Merge branch '10460-cwl-staging-fix' refs #10460
[arvados.git] / build / run-tests.sh
1 #!/bin/bash
2
3 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin
4
5 COLUMNS=80
6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
7
8 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
9 $(basename $0): Install and test Arvados components.
10
11 Exit non-zero if any tests fail.
12
13 Syntax:
14         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
15
16 Options:
17
18 --skip FOO     Do not test the FOO component.
19 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
20 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
21                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
22 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
23                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
24                subsequent invocations.
25 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
26                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
27                from a previous invocation if you use this option.
28 --only-install Run specific install step
29 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
30 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
31 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
32                (If none given, leave config files alone in source tree.)
33 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
34                Restrict apiserver tests to the given file
35 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
36                Restrict Python SDK tests to the given class
37 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
38                Restrict Workbench tests to the given file
39 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
40                Show all log messages, even when tests pass (also works
41                with services/keepstore_test etc.)
42 ARVADOS_DEBUG=1
43                Print more debug messages
44 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
45                *_test, and other examples shown above.
46
47 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
48 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
49 test suites depend on other components being installed, and installing
50 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
51
52 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
53 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
54
55 More information and background:
56
57 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
58
59 Available tests:
60
61 apps/workbench (*)
62 apps/workbench_units (*)
63 apps/workbench_functionals (*)
64 apps/workbench_integration (*)
65 apps/workbench_benchmark
66 apps/workbench_profile
67 doc
68 services/api
69 services/arv-git-httpd
70 services/crunchstat
71 services/dockercleaner
72 services/fuse
73 services/keep-web
74 services/keepproxy
75 services/keepstore
76 services/keep-balance
77 services/login-sync
78 services/nodemanager
79 services/crunch-run
80 services/crunch-dispatch-local
81 services/crunch-dispatch-slurm
82 sdk/cli
83 sdk/pam
84 sdk/python
85 sdk/ruby
86 sdk/go/arvados
87 sdk/go/arvadosclient
88 sdk/go/keepclient
89 sdk/go/httpserver
90 sdk/go/manifest
91 sdk/go/blockdigest
92 sdk/go/streamer
93 sdk/go/crunchrunner
94 sdk/cwl
95 tools/crunchstat-summary
96 tools/keep-exercise
97 tools/keep-rsync
98 tools/keep-block-check
99
100 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
101     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
102
103 EOF
104
105 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
106 # environment that could interfere with the tests.
107 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
108
109 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
110 # accident.
111 GITDIR=
112 GOPATH=
113 VENVDIR=
114 VENV3DIR=
115 PYTHONPATH=
116 GEMHOME=
117 PERLINSTALLBASE=
118
119 short=
120 skip_install=
121 temp=
122 temp_preserve=
123
124 clear_temp() {
125     if [[ -z "$temp" ]]; then
126         # we didn't even get as far as making a temp dir
127         :
128     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
129         rm -rf "$temp"
130     else
131         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
132     fi
133 }
134
135 fatal() {
136     clear_temp
137     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
138     exit 1
139 }
140
141 exit_cleanly() {
142     trap - INT
143     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
144     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
145     stop_services
146     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
147     report_outcomes
148     clear_temp
149     exit ${#failures}
150 }
151
152 sanity_checks() {
153     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
154         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
155     echo Checking dependencies:
156     echo -n 'virtualenv: '
157     virtualenv --version \
158         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
159     echo -n 'go: '
160     go version \
161         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
162     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 7 ]] \
163         || fatal "Go >= 1.7 required. See http://golang.org/doc/install"
164     echo -n 'gcc: '
165     gcc --version | egrep ^gcc \
166         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
167     echo -n 'fuse.h: '
168     find /usr/include -wholename '*fuse/fuse.h' \
169         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
170     echo -n 'pyconfig.h: '
171     find /usr/include -name pyconfig.h | egrep --max-count=1 . \
172         || fatal "No pyconfig.h. Try: apt-get install python-dev"
173     echo -n 'nginx: '
174     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
175         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
176     echo -n 'perl: '
177     perl -v | grep version \
178         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
179     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
180         echo -n "perl $mod: "
181         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
182             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
183     done
184     echo -n 'gitolite: '
185     which gitolite \
186         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
187 }
188
189 rotate_logfile() {
190   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
191   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
