build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
   5
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin.sh
   7
   8 COLUMNS=80
   9 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
  10
  11 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
  12 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  13
  14 Exit non-zero if any tests fail.
  15
  16 Syntax:
  17         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  18
  19 Options:
  20
  21 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  22 --skip sanity  Skip initial dev environment sanity checks.
  23 --skip install Do not run any install steps. Just run tests.
  24                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  25                from a previous invocation if you use this option.
  26 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  27 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  28                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  29 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  30                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  31                subsequent invocations.
  32 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  33 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  34 --only-install Run specific install step
  35 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  36 --interactive  Set up, then prompt for test/install steps to perform.
  37 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  38 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  39                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  40 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  41                Restrict apiserver tests to the given file
  42 sdk/python_test="--test-suite tests.test_keep_locator"
  43                Restrict Python SDK tests to the given class
  44 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  45                Restrict Workbench tests to the given file
  46 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  47                Show all log messages, even when tests pass (also works
  48                with services/keepstore_test etc.)
  49 ARVADOS_DEBUG=1
  50                Print more debug messages
  51 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  52                *_test, and other examples shown above.
  53
  54 Assuming "--skip install" is not given, all components are installed
  55 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  56 test suites depend on other components being installed, and installing
  57 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  58
  59 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  60 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  61
  62 More information and background:
  63
  64 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  65
  66 Available tests:
  67
  68 apps/workbench (*)
  69 apps/workbench_units (*)
  70 apps/workbench_functionals (*)
  71 apps/workbench_integration (*)
  72 apps/workbench_benchmark
  73 apps/workbench_profile
  74 cmd/arvados-client
  75 cmd/arvados-server
  76 doc
  77 lib/cli
  78 lib/cmd
  79 lib/controller
  80 lib/crunchstat
  81 lib/cloud
  82 lib/cloud/azure
  83 lib/dispatchcloud
  84 lib/dispatchcloud/container
  85 lib/dispatchcloud/scheduler
  86 lib/dispatchcloud/ssh_executor
  87 lib/dispatchcloud/worker
  88 lib/service
  89 services/api
  90 services/arv-git-httpd
  91 services/crunchstat
  92 services/dockercleaner
  93 services/fuse
  94 services/health
  95 services/keep-web
  96 services/keepproxy
  97 services/keepstore
  98 services/keep-balance
  99 services/login-sync
 100 services/nodemanager
 101 services/nodemanager_integration
 102 services/crunch-run
 103 services/crunch-dispatch-local
 104 services/crunch-dispatch-slurm
 105 services/ws
 106 sdk/cli
 107 sdk/pam
 108 sdk/python
 109 sdk/python:py3
 110 sdk/ruby
 111 sdk/go/arvados
 112 sdk/go/arvadosclient
 113 sdk/go/auth
 114 sdk/go/dispatch
 115 sdk/go/keepclient
 116 sdk/go/health
 117 sdk/go/httpserver
 118 sdk/go/manifest
 119 sdk/go/blockdigest
 120 sdk/go/asyncbuf
 121 sdk/go/stats
 122 sdk/go/crunchrunner
 123 sdk/cwl
 124 sdk/R
 125 sdk/java-v2
 126 tools/sync-groups
 127 tools/crunchstat-summary
 128 tools/crunchstat-summary:py3
 129 tools/keep-exercise
 130 tools/keep-rsync
 131 tools/keep-block-check
 132
 133 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 134     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 135
 136 EOF
 137
 138 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 139 # environment that could interfere with the tests.
 140 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 141
 142 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 143 # accident.
