Merge branch '17755-singularity-race' into main refs #17755
[arvados.git] / lib / crunchrun / docker.go
1 // Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
2 //
3 // SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
4 package crunchrun
5
6 import (
7         "fmt"
8         "io"
9         "io/ioutil"
10         "os"
11         "strings"
12         "time"
13
14         "git.arvados.org/arvados.git/sdk/go/arvados"
15         dockertypes "github.com/docker/docker/api/types"
16         dockercontainer "github.com/docker/docker/api/types/container"
17         dockerclient "github.com/docker/docker/client"
18         "golang.org/x/net/context"
19 )
20
21 // Docker daemon won't let you set a limit less than ~10 MiB
22 const minDockerRAM = int64(16 * 1024 * 1024)
23
24 type dockerExecutor struct {
25         containerUUID    string
26         logf             func(string, ...interface{})
27         watchdogInterval time.Duration
28         dockerclient     *dockerclient.Client
29         containerID      string
30         doneIO           chan struct{}
31         errIO            error
32 }
33
34 func newDockerExecutor(containerUUID string, logf func(string, ...interface{}), watchdogInterval time.Duration) (*dockerExecutor, error) {
35         // API version 1.21 corresponds to Docker 1.9, which is
36         // currently the minimum version we want to support.
37         client, err := dockerclient.NewClient(dockerclient.DefaultDockerHost, "1.21", nil, nil)
38         if watchdogInterval < 1 {
39                 watchdogInterval = time.Minute
40         }
41         return &dockerExecutor{
42                 containerUUID:    containerUUID,
43                 logf:             logf,
44                 watchdogInterval: watchdogInterval,
45                 dockerclient:     client,
46         }, err
47 }
48
49 func (e *dockerExecutor) LoadImage(imageID string, imageTarballPath string, container arvados.Container, arvMountPoint string,
50         containerClient *arvados.Client) error {
51         _, _, err := e.dockerclient.ImageInspectWithRaw(context.TODO(), imageID)
52         if err == nil {
53                 // already loaded
54                 return nil
55         }
56
57         f, err := os.Open(imageTarballPath)
58         if err != nil {
59                 return err
60         }
61         defer f.Close()
62         resp, err := e.dockerclient.ImageLoad(context.TODO(), f, true)
63         if err != nil {
64                 return fmt.Errorf("While loading container image into Docker: %v", err)
65         }
66         defer resp.Body.Close()
67         buf, _ := ioutil.ReadAll(resp.Body)
68         e.logf("loaded image: response %s", buf)
69         return nil
70 }
71
72 func (e *dockerExecutor) Create(spec containerSpec) error {
73         e.logf("Creating Docker container")
74         cfg := dockercontainer.Config{
75                 Image:        spec.Image,
76                 Cmd:          spec.Command,
77                 WorkingDir:   spec.WorkingDir,
78                 Volumes:      map[string]struct{}{},
79                 OpenStdin:    spec.Stdin != nil,
80                 StdinOnce:    spec.Stdin != nil,
81                 AttachStdin:  spec.Stdin != nil,
82                 AttachStdout: true,
83                 AttachStderr: true,
84         }
85         if cfg.WorkingDir == "." {
86                 cfg.WorkingDir = ""
87         }
88         for k, v := range spec.Env {
89                 cfg.Env = append(cfg.Env, k+"="+v)
90         }
91         if spec.RAM > 0 && spec.RAM < minDockerRAM {
92                 spec.RAM = minDockerRAM
93         }
94         hostCfg := dockercontainer.HostConfig{
95                 LogConfig: dockercontainer.LogConfig{
96                         Type: "none",
97                 },
98                 NetworkMode: dockercontainer.NetworkMode("none"),
99                 Resources: dockercontainer.Resources{
100                         CgroupParent: spec.CgroupParent,
101                         NanoCPUs:     int64(spec.VCPUs) * 1000000000,
102                         Memory:       spec.RAM, // RAM
103                         MemorySwap:   spec.RAM, // RAM+swap
104                         KernelMemory: spec.RAM, // kernel portion
105                 },
106         }
107         for path, mount := range spec.BindMounts {
108                 bind := mount.HostPath + ":" + path
109                 if mount.ReadOnly {
110                         bind += ":ro"
111                 }
112                 hostCfg.Binds = append(hostCfg.Binds, bind)
113         }
114         if spec.EnableNetwork {
115                 hostCfg.NetworkMode = dockercontainer.NetworkMode(spec.NetworkMode)
116         }
117
118         created, err := e.dockerclient.ContainerCreate(context.TODO(), &cfg, &hostCfg, nil, e.containerUUID)
119         if err != nil {
120                 return fmt.Errorf("While creating container: %v", err)
121         }
122         e.containerID = created.ID
123         return e.startIO(spec.Stdin, spec.Stdout, spec.Stderr)
124 }
125
126 func (e *dockerExecutor) CgroupID() string {
127         return e.containerID
128 }
129
130 func (e *dockerExecutor) Start() error {
131         return e.dockerclient.ContainerStart(context.TODO(), e.containerID, dockertypes.ContainerStartOptions{})
132 }
133
134 func (e *dockerExecutor) Stop() error {
135         err := e.dockerclient.ContainerRemove(context.TODO(), e.containerID, dockertypes.ContainerRemoveOptions{Force: true})
136         if err != nil && strings.Contains(err.Error(), "No such container: "+e.containerID) {
137                 err = nil
138         }
139         return err
140 }
141
142 // Wait for the container to terminate, capture the exit code, and
143 // wait for stdout/stderr logging to finish.
