build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
   5
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin.sh
   7
   8 COLUMNS=80
   9 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
  10
  11 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
  12 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  13
  14 Exit non-zero if any tests fail.
  15
  16 Syntax:
  17         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  18
  19 Options:
  20
  21 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  22 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  23 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  24                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  25 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  26                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  27                subsequent invocations.
  28 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  29 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  30 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
  31                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  32                from a previous invocation if you use this option.
  33 --only-install Run specific install step
  34 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  35 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  36 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  37                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  38 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  39                Restrict apiserver tests to the given file
  40 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
  41                Restrict Python SDK tests to the given class
  42 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  43                Restrict Workbench tests to the given file
  44 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  45                Show all log messages, even when tests pass (also works
  46                with services/keepstore_test etc.)
  47 ARVADOS_DEBUG=1
  48                Print more debug messages
  49 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  50                *_test, and other examples shown above.
  51
  52 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
  53 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  54 test suites depend on other components being installed, and installing
  55 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  56
  57 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  58 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  59
  60 More information and background:
  61
  62 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  63
  64 Available tests:
  65
  66 apps/workbench (*)
  67 apps/workbench_units (*)
  68 apps/workbench_functionals (*)
  69 apps/workbench_integration (*)
  70 apps/workbench_benchmark
  71 apps/workbench_profile
  72 doc
  73 services/api
  74 services/arv-git-httpd
  75 services/crunchstat
  76 services/dockercleaner
  77 services/fuse
  78 services/health
  79 services/keep-web
  80 services/keepproxy
  81 services/keepstore
  82 services/keep-balance
  83 services/login-sync
  84 services/nodemanager
  85 services/nodemanager_integration
  86 services/crunch-run
  87 services/crunch-dispatch-local
  88 services/crunch-dispatch-slurm
  89 services/ws
  90 sdk/cli
  91 sdk/pam
  92 sdk/python
  93 sdk/python:py3
  94 sdk/ruby
  95 sdk/go/arvados
  96 sdk/go/arvadosclient
  97 sdk/go/dispatch
  98 sdk/go/keepclient
  99 sdk/go/health
 100 sdk/go/httpserver
 101 sdk/go/manifest
 102 sdk/go/blockdigest
 103 sdk/go/streamer
 104 sdk/go/stats
 105 sdk/go/crunchrunner
 106 sdk/cwl
 107 tools/crunchstat-summary
 108 tools/keep-exercise
 109 tools/keep-rsync
 110 tools/keep-block-check
 111
 112 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 113     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 114
 115 EOF
 116
 117 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 118 # environment that could interfere with the tests.
 119 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 120
 121 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 122 # accident.
 123 GITDIR=
 124 GOPATH=
 125 VENVDIR=
 126 VENV3DIR=
 127 PYTHONPATH=
 128 GEMHOME=
 129 PERLINSTALLBASE=
 130
 131 short=
 132 only_install=
 133 temp=
 134 temp_preserve=
 135
 136 clear_temp() {
 137     if [[ -z "$temp" ]]; then
 138         # we didn't even get as far as making a temp dir
 139         :
 140     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 141         rm -rf "$temp"
 142     else
 143         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 144     fi
 145 }
 146
 147 fatal() {
 148     clear_temp
 149     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 150     exit 1
 151 }
 152
 153 exit_cleanly() {
 154     trap - INT
 155     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 156     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 157     stop_services
 158     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 159     report_outcomes
 160     clear_temp
 161     exit ${#failures}
 162 }
 163
 164 sanity_checks() {
 165     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 166         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 167     echo Checking dependencies:
 168     echo -n 'virtualenv: '
 169     virtualenv --version \
 170         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 171     echo -n 'ruby: '
 172     ruby -v \
 173         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 174     echo -n 'go: '
 175     go version \
 176         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 177     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 8 ]] \
 178         || fatal "Go >= 1.8 required. See http://golang.org/doc/install"
 179     echo -n 'gcc: '
 180     gcc --version | egrep ^gcc \
 181         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 182     echo -n 'fuse.h: '
 183     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 184         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 185     echo -n 'gnutls.h: '
 186     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 187         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 188     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
 189     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 190         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
 191     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 192     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 193         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 194     echo -n 'nginx: '
 195     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 196         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 197     echo -n 'perl: '
 198     perl -v | grep version \
 199         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 200     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 201         echo -n "perl $mod: "