 144 GITDIR=
 145 GOPATH=
 146 VENVDIR=
 147 VENV3DIR=
 148 PYTHONPATH=
 149 GEMHOME=
 150 PERLINSTALLBASE=
 151 R_LIBS=
 152 export LANG=en_US.UTF-8
 153
 154 short=
 155 only_install=
 156 temp=
 157 temp_preserve=
 158
 159 clear_temp() {
 160     if [[ -z "$temp" ]]; then
 161         # we didn't even get as far as making a temp dir
 162         :
 163     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 164         rm -rf "$temp"
 165     else
 166         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 167     fi
 168 }
 169
 170 fatal() {
 171     clear_temp
 172     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 173     exit 1
 174 }
 175
 176 exit_cleanly() {
 177     trap - INT
 178     if which create-plot-data-from-log.sh >/dev/null; then
 179         create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 180     fi
 181     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 182     stop_services
 183     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 184     report_outcomes
 185     clear_temp
 186     exit ${#failures}
 187 }
 188
 189 sanity_checks() {
 190     [[ -n "${skip[sanity]}" ]] && return 0
 191     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 192         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 193     echo Checking dependencies:
 194     echo "locale: ${LANG}"
 195     [[ "$(locale charmap)" = "UTF-8" ]] \
 196         || fatal "Locale '${LANG}' is broken/missing. Try: echo ${LANG} | sudo tee -a /etc/locale.gen && sudo locale-gen"
 197     echo -n 'virtualenv: '
 198     virtualenv --version \
 199         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 200     echo -n 'ruby: '
 201     ruby -v \
 202         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 203     echo -n 'go: '
 204     go version \
 205         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 206     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 10 ]] \
 207         || fatal "Go >= 1.10 required. See http://golang.org/doc/install"
 208     echo -n 'gcc: '
 209     gcc --version | egrep ^gcc \
 210         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 211     echo -n 'fuse.h: '
 212     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 213         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 214     echo -n 'gnutls.h: '
 215     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 216         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 217     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
 218     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 219         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
 220     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 221     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 222         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 223     echo -n 'nginx: '
 224     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 225         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 226     echo -n 'perl: '
 227     perl -v | grep version \
 228         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 229     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 230         echo -n "perl $mod: "
 231         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 232             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 233     done
 234     echo -n 'gitolite: '
 235     which gitolite \
 236         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 237     echo -n 'npm: '
 238     npm --version \
 239         || fatal "No npm. Try: wget -O- https://nodejs.org/dist/v6.11.2/node-v6.11.2-linux-x64.tar.xz | sudo tar -C /usr/local -xJf - && sudo ln -s ../node-v6.11.2-linux-x64/bin/{node,npm} /usr/local/bin/"
 240     echo -n 'cadaver: '
 241     cadaver --version | grep -w cadaver \
 242           || fatal "No cadaver. Try: apt-get install cadaver"
 243     echo -n 'libattr1 xattr.h: '
 244     find /usr/include -path '*/attr/xattr.h' | egrep --max-count=1 . \
 245         || fatal "No libattr1 xattr.h. Try: apt-get install libattr1-dev"
 246     echo -n 'libcurl curl.h: '
 247     find /usr/include -path '*/curl/curl.h' | egrep --max-count=1 . \
 248         || fatal "No libcurl curl.h. Try: apt-get install libcurl4-gnutls-dev"
 249     echo -n 'libpq libpq-fe.h: '
 250     find /usr/include -path '*/postgresql/libpq-fe.h' | egrep --max-count=1 . \
 251         || fatal "No libpq libpq-fe.h. Try: apt-get install libpq-dev"
 252     echo -n 'services/api/config/database.yml: '
 253     if [[ ! -f "$WORKSPACE/services/api/config/database.yml" ]]; then
 254             fatal "Please provide a database.yml file for the test suite"
 255     else
 256             echo "OK"
 257     fi
 258     echo -n 'postgresql: '
 259     psql --version || fatal "No postgresql. Try: apt-get install postgresql postgresql-client-common"
 260     echo -n 'phantomjs: '
 261     phantomjs --version || fatal "No phantomjs. Try: apt-get install phantomjs"
 262     echo -n 'xvfb: '
 263     which Xvfb || fatal "No xvfb. Try: apt-get install xvfb"
 264     echo -n 'graphviz: '
 265     dot -V || fatal "No graphviz. Try: apt-get install graphviz"
 266     echo -n 'geckodriver: '
 267     geckodriver --version | grep ^geckodriver || echo "No geckodriver. Try: wget -O- https://github.com/mozilla/geckodriver/releases/download/v0.23.0/geckodriver-v0.23.0-linux64.tar.gz | sudo tar -C /usr/local/bin -xzf - geckodriver"
 268
 269     if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 270       # R SDK stuff
 271       echo -n 'R: '
 272       which Rscript || fatal "No Rscript. Try: apt-get install r-base"
 273       echo -n 'testthat: '
 274       Rscript -e "library('testthat')" || fatal "No testthat. Try: apt-get install r-cran-testthat"
 275       # needed for roxygen2, needed for devtools, needed for R sdk
 276       pkg-config --exists libxml-2.0 || fatal "No libxml2. Try: apt-get install libxml2-dev"
 277       # needed for pkgdown, builds R SDK doc pages
 278       which pandoc || fatal "No pandoc. Try: apt-get install pandoc"
 279     fi
 280 }
 281
 282 rotate_logfile() {
 283   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 284   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 285   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 286     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 287     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 288     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 289   fi
 290 }
 291
 292 declare -a failures
 293 declare -A skip
 294 declare -A only
 295 declare -A testargs
 296 skip[apps/workbench_profile]=1
 297 # nodemanager_integration tests are not reliable, see #12061.
