build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2
   3 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin
   4
   5 COLUMNS=80
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
   7
   8 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
   9 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  10
  11 Exit non-zero if any tests fail.
  12
  13 Syntax:
  14         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  15
  16 Options:
  17
  18 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  19 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  20 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  21                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  22 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  23                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  24                subsequent invocations.
  25 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
  26                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  27                from a previous invocation if you use this option.
  28 --only-install Run specific install step
  29 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  30 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  31 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  32                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  33 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  34                Restrict apiserver tests to the given file
  35 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
  36                Restrict Python SDK tests to the given class
  37 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  38                Restrict Workbench tests to the given file
  39 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  40                Show all log messages, even when tests pass (also works
  41                with services/keepstore_test etc.)
  42 ARVADOS_DEBUG=1
  43                Print more debug messages
  44 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  45                *_test, and other examples shown above.
  46
  47 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
  48 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  49 test suites depend on other components being installed, and installing
  50 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  51
  52 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  53 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  54
  55 More information and background:
  56
  57 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  58
  59 Available tests:
  60
  61 apps/workbench (*)
  62 apps/workbench_units (*)
  63 apps/workbench_functionals (*)
  64 apps/workbench_integration (*)
  65 apps/workbench_benchmark
  66 apps/workbench_profile
  67 doc
  68 services/api
  69 services/arv-git-httpd
  70 services/crunchstat
  71 services/dockercleaner
  72 services/fuse
  73 services/keep-web
  74 services/keepproxy
  75 services/keepstore
  76 services/keep-balance
  77 services/login-sync
  78 services/nodemanager
  79 services/crunch-run
  80 services/crunch-dispatch-local
  81 services/crunch-dispatch-slurm
  82 services/ws
  83 sdk/cli
  84 sdk/pam
  85 sdk/python
  86 sdk/ruby
  87 sdk/go/arvados
  88 sdk/go/arvadosclient
  89 sdk/go/keepclient
  90 sdk/go/httpserver
  91 sdk/go/manifest
  92 sdk/go/blockdigest
  93 sdk/go/streamer
  94 sdk/go/stats
  95 sdk/go/crunchrunner
  96 sdk/cwl
  97 tools/crunchstat-summary
  98 tools/keep-exercise
  99 tools/keep-rsync
 100 tools/keep-block-check
 101
 102 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 103     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 104
 105 EOF
 106
 107 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 108 # environment that could interfere with the tests.
 109 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 110
 111 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 112 # accident.
 113 GITDIR=
 114 GOPATH=
 115 VENVDIR=
 116 VENV3DIR=
 117 PYTHONPATH=
 118 GEMHOME=
 119 PERLINSTALLBASE=
 120
 121 short=
 122 skip_install=
 123 temp=
 124 temp_preserve=
 125
 126 clear_temp() {
 127     if [[ -z "$temp" ]]; then
 128         # we didn't even get as far as making a temp dir
 129         :
 130     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 131         rm -rf "$temp"
 132     else
 133         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 134     fi
 135 }
 136
 137 fatal() {
 138     clear_temp
 139     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 140     exit 1
 141 }
 142
 143 exit_cleanly() {
 144     trap - INT
 145     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 146     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 147     stop_services
 148     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 149     report_outcomes
 150     clear_temp
 151     exit ${#failures}
 152 }
 153
 154 sanity_checks() {
 155     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 156         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 157     echo Checking dependencies:
 158     echo -n 'virtualenv: '
 159     virtualenv --version \
 160         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 161     echo -n 'ruby: '
 162     ruby -v \
 163         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 164     echo -n 'bundler: '
 165     bundle version \
 166         || fatal "No bundler. Try: gem install bundler"
 167     echo -n 'go: '
 168     go version \
 169         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 170     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 7 ]] \
 171         || fatal "Go >= 1.7 required. See http://golang.org/doc/install"
 172     echo -n 'gcc: '
 173     gcc --version | egrep ^gcc \
 174         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 175     echo -n 'fuse.h: '
 176     find /usr/include -wholename '*fuse/fuse.h' \
 177         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 178     echo -n 'pyconfig.h: '
 179     find /usr/include -name pyconfig.h | egrep --max-count=1 . \
 180         || fatal "No pyconfig.h. Try: apt-get install python-dev"
 181     echo -n 'nginx: '
 182     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 183         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 184     echo -n 'perl: '
 185     perl -v | grep version \
 186         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 187     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 188         echo -n "perl $mod: "
 189         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 190             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 191     done
 192     echo -n 'gitolite: '
 193     which gitolite \
 194         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 195 }
 196
 197 rotate_logfile() {