192   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
193     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
194     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
195     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
196   fi
197 }
198
199 declare -a failures
200 declare -A skip
201 declare -A testargs
202 skip[apps/workbench_profile]=1
203
204 while [[ -n "$1" ]]
205 do
206     arg="$1"; shift
207     case "$arg" in
208         --help)
209             echo >&2 "$helpmessage"
210             echo >&2
211             exit 1
212             ;;
213         --skip)
214             skipwhat="$1"; shift
215             if [[ "$skipwhat" == "apps/workbench" ]]; then
216               skip["apps/workbench_units"]=1
217               skip["apps/workbench_functionals"]=1
218               skip["apps/workbench_integration"]=1
219             else
220               skip[$skipwhat]=1
221             fi
222             ;;
223         --only)
224             only="$1"; skip[$1]=""; shift
225             ;;
226         --short)
227             short=1
228             ;;
229         --skip-install)
230             skip_install=1
231             ;;
232         --only-install)
233             skip_install=1
234             only_install="$1"; shift
235             ;;
236         --temp)
237             temp="$1"; shift
238             temp_preserve=1
239             ;;
240         --leave-temp)
241             temp_preserve=1
242             ;;
243         --retry)
244             retry=1
245             ;;
246         *_test=*)
247             suite="${arg%%_test=*}"
248             args="${arg#*=}"
249             testargs["$suite"]="$args"
250             ;;
251         *=*)
252             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
253             ;;
254         *)
255             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
256             exit 1
257             ;;
258     esac
259 done
260
261 start_api() {
262     echo 'Starting API server...'
263     cd "$WORKSPACE" \
264         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
265         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
266         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
267         && (env | egrep ^ARVADOS)
268 }
269
270 start_nginx_proxy_services() {
271     echo 'Starting keepproxy, keep-web, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
272     cd "$WORKSPACE" \
273         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
274         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
275         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
276         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
277         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1
278 }
279
280 stop_services() {
281     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES" ]]; then
282         unset ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
283         cd "$WORKSPACE" \
284             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
285             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
286             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
287             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy
288     fi
289     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
290         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
291         cd "$WORKSPACE" \
292             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
293     fi
294 }
295
296 interrupt() {
297     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
298     exit_cleanly
299 }
300 trap interrupt INT
301
302 sanity_checks
303
304 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
305
306 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
307     # Jenkins expects us to use this by default.
308     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
309 fi
310
311 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
312 cd "$WORKSPACE"
313 find -name '*.pyc' -delete
314
315 if [[ -z "$temp" ]]; then
316     temp="$(mktemp -d)"
317 fi
318
319 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
320 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
321 do
322     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
323         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
324     fi
325     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
326         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
327     fi
328 done
329
330 setup_ruby_environment() {
331     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
332       source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
333       using_rvm=true
334     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
335       source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
336       using_rvm=true
337     else
338       using_rvm=false
339     fi
340
341     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
342         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
343         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
344         # the environment to the "current gemset", which would lose
345         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
346         # programs (for example, the Workbench test suite could not
347         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
348         # rvm gemset and use it for everything.
349
350         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
351             || fatal 'rvm check'
352
353         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
354         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
355         # complaint about not being in first place already.
356         rvm use @default 2>/dev/null
357
358         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
359         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
360         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
361         # ruby to the caller.
362         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
363         rvm use "@${gemset}" --create \
364             || fatal 'rvm gemset setup'
365
366         rvm env
367     else
368         # When our "bundle install"s need to install new gems to
369         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
370         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
371         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
372         # should be installed, and we should leave it alone.)