 298 skip[services/nodemanager_integration]=1
 299
 300 while [[ -n "$1" ]]
 301 do
 302     arg="$1"; shift
 303     case "$arg" in
 304         --help)
 305             echo >&2 "$helpmessage"
 306             echo >&2
 307             exit 1
 308             ;;
 309         --skip)
 310             skip[$1]=1; shift
 311             ;;
 312         --only)
 313             only[$1]=1; skip[$1]=""; shift
 314             ;;
 315         --short)
 316             short=1
 317             ;;
 318         --interactive)
 319             interactive=1
 320             ;;
 321         --skip-install)
 322             skip[install]=1
 323             ;;
 324         --only-install)
 325             only_install="$1"; shift
 326             ;;
 327         --temp)
 328             temp="$1"; shift
 329             temp_preserve=1
 330             ;;
 331         --leave-temp)
 332             temp_preserve=1
 333             ;;
 334         --repeat)
 335             repeat=$((${1}+0)); shift
 336             ;;
 337         --retry)
 338             retry=1
 339             ;;
 340         *_test=*)
 341             suite="${arg%%_test=*}"
 342             args="${arg#*=}"
 343             testargs["$suite"]="$args"
 344             ;;
 345         *=*)
 346             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 347             ;;
 348         *)
 349             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 350             exit 1
 351             ;;
 352     esac
 353 done
 354
 355 # R SDK installation is very slow (~360s in a clean environment) and only
 356 # required when testing it. Skip that step if it is not needed.
 357 NEED_SDK_R=true
 358
 359 if [[ ${#only[@]} -ne 0 ]] &&
 360    [[ -z "${only['sdk/R']}" && -z "${only['doc']}" ]]; then
 361   NEED_SDK_R=false
 362 fi
 363
 364 if [[ ${skip["sdk/R"]} == 1 && ${skip["doc"]} == 1 ]]; then
 365   NEED_SDK_R=false
 366 fi
 367
 368 if [[ $NEED_SDK_R == false ]]; then
 369         echo "R SDK not needed, it will not be installed."
 370 fi
 371
 372 checkpidfile() {
 373     svc="$1"
 374     pid="$(cat "$WORKSPACE/tmp/${svc}.pid")"
 375     if [[ -z "$pid" ]] || ! kill -0 "$pid"; then
 376         tail $WORKSPACE/tmp/${1}*.log
 377         echo "${svc} pid ${pid} not running"
 378         return 1
 379     fi
 380     echo "${svc} pid ${pid} ok"
 381 }
 382
 383 checkdiscoverydoc() {
 384     dd="https://${1}/discovery/v1/apis/arvados/v1/rest"
 385     if ! (set -o pipefail; curl -fsk "$dd" | grep -q ^{ ); then
 386         echo >&2 "ERROR: could not retrieve discovery doc from RailsAPI at $dd"
 387         tail -v $WORKSPACE/services/api/log/test.log
 388         return 1
 389     fi
 390     echo "${dd} ok"
 391 }
 392
 393 start_services() {
 394     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 395         return 0
 396     fi
 397     . "$VENVDIR/bin/activate"
 398     echo 'Starting API, controller, keepproxy, keep-web, arv-git-httpd, ws, and nginx ssl proxy...'
