build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2
   3 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin
   4
   5 COLUMNS=80
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
   7
   8 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
   9 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  10
  11 Exit non-zero if any tests fail.
  12
  13 Syntax:
  14         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  15
  16 Options:
  17
  18 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  19 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  20 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  21                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  22 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  23                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  24                subsequent invocations.
  25 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  26 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  27 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
  28                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  29                from a previous invocation if you use this option.
  30 --only-install Run specific install step
  31 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  32 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  33 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  34                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  35 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  36                Restrict apiserver tests to the given file
  37 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
  38                Restrict Python SDK tests to the given class
  39 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  40                Restrict Workbench tests to the given file
  41 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  42                Show all log messages, even when tests pass (also works
  43                with services/keepstore_test etc.)
  44 ARVADOS_DEBUG=1
  45                Print more debug messages
  46 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  47                *_test, and other examples shown above.
  48
  49 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
  50 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  51 test suites depend on other components being installed, and installing
  52 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  53
  54 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  55 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  56
  57 More information and background:
  58
  59 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  60
  61 Available tests:
  62
  63 apps/workbench (*)
  64 apps/workbench_units (*)
  65 apps/workbench_functionals (*)
  66 apps/workbench_integration (*)
  67 apps/workbench_benchmark
  68 apps/workbench_profile
  69 doc
  70 services/api
  71 services/arv-git-httpd
  72 services/crunchstat
  73 services/dockercleaner
  74 services/fuse
  75 services/keep-web
  76 services/keepproxy
  77 services/keepstore
  78 services/keep-balance
  79 services/login-sync
  80 services/nodemanager
  81 services/crunch-run
  82 services/crunch-dispatch-local
  83 services/crunch-dispatch-slurm
  84 services/ws
  85 sdk/cli
  86 sdk/pam
  87 sdk/python
  88 sdk/python:py3
  89 sdk/ruby
  90 sdk/go/arvados
  91 sdk/go/arvadosclient
  92 sdk/go/dispatch
  93 sdk/go/keepclient
  94 sdk/go/httpserver
  95 sdk/go/manifest
  96 sdk/go/blockdigest
  97 sdk/go/streamer
  98 sdk/go/stats
  99 sdk/go/crunchrunner
 100 sdk/cwl
 101 tools/crunchstat-summary
 102 tools/keep-exercise
 103 tools/keep-rsync
 104 tools/keep-block-check
 105
 106 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 107     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 108
 109 EOF
 110
 111 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 112 # environment that could interfere with the tests.
 113 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 114
 115 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 116 # accident.
 117 GITDIR=
 118 GOPATH=
 119 VENVDIR=
 120 VENV3DIR=
 121 PYTHONPATH=
 122 GEMHOME=
 123 PERLINSTALLBASE=
 124
 125 short=
 126 only_install=
 127 temp=
 128 temp_preserve=
 129
 130 clear_temp() {
 131     if [[ -z "$temp" ]]; then
 132         # we didn't even get as far as making a temp dir
 133         :
 134     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 135         rm -rf "$temp"
 136     else
 137         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 138     fi
 139 }
 140
 141 fatal() {
 142     clear_temp
 143     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 144     exit 1
 145 }
 146
 147 exit_cleanly() {
 148     trap - INT
 149     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 150     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 151     stop_services
 152     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 153     report_outcomes
 154     clear_temp
 155     exit ${#failures}
 156 }
 157
 158 sanity_checks() {
 159     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 160         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 161     echo Checking dependencies:
 162     echo -n 'virtualenv: '
 163     virtualenv --version \
 164         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 165     echo -n 'ruby: '
 166     ruby -v \
 167         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 168     echo -n 'go: '
 169     go version \
 170         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 171     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 7 ]] \
 172         || fatal "Go >= 1.7 required. See http://golang.org/doc/install"
 173     echo -n 'gcc: '
 174     gcc --version | egrep ^gcc \
 175         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 176     echo -n 'fuse.h: '
 177     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 178         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 179     echo -n 'gnutls.h: '
 180     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 181         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 182     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
 183     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 184         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
 185     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 186     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 187         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 188     echo -n 'nginx: '
 189     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 190         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 191     echo -n 'perl: '