 202         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 203             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 204     done
 205     echo -n 'gitolite: '
 206     which gitolite \
 207         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 208     echo -n 'npm: '
 209     which npm \
 210           || fatal "No npm. Try: wget -O- https://nodejs.org/dist/v6.11.2/node-v6.11.2-linux-x64.tar.xz | sudo tar -C /usr/local -xJf - && sudo ln -s ../node-v6.11.2-linux-x64/bin/{node,npm} /usr/local/bin/"
 211 }
 212
 213 rotate_logfile() {
 214   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 215   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 216   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 217     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 218     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 219     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 220   fi
 221 }
 222
 223 declare -a failures
 224 declare -A skip
 225 declare -A testargs
 226 skip[apps/workbench_profile]=1
 227
 228 while [[ -n "$1" ]]
 229 do
 230     arg="$1"; shift
 231     case "$arg" in
 232         --help)
 233             echo >&2 "$helpmessage"
 234             echo >&2
 235             exit 1
 236             ;;
 237         --skip)
 238             skip[$1]=1; shift
 239             ;;
 240         --only)
 241             only="$1"; skip[$1]=""; shift
 242             ;;
 243         --short)
 244             short=1
 245             ;;
 246         --skip-install)
 247             only_install=nothing
 248             ;;
 249         --only-install)
 250             only_install="$1"; shift
 251             ;;
 252         --temp)
 253             temp="$1"; shift
 254             temp_preserve=1
 255             ;;
 256         --leave-temp)
 257             temp_preserve=1
 258             ;;
 259         --repeat)
 260             repeat=$((${1}+0)); shift
 261             ;;
 262         --retry)
 263             retry=1
 264             ;;
 265         *_test=*)
 266             suite="${arg%%_test=*}"
 267             args="${arg#*=}"
 268             testargs["$suite"]="$args"
 269             ;;
 270         *=*)
 271             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 272             ;;
 273         *)
 274             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 275             exit 1
 276             ;;
 277     esac
 278 done
 279
 280 start_api() {
 281     echo 'Starting API server...'
 282     cd "$WORKSPACE" \
 283         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 284         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 285         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 286         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 287         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 288         && (env | egrep ^ARVADOS)
 289 }
 290
 291 start_nginx_proxy_services() {
 292     echo 'Starting keepproxy, keep-web, ws, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
 293     cd "$WORKSPACE" \
 294         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 295         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 296         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 297         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 298         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 299         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1
 300 }
 301
 302 stop_services() {
 303     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES" ]]; then
 304         unset ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 305         cd "$WORKSPACE" \
 306             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 307             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 308             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 309             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 310             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy
 311     fi
 312     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 313         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 314         cd "$WORKSPACE" \
 315             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 316             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 317             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
 318     fi
 319 }
 320
 321 interrupt() {
 322     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 323     exit_cleanly
 324 }
 325 trap interrupt INT
 326
 327 sanity_checks
 328
 329 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 330
 331 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 332     # Jenkins expects us to use this by default.
 333     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 334 fi
 335
 336 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 337 cd "$WORKSPACE"
 338 find -name '*.pyc' -delete
 339
 340 if [[ -z "$temp" ]]; then
 341     temp="$(mktemp -d)"
 342 fi
 343
 344 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 345 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
 346 do
 347     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 348         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 349     fi
 350     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 351         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 352     fi
 353 done
 354
 355 setup_ruby_environment() {
 356     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 357         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 358         using_rvm=true
 359     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 360         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 361         using_rvm=true
 362     else
 363         using_rvm=false
 364     fi
 365
 366     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 367         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 368         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 369         # the environment to the "current gemset", which would lose
 370         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 371         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 372         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 373         # rvm gemset and use it for everything.
 374
 375         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 376             || fatal 'rvm check'
 377
 378         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 379         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 380         # complaint about not being in first place already.
 381         rvm use @default 2>/dev/null
 382
 383         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 384         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 385         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 386         # ruby to the caller.