 198   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 199   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 200   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 201     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 202     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 203     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 204   fi
 205 }
 206
 207 declare -a failures
 208 declare -A skip
 209 declare -A testargs
 210 skip[apps/workbench_profile]=1
 211
 212 while [[ -n "$1" ]]
 213 do
 214     arg="$1"; shift
 215     case "$arg" in
 216         --help)
 217             echo >&2 "$helpmessage"
 218             echo >&2
 219             exit 1
 220             ;;
 221         --skip)
 222             skipwhat="$1"; shift
 223             if [[ "$skipwhat" == "apps/workbench" ]]; then
 224               skip["apps/workbench_units"]=1
 225               skip["apps/workbench_functionals"]=1
 226               skip["apps/workbench_integration"]=1
 227             else
 228               skip[$skipwhat]=1
 229             fi
 230             ;;
 231         --only)
 232             only="$1"; skip[$1]=""; shift
 233             ;;
 234         --short)
 235             short=1
 236             ;;
 237         --skip-install)
 238             skip_install=1
 239             ;;
 240         --only-install)
 241             skip_install=1
 242             only_install="$1"; shift
 243             ;;
 244         --temp)
 245             temp="$1"; shift
 246             temp_preserve=1
 247             ;;
 248         --leave-temp)
 249             temp_preserve=1
 250             ;;
 251         --retry)
 252             retry=1
 253             ;;
 254         *_test=*)
 255             suite="${arg%%_test=*}"
 256             args="${arg#*=}"
 257             testargs["$suite"]="$args"
 258             ;;
 259         *=*)
 260             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 261             ;;
 262         *)
 263             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 264             exit 1
 265             ;;
 266     esac
 267 done
 268
 269 start_api() {
 270     echo 'Starting API server...'
 271     cd "$WORKSPACE" \
 272         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 273         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 274         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 275         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 276         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 277         && (env | egrep ^ARVADOS)
 278 }
 279
 280 start_nginx_proxy_services() {
 281     echo 'Starting keepproxy, keep-web, ws, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
 282     cd "$WORKSPACE" \
 283         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 284         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 285         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 286         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 287         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 288         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1
 289 }
 290
 291 stop_services() {
 292     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES" ]]; then
 293         unset ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 294         cd "$WORKSPACE" \
 295             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 296             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 297             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 298             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 299             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy
 300     fi
 301     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 302         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 303         cd "$WORKSPACE" \
 304             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 305             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 306             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
 307     fi
 308 }
 309
 310 interrupt() {
 311     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 312     exit_cleanly
 313 }
 314 trap interrupt INT
 315
 316 sanity_checks
 317
 318 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 319
 320 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 321     # Jenkins expects us to use this by default.
 322     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 323 fi
 324
 325 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 326 cd "$WORKSPACE"
 327 find -name '*.pyc' -delete
 328
 329 if [[ -z "$temp" ]]; then
 330     temp="$(mktemp -d)"
 331 fi
 332
 333 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 334 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
 335 do
 336     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 337         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 338     fi
 339     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 340         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 341     fi
 342 done
 343
 344 setup_ruby_environment() {
 345     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 346       source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 347       using_rvm=true
 348     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 349       source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 350       using_rvm=true
 351     else
 352       using_rvm=false
 353     fi
 354
 355     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 356         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 357         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 358         # the environment to the "current gemset", which would lose
 359         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 360         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 361         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 362         # rvm gemset and use it for everything.
 363
 364         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 365             || fatal 'rvm check'
 366
 367         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 368         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 369         # complaint about not being in first place already.
 370         rvm use @default 2>/dev/null
 371
 372         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 373         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 374         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 375         # ruby to the caller.
 376         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 377         rvm use "@${gemset}" --create \
 378             || fatal 'rvm gemset setup'
 379
 380         rvm env
 381     else
 382         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 383         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 384         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 385         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 386         # should be installed, and we should leave it alone.)