 192     perl -v | grep version \
 193         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 194     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 195         echo -n "perl $mod: "
 196         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 197             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 198     done
 199     echo -n 'gitolite: '
 200     which gitolite \
 201         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 202 }
 203
 204 rotate_logfile() {
 205   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 206   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 207   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 208     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 209     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 210     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 211   fi
 212 }
 213
 214 declare -a failures
 215 declare -A skip
 216 declare -A testargs
 217 skip[apps/workbench_profile]=1
 218
 219 while [[ -n "$1" ]]
 220 do
 221     arg="$1"; shift
 222     case "$arg" in
 223         --help)
 224             echo >&2 "$helpmessage"
 225             echo >&2
 226             exit 1
 227             ;;
 228         --skip)
 229             skip[$1]=1; shift
 230             ;;
 231         --only)
 232             only="$1"; skip[$1]=""; shift
 233             ;;
 234         --short)
 235             short=1
 236             ;;
 237         --skip-install)
 238             only_install=nothing
 239             ;;
 240         --only-install)
 241             only_install="$1"; shift
 242             ;;
 243         --temp)
 244             temp="$1"; shift
 245             temp_preserve=1
 246             ;;
 247         --leave-temp)
 248             temp_preserve=1
 249             ;;
 250         --repeat)
 251             repeat=$((${1}+0)); shift
 252             ;;
 253         --retry)
 254             retry=1
 255             ;;
 256         *_test=*)
 257             suite="${arg%%_test=*}"
 258             args="${arg#*=}"
 259             testargs["$suite"]="$args"
 260             ;;
 261         *=*)
 262             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 263             ;;
 264         *)
 265             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 266             exit 1
 267             ;;
 268     esac
 269 done
 270
 271 start_api() {
 272     echo 'Starting API server...'
 273     cd "$WORKSPACE" \
 274         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 275         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 276         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 277         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 278         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 279         && (env | egrep ^ARVADOS)
 280 }
 281
 282 start_nginx_proxy_services() {
 283     echo 'Starting keepproxy, keep-web, ws, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
 284     cd "$WORKSPACE" \
 285         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 286         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 287         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 288         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 289         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 290         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1
 291 }
 292
 293 stop_services() {
 294     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES" ]]; then
 295         unset ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 296         cd "$WORKSPACE" \
 297             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 298             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 299             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 300             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 301             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy
 302     fi
 303     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 304         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 305         cd "$WORKSPACE" \
 306             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 307             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 308             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
 309     fi
 310 }
 311
 312 interrupt() {
 313     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 314     exit_cleanly
 315 }
 316 trap interrupt INT
 317
 318 sanity_checks
 319
 320 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 321
 322 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 323     # Jenkins expects us to use this by default.
 324     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 325 fi
 326
 327 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 328 cd "$WORKSPACE"
 329 find -name '*.pyc' -delete
 330
 331 if [[ -z "$temp" ]]; then
 332     temp="$(mktemp -d)"
 333 fi
 334
 335 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 336 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
 337 do
 338     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 339         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 340     fi
 341     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 342         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 343     fi
 344 done
 345
 346 setup_ruby_environment() {
 347     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 348         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 349         using_rvm=true
 350     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 351         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 352         using_rvm=true
 353     else
 354         using_rvm=false
 355     fi
 356
 357     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 358         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 359         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 360         # the environment to the "current gemset", which would lose
 361         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 362         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 363         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 364         # rvm gemset and use it for everything.
 365
 366         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 367             || fatal 'rvm check'
 368
 369         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 370         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 371         # complaint about not being in first place already.
