build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
   5
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin.sh
   7
   8 COLUMNS=80
   9 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
  10
  11 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
  12 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  13
  14 Exit non-zero if any tests fail.
  15
  16 Syntax:
  17         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  18
  19 Options:
  20
  21 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  22 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  23 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  24                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  25 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  26                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  27                subsequent invocations.
  28 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  29 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  30 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
  31                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  32                from a previous invocation if you use this option.
  33 --only-install Run specific install step
  34 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  35 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  36 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  37                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  38 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  39                Restrict apiserver tests to the given file
  40 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
  41                Restrict Python SDK tests to the given class
  42 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  43                Restrict Workbench tests to the given file
  44 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  45                Show all log messages, even when tests pass (also works
  46                with services/keepstore_test etc.)
  47 ARVADOS_DEBUG=1
  48                Print more debug messages
  49 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  50                *_test, and other examples shown above.
  51
  52 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
  53 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  54 test suites depend on other components being installed, and installing
  55 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  56
  57 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  58 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  59
  60 More information and background:
  61
  62 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  63
  64 Available tests:
  65
  66 apps/workbench (*)
  67 apps/workbench_units (*)
  68 apps/workbench_functionals (*)
  69 apps/workbench_integration (*)
  70 apps/workbench_benchmark
  71 apps/workbench_profile
  72 doc
  73 services/api
  74 services/arv-git-httpd
  75 services/crunchstat
  76 services/dockercleaner
  77 services/fuse
  78 services/health
  79 services/keep-web
  80 services/keepproxy
  81 services/keepstore
  82 services/keep-balance
  83 services/login-sync
  84 services/nodemanager
  85 services/nodemanager_integration
  86 services/crunch-run
  87 services/crunch-dispatch-local
  88 services/crunch-dispatch-slurm
  89 services/ws
  90 sdk/cli
  91 sdk/pam
  92 sdk/python
  93 sdk/python:py3
  94 sdk/ruby
  95 sdk/go/arvados
  96 sdk/go/arvadosclient
  97 sdk/go/dispatch
  98 sdk/go/keepclient
  99 sdk/go/health
 100 sdk/go/httpserver
 101 sdk/go/manifest
 102 sdk/go/blockdigest
 103 sdk/go/streamer
 104 sdk/go/stats
 105 sdk/go/crunchrunner
 106 sdk/cwl
 107 tools/crunchstat-summary
 108 tools/keep-exercise
 109 tools/keep-rsync
 110 tools/keep-block-check
 111
 112 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 113     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 114
 115 EOF
 116
 117 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 118 # environment that could interfere with the tests.
 119 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 120
 121 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 122 # accident.
 123 GITDIR=
 124 GOPATH=
 125 VENVDIR=
 126 VENV3DIR=
 127 PYTHONPATH=
 128 GEMHOME=
 129 PERLINSTALLBASE=
 130
 131 short=
 132 only_install=
 133 temp=
 134 temp_preserve=
 135
 136 clear_temp() {
 137     if [[ -z "$temp" ]]; then
 138         # we didn't even get as far as making a temp dir
 139         :
 140     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 141         rm -rf "$temp"
 142     else
 143         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 144     fi
 145 }
 146
 147 fatal() {
 148     clear_temp
 149     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 150     exit 1
 151 }
 152
 153 exit_cleanly() {
 154     trap - INT
 155     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 156     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 157     stop_services
 158     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 159     report_outcomes
 160     clear_temp
 161     exit ${#failures}
 162 }
 163
 164 sanity_checks() {
 165     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 166         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 167     echo Checking dependencies:
 168     echo -n 'virtualenv: '
 169     virtualenv --version \
 170         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 171     echo -n 'ruby: '
 172     ruby -v \
 173         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 174     echo -n 'go: '
 175     go version \
 176         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 177     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 8 ]] \
 178         || fatal "Go >= 1.8 required. See http://golang.org/doc/install"
 179     echo -n 'gcc: '
 180     gcc --version | egrep ^gcc \
 181         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 182     echo -n 'fuse.h: '
 183     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 184         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 185     echo -n 'gnutls.h: '
 186     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 187         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 188     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
 189     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 190         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
 191     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 192     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 193         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 194     echo -n 'nginx: '
 195     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 196         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 197     echo -n 'perl: '
 198     perl -v | grep version \
 199         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 200     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 201         echo -n "perl $mod: "