 387         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 388         rvm use "@${gemset}" --create \
 389             || fatal 'rvm gemset setup'
 390
 391         rvm env
 392     else
 393         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 394         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 395         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 396         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 397         # should be installed, and we should leave it alone.)
 398
 399         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 400             user_gempath="$(gem env gempath)"
 401             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 402         fi
 403         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 404
 405         # When we build and install our own gems, we install them in our
 406         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 407         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 408         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 409
 410         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 411         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 412         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
 413
 414         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 415         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 416         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 417     fi
 418     bundle config || gem install bundler \
 419         || fatal 'install bundler'
 420 }
 421
 422 with_test_gemset() {
 423     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 424         "$@"
 425     else
 426         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 427     fi
 428 }
 429
 430 gem_uninstall_if_exists() {
 431     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 432         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 433     fi
 434 }
 435
 436 setup_virtualenv() {
 437     local venvdest="$1"; shift
 438     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 439         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 440     fi
 441     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 442         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 443         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 444     else
 445         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 446     fi
 447     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 448     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 449 }
 450
 451 export PERLINSTALLBASE
 452 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
 453
 454 export GOPATH
 455 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 456 ln -sfT "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
 457     || fatal "symlink failed"
 458 go get -v github.com/kardianos/govendor \
 459     || fatal "govendor install failed"
 460
 461 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 462 . "$VENVDIR/bin/activate"
 463
 464 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 465 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
 466     || pip install PyYAML >/dev/null \
 467     || fatal "pip install PyYAML failed"
 468
 469 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
 470 # won't pick it up by default.
 471 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 472     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
 473     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 474
 475 # We need an unreleased (as of 2017-08-17) llfuse bugfix, otherwise our fuse test suite deadlocks.
 476 pip freeze | grep -x llfuse==1.2.0 || (
 477     set -e
 478     yes | pip uninstall llfuse || true
 479     cython --version || fatal "no cython; try sudo apt-get install cython"
 480     cd "$temp"
 481     (cd python-llfuse 2>/dev/null || git clone https://github.com/curoverse/python-llfuse)
 482     cd python-llfuse
 483     git checkout 620722fd990ea642ddb8e7412676af482c090c0c
 484     git checkout setup.py
 485     sed -i -e "s:'1\\.2':'1.2.0':" setup.py
 486     python setup.py build_cython
 487     python setup.py install --force
 488 ) || fatal "llfuse fork failed"
 489 pip freeze | grep -x llfuse==1.2.0 || fatal "error: installed llfuse 1.2.0 but '$(pip freeze | grep llfuse)' ???"
 490
 491 # Deactivate Python 2 virtualenv
 492 deactivate
 493
 494 declare -a pythonstuff
 495 pythonstuff=(
 496     sdk/pam
 497     sdk/python
 498     sdk/python:py3
 499     sdk/cwl
 500     services/dockercleaner:py3
 501     services/fuse
 502     services/nodemanager
 503     tools/crunchstat-summary
 504     )
 505
 506 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 507 # Otherwise, skip dependent tests.
 508 PYTHON3=$(which python3)
 509 if [[ ${?} = 0 ]]; then
 510     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 511 else
 512     PYTHON3=
 513     cat >&2 <<EOF
 514
 515 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
 516
 517 EOF
 518 fi
 519
 520 # Reactivate Python 2 virtualenv
 521 . "$VENVDIR/bin/activate"
 522
 523 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 524 # whine a lot.
 525 setup_ruby_environment
 526
 527 echo "PATH is $PATH"
 528
 529 if ! which bundler >/dev/null
 530 then
 531     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 532 fi
 533
 534 retry() {
 535     remain="${repeat}"
 536     while :
 537     do
 538         if ${@}; then
 539             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 540                 remain=$((${remain}-1))
 541                 title "Repeating ${remain} more times"
 542             else
 543                 break
 544             fi
 545         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 546             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 547             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 548             then
 549                 break
 550             fi
 551         else
 552             break
 553         fi
 554     done
 555 }
 556
 557 do_test() {
 558     case "${1}" in
 559         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 560             suite=apps/workbench
 561             ;;
 562         services/nodemanager | services/nodemanager_integration)
 563             suite=services/nodemanager_suite
 564             ;;
 565         *)
 566             suite="${1}"
 567             ;;
 568     esac
 569     if [[ -z "${skip[$suite]}" && -z "${skip[$1]}" && \
 570                 (-z "${only}" || "${only}" == "${suite}" || \
 571                  "${only}" == "${1}") ]]; then
 572         retry do_test_once ${@}
 573     else
 574         title "Skipping ${1} tests"
 575     fi
 576 }
 577
 578 do_test_once() {
 579     unset result
 580
 581     title "Running $1 tests"
 582     timer_reset
 583     if [[ "$2" == "go" ]]
 584     then
 585         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 586         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 587         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 588         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 589         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 590         # compilation errors.