 372         rvm use @default 2>/dev/null
 373
 374         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 375         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 376         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 377         # ruby to the caller.
 378         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 379         rvm use "@${gemset}" --create \
 380             || fatal 'rvm gemset setup'
 381
 382         rvm env
 383     else
 384         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 385         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 386         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 387         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 388         # should be installed, and we should leave it alone.)
 389
 390         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 391             user_gempath="$(gem env gempath)"
 392             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 393         fi
 394         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 395
 396         # When we build and install our own gems, we install them in our
 397         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 398         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 399         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 400
 401         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 402         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 403         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
 404
 405         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 406         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 407         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 408     fi
 409     bundle config || gem install bundler \
 410         || fatal 'install bundler'
 411 }
 412
 413 with_test_gemset() {
 414     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 415         "$@"
 416     else
 417         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 418     fi
 419 }
 420
 421 gem_uninstall_if_exists() {
 422     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 423         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 424     fi
 425 }
 426
 427 setup_virtualenv() {
 428     local venvdest="$1"; shift
 429     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 430         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 431     fi
 432     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 433         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 434         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 435     else
 436         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 437     fi
 438     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 439     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 440 }
 441
 442 export PERLINSTALLBASE
 443 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
 444
 445 export GOPATH
 446 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 447 ln -sfT "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
 448     || fatal "symlink failed"
 449 go get -v github.com/kardianos/govendor \
 450     || fatal "govendor install failed"
 451
 452 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 453 . "$VENVDIR/bin/activate"
 454
 455 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 456 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
 457     || pip install PyYAML >/dev/null \
 458     || fatal "pip install PyYAML failed"
 459
 460 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
 461 # won't pick it up by default.
 462 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 463     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
 464     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 465
 466 # Uninstall old llfuse (<1.0), because services/fuse "pip install"
 467 # won't upgrade it by default.
 468 if pip freeze | egrep '^llfuse==0'; then
 469     yes | pip uninstall 'llfuse<1.0'
 470 fi
 471
 472 # Deactivate Python 2 virtualenv
 473 deactivate
 474
 475 declare -a pythonstuff
 476 pythonstuff=(
 477     sdk/pam
 478     sdk/python
 479     sdk/python:py3
 480     sdk/cwl
 481     services/dockercleaner:py3
 482     services/fuse
 483     services/nodemanager
 484     tools/crunchstat-summary
 485     )
 486
 487 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 488 # Otherwise, skip dependent tests.
 489 PYTHON3=$(which python3)
 490 if [[ ${?} = 0 ]]; then
 491     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 492 else
 493     PYTHON3=
 494     cat >&2 <<EOF
 495
 496 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
 497
 498 EOF
 499 fi
 500
 501 # Reactivate Python 2 virtualenv
 502 . "$VENVDIR/bin/activate"
 503
 504 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 505 # whine a lot.
 506 setup_ruby_environment
 507
 508 echo "PATH is $PATH"
 509
 510 if ! which bundler >/dev/null
 511 then
 512     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 513 fi
 514
 515 retry() {
 516     remain="${repeat}"
 517     while :
 518     do
 519         if ${@}; then
 520             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 521                 remain=$((${remain}-1))
 522                 title "Repeating ${remain} more times"
 523             else
 524                 break
 525             fi
 526         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 527             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 528             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 529             then
 530                 break
 531             fi
 532         else
 533             break
 534         fi
 535     done
 536 }
 537
 538 do_test() {
 539     case "${1}" in
 540         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 541             suite=apps/workbench
 542             ;;
 543         *)
 544             suite="${1}"
 545             ;;
 546     esac
 547     if [[ -z "${skip[$suite]}" && -z "${skip[$1]}" && \
 548                 (-z "${only}" || "${only}" == "${suite}" || \
 549                  "${only}" == "${1}") ]]; then
 550         retry do_test_once ${@}
 551     else
 552         title "Skipping ${1} tests"
 553     fi
 554 }
 555
 556 do_test_once() {
 557     unset result
 558
 559     title "Running $1 tests"
 560     timer_reset
 561     if [[ "$2" == "go" ]]
 562     then
 563         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 564         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 565         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 566         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 567         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 568         # compilation errors.
