Merge branch 'master' into 3373-improve-gatk3-snv-pipeline
[arvados.git] / services / api / app / controllers / application_controller.rb
1 module ApiTemplateOverride
2   def allowed_to_render?(fieldset, field, model, options)
3     if options[:select]
4       return options[:select].include? field.to_s
5     end
6     super
7   end
8 end
9
10 class ActsAsApi::ApiTemplate
11   prepend ApiTemplateOverride
12 end
13
14 require 'load_param'
15 require 'record_filters'
16
17 class ApplicationController < ActionController::Base
18   include CurrentApiClient
19   include ThemesForRails::ActionController
20   include LoadParam
21   include RecordFilters
22
23   respond_to :json
24   protect_from_forgery
25
26   ERROR_ACTIONS = [:render_error, :render_not_found]
27
28   before_filter :respond_with_json_by_default
29   before_filter :remote_ip
30   before_filter :load_read_auths
31   before_filter :require_auth_scope, except: ERROR_ACTIONS
32
33   before_filter :catch_redirect_hint
34   before_filter(:find_object_by_uuid,
35                 except: [:index, :create] + ERROR_ACTIONS)
36   before_filter :load_limit_offset_order_params, only: [:index, :contents]
37   before_filter :load_where_param, only: [:index, :contents]
38   before_filter :load_filters_param, only: [:index, :contents]
39   before_filter :find_objects_for_index, :only => :index
40   before_filter :reload_object_before_update, :only => :update
41   before_filter(:render_404_if_no_object,
42                 except: [:index, :create] + ERROR_ACTIONS)
43
44   theme :select_theme
45
46   attr_accessor :resource_attrs
47
48   begin
49     rescue_from(Exception,
50                 ArvadosModel::PermissionDeniedError,
51                 :with => :render_error)
52     rescue_from(ActiveRecord::RecordNotFound,
53                 ActionController::RoutingError,
54                 ActionController::UnknownController,
55                 AbstractController::ActionNotFound,
56                 :with => :render_not_found)
57   end
58
59   def index
60     @objects.uniq!(&:id) if @select.nil? or @select.include? "id"
61     if params[:eager] and params[:eager] != '0' and params[:eager] != 0 and params[:eager] != ''
62       @objects.each(&:eager_load_associations)
63     end
64     render_list
65   end
66
67   def show
68     render json: @object.as_api_response
69   end
70
71   def create
72     @object = model_class.new resource_attrs
73     @object.save!
74     show
75   end
76
77   def update
78     attrs_to_update = resource_attrs.reject { |k,v|
79       [:kind, :etag, :href].index k
80     }
81     @object.update_attributes! attrs_to_update
82     show
83   end
84
85   def destroy
86     @object.destroy
87     show
88   end
89
90   def catch_redirect_hint
91     if !current_user
92       if params.has_key?('redirect_to') then
93         session[:redirect_to] = params[:redirect_to]
94       end
95     end
96   end
97
98   def render_404_if_no_object
99     render_not_found "Object not found" if !@object
100   end
101
102   def render_error(e)
103     logger.error e.inspect
104     if e.respond_to? :backtrace and e.backtrace
105       logger.error e.backtrace.collect { |x| x + "\n" }.join('')
106     end
107     if @object and @object.errors and @object.errors.full_messages and not @object.errors.full_messages.empty?
108       errors = @object.errors.full_messages
109       logger.error errors.inspect
110     else
111       errors = [e.inspect]
112     end
113     status = e.respond_to?(:http_status) ? e.http_status : 422
114     send_error(*errors, status: status)
115   end
116
117   def render_not_found(e=ActionController::RoutingError.new("Path not found"))
118     logger.error e.inspect
119     send_error("Path not found", status: 404)
120   end
121
122   protected
123
124   def send_error(*args)
125     if args.last.is_a? Hash
126       err = args.pop
127     else
128       err = {}
129     end
130     err[:errors] ||= args
131     err[:error_token] = [Time.now.utc.to_i, "%08x" % rand(16 ** 8)].join("+")
132     status = err.delete(:status) || 422
133     logger.error "Error #{err[:error_token]}: #{status}"
134     render json: err, status: status
135   end
136
137   def find_objects_for_index
138     @objects ||= model_class.readable_by(*@read_users)
139     apply_where_limit_order_params
140   end
141
142   def apply_filters
143     ft = record_filters @filters, @objects.table_name
144     if ft[:cond_out].any?
145       @objects = @objects.where(ft[:cond_out].join(' AND '), *ft[:param_out])
146     end
147   end
148
149   def apply_where_limit_order_params
150     apply_filters
151
152     ar_table_name = @objects.table_name
153     if @where.is_a? Hash and @where.any?