 399     if [[ ! -d "$WORKSPACE/services/api/log" ]]; then
 400         mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/log"
 401     fi
 402     # Remove empty api.pid file if it exists
 403     if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid" && ! -s "$WORKSPACE/tmp/api.pid" ]]; then
 404         rm -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid"
 405     fi
 406     all_services_stopped=
 407     fail=1
 408     cd "$WORKSPACE" \
 409         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 410         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 411         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 412         && checkpidfile api \
 413         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 414         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_controller \
 415         && checkpidfile controller \
 416         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 417         && checkpidfile keepproxy \
 418         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 419         && checkpidfile keep-web \
 420         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 421         && checkpidfile arv-git-httpd \
 422         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 423         && checkpidfile ws \
 424         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx) \
 425         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 426         && checkpidfile nginx \
 427         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1 \
 428         && (env | egrep ^ARVADOS) \
 429         && fail=0
 430     deactivate
 431     if [[ $fail != 0 ]]; then
 432         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 433     fi
 434     return $fail
 435 }
 436
 437 stop_services() {
 438     if [[ -n "$all_services_stopped" ]]; then
 439         return
 440     fi
 441     unset ARVADOS_TEST_API_HOST ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 442     . "$VENVDIR/bin/activate" || return
 443     cd "$WORKSPACE" \
 444         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 445         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 446         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 447         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 448         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy \
 449         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_controller \
 450         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop \
 451         && all_services_stopped=1
 452     deactivate
 453 }
 454
 455 interrupt() {
 456     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 457     exit_cleanly
 458 }
 459 trap interrupt INT
 460
 461 setup_ruby_environment() {
 462     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 463         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 464         using_rvm=true
 465     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 466         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 467         using_rvm=true
 468     else
 469         using_rvm=false
 470     fi
 471
 472     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 473         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 474         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 475         # the environment to the "current gemset", which would lose
 476         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 477         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 478         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 479         # rvm gemset and use it for everything.
 480
 481         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 482             || fatal 'rvm check'
 483
 484         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 485         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 486         # complaint about not being in first place already.
 487         rvm use @default 2>/dev/null
 488
 489         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 490         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 491         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 492         # ruby to the caller.
 493         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 494         rvm use "@${gemset}" --create \
 495             || fatal 'rvm gemset setup'
 496
 497         rvm env
 498     else
 499         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 500         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 501         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 502         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 503         # should be installed, and we should leave it alone.)
 504
 505         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 506             user_gempath="$(gem env gempath)"
 507             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 508         fi
 509         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 510
 511         # When we build and install our own gems, we install them in our
 512         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 513         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 514         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 515
 516         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 517         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 518         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
 519
 520         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 521         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 522         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 523     fi
 524     bundle config || gem install bundler \
 525         || fatal 'install bundler'
 526 }
 527
 528 with_test_gemset() {
 529     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 530         "$@"
 531     else
 532         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 533     fi
 534 }
 535
 536 gem_uninstall_if_exists() {
 537     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 538         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 539     fi
 540 }
 541
 542 setup_virtualenv() {
 543     local venvdest="$1"; shift
 544     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 545         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 546     elif [[ -n "$short" ]]; then
 547         return
 548     fi
 549     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 550         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 551         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 552     else
 553         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 554     fi
 555     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 556     "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 557 }
 558
 559 initialize() {
 560     sanity_checks
 561
 562     echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 563
 564     if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 565         # Jenkins expects us to use this by default.
 566         CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 567     fi
 568
 569     # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 570     cd "$WORKSPACE"
 571     find -name '*.pyc' -delete
 572
 573     if [[ -z "$temp" ]]; then
 574         temp="$(mktemp -d)"
 575     fi
 576
 577     # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 578     for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE R_LIBS
 579     do
 580         if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 581             eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 582         fi
 583         if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 584             mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 585         fi
 586     done
 587
 588     rm -vf "${WORKSPACE}/tmp/*.log"
 589
 590     export PERLINSTALLBASE
 591     export PERL5LIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5${PERL5LIB:+:$PERL5LIB}"
 592
 593     export R_LIBS
 594
 595     export GOPATH
 596
 597     # Jenkins config requires that glob tmp/*.log match something. Ensure
 598     # that happens even if we don't end up running services that set up
 599     # logging.
 600     mkdir -p "${WORKSPACE}/tmp/" || fatal "could not mkdir ${WORKSPACE}/tmp"
 601     touch "${WORKSPACE}/tmp/controller.log" || fatal "could not touch ${WORKSPACE}/tmp/controller.log"
 602
 603     unset http_proxy https_proxy no_proxy
 604
 605
 606     # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 607     # whine a lot.
 608     setup_ruby_environment
 609
 610     echo "PATH is $PATH"
 611 }
 612
 613 install_env() {
 614     (
 615         set -e
 616         mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 617         if [[ ! -h "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" ]]; then
 618             for d in \
 619                 "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/tmp/GOPATH" \
 620                     "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/tmp" \
 621                     "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"; do
 622                 [[ -d "$d" ]] && rmdir "$d"
 623             done
 624         fi
 625         for d in \
 626             "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/arvados" \
 627                 "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"; do
 628             [[ -h "$d" ]] && rm "$d"
 629         done
 630         ln -vsfT "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
 631         go get -v github.com/kardianos/govendor
 632         cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
 633         if [[ -n "$short" ]]; then
 634             go get -v -d ...