 569         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 570             cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 571             [[ -z "$(gofmt -e -d . | tee /dev/stderr)" ]] && \
 572             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 573         then
 574             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 575             # does:
 576             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 577         else
 578             # The above form gets verbose even when testargs is
 579             # empty, so use this form in such cases:
 580             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 581         fi
 582         result=${result:-$?}
 583         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 584         then
 585             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 586             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 587         fi
 588     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 589     then
 590         tries=0
 591         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 592         do
 593             tries=$((${tries}+1))
 594             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 595             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 596             "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 597             result=$?
 598             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 599             then
 600                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 601                 continue
 602             else
 603                 break
 604             fi
 605         done
 606     elif [[ "$2" != "" ]]
 607     then
 608         "test_$2"
 609     else
 610         "test_$1"
 611     fi
 612     result=${result:-$?}
 613     checkexit $result "$1 tests"
 614     title "End of $1 tests (`timer`)"
 615     return $result
 616 }
 617
 618 do_install() {
 619     if [[ -z "${only_install}" || "${only_install}" == "${1}" ]]; then
 620         retry do_install_once ${@}
 621     else
 622         title "Skipping $1 install"
 623     fi
 624 }
 625
 626 do_install_once() {
 627     title "Running $1 install"
 628     timer_reset
 629     if [[ "$2" == "go" ]]
 630     then
 631         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 632     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 633     then
 634         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 635         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 636
 637         # Need to change to a different directory after creating
 638         # the source dist package to avoid a pip bug.
 639         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 640
 641         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 642         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 643         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 644         # install" ensures that we've actually installed the local package
 645         # we just built.
 646         cd "$WORKSPACE/$1" \
 647             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 648             && cd "$WORKSPACE" \
 649             && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 650             && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 651     elif [[ "$2" != "" ]]
 652     then
 653         "install_$2"
 654     else
 655         "install_$1"
 656     fi
 657     result=$?
 658     checkexit $result "$1 install"
 659     title "End of $1 install (`timer`)"
 660     return $result
 661 }
 662
 663 bundle_install_trylocal() {
 664     (
 665         set -e
 666         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 667         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 668             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 669             bundle install --no-deployment
 670         fi
 671         bundle package --all
 672     )
 673 }
 674
 675 install_doc() {
 676     cd "$WORKSPACE/doc" \
 677         && bundle_install_trylocal \
 678         && rm -rf .site
 679 }
 680 do_install doc
 681
 682 install_gem() {
 683     gemname=$1
 684     srcpath=$2
 685     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 686         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 687         && bundle_install_trylocal \
 688         && gem build "$gemname.gemspec" \
 689         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 690 }
 691
 692 install_ruby_sdk() {
 693     install_gem arvados sdk/ruby
 694 }
 695 do_install sdk/ruby ruby_sdk
 696
 697 install_perl_sdk() {
 698     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 699         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 700         && make install INSTALLDIRS=perl
 701 }
 702 do_install sdk/perl perl_sdk
 703
 704 install_cli() {
 705     install_gem arvados-cli sdk/cli
 706 }
 707 do_install sdk/cli cli
 708
 709 install_login-sync() {
 710     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 711 }
 712 do_install services/login-sync login-sync
 713
 714 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
 715 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
 716 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
 717 # its own test suite brings up some of those other programs (like
 718 # keepproxy).