 591         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 592             cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 593             [[ -z "$(gofmt -e -d . | tee /dev/stderr)" ]] && \
 594             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 595         then
 596             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 597             # does:
 598             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 599         else
 600             # The above form gets verbose even when testargs is
 601             # empty, so use this form in such cases:
 602             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 603         fi
 604         result=${result:-$?}
 605         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 606         then
 607             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 608             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 609         fi
 610     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 611     then
 612         tries=0
 613         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 614         do
 615             tries=$((${tries}+1))
 616             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 617             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 618             "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 619             result=$?
 620             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 621             then
 622                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 623                 continue
 624             else
 625                 break
 626             fi
 627         done
 628     elif [[ "$2" != "" ]]
 629     then
 630         "test_$2"
 631     else
 632         "test_$1"
 633     fi
 634     result=${result:-$?}
 635     checkexit $result "$1 tests"
 636     title "End of $1 tests (`timer`)"
 637     return $result
 638 }
 639
 640 do_install() {
 641     if [[ -z "${only_install}" || "${only_install}" == "${1}" ]]; then
 642         retry do_install_once ${@}
 643     else
 644         title "Skipping $1 install"
 645     fi
 646 }
 647
 648 do_install_once() {
 649     title "Running $1 install"
 650     timer_reset
 651     if [[ "$2" == "go" ]]
 652     then
 653         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 654     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 655     then
 656         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 657         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 658
 659         # Need to change to a different directory after creating
 660         # the source dist package to avoid a pip bug.
 661         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 662
 663         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 664         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 665         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 666         # install" ensures that we've actually installed the local package
 667         # we just built.
 668         cd "$WORKSPACE/$1" \
 669             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 670             && cd "$WORKSPACE" \
 671             && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 672             && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 673     elif [[ "$2" != "" ]]
 674     then
 675         "install_$2"
 676     else
 677         "install_$1"
 678     fi
 679     result=$?
 680     checkexit $result "$1 install"
 681     title "End of $1 install (`timer`)"
 682     return $result
 683 }
 684
 685 bundle_install_trylocal() {
 686     (
 687         set -e
 688         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 689         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 690             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 691             bundle install --no-deployment
 692         fi
 693         bundle package --all
 694     )
 695 }
 696
 697 install_doc() {
 698     cd "$WORKSPACE/doc" \
 699         && bundle_install_trylocal \
 700         && rm -rf .site
 701 }
 702 do_install doc
 703
 704 install_gem() {
 705     gemname=$1
 706     srcpath=$2
 707     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 708         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 709         && bundle_install_trylocal \
 710         && gem build "$gemname.gemspec" \
 711         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 712 }
 713
 714 install_ruby_sdk() {
 715     install_gem arvados sdk/ruby
 716 }
 717 do_install sdk/ruby ruby_sdk
 718
 719 install_perl_sdk() {
 720     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 721         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 722         && make install INSTALLDIRS=perl
 723 }
 724 do_install sdk/perl perl_sdk
 725
 726 install_cli() {
 727     install_gem arvados-cli sdk/cli
 728 }
 729 do_install sdk/cli cli
 730
 731 install_login-sync() {
 732     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 733 }
 734 do_install services/login-sync login-sync
 735
 736 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
 737 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
 738 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
 739 # its own test suite brings up some of those other programs (like
 740 # keepproxy).
