Add another missing dependency to the sanity check in run-tests.sh.
[arvados.git] / build / run-tests.sh
1 #!/bin/bash
2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
3 #
4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
5
6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin.sh
7
8 COLUMNS=80
9 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
10
11 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
12 $(basename $0): Install and test Arvados components.
13
14 Exit non-zero if any tests fail.
15
16 Syntax:
17         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
18
19 Options:
20
21 --skip FOO     Do not test the FOO component.
22 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
23 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
24                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
25 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
26                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
27                subsequent invocations.
28 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
29 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
30 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
31                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
32                from a previous invocation if you use this option.
33 --only-install Run specific install step
34 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
35 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
36 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
37                (If none given, leave config files alone in source tree.)
38 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
39                Restrict apiserver tests to the given file
40 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
41                Restrict Python SDK tests to the given class
42 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
43                Restrict Workbench tests to the given file
44 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
45                Show all log messages, even when tests pass (also works
46                with services/keepstore_test etc.)
47 ARVADOS_DEBUG=1
48                Print more debug messages
49 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
50                *_test, and other examples shown above.
51
52 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
53 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
54 test suites depend on other components being installed, and installing
55 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
56
57 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
58 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
59
60 More information and background:
61
62 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
63
64 Available tests:
65
66 apps/workbench (*)
67 apps/workbench_units (*)
68 apps/workbench_functionals (*)
69 apps/workbench_integration (*)
70 apps/workbench_benchmark
71 apps/workbench_profile
72 doc
73 services/api
74 services/arv-git-httpd
75 services/crunchstat
76 services/dockercleaner
77 services/fuse
78 services/health
79 services/keep-web
80 services/keepproxy
81 services/keepstore
82 services/keep-balance
83 services/login-sync
84 services/nodemanager
85 services/nodemanager_integration
86 services/crunch-run
87 services/crunch-dispatch-local
88 services/crunch-dispatch-slurm
89 services/ws
90 sdk/cli
91 sdk/pam
92 sdk/python
93 sdk/python:py3
94 sdk/ruby
95 sdk/go/arvados
96 sdk/go/arvadosclient
97 sdk/go/dispatch
98 sdk/go/keepclient
99 sdk/go/health
100 sdk/go/httpserver
101 sdk/go/manifest
102 sdk/go/blockdigest
103 sdk/go/streamer
104 sdk/go/stats
105 sdk/go/crunchrunner
106 sdk/cwl
107 tools/arv-sync-groups
108 tools/crunchstat-summary
109 tools/keep-exercise
110 tools/keep-rsync
111 tools/keep-block-check
112
113 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
114     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
115
116 EOF
117
118 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
119 # environment that could interfere with the tests.
120 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
121
122 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
123 # accident.
124 GITDIR=
125 GOPATH=
126 VENVDIR=
127 VENV3DIR=
128 PYTHONPATH=
129 GEMHOME=
130 PERLINSTALLBASE=
131
132 short=
133 only_install=
134 temp=
135 temp_preserve=
136
137 clear_temp() {
138     if [[ -z "$temp" ]]; then
139         # we didn't even get as far as making a temp dir
140         :
141     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
142         rm -rf "$temp"
143     else
144         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
145     fi
146 }
147
148 fatal() {
149     clear_temp
150     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
151     exit 1
152 }
153
154 exit_cleanly() {
155     trap - INT
156     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
157     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
158     stop_services
159     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
160     report_outcomes
161     clear_temp
162     exit ${#failures}
163 }
164
165 sanity_checks() {
166     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
167         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
168     echo Checking dependencies:
169     echo -n 'virtualenv: '
170     virtualenv --version \
171         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
172     echo -n 'ruby: '
173     ruby -v \
174         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
175     echo -n 'go: '
176     go version \
177         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
178     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 8 ]] \
179         || fatal "Go >= 1.8 required. See http://golang.org/doc/install"
180     echo -n 'gcc: '
181     gcc --version | egrep ^gcc \
182         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
183     echo -n 'fuse.h: '
184     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
185         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
186     echo -n 'gnutls.h: '
187     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
188         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
189     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
190     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
191         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
192     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
193     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
194         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
195     echo -n 'nginx: '
196     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