 635             "$GOPATH/bin/govendor" sync
 636         else
 637             # Remove cached source dirs in workdir. Otherwise, they will
 638             # not qualify as +missing or +external below, and we won't be
 639             # able to detect that they're missing from vendor/vendor.json.
 640             rm -rf vendor/*/
 641             go get -v -d ...
 642             "$GOPATH/bin/govendor" sync
 643             [[ -z $("$GOPATH/bin/govendor" list +unused +missing +external | tee /dev/stderr) ]] \
 644                 || fatal "vendor/vendor.json has unused or missing dependencies -- try:
 645
 646 (export GOPATH=\"${GOPATH}\"; cd \$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git && \$GOPATH/bin/govendor add +missing +external && \$GOPATH/bin/govendor remove +unused)
 647
 648 ";
 649         fi
 650     ) || fatal "Go setup failed"
 651
 652     setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 653     . "$VENVDIR/bin/activate"
 654
 655     # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 656     pip install --no-cache-dir PyYAML \
 657         || fatal "pip install PyYAML failed"
 658
 659     # Preinstall libcloud if using a fork; otherwise nodemanager "pip
 660     # install" won't pick it up by default.
 661     if [[ -n "$LIBCLOUD_PIN_SRC" ]]; then
 662         pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 663             || pip install --pre --ignore-installed --no-cache-dir "$LIBCLOUD_PIN_SRC" >/dev/null \
 664             || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 665     fi
 666
 667     # Deactivate Python 2 virtualenv
 668     deactivate
 669
 670     # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 671     # Otherwise, skip dependent tests.
 672     PYTHON3=$(which python3)
 673     if [[ ${?} = 0 ]]; then
 674         setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 675     else
 676         PYTHON3=
 677         cat >&2 <<EOF
 678
 679 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
 680
 681 EOF
 682     fi
 683
 684     if ! which bundler >/dev/null
 685     then
 686         gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 687     fi
 688 }
 689
 690 retry() {
 691     remain="${repeat}"
 692     while :
 693     do
 694         if ${@}; then
 695             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 696                 remain=$((${remain}-1))
 697                 title "(repeating ${remain} more times)"
 698             else
 699                 break
 700             fi
 701         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 702             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 703             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 704             then
 705                 break
 706             fi
 707         else
 708             break
 709         fi
 710     done
 711 }
 712
 713 do_test() {
 714     case "${1}" in
 715         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 716             suite=apps/workbench
 717             ;;
 718         services/nodemanager | services/nodemanager_integration)
 719             suite=services/nodemanager_suite
 720             ;;
 721         *)
 722             suite="${1}"
 723             ;;
 724     esac
 725     if [[ -n "${skip[$suite]}" || \
 726               -n "${skip[$1]}" || \
 727               (${#only[@]} -ne 0 && ${only[$suite]} -eq 0 && ${only[$1]} -eq 0) ]]; then
 728         return 0
 729     fi
 730     case "${1}" in
 731         services/api)
 732             stop_services
 733             ;;
 734         gofmt | doc | lib/cli | lib/cloud/azure | lib/cloud/ec2 | lib/cmd | lib/dispatchcloud/ssh_executor | lib/dispatchcloud/worker)
 735             # don't care whether services are running
 736             ;;
 737         *)
 738             if ! start_services; then
 739                 title "test $1 -- failed to start services"
 740                 return 1
 741             fi
 742             ;;
 743     esac
 744     retry do_test_once ${@}
 745 }
 746
 747 do_test_once() {
 748     unset result
 749
 750     title "test $1"
 751     timer_reset
 752
 753     result=
 754     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 755     if ! . "$VENVDIR/bin/activate"
 756     then
 757         result=1
 758     elif [[ "$2" == "go" ]]
 759     then
 760         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 761         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 762         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 763         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 764         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 765         # compilation errors.
 766         go get -ldflags "-X main.version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}" -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 767             cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 768             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 769         then
 770             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 771             # does:
 772             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 773         else
 774             # The above form gets verbose even when testargs is
 775             # empty, so use this form in such cases:
 776             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 777         fi
 778         result=${result:-$?}
 779         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 780         then
 781             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 782             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 783         fi
 784         [[ $result = 0 ]] && gofmt -e -d *.go
 785     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 786     then
 787         tries=0
 788         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 789         do
 790             tries=$((${tries}+1))
 791             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 792             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 793             "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 794             result=$?
