build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2
   3 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin
   4
   5 COLUMNS=80
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
   7
   8 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
   9 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  10
  11 Exit non-zero if any tests fail.
  12
  13 Syntax:
  14         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  15
  16 Options:
  17
  18 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  19 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  20 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  21                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  22 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  23                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  24                subsequent invocations.
  25 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
  26                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  27                from a previous invocation if you use this option.
  28 --only-install Run specific install step
  29 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  30 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  31 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  32                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  33 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  34                Restrict apiserver tests to the given file
  35 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
  36                Restrict Python SDK tests to the given class
  37 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  38                Restrict Workbench tests to the given file
  39 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  40                Show all log messages, even when tests pass (also works
  41                with services/keepstore_test etc.)
  42 ARVADOS_DEBUG=1
  43                Print more debug messages
  44 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  45                *_test, and other examples shown above.
  46
  47 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
  48 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  49 test suites depend on other components being installed, and installing
  50 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  51
  52 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  53 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  54
  55 More information and background:
  56
  57 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  58
  59 Available tests:
  60
  61 apps/workbench
  62 apps/workbench_benchmark
  63 apps/workbench_profile
  64 doc
  65 services/api
  66 services/arv-git-httpd
  67 services/crunchstat
  68 services/dockercleaner
  69 services/fuse
  70 services/keep-web
  71 services/keepproxy
  72 services/keepstore
  73 services/login-sync
  74 services/nodemanager
  75 services/crunch-run
  76 services/crunch-dispatch-local
  77 services/crunch-dispatch-slurm
  78 sdk/cli
  79 sdk/pam
  80 sdk/python
  81 sdk/ruby
  82 sdk/go/arvadosclient
  83 sdk/go/keepclient
  84 sdk/go/httpserver
  85 sdk/go/manifest
  86 sdk/go/blockdigest
  87 sdk/go/streamer
  88 sdk/go/crunchrunner
  89 sdk/cwl
  90 tools/crunchstat-summary
  91 tools/keep-rsync
  92 tools/keep-block-check
  93
  94 EOF
  95
  96 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
  97 # environment that could interfere with the tests.
  98 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
  99
 100 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 101 # accident.
 102 GITDIR=
 103 GOPATH=
 104 VENVDIR=
 105 VENV3DIR=
 106 PYTHONPATH=
 107 GEMHOME=
 108 PERLINSTALLBASE=
 109
 110 short=
 111 skip_install=
 112 temp=
 113 temp_preserve=
 114
 115 clear_temp() {
 116     if [[ -z "$temp" ]]; then
 117         # we didn't even get as far as making a temp dir
 118         :
 119     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 120         rm -rf "$temp"
 121     else
 122         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 123     fi
 124 }
 125
 126 fatal() {
 127     clear_temp
 128     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 129     exit 1
 130 }
 131
 132 exit_cleanly() {
 133     trap - INT
 134     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 135     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 136     stop_services
 137     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 138     report_outcomes
 139     clear_temp
 140     exit ${#failures}
 141 }
 142
 143 sanity_checks() {
 144     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 145         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 146     echo Checking dependencies:
 147     echo -n 'virtualenv: '
 148     virtualenv --version \
 149         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 150     echo -n 'go: '
 151     go version \
 152         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 153     echo -n 'gcc: '
 154     gcc --version | egrep ^gcc \
 155         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 156     echo -n 'fuse.h: '
 157     find /usr/include -wholename '*fuse/fuse.h' \
 158         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 159     echo -n 'pyconfig.h: '
 160     find /usr/include -name pyconfig.h | egrep --max-count=1 . \
 161         || fatal "No pyconfig.h. Try: apt-get install python-dev"
 162     echo -n 'nginx: '
 163     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 164         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 165     echo -n 'perl: '
 166     perl -v | grep version \
 167         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 168     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 169         echo -n "perl $mod: "
 170         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 171             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 172     done
 173     echo -n 'gitolite: '
 174     which gitolite \
 175         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 176 }
 177
 178 rotate_logfile() {
 179   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 180   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 181   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 182     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 183     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 184     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 185   fi
 186 }
 187
 188 declare -a failures
 189 declare -A skip
 190 declare -A testargs
 191 skip[apps/workbench_profile]=1
 192
 193 while [[ -n "$1" ]]
 194 do
 195     arg="$1"; shift
 196     case "$arg" in
 197         --help)
 198             echo >&2 "$helpmessage"
 199             echo >&2
 200             exit 1
 201             ;;
 202         --skip)
 203             skipwhat="$1"; shift
 204             skip[$skipwhat]=1
 205             ;;
 206         --only)
 207             only="$1"; skip[$1]=""; shift
 208             ;;
 209         --short)
 210             short=1
 211             ;;
 212         --skip-install)
 213             skip_install=1
 214             ;;
 215         --only-install)
 216             skip_install=1
 217             only_install="$1"; shift
 218             ;;
 219         --temp)
 220             temp="$1"; shift
 221             temp_preserve=1
 222             ;;
 223         --leave-temp)
 224             temp_preserve=1
 225             ;;
 226         --retry)
 227             retry=1
 228             ;;
 229         *_test=*)
 230             suite="${arg%%_test=*}"
 231             args="${arg#*=}"
 232             testargs["$suite"]="$args"
 233             ;;
 234         *=*)
 235             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 236             ;;
 237         *)
 238             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 239             exit 1
 240             ;;
 241     esac
 242 done
 243
 244 start_api() {
 245     echo 'Starting API server...'