373
374         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
375             user_gempath="$(gem env gempath)"
376             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
377         fi
378         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
379
380         # When we build and install our own gems, we install them in our
381         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
382         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
383         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
384
385         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
386         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
387         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home:$(gem env gempath)"
388
389         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
390         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
391         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
392     fi
393 }
394
395 with_test_gemset() {
396     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
397         "$@"
398     else
399         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
400     fi
401 }
402
403 gem_uninstall_if_exists() {
404     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
405         gem uninstall --force --all --executables "$1"
406     fi
407 }
408
409 setup_virtualenv() {
410     local venvdest="$1"; shift
411     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
412         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
413     fi
414     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
415         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
416         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
417     else
418         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
419     fi
420     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
421     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
422 }
423
424 export PERLINSTALLBASE
425 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
426
427 export GOPATH
428 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
429 ln -sfn "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
430     || fatal "symlink failed"
431
432 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
433 . "$VENVDIR/bin/activate"
434
435 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
436 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
437     || pip install PyYAML >/dev/null \
438     || fatal "pip install PyYAML failed"
439
440 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
441 # won't pick it up by default.
442 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
443     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
444     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
445
446 # This will help people who reuse --temp dirs when we upgrade to llfuse 0.42
447 if egrep -q 'llfuse.*>= *0\.42' "$WORKSPACE/services/fuse/setup.py"; then
448     # Uninstall old llfuse, because services/fuse "pip install" won't
449     # upgrade it by default.
450     if pip freeze | egrep '^llfuse==0\.41\.'; then
451         yes | pip uninstall 'llfuse<0.42'
452     fi
453 fi
454
455 # Deactivate Python 2 virtualenv
456 deactivate
457
458 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
459 # Otherwise, skip dependent tests.
460 PYTHON3=$(which python3)
461 if [ "0" = "$?" ]; then
462     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
463 else
464     PYTHON3=
465     skip[services/dockercleaner]=1
466     cat >&2 <<EOF
467
468 Warning: python3 could not be found
469 services/dockercleaner install and tests will be skipped
470
471 EOF
472 fi
473
474 # Reactivate Python 2 virtualenv
475 . "$VENVDIR/bin/activate"
476
477 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
478 # whine a lot.
479 setup_ruby_environment
480
481 echo "PATH is $PATH"
482
483 if ! which bundler >/dev/null
484 then
485     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
486 fi
487
488 retry() {
489     while ! ${@} && [[ "$retry" == 1 ]]
490     do
491         read -p 'Try again? [Y/n] ' x
492         if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
493         then
494             break
495         fi
496     done
497 }
498
499 do_test() {
500     retry do_test_once ${@}
501 }
502
503 do_test_once() {
504     unset result
505     to_test=$1
506     if (( [[ "$only" == "apps/workbench" ]] ) &&
507        ( [[ "$to_test" == "apps/workbench_units" ]] || [[ "$to_test" == "apps/workbench_functionals" ]] ||
508          [[ "$to_test" == "apps/workbench_integration" ]])); then
509       to_test="apps/workbench"
510     fi
511     if [[ -z "${skip[$1]}" ]] && ( [[ -z "$only" ]] || [[ "$only" == "$to_test" ]] )
512     then
513         title "Running $1 tests"
514         timer_reset
515         if [[ "$2" == "go" ]]
516         then
517             covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
518             coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
519             # We do "go get -t" here to catch compilation errors
520             # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
521             # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
522             # compilation errors.
523             go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" || return 1
524             cd "$WORKSPACE/$1" || return 1
525             gofmt -e -d . | egrep . && result=1
526             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
527             then
528                 # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
529                 # does:
530                 cd "$WORKSPACE/$1" && go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
531             else
532                 # The above form gets verbose even when testargs is
533                 # empty, so use this form in such cases:
534                 go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
535             fi
536             result=${result:-$?}
537             if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
538             then
539                 go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
540                 rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
541             fi
542         elif [[ "$2" == "pip" ]]
543         then
544             tries=0
545             cd "$WORKSPACE/$1" && while :
546             do
547                 tries=$((${tries}+1))
548                 # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
549                 # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
550                 "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
551                 result=$?