 202         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 203             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 204     done
 205     echo -n 'gitolite: '
 206     which gitolite \
 207         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 208     echo -n 'npm: '
 209     npm --version \
 210         || fatal "No npm. Try: wget -O- https://nodejs.org/dist/v6.11.2/node-v6.11.2-linux-x64.tar.xz | sudo tar -C /usr/local -xJf - && sudo ln -s ../node-v6.11.2-linux-x64/bin/{node,npm} /usr/local/bin/"
 211     echo -n 'cadaver: '
 212     cadaver --version | grep -w cadaver \
 213           || fatal "No cadaver. Try: apt-get install cadaver"
 214 }
 215
 216 rotate_logfile() {
 217   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 218   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 219   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 220     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 221     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 222     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 223   fi
 224 }
 225
 226 declare -a failures
 227 declare -A skip
 228 declare -A testargs
 229 skip[apps/workbench_profile]=1
 230
 231 while [[ -n "$1" ]]
 232 do
 233     arg="$1"; shift
 234     case "$arg" in
 235         --help)
 236             echo >&2 "$helpmessage"
 237             echo >&2
 238             exit 1
 239             ;;
 240         --skip)
 241             skip[$1]=1; shift
 242             ;;
 243         --only)
 244             only="$1"; skip[$1]=""; shift
 245             ;;
 246         --short)
 247             short=1
 248             ;;
 249         --skip-install)
 250             only_install=nothing
 251             ;;
 252         --only-install)
 253             only_install="$1"; shift
 254             ;;
 255         --temp)
 256             temp="$1"; shift
 257             temp_preserve=1
 258             ;;
 259         --leave-temp)
 260             temp_preserve=1
 261             ;;
 262         --repeat)
 263             repeat=$((${1}+0)); shift
 264             ;;
 265         --retry)
 266             retry=1
 267             ;;
 268         *_test=*)
 269             suite="${arg%%_test=*}"
 270             args="${arg#*=}"
 271             testargs["$suite"]="$args"
 272             ;;
 273         *=*)
 274             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 275             ;;
 276         *)
 277             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 278             exit 1
 279             ;;
 280     esac
 281 done
 282
 283 start_api() {
 284     echo 'Starting API server...'
 285     cd "$WORKSPACE" \
 286         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 287         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 288         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 289         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 290         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 291         && (env | egrep ^ARVADOS)
 292 }
 293
 294 start_nginx_proxy_services() {
 295     echo 'Starting keepproxy, keep-web, ws, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
 296     cd "$WORKSPACE" \
 297         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 298         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 299         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 300         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 301         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 302         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1
 303 }
 304
 305 stop_services() {
 306     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES" ]]; then
 307         unset ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 308         cd "$WORKSPACE" \
 309             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 310             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 311             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 312             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 313             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy
 314     fi
 315     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 316         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 317         cd "$WORKSPACE" \
 318             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 319             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 320             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
 321     fi
 322 }
 323
 324 interrupt() {
 325     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 326     exit_cleanly
 327 }
 328 trap interrupt INT
 329
 330 sanity_checks
 331
 332 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 333
 334 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 335     # Jenkins expects us to use this by default.
 336     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 337 fi
 338
 339 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 340 cd "$WORKSPACE"
 341 find -name '*.pyc' -delete
 342
 343 if [[ -z "$temp" ]]; then
 344     temp="$(mktemp -d)"
 345 fi
 346
 347 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 348 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
 349 do
 350     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 351         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 352     fi
 353     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 354         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 355     fi
 356 done
 357
 358 setup_ruby_environment() {
 359     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 360         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 361         using_rvm=true
 362     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 363         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 364         using_rvm=true
 365     else
 366         using_rvm=false
 367     fi
 368
 369     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 370         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 371         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 372         # the environment to the "current gemset", which would lose
 373         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 374         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 375         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 376         # rvm gemset and use it for everything.
 377
 378         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 379             || fatal 'rvm check'
 380
 381         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 382         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 383         # complaint about not being in first place already.
 384         rvm use @default 2>/dev/null
 385
 386         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 387         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 388         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 389         # ruby to the caller.