197         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
198     echo -n 'perl: '
199     perl -v | grep version \
200         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
201     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
202         echo -n "perl $mod: "
203         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
204             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
205     done
206     echo -n 'gitolite: '
207     which gitolite \
208         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
209     echo -n 'npm: '
210     npm --version \
211         || fatal "No npm. Try: wget -O- https://nodejs.org/dist/v6.11.2/node-v6.11.2-linux-x64.tar.xz | sudo tar -C /usr/local -xJf - && sudo ln -s ../node-v6.11.2-linux-x64/bin/{node,npm} /usr/local/bin/"
212     echo -n 'cadaver: '
213     cadaver --version | grep -w cadaver \
214           || fatal "No cadaver. Try: apt-get install cadaver"
215     echo -n 'libattr1 xattr.h: '
216     find /usr/include -path '*/attr/xattr.h' | egrep --max-count=1 . \
217         || fatal "No libattr1 xattr.h. Try: apt-get install libattr1-dev"
218     echo -n 'libcurl curl.h: '
219     find /usr/include -path '*/curl/curl.h' | egrep --max-count=1 . \
220         || fatal "No libcurl curl.h. Try: apt-get install libcurl4-gnutls-dev"
221     echo -n 'libpq libpq-fe.h: '
222     find /usr/include -path '*/postgresql/libpq-fe.h' | egrep --max-count=1 . \
223         || fatal "No libpq libpq-fe.h. Try: apt-get install libpq-dev"
224     echo -n 'services/api/config/database.yml: '
225     if [[ ! -f "$WORKSPACE/services/api/config/database.yml" ]]; then
226             fatal "Please provide a database.yml file for the test suite"
227     else
228             echo "OK"
229     fi
230     echo -n 'postgresql: '
231     psql --version || fatal "No postgresql. Try: apt-get install postgresql postgresql-client-common"
232     echo -n 'phantomjs: '
233     phantomjs --version || fatal "No phantomjs. Try: apt-get install phantomjs"
234     echo -n 'xvfb: '
235     which Xvfb || fatal "No xvfb. Try: apt-get install xvfb"
236     echo -n 'graphviz: '
237     dot -V || fatal "No graphviz. Try: apt-get install graphviz"
238 }
239
240 rotate_logfile() {
241   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
242   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
243   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
244     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
245     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
246     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
247   fi
248 }
249
250 declare -a failures
251 declare -A skip
252 declare -A testargs
253 skip[apps/workbench_profile]=1
254
255 while [[ -n "$1" ]]
256 do
257     arg="$1"; shift
258     case "$arg" in
259         --help)
260             echo >&2 "$helpmessage"
261             echo >&2
262             exit 1
263             ;;
264         --skip)
265             skip[$1]=1; shift
266             ;;
267         --only)
268             only="$1"; skip[$1]=""; shift
269             ;;
270         --short)
271             short=1
272             ;;
273         --skip-install)
274             only_install=nothing
275             ;;
276         --only-install)
277             only_install="$1"; shift
278             ;;
279         --temp)
280             temp="$1"; shift
281             temp_preserve=1
282             ;;
283         --leave-temp)
284             temp_preserve=1
285             ;;
286         --repeat)
287             repeat=$((${1}+0)); shift
288             ;;
289         --retry)
290             retry=1
291             ;;
292         *_test=*)
293             suite="${arg%%_test=*}"
294             args="${arg#*=}"
295             testargs["$suite"]="$args"
296             ;;
297         *=*)
298             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
299             ;;
300         *)
301             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
302             exit 1
303             ;;
304     esac
305 done
306
307 start_api() {
308     echo 'Starting API server...'
309     if [[ ! -d "$WORKSPACE/services/api/log" ]]; then
310         mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/log"
311     fi
312     # Remove empty api.pid file if it exists
313     if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid" && ! -s "$WORKSPACE/tmp/api.pid" ]]; then
314         rm -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid"
315     fi
316     cd "$WORKSPACE" \
317         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
318         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
319         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
320         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
321         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
322         && (env | egrep ^ARVADOS)
323 }
324
325 start_nginx_proxy_services() {
326     echo 'Starting keepproxy, keep-web, ws, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
327     cd "$WORKSPACE" \
328         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
329         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
330         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
331         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
332         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
333         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1
334 }
335
336 stop_services() {
337     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES" ]]; then
338         unset ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
339         cd "$WORKSPACE" \
340             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
341             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
342             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
343             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
344             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy
345     fi
346     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
347         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
348         cd "$WORKSPACE" \
349             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
350             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
351             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
352     fi
353 }
354
355 interrupt() {
356     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
357     exit_cleanly
358 }
359 trap interrupt INT
360
361 sanity_checks
362
363 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
364
365 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
366     # Jenkins expects us to use this by default.