552                 if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
553                 then
554                     printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
555                     continue
556                 else
557                     break
558                 fi
559             done
560         elif [[ "$2" != "" ]]
561         then
562             "test_$2"
563         else
564             "test_$1"
565         fi
566         result=${result:-$?}
567         checkexit $result "$1 tests"
568         title "End of $1 tests (`timer`)"
569         return $result
570     else
571         title "Skipping $1 tests"
572     fi
573 }
574
575 do_install() {
576     retry do_install_once ${@}
577 }
578
579 do_install_once() {
580     if [[ -z "$skip_install" || (-n "$only_install" && "$only_install" == "$1") ]]
581     then
582         title "Running $1 install"
583         timer_reset
584         if [[ "$2" == "go" ]]
585         then
586             go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
587         elif [[ "$2" == "pip" ]]
588         then
589             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
590             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
591
592             # Need to change to a different directory after creating
593             # the source dist package to avoid a pip bug.
594             # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
595
596             # Also need to install twice, because if it believes the package is
597             # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
598             # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
599             # install" ensures that we've actually installed the local package
600             # we just built.
601             cd "$WORKSPACE/$1" \
602                 && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
603                 && cd "$WORKSPACE" \
604                 && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
605                 && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
606         elif [[ "$2" != "" ]]
607         then
608             "install_$2"
609         else
610             "install_$1"
611         fi
612         result=$?
613         checkexit $result "$1 install"
614         title "End of $1 install (`timer`)"
615         return $result
616     else
617         title "Skipping $1 install"
618     fi
619 }
620
621 bundle_install_trylocal() {
622     (
623         set -e
624         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
625         if ! bundle install --local --no-deployment; then
626             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
627             bundle install --no-deployment
628         fi
629         bundle package --all
630     )
631 }
632
633 install_doc() {
634     cd "$WORKSPACE/doc" \
635         && bundle_install_trylocal \
636         && rm -rf .site
637 }
638 do_install doc
639
640 install_gem() {
641     gemname=$1
642     srcpath=$2
643     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
644         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
645         && bundle_install_trylocal \
646         && gem build "$gemname.gemspec" \
647         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
648 }
649
650 install_ruby_sdk() {
651     install_gem arvados sdk/ruby
652 }
653 do_install sdk/ruby ruby_sdk
654
655 install_perl_sdk() {
656     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
657         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
658         && make install INSTALLDIRS=perl
659 }
660 do_install sdk/perl perl_sdk
661
662 install_cli() {
663     install_gem arvados-cli sdk/cli
664 }
665 do_install sdk/cli cli
666
667 install_login-sync() {
668     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
669 }
670 do_install services/login-sync login-sync
671
672 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
673 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
674 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
675 # its own test suite brings up some of those other programs (like
676 # keepproxy).
677 declare -a pythonstuff
678 pythonstuff=(
679     sdk/pam
680     sdk/python
681     sdk/cwl
682     services/fuse
683     services/nodemanager
684     tools/crunchstat-summary
685     )
686 for p in "${pythonstuff[@]}"
687 do
688     do_install "$p" pip
689 done
690 if [ -n "$PYTHON3" ]; then
691     do_install services/dockercleaner pip "$VENV3DIR/bin/"
692 fi
693
694 install_apiserver() {
695     cd "$WORKSPACE/services/api" \
696         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
697
698     rm -f config/environments/test.rb
699     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
700
701     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
702     then
703         for f in database.yml application.yml
704         do
705             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
706         done
707     fi
708
709     # Fill in a random secret_token and blob_signing_key for testing
710     SECRET_TOKEN=`echo 'puts rand(2**512).to_s(36)' |ruby`
711     BLOB_SIGNING_KEY=`echo 'puts rand(2**512).to_s(36)' |ruby`
712
713     sed -i'' -e "s:SECRET_TOKEN:$SECRET_TOKEN:" config/application.yml
714     sed -i'' -e "s:BLOB_SIGNING_KEY:$BLOB_SIGNING_KEY:" config/application.yml
715
716     # Set up empty git repo (for git tests)
717     GITDIR=$(mktemp -d)
718     sed -i'' -e "s:/var/cache/git:$GITDIR:" config/application.default.yml
719
720     rm -rf $GITDIR
721     mkdir -p $GITDIR/test
722     cd $GITDIR/test \
723         && git init \
724         && git config user.email "jenkins@ci.curoverse.com" \
725         && git config user.name "Jenkins, CI" \
726         && touch tmp \
727         && git add tmp \
728         && git commit -m 'initial commit'
729
730     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
731     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
732     # is a postgresql superuser.