 390         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 391         rvm use "@${gemset}" --create \
 392             || fatal 'rvm gemset setup'
 393
 394         rvm env
 395     else
 396         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 397         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 398         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 399         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 400         # should be installed, and we should leave it alone.)
 401
 402         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 403             user_gempath="$(gem env gempath)"
 404             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 405         fi
 406         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 407
 408         # When we build and install our own gems, we install them in our
 409         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 410         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 411         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 412
 413         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 414         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 415         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
 416
 417         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 418         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 419         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 420     fi
 421     bundle config || gem install bundler \
 422         || fatal 'install bundler'
 423 }
 424
 425 with_test_gemset() {
 426     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 427         "$@"
 428     else
 429         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 430     fi
 431 }
 432
 433 gem_uninstall_if_exists() {
 434     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 435         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 436     fi
 437 }
 438
 439 setup_virtualenv() {
 440     local venvdest="$1"; shift
 441     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 442         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 443     fi
 444     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 445         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 446         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 447     else
 448         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 449     fi
 450     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 451     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 452 }
 453
 454 export PERLINSTALLBASE
 455 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
 456
 457 export GOPATH
 458 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 459 ln -sfT "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
 460     || fatal "symlink failed"
 461 go get -v github.com/kardianos/govendor \
 462     || fatal "govendor install failed"
 463
 464 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 465 . "$VENVDIR/bin/activate"
 466
 467 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 468 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
 469     || pip install PyYAML >/dev/null \
 470     || fatal "pip install PyYAML failed"
 471
 472 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
 473 # won't pick it up by default.
 474 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 475     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
 476     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 477
 478 # We need an unreleased (as of 2017-08-17) llfuse bugfix, otherwise our fuse test suite deadlocks.
 479 pip freeze | grep -x llfuse==1.2.0 || (
 480     set -e
 481     yes | pip uninstall llfuse || true
 482     cython --version || fatal "no cython; try sudo apt-get install cython"
 483     cd "$temp"
 484     (cd python-llfuse 2>/dev/null || git clone https://github.com/curoverse/python-llfuse)
 485     cd python-llfuse
 486     git checkout 620722fd990ea642ddb8e7412676af482c090c0c
 487     git checkout setup.py
 488     sed -i -e "s:'1\\.2':'1.2.0':" setup.py
 489     python setup.py build_cython
 490     python setup.py install --force
 491 ) || fatal "llfuse fork failed"
 492 pip freeze | grep -x llfuse==1.2.0 || fatal "error: installed llfuse 1.2.0 but '$(pip freeze | grep llfuse)' ???"
 493
 494 # Deactivate Python 2 virtualenv
 495 deactivate
 496
 497 declare -a pythonstuff
 498 pythonstuff=(
 499     sdk/pam
 500     sdk/python
 501     sdk/python:py3
 502     sdk/cwl
 503     services/dockercleaner:py3
 504     services/fuse
 505     services/nodemanager
 506     tools/crunchstat-summary
 507     )
 508
 509 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 510 # Otherwise, skip dependent tests.
 511 PYTHON3=$(which python3)
 512 if [[ ${?} = 0 ]]; then
 513     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 514 else
 515     PYTHON3=
 516     cat >&2 <<EOF
 517
 518 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
 519
 520 EOF
 521 fi
 522
 523 # Reactivate Python 2 virtualenv
 524 . "$VENVDIR/bin/activate"
 525
 526 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 527 # whine a lot.
 528 setup_ruby_environment
 529
 530 echo "PATH is $PATH"
 531
 532 if ! which bundler >/dev/null
 533 then
 534     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 535 fi
 536
 537 retry() {
 538     remain="${repeat}"
 539     while :
 540     do
 541         if ${@}; then
 542             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 543                 remain=$((${remain}-1))
 544                 title "Repeating ${remain} more times"
 545             else
 546                 break
 547             fi
 548         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 549             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 550             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 551             then
 552                 break
 553             fi
 554         else
 555             break
 556         fi
 557     done
 558 }
 559
 560 do_test() {
 561     case "${1}" in
 562         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 563             suite=apps/workbench
 564             ;;
 565         services/nodemanager | services/nodemanager_integration)
 566             suite=services/nodemanager_suite
 567             ;;
 568         *)
 569             suite="${1}"
 570             ;;
 571     esac
 572     if [[ -z "${skip[$suite]}" && -z "${skip[$1]}" && \
 573                 (-z "${only}" || "${only}" == "${suite}" || \
 574                  "${only}" == "${1}") ]]; then
 575         retry do_test_once ${@}
 576     else
 577         title "Skipping ${1} tests"
 578     fi
 579 }
 580
 581 do_test_once() {
 582     unset result
 583
 584     title "Running $1 tests"
 585     timer_reset
 586     if [[ "$2" == "go" ]]
 587     then
 588         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 589         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 590         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 591         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 592         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 593         # compilation errors.