 795             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 796             then
 797                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 798                 continue
 799             else
 800                 break
 801             fi
 802         done
 803     elif [[ "$2" != "" ]]
 804     then
 805         "test_$2"
 806     else
 807         "test_$1"
 808     fi
 809     result=${result:-$?}
 810     checkexit $result "$1 tests"
 811     title "test $1 -- `timer`"
 812     return $result
 813 }
 814
 815 do_install() {
 816     if [[ -n "${skip[install]}" || ( -n "${only_install}" && "${only_install}" != "${1}" && "${only_install}" != "${2}" ) ]]; then
 817         return 0
 818     fi
 819     retry do_install_once ${@}
 820 }
 821
 822 do_install_once() {
 823     title "install $1"
 824     timer_reset
 825
 826     result=
 827     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 828     if [[ "$1" != "env" ]] && ! . "$VENVDIR/bin/activate"; then
 829         result=1
 830     elif [[ "$2" == "go" ]]
 831     then
 832         go get -ldflags "-X main.version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}" -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 833     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 834     then
 835         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 836         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 837
 838         # Need to change to a different directory after creating
 839         # the source dist package to avoid a pip bug.
 840         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 841
 842         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 843         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 844         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 845         # install" ensures that we've actually installed the local package
 846         # we just built.
 847         cd "$WORKSPACE/$1" \
 848             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 849             && cd "$WORKSPACE" \
 850             && "${3}pip" install --no-cache-dir --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 851             && "${3}pip" install --no-cache-dir --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 852     elif [[ "$2" != "" ]]
 853     then
 854         "install_$2"
 855     else
 856         "install_$1"
 857     fi
 858     result=${result:-$?}
 859     checkexit $result "$1 install"
 860     title "install $1 -- `timer`"
 861     return $result
 862 }
 863
 864 bundle_install_trylocal() {
 865     (
 866         set -e
 867         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 868         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 869             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 870             bundle install --no-deployment
 871         fi
 872         bundle package --all
 873     )
 874 }
 875
 876 install_doc() {
 877     cd "$WORKSPACE/doc" \
 878         && bundle_install_trylocal \
 879         && rm -rf .site
 880 }
 881
 882 install_gem() {
 883     gemname=$1
 884     srcpath=$2
 885     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 886         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 887         && bundle_install_trylocal \
 888         && gem build "$gemname.gemspec" \
 889         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 890 }
 891
 892 install_sdk/ruby() {
 893     install_gem arvados sdk/ruby
 894 }
 895
 896 install_sdk/R() {
 897   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 898     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
 899        && Rscript --vanilla install_deps.R
 900   fi
 901 }
 902
 903 install_sdk/perl() {
 904     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 905         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 906         && make install INSTALLDIRS=perl
 907 }
 908
 909 install_sdk/cli() {
 910     install_gem arvados-cli sdk/cli
 911 }
 912
 913 install_services/login-sync() {
 914     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 915 }
 916
 917 install_services/api() {
 918     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 919         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 920
 921     rm -f config/environments/test.rb
 922     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 923
 924     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 925     then
 926         for f in database.yml
 927         do
 928             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 929         done
 930     fi
 931
 932     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 933     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 934     # is a postgresql superuser.
 935     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 936         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.safe_load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 937         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.pid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 938
 939     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 940
 941     cert="$WORKSPACE/services/api/tmp/self-signed"
 942     if [[ ! -e "$cert.pem" || "$(date -r "$cert.pem" +%s)" -lt 1512659226 ]]; then
 943         (
 944             dir="$WORKSPACE/services/api/tmp"
 945             set -ex
 946             openssl req -newkey rsa:2048 -nodes -subj '/C=US/ST=State/L=City/CN=localhost' -out "$cert.csr" -keyout "$cert.key" </dev/null
 947             openssl x509 -req -in "$cert.csr" -signkey "$cert.key" -out "$cert.pem" -days 3650 -extfile <(printf 'subjectAltName=DNS:localhost,DNS:::1,DNS:0.0.0.0,DNS:127.0.0.1,IP:::1,IP:0.0.0.0,IP:127.0.0.1')