 387
 388         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 389             user_gempath="$(gem env gempath)"
 390             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 391         fi
 392         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 393
 394         # When we build and install our own gems, we install them in our
 395         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 396         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 397         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 398
 399         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 400         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 401         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home:$(gem env gempath)"
 402
 403         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 404         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 405         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 406     fi
 407 }
 408
 409 with_test_gemset() {
 410     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 411         "$@"
 412     else
 413         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 414     fi
 415 }
 416
 417 gem_uninstall_if_exists() {
 418     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 419         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 420     fi
 421 }
 422
 423 setup_virtualenv() {
 424     local venvdest="$1"; shift
 425     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 426         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 427     fi
 428     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 429         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 430         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 431     else
 432         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 433     fi
 434     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 435     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 436 }
 437
 438 export PERLINSTALLBASE
 439 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
 440
 441 export GOPATH
 442 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 443 ln -sfn "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
 444     || fatal "symlink failed"
 445
 446 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 447 . "$VENVDIR/bin/activate"
 448
 449 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 450 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
 451     || pip install PyYAML >/dev/null \
 452     || fatal "pip install PyYAML failed"
 453
 454 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
 455 # won't pick it up by default.
 456 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 457     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
 458     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 459
 460 # This will help people who reuse --temp dirs when we upgrade to llfuse 0.42
 461 if egrep -q 'llfuse.*>= *0\.42' "$WORKSPACE/services/fuse/setup.py"; then
 462     # Uninstall old llfuse, because services/fuse "pip install" won't
 463     # upgrade it by default.
 464     if pip freeze | egrep '^llfuse==0\.41\.'; then
 465         yes | pip uninstall 'llfuse<0.42'
 466     fi
 467 fi
 468
 469 # Deactivate Python 2 virtualenv
 470 deactivate
 471
 472 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 473 # Otherwise, skip dependent tests.
 474 PYTHON3=$(which python3)
 475 if [ "0" = "$?" ]; then
 476     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 477 else
 478     PYTHON3=
 479     skip[services/dockercleaner]=1
 480     cat >&2 <<EOF
 481
 482 Warning: python3 could not be found
 483 services/dockercleaner install and tests will be skipped
 484
 485 EOF
 486 fi
 487
 488 # Reactivate Python 2 virtualenv
 489 . "$VENVDIR/bin/activate"
 490
 491 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 492 # whine a lot.
 493 setup_ruby_environment
 494
 495 echo "PATH is $PATH"
 496
 497 if ! which bundler >/dev/null
 498 then
 499     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 500 fi
 501
 502 retry() {
 503     while ! ${@} && [[ "$retry" == 1 ]]
 504     do
 505         read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 506         if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 507         then
 508             break
 509         fi
 510     done
 511 }
 512
 513 do_test() {
 514     retry do_test_once ${@}
 515 }
 516
 517 do_test_once() {
 518     unset result
 519     to_test=$1
 520     if (( [[ "$only" == "apps/workbench" ]] ) &&
 521        ( [[ "$to_test" == "apps/workbench_units" ]] || [[ "$to_test" == "apps/workbench_functionals" ]] ||
 522          [[ "$to_test" == "apps/workbench_integration" ]])); then
 523       to_test="apps/workbench"
 524     fi
 525     if [[ -z "${skip[$1]}" ]] && ( [[ -z "$only" ]] || [[ "$only" == "$to_test" ]] )
 526     then
 527         title "Running $1 tests"
 528         timer_reset
 529         if [[ "$2" == "go" ]]
 530         then
 531             covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 532             coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 533             # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 534             # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 535             # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 536             # compilation errors.
 537             go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" || return 1
 538             cd "$WORKSPACE/$1" || return 1
 539             gofmt -e -d . | egrep . && result=1
 540             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 541             then
 542                 # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 543                 # does:
 544                 cd "$WORKSPACE/$1" && go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 545             else
 546                 # The above form gets verbose even when testargs is
 547                 # empty, so use this form in such cases:
 548                 go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 549             fi
 550             result=${result:-$?}
 551             if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 552             then
 553                 go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 554                 rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 555             fi
 556         elif [[ "$2" == "pip" ]]
 557         then
 558             tries=0
 559             cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 560             do
 561                 tries=$((${tries}+1))
 562                 # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 563                 # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 564                 "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 565                 result=$?