 594         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 595             cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 596             [[ -z "$(gofmt -e -d . | tee /dev/stderr)" ]] && \
 597             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 598         then
 599             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 600             # does:
 601             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 602         else
 603             # The above form gets verbose even when testargs is
 604             # empty, so use this form in such cases:
 605             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 606         fi
 607         result=${result:-$?}
 608         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 609         then
 610             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 611             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 612         fi
 613     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 614     then
 615         tries=0
 616         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 617         do
 618             tries=$((${tries}+1))
 619             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 620             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 621             "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 622             result=$?
 623             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 624             then
 625                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 626                 continue
 627             else
 628                 break
 629             fi
 630         done
 631     elif [[ "$2" != "" ]]
 632     then
 633         "test_$2"
 634     else
 635         "test_$1"
 636     fi
 637     result=${result:-$?}
 638     checkexit $result "$1 tests"
 639     title "End of $1 tests (`timer`)"
 640     return $result
 641 }
 642
 643 do_install() {
 644     if [[ -z "${only_install}" || "${only_install}" == "${1}" ]]; then
 645         retry do_install_once ${@}
 646     else
 647         title "Skipping $1 install"
 648     fi
 649 }
 650
 651 do_install_once() {
 652     title "Running $1 install"
 653     timer_reset
 654     if [[ "$2" == "go" ]]
 655     then
 656         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 657     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 658     then
 659         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 660         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 661
 662         # Need to change to a different directory after creating
 663         # the source dist package to avoid a pip bug.
 664         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 665
 666         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 667         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 668         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 669         # install" ensures that we've actually installed the local package
 670         # we just built.
 671         cd "$WORKSPACE/$1" \
 672             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 673             && cd "$WORKSPACE" \
 674             && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 675             && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 676     elif [[ "$2" != "" ]]
 677     then
 678         "install_$2"
 679     else
 680         "install_$1"
 681     fi
 682     result=$?
 683     checkexit $result "$1 install"
 684     title "End of $1 install (`timer`)"
 685     return $result
 686 }
 687
 688 bundle_install_trylocal() {
 689     (
 690         set -e
 691         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 692         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 693             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 694             bundle install --no-deployment
 695         fi
 696         bundle package --all
 697     )
 698 }
 699
 700 install_doc() {
 701     cd "$WORKSPACE/doc" \
 702         && bundle_install_trylocal \
 703         && rm -rf .site
 704 }
 705 do_install doc
 706
 707 install_gem() {
 708     gemname=$1
 709     srcpath=$2
 710     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 711         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 712         && bundle_install_trylocal \
 713         && gem build "$gemname.gemspec" \
 714         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 715 }
 716
 717 install_ruby_sdk() {
 718     install_gem arvados sdk/ruby
 719 }
 720 do_install sdk/ruby ruby_sdk
 721
 722 install_perl_sdk() {
 723     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 724         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 725         && make install INSTALLDIRS=perl
 726 }
 727 do_install sdk/perl perl_sdk
 728
 729 install_cli() {
 730     install_gem arvados-cli sdk/cli
 731 }
 732 do_install sdk/cli cli
 733
 734 install_login-sync() {
 735     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 736 }
 737 do_install services/login-sync login-sync
 738
 739 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
 740 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
 741 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
 742 # its own test suite brings up some of those other programs (like
 743 # keepproxy).