 246     cd "$WORKSPACE" \
 247         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 248         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 249         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 250         && (env | egrep ^ARVADOS)
 251 }
 252
 253 start_nginx_proxy_services() {
 254     echo 'Starting keepproxy, keep-web, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
 255     cd "$WORKSPACE" \
 256         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 257         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 258         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 259         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 260         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1
 261 }
 262
 263 stop_services() {
 264     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES" ]]; then
 265         unset ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 266         cd "$WORKSPACE" \
 267             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 268             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 269             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 270             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy
 271     fi
 272     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 273         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 274         cd "$WORKSPACE" \
 275             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
 276     fi
 277 }
 278
 279 interrupt() {
 280     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 281     exit_cleanly
 282 }
 283 trap interrupt INT
 284
 285 sanity_checks
 286
 287 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 288
 289 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 290     # Jenkins expects us to use this by default.
 291     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 292 fi
 293
 294 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 295 cd "$WORKSPACE"
 296 find -name '*.pyc' -delete
 297
 298 if [[ -z "$temp" ]]; then
 299     temp="$(mktemp -d)"
 300 fi
 301
 302 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 303 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
 304 do
 305     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 306         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 307     fi
 308     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 309         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 310     fi
 311 done
 312
 313 setup_ruby_environment() {
 314     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 315       source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 316       using_rvm=true
 317     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 318       source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 319       using_rvm=true
 320     else
 321       using_rvm=false
 322     fi
 323
 324     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 325         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 326         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 327         # the environment to the "current gemset", which would lose
 328         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 329         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 330         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 331         # rvm gemset and use it for everything.
 332
 333         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 334             || fatal 'rvm check'
 335
 336         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 337         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 338         # complaint about not being in first place already.
 339         rvm use @default 2>/dev/null
 340
 341         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests
 342         # gemset. (Leave the choice of ruby to the caller.)
 343         rvm use @arvados-tests --create \
 344             || fatal 'rvm gemset setup'
 345
 346         rvm env
 347     else
 348         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 349         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 350         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 351         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 352         # should be installed, and we should leave it alone.)
 353
 354         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 355             user_gempath="$(gem env gempath)"
 356             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 357         fi
 358         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 359
 360         # When we build and install our own gems, we install them in our
 361         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 362         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 363         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 364
 365         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 366         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 367         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home:$(gem env gempath)"
 368
 369         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 370         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 371         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 372     fi
 373 }
 374
 375 with_test_gemset() {
 376     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 377         "$@"
 378     else
 379         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 380     fi
 381 }
 382
 383 gem_uninstall_if_exists() {
 384     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 385         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 386     fi
 387 }
 388
 389 setup_virtualenv() {
 390     local venvdest="$1"; shift
 391     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 392         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 393     fi
 394     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 395         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 396         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18' 'pip>=7,<8'
 397     else
 398         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18' 'pip>=7'
 399     fi
 400     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 401     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 402 }
 403
 404 export PERLINSTALLBASE
 405 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
 406
 407 export GOPATH
 408 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 409 ln -sfn "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
 410     || fatal "symlink failed"
 411
 412 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 413 . "$VENVDIR/bin/activate"
 414
 415 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 416 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
 417     || pip install PyYAML >/dev/null \
 418     || fatal "pip install PyYAML failed"
 419
 420 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
 421 # won't pick it up by default.
 422 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 423     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
 424     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 425
 426 # This will help people who reuse --temp dirs when we upgrade to llfuse 0.42
 427 if egrep -q 'llfuse.*>= *0\.42' "$WORKSPACE/services/fuse/setup.py"; then
 428     # Uninstall old llfuse, because services/fuse "pip install" won't
 429     # upgrade it by default.
 430     if pip freeze | egrep '^llfuse==0\.41\.'; then
 431         yes | pip uninstall 'llfuse<0.42'
 432     fi
 433 fi
 434
 435 # Deactivate Python 2 virtualenv
 436 deactivate
 437
 438 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 439 # Otherwise, skip dependent tests.