 566                 if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 567                 then
 568                     printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 569                     continue
 570                 else
 571                     break
 572                 fi
 573             done
 574         elif [[ "$2" != "" ]]
 575         then
 576             "test_$2"
 577         else
 578             "test_$1"
 579         fi
 580         result=${result:-$?}
 581         checkexit $result "$1 tests"
 582         title "End of $1 tests (`timer`)"
 583         return $result
 584     else
 585         title "Skipping $1 tests"
 586     fi
 587 }
 588
 589 do_install() {
 590     retry do_install_once ${@}
 591 }
 592
 593 do_install_once() {
 594     if [[ -z "$skip_install" || (-n "$only_install" && "$only_install" == "$1") ]]
 595     then
 596         title "Running $1 install"
 597         timer_reset
 598         if [[ "$2" == "go" ]]
 599         then
 600             go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 601         elif [[ "$2" == "pip" ]]
 602         then
 603             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 604             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 605
 606             # Need to change to a different directory after creating
 607             # the source dist package to avoid a pip bug.
 608             # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 609
 610             # Also need to install twice, because if it believes the package is
 611             # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 612             # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 613             # install" ensures that we've actually installed the local package
 614             # we just built.
 615             cd "$WORKSPACE/$1" \
 616                 && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 617                 && cd "$WORKSPACE" \
 618                 && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 619                 && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 620         elif [[ "$2" != "" ]]
 621         then
 622             "install_$2"
 623         else
 624             "install_$1"
 625         fi
 626         result=$?
 627         checkexit $result "$1 install"
 628         title "End of $1 install (`timer`)"
 629         return $result
 630     else
 631         title "Skipping $1 install"
 632     fi
 633 }
 634
 635 bundle_install_trylocal() {
 636     (
 637         set -e
 638         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 639         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 640             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 641             bundle install --no-deployment
 642         fi
 643         bundle package --all
 644     )
 645 }
 646
 647 install_doc() {
 648     cd "$WORKSPACE/doc" \
 649         && bundle_install_trylocal \
 650         && rm -rf .site
 651 }
 652 do_install doc
 653
 654 install_gem() {
 655     gemname=$1
 656     srcpath=$2
 657     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 658         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 659         && bundle_install_trylocal \
 660         && gem build "$gemname.gemspec" \
 661         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 662 }
 663
 664 install_ruby_sdk() {
 665     install_gem arvados sdk/ruby
 666 }
 667 do_install sdk/ruby ruby_sdk
 668
 669 install_perl_sdk() {
 670     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 671         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 672         && make install INSTALLDIRS=perl
 673 }
 674 do_install sdk/perl perl_sdk
 675
 676 install_cli() {
 677     install_gem arvados-cli sdk/cli
 678 }
 679 do_install sdk/cli cli
 680
 681 install_login-sync() {
 682     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 683 }
 684 do_install services/login-sync login-sync
 685
 686 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
 687 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
 688 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
 689 # its own test suite brings up some of those other programs (like
 690 # keepproxy).
 691 declare -a pythonstuff
 692 pythonstuff=(
 693     sdk/pam
 694     sdk/python
 695     sdk/cwl
 696     services/fuse
 697     services/nodemanager
 698     tools/crunchstat-summary
 699     )
 700 for p in "${pythonstuff[@]}"
 701 do
 702     do_install "$p" pip
 703 done
 704 if [ -n "$PYTHON3" ]; then
 705     do_install services/dockercleaner pip "$VENV3DIR/bin/"
 706 fi
 707
 708 install_apiserver() {
 709     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 710         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 711
 712     rm -f config/environments/test.rb
 713     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 714
 715     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 716     then
 717         for f in database.yml application.yml
 718         do
 719             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 720         done
 721     fi
 722
 723     # Fill in a random secret_token and blob_signing_key for testing
 724     SECRET_TOKEN=`echo 'puts rand(2**512).to_s(36)' |ruby`
 725     BLOB_SIGNING_KEY=`echo 'puts rand(2**512).to_s(36)' |ruby`
 726
 727     sed -i'' -e "s:SECRET_TOKEN:$SECRET_TOKEN:" config/application.yml
 728     sed -i'' -e "s:BLOB_SIGNING_KEY:$BLOB_SIGNING_KEY:" config/application.yml
 729
 730     # Set up empty git repo (for git tests)
 731     GITDIR=$(mktemp -d)
 732     sed -i'' -e "s:/var/cache/git:$GITDIR:" config/application.default.yml
 733
 734     rm -rf $GITDIR
 735     mkdir -p $GITDIR/test
 736     cd $GITDIR/test \
 737         && git init \
 738         && git config user.email "jenkins@ci.curoverse.com" \
 739         && git config user.name "Jenkins, CI" \
 740         && touch tmp \
 741         && git add tmp \
 742         && git commit -m 'initial commit'
 743
 744     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 745     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 746     # is a postgresql superuser.