 948         ) || return 1
 949     fi
 950
 951     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 952         && rm -rf tmp/git \
 953         && mkdir -p tmp/git \
 954         && cd tmp/git \
 955         && tar xf ../../test/test.git.tar \
 956         && mkdir -p internal.git \
 957         && git --git-dir internal.git init \
 958             || return 1
 959
 960     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 961         && RAILS_ENV=test bundle exec rails db:environment:set \
 962         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 963         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 964         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 965 }
 966
 967 declare -a pythonstuff
 968 pythonstuff=(
 969     sdk/pam
 970     sdk/python
 971     sdk/python:py3
 972     sdk/cwl
 973     sdk/cwl:py3
 974     services/dockercleaner:py3
 975     services/fuse
 976     services/nodemanager
 977     tools/crunchstat-summary
 978 )
 979
 980 declare -a gostuff
 981 gostuff=(
 982     cmd/arvados-client
 983     cmd/arvados-server
 984     lib/cli
 985     lib/cmd
 986     lib/controller
 987     lib/crunchstat
 988     lib/cloud
 989     lib/cloud/azure
 990     lib/cloud/ec2
 991     lib/dispatchcloud
 992     lib/dispatchcloud/container
 993     lib/dispatchcloud/scheduler
 994     lib/dispatchcloud/ssh_executor
 995     lib/dispatchcloud/worker
 996     lib/service
 997     sdk/go/arvados
 998     sdk/go/arvadosclient
 999     sdk/go/auth
1000     sdk/go/blockdigest
1001     sdk/go/dispatch
1002     sdk/go/health
1003     sdk/go/httpserver
1004     sdk/go/manifest
1005     sdk/go/asyncbuf
1006     sdk/go/crunchrunner
1007     sdk/go/stats
1008     services/arv-git-httpd
1009     services/crunchstat
1010     services/health
1011     services/keep-web
1012     services/keepstore
1013     sdk/go/keepclient
1014     services/keep-balance
1015     services/keepproxy
1016     services/crunch-dispatch-local
1017     services/crunch-dispatch-slurm
1018     services/crunch-run
1019     services/ws
1020     tools/keep-block-check
1021     tools/keep-exercise
1022     tools/keep-rsync
1023     tools/sync-groups
1024 )
1025
1026 install_apps/workbench() {
1027     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1028         && mkdir -p tmp/cache \
1029         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
1030         && RAILS_ENV=test RAILS_GROUPS=assets bundle exec rake npm:install
1031 }
1032
1033 test_doc() {
1034     (
1035         set -e
1036         cd "$WORKSPACE/doc"
1037         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
1038         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
1039         # do much good!
1040         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
1041     )
1042 }
1043
1044 test_gofmt() {
1045     cd "$WORKSPACE" || return 1
1046     dirs=$(ls -d */ | egrep -v 'vendor|tmp')
1047     [[ -z "$(gofmt -e -d $dirs | tee -a /dev/stderr)" ]]
1048 }
1049
1050 test_services/api() {
1051     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
1052     cd "$WORKSPACE/services/api" \
1053         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
1054 }
1055
1056 test_sdk/ruby() {
1057     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
1058         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
1059 }
1060
1061 test_sdk/R() {
1062   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
1063     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
1064         && Rscript --vanilla run_test.R
1065   fi
1066 }
1067
1068 test_sdk/cli() {
1069     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
1070         && mkdir -p /tmp/keep \
1071         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
1072 }
1073
1074 test_sdk/java-v2() {
1075     cd "$WORKSPACE/sdk/java-v2" && gradle test
1076 }
1077
1078 test_services/login-sync() {
1079     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
1080         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
1081 }
1082
1083 test_services/nodemanager_integration() {
1084     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
1085         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager_integration]}
1086 }
1087
1088 test_apps/workbench_units() {
1089     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1090         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_units]}
1091 }
1092
1093 test_apps/workbench_functionals() {
1094     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1095         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_functionals]}
1096 }
1097
1098 test_apps/workbench_integration() {
1099     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1100         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_integration]}
1101 }
1102
1103 test_apps/workbench_benchmark() {
1104     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1105         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
1106 }
1107
1108 test_apps/workbench_profile() {
1109     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1110         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
1111 }
1112
1113 install_deps() {
1114     # Install parts needed by test suites
1115     do_install env
1116     do_install cmd/arvados-server go
1117     do_install sdk/cli
1118     do_install sdk/perl
1119     do_install sdk/python pip
1120     do_install sdk/ruby
1121     do_install services/api
1122     do_install services/arv-git-httpd go
1123     do_install services/keepproxy go
1124     do_install services/keepstore go
1125     do_install services/keep-web go