 440 PYTHON3=$(which python3)
 441 if [ "0" = "$?" ]; then
 442     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 443 else
 444     PYTHON3=
 445     skip[services/dockercleaner]=1
 446     cat >&2 <<EOF
 447
 448 Warning: python3 could not be found
 449 services/dockercleaner install and tests will be skipped
 450
 451 EOF
 452 fi
 453
 454 # Reactivate Python 2 virtualenv
 455 . "$VENVDIR/bin/activate"
 456
 457 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 458 # whine a lot.
 459 setup_ruby_environment
 460
 461 echo "PATH is $PATH"
 462
 463 if ! which bundler >/dev/null
 464 then
 465     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 466 fi
 467
 468 retry() {
 469     while ! ${@} && [[ "$retry" == 1 ]]
 470     do
 471         read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 472         if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 473         then
 474             break
 475         fi
 476     done
 477 }
 478
 479 do_test() {
 480     retry do_test_once ${@}
 481 }
 482
 483 do_test_once() {
 484     unset result
 485     if [[ -z "${skip[$1]}" ]] && ( [[ -z "$only" ]] || [[ "$only" == "$1" ]] )
 486     then
 487         title "Running $1 tests"
 488         timer_reset
 489         if [[ "$2" == "go" ]]
 490         then
 491             covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 492             coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 493             # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 494             # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 495             # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 496             # compilation errors.
 497             go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" || return 1
 498             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 499             then
 500                 # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 501                 # does:
 502                 cd "$WORKSPACE/$1" && go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} ${testargs[$1]}
 503             else
 504                 # The above form gets verbose even when testargs is
 505                 # empty, so use this form in such cases:
 506                 go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 507             fi
 508             result="$?"
 509             if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 510             then
 511                 go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 512                 rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 513             fi
 514         elif [[ "$2" == "pip" ]]
 515         then
 516             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 517             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 518             cd "$WORKSPACE/$1" \
 519                 && "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 520         elif [[ "$2" != "" ]]
 521         then
 522             "test_$2"
 523         else
 524             "test_$1"
 525         fi
 526         result=${result:-$?}
 527         checkexit $result "$1 tests"
 528         title "End of $1 tests (`timer`)"
 529         return $result
 530     else
 531         title "Skipping $1 tests"
 532     fi
 533 }
 534
 535 do_install() {
 536     retry do_install_once ${@}
 537 }
 538
 539 do_install_once() {
 540     if [[ -z "$skip_install" || (-n "$only_install" && "$only_install" == "$1") ]]
 541     then
 542         title "Running $1 install"
 543         timer_reset
 544         if [[ "$2" == "go" ]]
 545         then
 546             go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 547         elif [[ "$2" == "pip" ]]
 548         then
 549             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 550             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 551
 552             # Need to change to a different directory after creating
 553             # the source dist package to avoid a pip bug.
 554             # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 555
 556             # Also need to install twice, because if it believes the package is
 557             # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 558             # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 559             # install" ensures that we've actually installed the local package
 560             # we just built.
 561             cd "$WORKSPACE/$1" \
 562                 && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 563                 && cd "$WORKSPACE" \
 564                 && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 565                 && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 566         elif [[ "$2" != "" ]]
 567         then
 568             "install_$2"
 569         else
 570             "install_$1"
 571         fi
 572         result=$?
 573         checkexit $result "$1 install"
 574         title "End of $1 install (`timer`)"
 575         return $result
 576     else
 577         title "Skipping $1 install"
 578     fi
 579 }
 580
 581 bundle_install_trylocal() {
 582     (
 583         set -e
 584         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 585         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 586             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 587             bundle install --no-deployment
 588         fi
 589         bundle package --all
 590     )
 591 }
 592
 593 install_doc() {
 594     cd "$WORKSPACE/doc" \
 595         && bundle_install_trylocal \
 596         && rm -rf .site
 597 }
 598 do_install doc
 599
 600 install_gem() {
 601     gemname=$1
 602     srcpath=$2
 603     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 604         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 605         && bundle_install_trylocal \
 606         && gem build "$gemname.gemspec" \
 607         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 608 }
 609
 610 install_ruby_sdk() {
 611     install_gem arvados sdk/ruby
 612 }
 613 do_install sdk/ruby ruby_sdk
 614
 615 install_perl_sdk() {
 616     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 617         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 618         && make install INSTALLDIRS=perl
 619 }
 620 do_install sdk/perl perl_sdk
 621
 622 install_cli() {
 623     install_gem arvados-cli sdk/cli
 624 }
 625 do_install sdk/cli cli
 626
 627 install_login-sync() {
 628     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 629 }
 630 do_install services/login-sync login-sync
 631
 632 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
 633 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
 634 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
 635 # its own test suite brings up some of those other programs (like
 636 # keepproxy).
