sdk/cwl/tests/federation/arvbox/start.cwl

   1 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   2 #
   3 # SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
   4
   5 cwlVersion: v1.0
   6 class: CommandLineTool
   7 $namespaces:
   8   arv: "http://arvados.org/cwl#"
   9   cwltool: "http://commonwl.org/cwltool#"
  10 inputs:
  11   container_name: string
  12   arvbox_data: Directory
  13   arvbox_bin: File
  14   branch:
  15     type: string
  16     default: master
  17 outputs:
  18   cluster_id:
  19     type: string
  20     outputBinding:
  21       glob: status.txt
  22       loadContents: true
  23       outputEval: |
  24         ${
  25         var sp = self[0].contents.split("\n");
  26         for (var i = 0; i < sp.length; i++) {
  27           if (sp[i].startsWith("Cluster id: ")) {
  28             return sp[i].substr(12);
  29           }
  30         }
  31         }
  32   container_host:
  33     type: string
  34     outputBinding:
  35       glob: status.txt
  36       loadContents: true
  37       outputEval: |
  38         ${
  39         var sp = self[0].contents.split("\n");
  40         for (var i = 0; i < sp.length; i++) {
  41           if (sp[i].startsWith("Container IP: ")) {
  42             return sp[i].substr(14)+":8000";
  43           }
  44         }
  45         }
  46   superuser_token:
  47     type: string
  48     outputBinding:
  49       glob: superuser_token.txt
  50       loadContents: true
  51       outputEval: $(self[0].contents.trim())
  52   arvbox_data_out:
  53     type: Directory
  54     outputBinding:
  55       outputEval: $(inputs.arvbox_data)
  56 requirements:
  57   EnvVarRequirement:
  58     envDef:
  59       ARVBOX_CONTAINER: $(inputs.container_name)
  60       ARVBOX_DATA: $(inputs.arvbox_data.path)
  61   ShellCommandRequirement: {}
  62   InitialWorkDirRequirement:
  63     listing:
  64       - entry: $(inputs.arvbox_data)
  65         entryname: $(inputs.container_name)
  66         writable: true
  67   cwltool:InplaceUpdateRequirement:
  68     inplaceUpdate: true
  69   InlineJavascriptRequirement: {}
  70 arguments:
  71   - shellQuote: false
  72     valueFrom: |
  73       set -ex
  74       mkdir -p $ARVBOX_DATA
  75       if ! test -d $ARVBOX_DATA/arvados ; then
  76         cd $ARVBOX_DATA
  77         git clone https://github.com/curoverse/arvados.git
  78       fi
  79       cd $ARVBOX_DATA/arvados
  80       gitver=`git rev-parse HEAD`
  81       git fetch
  82       git checkout -f $(inputs.branch)
  83       git pull
  84       pulled=`git rev-parse HEAD`
  85       git --no-pager log -n1 $pulled
  86
  87       cd $(runtime.outdir)
  88       if test "$gitver" = "$pulled" ; then
  89         $(inputs.arvbox_bin.path) start dev
  90       else
  91         $(inputs.arvbox_bin.path) restart dev
  92       fi
  93       $(inputs.arvbox_bin.path) status > status.txt
  94       $(inputs.arvbox_bin.path) cat /var/lib/arvados/superuser_token > superuser_token.txt