367     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
368 fi
369
370 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
371 cd "$WORKSPACE"
372 find -name '*.pyc' -delete
373
374 if [[ -z "$temp" ]]; then
375     temp="$(mktemp -d)"
376 fi
377
378 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
379 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
380 do
381     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
382         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
383     fi
384     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
385         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
386     fi
387 done
388
389 setup_ruby_environment() {
390     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
391         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
392         using_rvm=true
393     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
394         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
395         using_rvm=true
396     else
397         using_rvm=false
398     fi
399
400     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
401         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
402         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
403         # the environment to the "current gemset", which would lose
404         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
405         # programs (for example, the Workbench test suite could not
406         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
407         # rvm gemset and use it for everything.
408
409         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
410             || fatal 'rvm check'
411
412         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
413         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
414         # complaint about not being in first place already.
415         rvm use @default 2>/dev/null
416
417         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
418         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
419         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
420         # ruby to the caller.
421         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
422         rvm use "@${gemset}" --create \
423             || fatal 'rvm gemset setup'
424
425         rvm env
426     else
427         # When our "bundle install"s need to install new gems to
428         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
429         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
430         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
431         # should be installed, and we should leave it alone.)
432
433         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
434             user_gempath="$(gem env gempath)"
435             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
436         fi
437         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
438
439         # When we build and install our own gems, we install them in our
440         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
441         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
442         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
443
444         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
445         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
446         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
447
448         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
449         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
450         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
451     fi
452     bundle config || gem install bundler \
453         || fatal 'install bundler'
454 }
455
456 with_test_gemset() {
457     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
458         "$@"
459     else
460         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
461     fi
462 }
463
464 gem_uninstall_if_exists() {
465     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
466         gem uninstall --force --all --executables "$1"
467     fi
468 }
469
470 setup_virtualenv() {
471     local venvdest="$1"; shift
472     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
473         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
474     fi
475     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
476         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
477         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
478     else
479         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
480     fi
481     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
482     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
483 }
484
485 export PERLINSTALLBASE
486 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
487
488 export GOPATH
489 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
490 ln -sfT "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
491     || fatal "symlink failed"
492 go get -v github.com/kardianos/govendor \
493     || fatal "govendor install failed"
494
495 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
496 . "$VENVDIR/bin/activate"
497
498 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
499 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
500     || pip install PyYAML >/dev/null \
501     || fatal "pip install PyYAML failed"
502
503 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
504 # won't pick it up by default.
505 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
506     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
507     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
508
509 # We need an unreleased (as of 2017-08-17) llfuse bugfix, otherwise our fuse test suite deadlocks.
510 pip freeze | grep -x llfuse==1.2.0 || (
511     set -e
512     yes | pip uninstall llfuse || true
513     cython --version || fatal "no cython; try sudo apt-get install cython"
514     cd "$temp"
515     (cd python-llfuse 2>/dev/null || git clone https://github.com/curoverse/python-llfuse)
516     cd python-llfuse
517     git checkout 620722fd990ea642ddb8e7412676af482c090c0c
518     git checkout setup.py
519     sed -i -e "s:'1\\.2':'1.2.0':" setup.py
520     python setup.py build_cython
521     python setup.py install --force
522 ) || fatal "llfuse fork failed"
523 pip freeze | grep -x llfuse==1.2.0 || fatal "error: installed llfuse 1.2.0 but '$(pip freeze | grep llfuse)' ???"
524
525 # Deactivate Python 2 virtualenv
526 deactivate
527
528 declare -a pythonstuff
529 pythonstuff=(
530     sdk/pam
531     sdk/python
532     sdk/python:py3
533     sdk/cwl
534     services/dockercleaner:py3
535     services/fuse
536     services/nodemanager
537     tools/crunchstat-summary
538     )
539
540 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
541 # Otherwise, skip dependent tests.
542 PYTHON3=$(which python3)
543 if [[ ${?} = 0 ]]; then
544     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
545 else
546     PYTHON3=
547     cat >&2 <<EOF
548
549 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
550
551 EOF
552 fi
553
554 # Reactivate Python 2 virtualenv
555 . "$VENVDIR/bin/activate"
556
557 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
558 # whine a lot.
