 567         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 568             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 569             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 570             then
 571                 break
 572             fi
 573         else
 574             break
 575         fi
 576     done
 577 }
 578
 579 do_test() {
 580     case "${1}" in
 581         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 582             suite=apps/workbench
 583             ;;
 584         services/nodemanager | services/nodemanager_integration)
 585             suite=services/nodemanager_suite
 586             ;;
 587         *)
 588             suite="${1}"
 589             ;;
 590     esac
 591     if [[ -z "${skip[$suite]}" && -z "${skip[$1]}" && \
 592                 (-z "${only}" || "${only}" == "${suite}" || \
 593                  "${only}" == "${1}") ]]; then
 594         retry do_test_once ${@}
 595     else
 596         title "Skipping ${1} tests"
 597     fi
 598 }
 599
 600 do_test_once() {
 601     unset result
 602
 603     title "Running $1 tests"
 604     timer_reset
 605     if [[ "$2" == "go" ]]
 606     then
 607         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 608         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 609         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 610         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 611         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 612         # compilation errors.
 613         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 614             cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 615             [[ -z "$(gofmt -e -d . | tee /dev/stderr)" ]] && \
 616             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 617         then
 618             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 619             # does:
 620             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 621         else
 622             # The above form gets verbose even when testargs is
 623             # empty, so use this form in such cases:
 624             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 625         fi
 626         result=${result:-$?}
 627         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 628         then
 629             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 630             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 631         fi
 632     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 633     then
 634         tries=0
 635         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 636         do
 637             tries=$((${tries}+1))
 638             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 639             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 640             "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 641             result=$?
 642             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 643             then
 644                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 645                 continue
 646             else
 647                 break
 648             fi
 649         done
 650     elif [[ "$2" != "" ]]
 651     then
 652         "test_$2"
 653     else
 654         "test_$1"
 655     fi
 656     result=${result:-$?}
 657     checkexit $result "$1 tests"
 658     title "End of $1 tests (`timer`)"
 659     return $result
 660 }
 661
 662 do_install() {
 663     if [[ -z "${only_install}" || "${only_install}" == "${1}" ]]; then
 664         retry do_install_once ${@}
 665     else
 666         title "Skipping $1 install"
 667     fi
 668 }
 669
 670 do_install_once() {
 671     title "Running $1 install"
 672     timer_reset
 673     if [[ "$2" == "go" ]]
 674     then
 675         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 676     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 677     then
 678         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 679         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 680
 681         # Need to change to a different directory after creating
 682         # the source dist package to avoid a pip bug.
 683         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 684
 685         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 686         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 687         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 688         # install" ensures that we've actually installed the local package
 689         # we just built.
 690         cd "$WORKSPACE/$1" \
 691             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 692             && cd "$WORKSPACE" \
 693             && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 694             && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 695     elif [[ "$2" != "" ]]
 696     then
 697         "install_$2"
 698     else
 699         "install_$1"
 700     fi
 701     result=$?
 702     checkexit $result "$1 install"
 703     title "End of $1 install (`timer`)"
 704     return $result
 705 }
 706
 707 bundle_install_trylocal() {
 708     (
 709         set -e
 710         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 711         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 712             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 713             bundle install --no-deployment
 714         fi
 715         bundle package --all
 716     )
 717 }
 718
 719 install_doc() {
 720     cd "$WORKSPACE/doc" \
 721         && bundle_install_trylocal \
 722         && rm -rf .site
 723 }
 724 do_install doc
 725
 726 install_gem() {
 727     gemname=$1
 728     srcpath=$2
 729     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 730         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 731         && bundle_install_trylocal \
 732         && gem build "$gemname.gemspec" \
 733         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 734 }
 735
 736 install_ruby_sdk() {
 737     install_gem arvados sdk/ruby
 738 }
 739 do_install sdk/ruby ruby_sdk
 740
 741 install_perl_sdk() {
 742     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 743         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 744         && make install INSTALLDIRS=perl
 745 }
 746 do_install sdk/perl perl_sdk
 747
 748 install_cli() {
 749     install_gem arvados-cli sdk/cli
 750 }
 751 do_install sdk/cli cli
 752
 753 install_login-sync() {
 754     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 755 }
 756 do_install services/login-sync login-sync
 757
 758 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
 759 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
 760 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
 761 # its own test suite brings up some of those other programs (like
 762 # keepproxy).
 763 for p in "${pythonstuff[@]}"
 764 do
 765     dir=${p%:py3}
 766     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
 767         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
 768             do_install ${dir} pip
 769         fi
 770     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
 771         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
 772             do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
 773         fi
 774     fi
 775 done
 776
 777 install_apiserver() {
 778     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 779         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 780
 781     rm -f config/environments/test.rb
 782     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 783
 784     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 785     then
 786         for f in database.yml
 787         do
 788             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 789         done
 790     fi
 791
 792     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 793     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 794     # is a postgresql superuser.