 744 for p in "${pythonstuff[@]}"
 745 do
 746     dir=${p%:py3}
 747     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
 748         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
 749             do_install ${dir} pip
 750         fi
 751     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
 752         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
 753             do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
 754         fi
 755     fi
 756 done
 757
 758 install_apiserver() {
 759     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 760         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 761
 762     rm -f config/environments/test.rb
 763     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 764
 765     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 766     then
 767         for f in database.yml
 768         do
 769             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 770         done
 771     fi
 772
 773     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 774     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 775     # is a postgresql superuser.
 776     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 777         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 778         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 779
 780     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 781
 782     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 783         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 784         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 785         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 786 }
 787 do_install services/api apiserver
 788
 789 cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" && \
 790     "$GOPATH/bin/govendor" sync -v || \
 791         fatal "govendor sync failed"
 792 declare -a gostuff
 793 gostuff=(
 794     sdk/go/arvados
 795     sdk/go/arvadosclient
 796     sdk/go/blockdigest
 797     sdk/go/dispatch
 798     sdk/go/health
 799     sdk/go/httpserver
 800     sdk/go/manifest
 801     sdk/go/streamer
 802     sdk/go/crunchrunner
 803     sdk/go/stats
 804     lib/crunchstat
 805     services/arv-git-httpd
 806     services/crunchstat
 807     services/health
 808     services/keep-web
 809     services/keepstore
 810     sdk/go/keepclient
 811     services/keep-balance
 812     services/keepproxy
 813     services/crunch-dispatch-local
 814     services/crunch-dispatch-slurm
 815     services/crunch-run
 816     services/ws
 817     tools/keep-block-check
 818     tools/keep-exercise
 819     tools/keep-rsync
 820 )
 821 for g in "${gostuff[@]}"
 822 do
 823     do_install "$g" go
 824 done
 825
 826 install_workbench() {
 827     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 828         && mkdir -p tmp/cache \
 829         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
 830         && RAILS_ENV=test RAILS_GROUPS=assets bundle exec rake npm:install
 831 }
 832 do_install apps/workbench workbench
 833
 834 unset http_proxy https_proxy no_proxy
 835
 836 test_doclinkchecker() {
 837     (
 838         set -e
 839         cd "$WORKSPACE/doc"
 840         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
 841         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
 842         # do much good!
 843         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
 844     )
 845 }
 846 do_test doc doclinkchecker
 847
 848 stop_services
 849
 850 test_apiserver() {
 851     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
 852     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 853         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
 854 }
 855 do_test services/api apiserver
 856
 857 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
 858 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
 859 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
 860   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 861   exit_cleanly
 862 fi
 863
 864 start_api || { stop_services; fatal "start_api"; }
 865
 866 test_ruby_sdk() {
 867     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
 868         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
 869 }
 870 do_test sdk/ruby ruby_sdk
 871
 872 test_cli() {
 873     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
 874         && mkdir -p /tmp/keep \
 875         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
 876 }
 877 do_test sdk/cli cli
 878
 879 test_login-sync() {
 880     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
 881         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
 882 }
 883 do_test services/login-sync login-sync
 884
 885 test_nodemanager_integration() {
 886     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
 887         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager_integration]}
 888 }
 889 do_test services/nodemanager_integration nodemanager_integration
 890
 891 for p in "${pythonstuff[@]}"
 892 do
 893     dir=${p%:py3}
 894     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
 895         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
 896             do_test ${dir} pip
 897         fi
 898     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
 899         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
 900             do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
 901         fi
 902     fi
 903 done
 904
 905 for g in "${gostuff[@]}"
 906 do
 907     do_test "$g" go
 908 done
 909
 910 test_workbench_units() {
 911     start_nginx_proxy_services \
 912         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 913         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 914 }
 915 do_test apps/workbench_units workbench_units
 916
 917 test_workbench_functionals() {
 918     start_nginx_proxy_services \
 919         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 920         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 921 }
 922 do_test apps/workbench_functionals workbench_functionals
 923
 924 test_workbench_integration() {
 925     start_nginx_proxy_services \
 926         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 927         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 928 }
 929 do_test apps/workbench_integration workbench_integration
 930
 931
 932 test_workbench_benchmark() {
 933     start_nginx_proxy_services \
 934         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 935         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
 936 }
 937 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
 938
 939 test_workbench_profile() {
 940     start_nginx_proxy_services \
 941         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 942         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
 943 }
 944 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
 945
 946 exit_cleanly