154       conditions = ['1=1']
155       @where.each do |attr,value|
156         if attr.to_s == 'any'
157           if value.is_a?(Array) and
158               value.length == 2 and
159               value[0] == 'contains' then
160             ilikes = []
161             model_class.searchable_columns('ilike').each do |column|
162               # Including owner_uuid in an "any column" search will
163               # probably just return a lot of false positives.
164               next if column == 'owner_uuid'
165               ilikes << "#{ar_table_name}.#{column} ilike ?"
166               conditions << "%#{value[1]}%"
167             end
168             if ilikes.any?
169               conditions[0] << ' and (' + ilikes.join(' or ') + ')'
170             end
171           end
172         elsif attr.to_s.match(/^[a-z][_a-z0-9]+$/) and
173             model_class.columns.collect(&:name).index(attr.to_s)
174           if value.nil?
175             conditions[0] << " and #{ar_table_name}.#{attr} is ?"
176             conditions << nil
177           elsif value.is_a? Array
178             if value[0] == 'contains' and value.length == 2
179               conditions[0] << " and #{ar_table_name}.#{attr} like ?"
180               conditions << "%#{value[1]}%"
181             else
182               conditions[0] << " and #{ar_table_name}.#{attr} in (?)"
183               conditions << value
184             end
185           elsif value.is_a? String or value.is_a? Fixnum or value == true or value == false
186             conditions[0] << " and #{ar_table_name}.#{attr}=?"
187             conditions << value
188           elsif value.is_a? Hash
189             # Not quite the same thing as "equal?" but better than nothing?
190             value.each do |k,v|
191               if v.is_a? String
192                 conditions[0] << " and #{ar_table_name}.#{attr} ilike ?"
193                 conditions << "%#{k}%#{v}%"
194               end
195             end
196           end
197         end
198       end
199       if conditions.length > 1
200         conditions[0].sub!(/^1=1 and /, '')
201         @objects = @objects.
202           where(*conditions)
203       end
204     end
205
206     @objects = @objects.select(@select.map { |s| "#{table_name}.#{ActiveRecord::Base.connection.quote_column_name s.to_s}" }.join ", ") if @select
207     @objects = @objects.order(@orders.join ", ") if @orders.any?
208     @objects = @objects.limit(@limit)
209     @objects = @objects.offset(@offset)
210     @objects = @objects.uniq(@distinct) if not @distinct.nil?
211   end
212
213   def resource_attrs
214     return @attrs if @attrs
215     @attrs = params[resource_name]
216     if @attrs.is_a? String
217       @attrs = Oj.load @attrs, symbol_keys: true
218     end
219     unless @attrs.is_a? Hash
220       message = "No #{resource_name}"
221       if resource_name.index('_')
222         message << " (or #{resource_name.camelcase(:lower)})"
223       end
224       message << " hash provided with request"
225       raise ArgumentError.new(message)
226     end
227     %w(created_at modified_by_client_uuid modified_by_user_uuid modified_at).each do |x|
228       @attrs.delete x.to_sym
229     end
230     @attrs = @attrs.symbolize_keys if @attrs.is_a? HashWithIndifferentAccess
231     @attrs
232   end
233
234   # Authentication
235   def load_read_auths
236     @read_auths = []
237     if current_api_client_authorization
238       @read_auths << current_api_client_authorization
239     end
240     # Load reader tokens if this is a read request.
241     # If there are too many reader tokens, assume the request is malicious
242     # and ignore it.
243     if request.get? and params[:reader_tokens] and
244         params[:reader_tokens].size < 100
245       @read_auths += ApiClientAuthorization
246         .includes(:user)
247         .where('api_token IN (?) AND
248                 (expires_at IS NULL OR expires_at > CURRENT_TIMESTAMP)',
249                params[:reader_tokens])
250         .all
251     end
252     @read_auths.select! { |auth| auth.scopes_allow_request? request }
253     @read_users = @read_auths.map { |auth| auth.user }.uniq
254   end
255
256   def require_login
257     if not current_user
258       respond_to do |format|
259         format.json { send_error("Not logged in", status: 401) }
260         format.html { redirect_to '/auth/joshid' }
261       end
262       false
263     end
264   end
265
266   def admin_required
267     unless current_user and current_user.is_admin
268       send_error("Forbidden", status: 403)
269     end
270   end
271
272   def require_auth_scope
273     if @read_auths.empty?