559 setup_ruby_environment
560
561 echo "PATH is $PATH"
562
563 if ! which bundler >/dev/null
564 then
565     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
566 fi
567
568 retry() {
569     remain="${repeat}"
570     while :
571     do
572         if ${@}; then
573             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
574                 remain=$((${remain}-1))
575                 title "Repeating ${remain} more times"
576             else
577                 break
578             fi
579         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
580             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
581             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
582             then
583                 break
584             fi
585         else
586             break
587         fi
588     done
589 }
590
591 do_test() {
592     case "${1}" in
593         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
594             suite=apps/workbench
595             ;;
596         services/nodemanager | services/nodemanager_integration)
597             suite=services/nodemanager_suite
598             ;;
599         *)
600             suite="${1}"
601             ;;
602     esac
603     if [[ -z "${skip[$suite]}" && -z "${skip[$1]}" && \
604                 (-z "${only}" || "${only}" == "${suite}" || \
605                  "${only}" == "${1}") ]]; then
606         retry do_test_once ${@}
607     else
608         title "Skipping ${1} tests"
609     fi
610 }
611
612 do_test_once() {
613     unset result
614
615     title "Running $1 tests"
616     timer_reset
617     if [[ "$2" == "go" ]]
618     then
619         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
620         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
621         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
622         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
623         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
624         # compilation errors.
625         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
626             cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
627             [[ -z "$(gofmt -e -d . | tee /dev/stderr)" ]] && \
628             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
629         then
630             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
631             # does:
632             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
633         else
634             # The above form gets verbose even when testargs is
635             # empty, so use this form in such cases:
636             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
637         fi
638         result=${result:-$?}
639         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
640         then
641             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
642             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
643         fi
644     elif [[ "$2" == "pip" ]]
645     then
646         tries=0
647         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
648         do
649             tries=$((${tries}+1))
650             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
651             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
652             "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
653             result=$?
654             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
655             then
656                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
657                 continue
658             else
659                 break
660             fi
661         done
662     elif [[ "$2" != "" ]]
663     then
664         "test_$2"
665     else
666         "test_$1"
667     fi
668     result=${result:-$?}
669     checkexit $result "$1 tests"
670     title "End of $1 tests (`timer`)"
671     return $result
672 }
673
674 do_install() {
675     if [[ -z "${only_install}" || "${only_install}" == "${1}" ]]; then
676         retry do_install_once ${@}
677     else
678         title "Skipping $1 install"
679     fi
680 }
681
682 do_install_once() {
683     title "Running $1 install"
684     timer_reset
685     if [[ "$2" == "go" ]]
686     then
687         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
688     elif [[ "$2" == "pip" ]]
689     then
690         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
691         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
692
693         # Need to change to a different directory after creating
694         # the source dist package to avoid a pip bug.
695         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
696
697         # Also need to install twice, because if it believes the package is
698         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
699         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
700         # install" ensures that we've actually installed the local package
701         # we just built.
702         cd "$WORKSPACE/$1" \
703             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
704             && cd "$WORKSPACE" \
705             && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
706             && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
707     elif [[ "$2" != "" ]]
708     then
709         "install_$2"
710     else
711         "install_$1"
712     fi
713     result=$?
714     checkexit $result "$1 install"
715     title "End of $1 install (`timer`)"
716     return $result
717 }
718
719 bundle_install_trylocal() {
720     (
721         set -e
722         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
723         if ! bundle install --local --no-deployment; then
724             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
725             bundle install --no-deployment
726         fi
727         bundle package --all
728     )
729 }
730
731 install_doc() {
732     cd "$WORKSPACE/doc" \
733         && bundle_install_trylocal \
734         && rm -rf .site
735 }
736 do_install doc
737
738 install_gem() {
739     gemname=$1
740     srcpath=$2
741     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
742         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
743         && bundle_install_trylocal \
744         && gem build "$gemname.gemspec" \
745         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
746 }
747
748 install_ruby_sdk() {
749     install_gem arvados sdk/ruby
750 }
751 do_install sdk/ruby ruby_sdk
752
753 install_perl_sdk() {
754     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
755         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
756         && make install INSTALLDIRS=perl
757 }
758 do_install sdk/perl perl_sdk
759
760 install_cli() {
761     install_gem arvados-cli sdk/cli
762 }
763 do_install sdk/cli cli
764
765 install_login-sync() {
766     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
767 }
768 do_install services/login-sync login-sync
769
770 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
771 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
772 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
773 # its own test suite brings up some of those other programs (like
774 # keepproxy).