 795     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 796         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 797         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 798
 799     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 800
 801     cert="$WORKSPACE/services/api/tmp/self-signed"
 802     if [[ ! -e "$cert.pem" || "$(date -r "$cert.pem" +%s)" -lt 1512659226 ]]; then
 803         (
 804             dir="$WORKSPACE/services/api/tmp"
 805             set -ex
 806             openssl req -newkey rsa:2048 -nodes -subj '/C=US/ST=State/L=City/CN=localhost' -out "$cert.csr" -keyout "$cert.key" </dev/null
 807             openssl x509 -req -in "$cert.csr" -signkey "$cert.key" -out "$cert.pem" -days 3650 -extfile <(printf 'subjectAltName=DNS:localhost,DNS:::1,DNS:0.0.0.0,DNS:127.0.0.1,IP:::1,IP:0.0.0.0,IP:127.0.0.1')
 808         ) || return 1
 809     fi
 810
 811     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 812         && rm -rf tmp/git \
 813         && mkdir -p tmp/git \
 814         && cd tmp/git \
 815         && tar xf ../../test/test.git.tar \
 816         && mkdir -p internal.git \
 817         && git --git-dir internal.git init \
 818             || return 1
 819
 820     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 821         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 822         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 823         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 824 }
 825 do_install services/api apiserver
 826
 827 cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" && \
 828     "$GOPATH/bin/govendor" sync -v || \
 829         fatal "govendor sync failed"
 830 declare -a gostuff
 831 gostuff=(
 832     sdk/go/arvados
 833     sdk/go/arvadosclient
 834     sdk/go/blockdigest
 835     sdk/go/dispatch
 836     sdk/go/health
 837     sdk/go/httpserver
 838     sdk/go/manifest
 839     sdk/go/asyncbuf
 840     sdk/go/crunchrunner
 841     sdk/go/stats
 842     lib/crunchstat
 843     services/arv-git-httpd
 844     services/crunchstat
 845     services/health
 846     services/keep-web
 847     services/keepstore
 848     sdk/go/keepclient
 849     services/keep-balance
 850     services/keepproxy
 851     services/crunch-dispatch-local
 852     services/crunch-dispatch-slurm
 853     services/crunch-run
 854     services/ws
 855     tools/keep-block-check
 856     tools/keep-exercise
 857     tools/keep-rsync
 858     tools/sync-groups
 859 )
 860 for g in "${gostuff[@]}"
 861 do
 862     do_install "$g" go
 863 done
 864
 865 install_workbench() {
 866     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 867         && mkdir -p tmp/cache \
 868         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
 869         && RAILS_ENV=test RAILS_GROUPS=assets bundle exec rake npm:install
 870 }
 871 do_install apps/workbench workbench
 872
 873 unset http_proxy https_proxy no_proxy
 874
 875 test_doclinkchecker() {
 876     (
 877         set -e
 878         cd "$WORKSPACE/doc"
 879         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
 880         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
 881         # do much good!
 882         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
 883     )
 884 }
 885 do_test doc doclinkchecker
 886
 887 stop_services
 888
 889 test_apiserver() {
 890     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
 891     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 892         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
 893 }
 894 do_test services/api apiserver
 895
 896 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
 897 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
 898 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
 899   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 900   exit_cleanly
 901 fi
 902
 903 start_services || { stop_services; fatal "start_services"; }
 904
 905 test_ruby_sdk() {
 906     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
 907         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
 908 }
 909 do_test sdk/ruby ruby_sdk
 910
 911 test_cli() {
 912     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
 913         && mkdir -p /tmp/keep \
 914         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
 915 }
 916 do_test sdk/cli cli
 917
 918 test_login-sync() {
 919     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
 920         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
 921 }
 922 do_test services/login-sync login-sync
 923
 924 test_nodemanager_integration() {
 925     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
 926         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager_integration]}
 927 }
 928 do_test services/nodemanager_integration nodemanager_integration
 929
 930 for p in "${pythonstuff[@]}"
 931 do
 932     dir=${p%:py3}
 933     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
 934         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
 935             do_test ${dir} pip
 936         fi
 937     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
 938         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
 939             do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
 940         fi
 941     fi
 942 done
 943
 944 for g in "${gostuff[@]}"
 945 do
 946     do_test "$g" go
 947 done
 948
 949 test_workbench_units() {
 950     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 951         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 952 }
 953 do_test apps/workbench_units workbench_units
 954
 955 test_workbench_functionals() {
 956     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 957         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 958 }
 959 do_test apps/workbench_functionals workbench_functionals
 960
 961 test_workbench_integration() {
 962     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 963         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 964 }
 965 do_test apps/workbench_integration workbench_integration
 966
 967
 968 test_workbench_benchmark() {
 969     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 970         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
 971 }
 972 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
 973
 974 test_workbench_profile() {
 975     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 976         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
 977 }
 978 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
 979
 980 exit_cleanly