733     cd "$WORKSPACE/services/api" \
734         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
735         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
736
737     cd "$WORKSPACE/services/api" \
738         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
739         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
740         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
741 }
742 do_install services/api apiserver
743
744 declare -a gostuff
745 gostuff=(
746     sdk/go/arvados
747     sdk/go/arvadosclient
748     sdk/go/blockdigest
749     sdk/go/httpserver
750     sdk/go/manifest
751     sdk/go/streamer
752     sdk/go/crunchrunner
753     lib/crunchstat
754     services/arv-git-httpd
755     services/crunchstat
756     services/keep-web
757     services/keepstore
758     sdk/go/keepclient
759     services/keep-balance
760     services/keepproxy
761     services/datamanager/summary
762     services/datamanager/collection
763     services/datamanager/keep
764     services/datamanager
765     services/crunch-dispatch-local
766     services/crunch-dispatch-slurm
767     services/crunch-run
768     tools/keep-block-check
769     tools/keep-exercise
770     tools/keep-rsync
771     )
772 for g in "${gostuff[@]}"
773 do
774     do_install "$g" go
775 done
776
777 install_workbench() {
778     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
779         && mkdir -p tmp/cache \
780         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
781 }
782 do_install apps/workbench workbench
783
784 test_doclinkchecker() {
785     (
786         set -e
787         cd "$WORKSPACE/doc"
788         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
789         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
790         # do much good!
791         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
792     )
793 }
794 do_test doc doclinkchecker
795
796 stop_services
797
798 test_apiserver() {
799     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
800     cd "$WORKSPACE/services/api" \
801         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
802 }
803 do_test services/api apiserver
804
805 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
806 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
807 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
808   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
809   exit_cleanly
810 fi
811
812 start_api
813
814 test_ruby_sdk() {
815     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
816         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
817 }
818 do_test sdk/ruby ruby_sdk
819
820 test_cli() {
821     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
822         && mkdir -p /tmp/keep \
823         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
824 }
825 do_test sdk/cli cli
826
827 test_login-sync() {
828     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
829         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
830 }
831 do_test services/login-sync login-sync
832
833 for p in "${pythonstuff[@]}"
834 do
835     do_test "$p" pip
836 done
837 do_test services/dockercleaner pip "$VENV3DIR/bin/"
838
839 for g in "${gostuff[@]}"
840 do
841     do_test "$g" go
842 done
843
844 test_workbench_units() {
845     start_nginx_proxy_services \
846         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
847         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
848 }
849 do_test apps/workbench_units workbench_units
850
851 test_workbench_functionals() {
852     start_nginx_proxy_services \
853         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
854         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
855 }
856 do_test apps/workbench_functionals workbench_functionals
857
858 test_workbench_integration() {
859     start_nginx_proxy_services \
860         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
861         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
862 }
863 do_test apps/workbench_integration workbench_integration
864
865
866 test_workbench_benchmark() {
867     start_nginx_proxy_services \
868         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
869         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
870 }
871 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
872
873 test_workbench_profile() {
874     start_nginx_proxy_services \
875         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
876         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
877 }
878 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
879
880 exit_cleanly