775 for p in "${pythonstuff[@]}"
776 do
777     dir=${p%:py3}
778     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
779         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
780             do_install ${dir} pip
781         fi
782     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
783         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
784             do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
785         fi
786     fi
787 done
788
789 install_apiserver() {
790     cd "$WORKSPACE/services/api" \
791         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
792
793     rm -f config/environments/test.rb
794     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
795
796     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
797     then
798         for f in database.yml
799         do
800             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
801         done
802     fi
803
804     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
805     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
806     # is a postgresql superuser.
807     cd "$WORKSPACE/services/api" \
808         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
809         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
810
811     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
812
813     cd "$WORKSPACE/services/api" \
814         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
815         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
816         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
817 }
818 do_install services/api apiserver
819
820 cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" && \
821     "$GOPATH/bin/govendor" sync -v || \
822         fatal "govendor sync failed"
823 declare -a gostuff
824 gostuff=(
825     sdk/go/arvados
826     sdk/go/arvadosclient
827     sdk/go/blockdigest
828     sdk/go/dispatch
829     sdk/go/health
830     sdk/go/httpserver
831     sdk/go/manifest
832     sdk/go/streamer
833     sdk/go/crunchrunner
834     sdk/go/stats
835     lib/crunchstat
836     services/arv-git-httpd
837     services/crunchstat
838     services/health
839     services/keep-web
840     services/keepstore
841     sdk/go/keepclient
842     services/keep-balance
843     services/keepproxy
844     services/crunch-dispatch-local
845     services/crunch-dispatch-slurm
846     services/crunch-run
847     services/ws
848     tools/keep-block-check
849     tools/keep-exercise
850     tools/keep-rsync
851     tools/arv-sync-groups
852 )
853 for g in "${gostuff[@]}"
854 do
855     do_install "$g" go
856 done
857
858 install_workbench() {
859     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
860         && mkdir -p tmp/cache \
861         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
862         && RAILS_ENV=test RAILS_GROUPS=assets bundle exec rake npm:install
863 }
864 do_install apps/workbench workbench
865
866 unset http_proxy https_proxy no_proxy
867
868 test_doclinkchecker() {
869     (
870         set -e
871         cd "$WORKSPACE/doc"
872         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
873         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
874         # do much good!
875         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
876     )
877 }
878 do_test doc doclinkchecker
879
880 stop_services
881
882 test_apiserver() {
883     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
884     cd "$WORKSPACE/services/api" \
885         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
886 }
887 do_test services/api apiserver
888
889 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
890 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
891 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
892   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
893   exit_cleanly
894 fi
895
896 start_api || { stop_services; fatal "start_api"; }
897
898 test_ruby_sdk() {
899     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
900         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
901 }
902 do_test sdk/ruby ruby_sdk
903
904 test_cli() {
905     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
906         && mkdir -p /tmp/keep \
907         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
908 }
909 do_test sdk/cli cli
910
911 test_login-sync() {
912     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
913         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
914 }
915 do_test services/login-sync login-sync
916
917 test_nodemanager_integration() {
918     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
919         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager_integration]}
920 }
921 do_test services/nodemanager_integration nodemanager_integration
922
923 for p in "${pythonstuff[@]}"
924 do
925     dir=${p%:py3}
926     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
927         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
928             do_test ${dir} pip
929         fi
930     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
931         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
932             do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
933         fi
934     fi
935 done
936
937 for g in "${gostuff[@]}"
938 do
939     do_test "$g" go
940 done
941
942 test_workbench_units() {
943     start_nginx_proxy_services \
944         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
945         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
946 }
947 do_test apps/workbench_units workbench_units
948
949 test_workbench_functionals() {
950     start_nginx_proxy_services \
951         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
952         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
953 }
954 do_test apps/workbench_functionals workbench_functionals
955
956 test_workbench_integration() {
957     start_nginx_proxy_services \
958         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
959         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
960 }
961 do_test apps/workbench_integration workbench_integration
962
963
964 test_workbench_benchmark() {
965     start_nginx_proxy_services \
966         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
967         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
968 }
969 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
970
971 test_workbench_profile() {
972     start_nginx_proxy_services \
973         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
974         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
975 }
976 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
977
978 exit_cleanly