1126     do_install services/ws go
1127 }
1128
1129 install_all() {
1130     do_install env
1131     do_install doc
1132     do_install sdk/ruby
1133     do_install sdk/R
1134     do_install sdk/perl
1135     do_install sdk/cli
1136     do_install services/login-sync
1137     for p in "${pythonstuff[@]}"
1138     do
1139         dir=${p%:py3}
1140         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1141             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1142                 do_install ${dir} pip
1143             fi
1144         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1145             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1146                 do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1147             fi
1148         fi
1149     done
1150     do_install services/api
1151     for g in "${gostuff[@]}"
1152     do
1153         do_install "$g" go
1154     done
1155     do_install apps/workbench
1156 }
1157
1158 test_all() {
1159     stop_services
1160     do_test services/api
1161
1162     # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
1163     # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
1164     if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
1165         rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
1166         exit_cleanly
1167     fi
1168
1169     do_test gofmt
1170     do_test doc
1171     do_test sdk/ruby
1172     do_test sdk/R
1173     do_test sdk/cli
1174     do_test services/login-sync
1175     do_test sdk/java-v2
1176     do_test services/nodemanager_integration
1177     for p in "${pythonstuff[@]}"
1178     do
1179         dir=${p%:py3}
1180         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1181             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1182                 do_test ${dir} pip
1183             fi
1184         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1185             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1186                 do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1187             fi
1188         fi
1189     done
1190
1191     for g in "${gostuff[@]}"
1192     do
1193         do_test "$g" go
1194     done
1195     do_test apps/workbench_units
1196     do_test apps/workbench_functionals
1197     do_test apps/workbench_integration
1198     do_test apps/workbench_benchmark
1199     do_test apps/workbench_profile
1200 }
1201
1202 help_interactive() {
1203     echo "== Interactive commands:"
1204     echo "TARGET                 (short for 'test DIR')"
1205     echo "test TARGET"
1206     echo "test TARGET:py3        (test with python3)"
1207     echo "test TARGET -check.vv  (pass arguments to test)"
1208     echo "install TARGET"
1209     echo "install env            (go/python libs)"
1210     echo "install deps           (go/python libs + arvados components needed for integration tests)"
1211     echo "reset                  (...services used by integration tests)"
1212     echo "exit"
1213     echo "== Test targets:"
1214     echo "${!testfuncargs[@]}" | tr ' ' '\n' | sort | column
1215 }
1216
1217 initialize
1218
1219 declare -A testfuncargs=()
1220 for g in "${gostuff[@]}"; do
1221     testfuncargs[$g]="$g go"
1222 done
1223 for p in "${pythonstuff[@]}"; do
1224     dir=${p%:py3}
1225     testfuncargs[$dir]="$dir pip $VENVDIR/bin/"
1226     testfuncargs[$dir:py3]="$dir pip $VENV3DIR/bin/"
1227 done
1228
1229 if [[ -z ${interactive} ]]; then
1230     install_all
1231     test_all
1232 else
1233     skip=()
1234     only=()
1235     only_install=()
1236     if [[ -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then stop_services; fi
1237     setnextcmd() {
1238         if [[ "$TERM" = dumb ]]; then
1239             # assume emacs, or something, is offering a history buffer
1240             # and pre-populating the command will only cause trouble
1241             nextcmd=
1242         elif [[ "$nextcmd" != "install deps" ]]; then
1243             :
1244         elif [[ -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then
1245             nextcmd="test lib/cmd"
1246         else
1247             nextcmd="install deps"
1248         fi
1249     }
1250     echo
1251     help_interactive
1252     nextcmd="install deps"
1253     setnextcmd
1254     while read -p 'What next? ' -e -i "${nextcmd}" nextcmd; do
1255         read verb target opts <<<"${nextcmd}"
1256         target="${target%/}"
1257         target="${target/\/:/:}"
1258         case "${verb}" in
1259             "exit" | "quit")
1260                 exit_cleanly
1261                 ;;
1262             "reset")
1263                 stop_services
1264                 ;;
1265             "test" | "install")
1266                 case "$target" in
1267                     "")
1268                         help_interactive
1269                         ;;
1270                     all | deps)
1271                         ${verb}_${target}
1272                         ;;
1273                     *)
1274                         testargs["$target"]="${opts}"
1275                         tt="${testfuncargs[${target}]}"
1276                         tt="${tt:-$target}"
1277                         do_$verb $tt
1278                         ;;
1279                 esac
1280                 ;;
1281             "" | "help" | *)
1282                 help_interactive
1283                 ;;
1284         esac
1285         if [[ ${#successes[@]} -gt 0 || ${#failures[@]} -gt 0 ]]; then
1286             report_outcomes
1287             successes=()
1288             failures=()
1289         fi
1290         cd "$WORKSPACE"
1291         setnextcmd
1292     done
1293     echo
1294 fi
1295 exit_cleanly