144 func (e *dockerExecutor) Wait(ctx context.Context) (int, error) {
145         ctx, cancel := context.WithCancel(ctx)
146         defer cancel()
147         watchdogErr := make(chan error, 1)
148         go func() {
149                 ticker := time.NewTicker(e.watchdogInterval)
150                 defer ticker.Stop()
151                 for range ticker.C {
152                         dctx, dcancel := context.WithDeadline(ctx, time.Now().Add(e.watchdogInterval))
153                         ctr, err := e.dockerclient.ContainerInspect(dctx, e.containerID)
154                         dcancel()
155                         if ctx.Err() != nil {
156                                 // Either the container already
157                                 // exited, or our caller is trying to
158                                 // kill it.
159                                 return
160                         } else if err != nil {
161                                 e.logf("Error inspecting container: %s", err)
162                                 watchdogErr <- err
163                                 return
164                         } else if ctr.State == nil || !(ctr.State.Running || ctr.State.Status == "created") {
165                                 watchdogErr <- fmt.Errorf("Container is not running: State=%v", ctr.State)
166                                 return
167                         }
168                 }
169         }()
170
171         waitOk, waitErr := e.dockerclient.ContainerWait(ctx, e.containerID, dockercontainer.WaitConditionNotRunning)
172         for {
173                 select {
174                 case waitBody := <-waitOk:
175                         e.logf("Container exited with code: %v", waitBody.StatusCode)
176                         // wait for stdout/stderr to complete
177                         <-e.doneIO
178                         return int(waitBody.StatusCode), nil
179
180                 case err := <-waitErr:
181                         return -1, fmt.Errorf("container wait: %v", err)
182
183                 case <-ctx.Done():
184                         return -1, ctx.Err()
185
186                 case err := <-watchdogErr:
187                         return -1, err
188                 }
189         }
190 }
191
192 func (e *dockerExecutor) startIO(stdin io.Reader, stdout, stderr io.Writer) error {
193         resp, err := e.dockerclient.ContainerAttach(context.TODO(), e.containerID, dockertypes.ContainerAttachOptions{
194                 Stream: true,
195                 Stdin:  stdin != nil,
196                 Stdout: true,
197                 Stderr: true,
198         })
199         if err != nil {
200                 return fmt.Errorf("error attaching container stdin/stdout/stderr streams: %v", err)
201         }
202         var errStdin error
203         if stdin != nil {
204                 go func() {
205                         errStdin = e.handleStdin(stdin, resp.Conn, resp.CloseWrite)
206                 }()
207         }
208         e.doneIO = make(chan struct{})
209         go func() {
210                 e.errIO = e.handleStdoutStderr(stdout, stderr, resp.Reader)
211                 if e.errIO == nil && errStdin != nil {
212                         e.errIO = errStdin
213                 }
214                 close(e.doneIO)
215         }()
216         return nil
217 }
218
219 func (e *dockerExecutor) handleStdin(stdin io.Reader, conn io.Writer, closeConn func() error) error {
220         defer closeConn()
221         _, err := io.Copy(conn, stdin)
222         if err != nil {
223                 return fmt.Errorf("While writing to docker container on stdin: %v", err)
224         }
225         return nil
226 }
227
228 // Handle docker log protocol; see
229 // https://docs.docker.com/engine/reference/api/docker_remote_api_v1.15/#attach-to-a-container
230 func (e *dockerExecutor) handleStdoutStderr(stdout, stderr io.Writer, reader io.Reader) error {
231         header := make([]byte, 8)
232         var err error
233         for err == nil {
234                 _, err = io.ReadAtLeast(reader, header, 8)
235                 if err != nil {
236                         if err == io.EOF {
237                                 err = nil
238                         }
239                         break
240                 }
241                 readsize := int64(header[7]) | (int64(header[6]) << 8) | (int64(header[5]) << 16) | (int64(header[4]) << 24)
242                 if header[0] == 1 {
243                         _, err = io.CopyN(stdout, reader, readsize)
244                 } else {
245                         // stderr
246                         _, err = io.CopyN(stderr, reader, readsize)
247                 }
248         }
249         if err != nil {
250                 return fmt.Errorf("error copying stdout/stderr from docker: %v", err)
251         }
252         return nil
253 }
254
255 func (e *dockerExecutor) Close() {
256         e.dockerclient.ContainerRemove(context.TODO(), e.containerID, dockertypes.ContainerRemoveOptions{Force: true})
257 }