 719 for p in "${pythonstuff[@]}"
 720 do
 721     dir=${p%:py3}
 722     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
 723         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
 724             do_install ${dir} pip
 725         fi
 726     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
 727         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
 728             do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
 729         fi
 730     fi
 731 done
 732
 733 install_apiserver() {
 734     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 735         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 736
 737     rm -f config/environments/test.rb
 738     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 739
 740     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 741     then
 742         for f in database.yml
 743         do
 744             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 745         done
 746     fi
 747
 748     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 749     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 750     # is a postgresql superuser.
 751     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 752         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 753         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 754
 755     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 756
 757     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 758         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 759         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 760         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 761 }
 762 do_install services/api apiserver
 763
 764 cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" && \
 765     "$GOPATH/bin/govendor" sync -v || \
 766         fatal "govendor sync failed"
 767 declare -a gostuff
 768 gostuff=(
 769     sdk/go/arvados
 770     sdk/go/arvadosclient
 771     sdk/go/blockdigest
 772     sdk/go/dispatch
 773     sdk/go/httpserver
 774     sdk/go/manifest
 775     sdk/go/streamer
 776     sdk/go/crunchrunner
 777     sdk/go/stats
 778     lib/crunchstat
 779     services/arv-git-httpd
 780     services/crunchstat
 781     services/keep-web
 782     services/keepstore
 783     sdk/go/keepclient
 784     services/keep-balance
 785     services/keepproxy
 786     services/crunch-dispatch-local
 787     services/crunch-dispatch-slurm
 788     services/crunch-run
 789     services/ws
 790     tools/keep-block-check
 791     tools/keep-exercise
 792     tools/keep-rsync
 793 )
 794 for g in "${gostuff[@]}"
 795 do
 796     do_install "$g" go
 797 done
 798
 799 install_workbench() {
 800     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 801         && mkdir -p tmp/cache \
 802         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 803 }
 804 do_install apps/workbench workbench
 805
 806 unset http_proxy https_proxy no_proxy
 807
 808 test_doclinkchecker() {
 809     (
 810         set -e
 811         cd "$WORKSPACE/doc"
 812         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
 813         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
 814         # do much good!
 815         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
 816     )
 817 }
 818 do_test doc doclinkchecker
 819
 820 stop_services
 821
 822 test_apiserver() {
 823     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
 824     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 825         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
 826 }
 827 do_test services/api apiserver
 828
 829 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
 830 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
 831 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
 832   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 833   exit_cleanly
 834 fi
 835
 836 start_api || { stop_services; fatal "start_api"; }
 837
 838 test_ruby_sdk() {
 839     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
 840         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
 841 }
 842 do_test sdk/ruby ruby_sdk
 843
 844 test_cli() {
 845     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
 846         && mkdir -p /tmp/keep \
 847         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
 848 }
 849 do_test sdk/cli cli
 850
 851 test_login-sync() {
 852     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
 853         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
 854 }
 855 do_test services/login-sync login-sync
 856
 857 for p in "${pythonstuff[@]}"
 858 do
 859     dir=${p%:py3}
 860     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
 861         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
 862             do_test ${dir} pip
 863         fi
 864     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
 865         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
 866             do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
 867         fi
 868     fi
 869 done
 870
 871 for g in "${gostuff[@]}"
 872 do
 873     do_test "$g" go
 874 done
 875
 876 test_workbench_units() {
 877     start_nginx_proxy_services \
 878         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 879         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 880 }
 881 do_test apps/workbench_units workbench_units
 882
 883 test_workbench_functionals() {
 884     start_nginx_proxy_services \
 885         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 886         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 887 }
 888 do_test apps/workbench_functionals workbench_functionals
 889
 890 test_workbench_integration() {
 891     start_nginx_proxy_services \
 892         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 893         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 894 }
 895 do_test apps/workbench_integration workbench_integration
 896
 897
 898 test_workbench_benchmark() {
 899     start_nginx_proxy_services \
 900         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 901         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
 902 }
 903 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
 904
 905 test_workbench_profile() {
 906     start_nginx_proxy_services \
 907         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 908         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
 909 }
 910 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
 911
 912 exit_cleanly