274       if require_login != false
275         send_error("Forbidden", status: 403)
276       end
277       false
278     end
279   end
280
281   def respond_with_json_by_default
282     html_index = request.accepts.index(Mime::HTML)
283     if html_index.nil? or request.accepts[0...html_index].include?(Mime::JSON)
284       request.format = :json
285     end
286   end
287
288   def model_class
289     controller_name.classify.constantize
290   end
291
292   def resource_name             # params[] key used by client
293     controller_name.singularize
294   end
295
296   def table_name
297     controller_name
298   end
299
300   def find_object_by_uuid
301     if params[:id] and params[:id].match /\D/
302       params[:uuid] = params.delete :id
303     end
304     @where = { uuid: params[:uuid] }
305     @offset = 0
306     @limit = 1
307     @orders = []
308     @filters = []
309     @objects = nil
310     find_objects_for_index
311     @object = @objects.first
312   end
313
314   def reload_object_before_update
315     # This is necessary to prevent an ActiveRecord::ReadOnlyRecord
316     # error when updating an object which was retrieved using a join.
317     if @object.andand.readonly?
318       @object = model_class.find_by_uuid(@objects.first.uuid)
319     end
320   end
321
322   def load_json_value(hash, key, must_be_class=nil)
323     if hash[key].is_a? String
324       hash[key] = Oj.load(hash[key], symbol_keys: false)
325       if must_be_class and !hash[key].is_a? must_be_class
326         raise TypeError.new("parameter #{key.to_s} must be a #{must_be_class.to_s}")
327       end
328     end
329   end
330
331   def self.accept_attribute_as_json(attr, must_be_class=nil)
332     before_filter lambda { accept_attribute_as_json attr, must_be_class }
333   end
334   accept_attribute_as_json :properties, Hash
335   accept_attribute_as_json :info, Hash
336   def accept_attribute_as_json(attr, must_be_class)
337     if params[resource_name] and resource_attrs.is_a? Hash
338       if resource_attrs[attr].is_a? Hash
339         # Convert symbol keys to strings (in hashes provided by
340         # resource_attrs)
341         resource_attrs[attr] = resource_attrs[attr].
342           with_indifferent_access.to_hash
343       else
344         load_json_value(resource_attrs, attr, must_be_class)
345       end
346     end
347   end
348
349   def self.accept_param_as_json(key, must_be_class=nil)
350     prepend_before_filter lambda { load_json_value(params, key, must_be_class) }
351   end
352   accept_param_as_json :reader_tokens, Array
353
354   def render_list
355     if @select
356       # This information helps clients understand what they're seeing
357       # (Workbench always expects it), but they can't select it explicitly
358       # because it's not an SQL column.  Always add it.
359       # I believe this is safe because clients can always deduce what they're
360       # looking at by the returned UUID anyway.
361       @select |= ["kind"]
362     end
363     @object_list = {
364       :kind  => "arvados##{(@response_resource_name || resource_name).camelize(:lower)}List",
365       :etag => "",
366       :self_link => "",
367       :offset => @offset,
368       :limit => @limit,
369       :items => @objects.as_api_response(nil, {select: @select})
370     }
371     if @objects.respond_to? :except
372       @object_list[:items_available] = @objects.
373         except(:limit).except(:offset).
374         count(:id, distinct: true)
375     end
376     render json: @object_list
377   end
378
379   def remote_ip
380     # Caveat: this is highly dependent on the proxy setup. YMMV.
381     if request.headers.has_key?('HTTP_X_REAL_IP') then
382       # We're behind a reverse proxy
383       @remote_ip = request.headers['HTTP_X_REAL_IP']
384     else
385       # Hopefully, we are not!
386       @remote_ip = request.env['REMOTE_ADDR']
387     end
388   end
389
390   def self._index_requires_parameters
391     {
392       filters: { type: 'array', required: false },
393       where: { type: 'object', required: false },
394       order: { type: 'array', required: false },
395       select: { type: 'array', required: false },
396       distinct: { type: 'boolean', required: false },
397       limit: { type: 'integer', required: false, default: DEFAULT_LIMIT },
398       offset: { type: 'integer', required: false, default: 0 },
399     }
400   end
401
402   def client_accepts_plain_text_stream
403     (request.headers['Accept'].split(' ') &
404      ['text/plain', '*/*']).count > 0
405   end
406
407   def render *opts
408     if opts.first
409       response = opts.first[:json]
410       if response.is_a?(Hash) &&
411           params[:_profile] &&
412           Thread.current[:request_starttime]
413         response[:_profile] = {
414           request_time: Time.now - Thread.current[:request_starttime]
415         }
416       end
417     end
418     super *opts
419   end
420
421   def select_theme
422     return Rails.configuration.arvados_theme
423   end
424 end