 741 for p in "${pythonstuff[@]}"
 742 do
 743     dir=${p%:py3}
 744     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
 745         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
 746             do_install ${dir} pip
 747         fi
 748     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
 749         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
 750             do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
 751         fi
 752     fi
 753 done
 754
 755 install_apiserver() {
 756     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 757         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 758
 759     rm -f config/environments/test.rb
 760     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 761
 762     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 763     then
 764         for f in database.yml
 765         do
 766             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 767         done
 768     fi
 769
 770     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 771     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 772     # is a postgresql superuser.
 773     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 774         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 775         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 776
 777     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 778
 779     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 780         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 781         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 782         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 783 }
 784 do_install services/api apiserver
 785
 786 cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" && \
 787     "$GOPATH/bin/govendor" sync -v || \
 788         fatal "govendor sync failed"
 789 declare -a gostuff
 790 gostuff=(
 791     sdk/go/arvados
 792     sdk/go/arvadosclient
 793     sdk/go/blockdigest
 794     sdk/go/dispatch
 795     sdk/go/health
 796     sdk/go/httpserver
 797     sdk/go/manifest
 798     sdk/go/streamer
 799     sdk/go/crunchrunner
 800     sdk/go/stats
 801     lib/crunchstat
 802     services/arv-git-httpd
 803     services/crunchstat
 804     services/health
 805     services/keep-web
 806     services/keepstore
 807     sdk/go/keepclient
 808     services/keep-balance
 809     services/keepproxy
 810     services/crunch-dispatch-local
 811     services/crunch-dispatch-slurm
 812     services/crunch-run
 813     services/ws
 814     tools/keep-block-check
 815     tools/keep-exercise
 816     tools/keep-rsync
 817 )
 818 for g in "${gostuff[@]}"
 819 do
 820     do_install "$g" go
 821 done
 822
 823 install_workbench() {
 824     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 825         && mkdir -p tmp/cache \
 826         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
 827         && RAILS_ENV=test RAILS_GROUPS=assets bundle exec rake npm:install
 828 }
 829 do_install apps/workbench workbench
 830
 831 unset http_proxy https_proxy no_proxy
 832
 833 test_doclinkchecker() {
 834     (
 835         set -e
 836         cd "$WORKSPACE/doc"
 837         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
 838         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
 839         # do much good!
 840         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
 841     )
 842 }
 843 do_test doc doclinkchecker
 844
 845 stop_services
 846
 847 test_apiserver() {
 848     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
 849     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 850         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
 851 }
 852 do_test services/api apiserver
 853
 854 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
 855 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
 856 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
 857   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 858   exit_cleanly
 859 fi
 860
 861 start_api || { stop_services; fatal "start_api"; }
 862
 863 test_ruby_sdk() {
 864     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
 865         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
 866 }
 867 do_test sdk/ruby ruby_sdk
 868
 869 test_cli() {
 870     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
 871         && mkdir -p /tmp/keep \
 872         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
 873 }
 874 do_test sdk/cli cli
 875
 876 test_login-sync() {
 877     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
 878         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
 879 }
 880 do_test services/login-sync login-sync
 881
 882 test_nodemanager_integration() {
 883     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
 884         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager_integration]}
 885 }
 886 do_test services/nodemanager_integration nodemanager_integration
 887
 888 for p in "${pythonstuff[@]}"
 889 do
 890     dir=${p%:py3}
 891     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
 892         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
 893             do_test ${dir} pip
 894         fi
 895     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
 896         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
 897             do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
 898         fi
 899     fi
 900 done
 901
 902 for g in "${gostuff[@]}"
 903 do
 904     do_test "$g" go
 905 done
 906
 907 test_workbench_units() {
 908     start_nginx_proxy_services \
 909         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 910         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 911 }
 912 do_test apps/workbench_units workbench_units
 913
 914 test_workbench_functionals() {
 915     start_nginx_proxy_services \
 916         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 917         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 918 }
 919 do_test apps/workbench_functionals workbench_functionals
 920
 921 test_workbench_integration() {
 922     start_nginx_proxy_services \
 923         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 924         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 925 }
 926 do_test apps/workbench_integration workbench_integration
 927
 928
 929 test_workbench_benchmark() {
 930     start_nginx_proxy_services \
 931         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 932         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
 933 }
 934 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
 935
 936 test_workbench_profile() {
 937     start_nginx_proxy_services \
 938         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 939         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
 940 }
 941 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
 942
 943 exit_cleanly