 637 declare -a pythonstuff
 638 pythonstuff=(
 639     sdk/pam
 640     sdk/python
 641     sdk/cwl
 642     services/fuse
 643     services/nodemanager
 644     tools/crunchstat-summary
 645     )
 646 for p in "${pythonstuff[@]}"
 647 do
 648     do_install "$p" pip
 649 done
 650 if [ -n "$PYTHON3" ]; then
 651     do_install services/dockercleaner pip "$VENV3DIR/bin/"
 652 fi
 653
 654 install_apiserver() {
 655     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 656         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 657
 658     rm -f config/environments/test.rb
 659     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 660
 661     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 662     then
 663         for f in database.yml application.yml
 664         do
 665             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 666         done
 667     fi
 668
 669     # Fill in a random secret_token and blob_signing_key for testing
 670     SECRET_TOKEN=`echo 'puts rand(2**512).to_s(36)' |ruby`
 671     BLOB_SIGNING_KEY=`echo 'puts rand(2**512).to_s(36)' |ruby`
 672
 673     sed -i'' -e "s:SECRET_TOKEN:$SECRET_TOKEN:" config/application.yml
 674     sed -i'' -e "s:BLOB_SIGNING_KEY:$BLOB_SIGNING_KEY:" config/application.yml
 675
 676     # Set up empty git repo (for git tests)
 677     GITDIR=$(mktemp -d)
 678     sed -i'' -e "s:/var/cache/git:$GITDIR:" config/application.default.yml
 679
 680     rm -rf $GITDIR
 681     mkdir -p $GITDIR/test
 682     cd $GITDIR/test \
 683         && git init \
 684         && git config user.email "jenkins@ci.curoverse.com" \
 685         && git config user.name "Jenkins, CI" \
 686         && touch tmp \
 687         && git add tmp \
 688         && git commit -m 'initial commit'
 689
 690     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 691     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 692     # is a postgresql superuser.
 693     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 694         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 695         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 696
 697     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 698         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 699         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 700         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 701 }
 702 do_install services/api apiserver
 703
 704 declare -a gostuff
 705 gostuff=(
 706     sdk/go/arvadosclient
 707     sdk/go/blockdigest
 708     sdk/go/httpserver
 709     sdk/go/manifest
 710     sdk/go/streamer
 711     sdk/go/crunchrunner
 712     services/arv-git-httpd
 713     services/crunchstat
 714     services/keep-web
 715     services/keepstore
 716     sdk/go/keepclient
 717     services/keepproxy
 718     services/datamanager/summary
 719     services/datamanager/collection
 720     services/datamanager/keep
 721     services/datamanager
 722     services/crunch-dispatch-local
 723     services/crunch-dispatch-slurm
 724     services/crunch-run
 725     tools/keep-rsync
 726     tools/keep-block-check
 727     )
 728 for g in "${gostuff[@]}"
 729 do
 730     do_install "$g" go
 731 done
 732
 733 install_workbench() {
 734     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 735         && mkdir -p tmp/cache \
 736         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 737 }
 738 do_install apps/workbench workbench
 739
 740 test_doclinkchecker() {
 741     (
 742         set -e
 743         cd "$WORKSPACE/doc"
 744         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
 745         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
 746         # do much good!
 747         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
 748     )
 749 }
 750 do_test doc doclinkchecker
 751
 752 stop_services
 753
 754 test_apiserver() {
 755     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
 756     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 757         && RAILS_ENV=test bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
 758 }
 759 do_test services/api apiserver
 760
 761 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
 762 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
 763 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
 764   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 765   exit_cleanly
 766 fi
 767
 768 start_api
 769
 770 test_ruby_sdk() {
 771     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
 772         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
 773 }
 774 do_test sdk/ruby ruby_sdk
 775
 776 test_cli() {
 777     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
 778         && mkdir -p /tmp/keep \
 779         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
 780 }
 781 do_test sdk/cli cli
 782
 783 test_login-sync() {
 784     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
 785         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
 786 }
 787 do_test services/login-sync login-sync
 788
 789 for p in "${pythonstuff[@]}"
 790 do
 791     do_test "$p" pip
 792 done
 793 do_test services/dockercleaner pip "$VENV3DIR/bin/"
 794
 795 for g in "${gostuff[@]}"
 796 do
 797     do_test "$g" go
 798 done
 799
 800 test_workbench() {
 801     start_nginx_proxy_services \
 802         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 803         && RAILS_ENV=test bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 804 }
 805 do_test apps/workbench workbench
 806
 807 test_workbench_benchmark() {
 808     start_nginx_proxy_services \
 809         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 810         && RAILS_ENV=test bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
 811 }
 812 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
 813
 814 test_workbench_profile() {
 815     start_nginx_proxy_services \
 816         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 817         && RAILS_ENV=test bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
 818 }
 819 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
 820
 821 exit_cleanly