doc/user/index.html.textile.liquid

   1 ---
   2 layout: default
   3 navsection: userguide
   4 title: Welcome to Arvados&trade;!
   5 ...
   6 {% comment %}
   7 Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   8
   9 SPDX-License-Identifier: CC-BY-SA-3.0
  10 {% endcomment %}
  11
  12 Arvados is an "open source":copying/copying.html platform for managing, processing, and sharing genomic and other large scientific and biomedical data.  With Arvados, bioinformaticians run and scale compute-intensive workflows, developers create biomedical applications, and IT administrators manage large compute and storage resources.
  13
  14 This guide provides a reference for using Arvados to solve scientific big data problems.
  15
  16 The examples in this guide use the Arvados instance located at <a href="{{site.arvados_workbench_host}}/" target="_blank">{{site.arvados_workbench_host}}</a>.  If you are using a different Arvados instance replace @{{ site.arvados_workbench_host }}@ with your private instance in all of the examples in this guide.
  17
  18 h2. Typographic conventions
  19
  20 This manual uses the following typographic conventions:
  21
  22 <notextile>
  23 <ul>
  24 <li>Code blocks which are set aside from the text indicate user input to the system.  Commands that should be entered into a Unix shell are indicated by the directory where you should  enter the command ('~' indicates your home directory) followed by '$', followed by the highlighted <span class="userinput">command to enter</span> (do not enter the '$'), and possibly followed by example command output in black.  For example, the following block indicates that you should type <code>ls foo.*</code> while in your home directory and the expected output will be "foo.input" and "foo.output".
  25 <pre><code>~$ <span class="userinput">ls foo.*</span>
  26 foo.input foo.output
  27 </code></pre>
  28 </li>
  29
  30 <li>Code blocks inline with text emphasize specific <code>programs</code>, <code>files</code>, or <code>options</code> that are being discussed.</li>
  31 <li>Bold text emphasizes <b>specific items</b> to review on Arvados Workbench pages.</li>
  32 <li>A sequence of steps separated by right arrows (<span class="rarr">&rarr;</span>) indicate a path the user should follow through the Arvados Workbench.  The steps indicate a menu, hyperlink, column name, field name, or other label on the page that guide the user where to look or click.
  33 </li>
  34 </ul>
  35 </notextile>