 747     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 748         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 749         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 750
 751     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 752         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 753         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 754         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 755 }
 756 do_install services/api apiserver
 757
 758 declare -a gostuff
 759 gostuff=(
 760     sdk/go/arvados
 761     sdk/go/arvadosclient
 762     sdk/go/blockdigest
 763     sdk/go/httpserver
 764     sdk/go/manifest
 765     sdk/go/streamer
 766     sdk/go/crunchrunner
 767     sdk/go/stats
 768     lib/crunchstat
 769     services/arv-git-httpd
 770     services/crunchstat
 771     services/keep-web
 772     services/keepstore
 773     sdk/go/keepclient
 774     services/keep-balance
 775     services/keepproxy
 776     services/crunch-dispatch-local
 777     services/crunch-dispatch-slurm
 778     services/crunch-run
 779     services/ws
 780     tools/keep-block-check
 781     tools/keep-exercise
 782     tools/keep-rsync
 783     )
 784 for g in "${gostuff[@]}"
 785 do
 786     do_install "$g" go
 787 done
 788
 789 install_workbench() {
 790     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 791         && mkdir -p tmp/cache \
 792         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 793 }
 794 do_install apps/workbench workbench
 795
 796 test_doclinkchecker() {
 797     (
 798         set -e
 799         cd "$WORKSPACE/doc"
 800         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
 801         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
 802         # do much good!
 803         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
 804     )
 805 }
 806 do_test doc doclinkchecker
 807
 808 stop_services
 809
 810 test_apiserver() {
 811     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
 812     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 813         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
 814 }
 815 do_test services/api apiserver
 816
 817 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
 818 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
 819 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
 820   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 821   exit_cleanly
 822 fi
 823
 824 start_api
 825
 826 test_ruby_sdk() {
 827     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
 828         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
 829 }
 830 do_test sdk/ruby ruby_sdk
 831
 832 test_cli() {
 833     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
 834         && mkdir -p /tmp/keep \
 835         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
 836 }
 837 do_test sdk/cli cli
 838
 839 test_login-sync() {
 840     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
 841         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
 842 }
 843 do_test services/login-sync login-sync
 844
 845 for p in "${pythonstuff[@]}"
 846 do
 847     do_test "$p" pip
 848 done
 849 do_test services/dockercleaner pip "$VENV3DIR/bin/"
 850
 851 for g in "${gostuff[@]}"
 852 do
 853     do_test "$g" go
 854 done
 855
 856 test_workbench_units() {
 857     start_nginx_proxy_services \
 858         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 859         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 860 }
 861 do_test apps/workbench_units workbench_units
 862
 863 test_workbench_functionals() {
 864     start_nginx_proxy_services \
 865         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 866         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 867 }
 868 do_test apps/workbench_functionals workbench_functionals
 869
 870 test_workbench_integration() {
 871     start_nginx_proxy_services \
 872         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 873         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 874 }
 875 do_test apps/workbench_integration workbench_integration
 876
 877
 878 test_workbench_benchmark() {
 879     start_nginx_proxy_services \
 880         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 881         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
 882 }
 883 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
 884
 885 test_workbench_profile() {
 886     start_nginx_proxy_services \
 887         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 888         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
 889 }
 890 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
 891
 892 exit_cleanly