apps/workbench/app/controllers/pipeline_instances_controller.rb

   1 class PipelineInstancesController < ApplicationController
   2   skip_before_filter :find_object_by_uuid, only: :compare
   3   before_filter :find_objects_by_uuid, only: :compare
   4   include PipelineInstancesHelper
   5
   6   def graph(pipelines)
   7     count = {}
   8     provenance = {}
   9     pips = {}
  10     n = 1
  11
  12     pipelines.each do |p|
  13       collections = []
  14
  15       p.components.each do |k, v|
  16         j = v[:job] || next
  17
  18         uuid = j[:uuid].intern
  19         provenance[uuid] = j
  20         pips[uuid] = 0 unless pips[uuid] != nil
  21         pips[uuid] |= n
  22
  23         collections << j[:output]
  24         ProvenanceHelper::find_collections(j[:script_parameters]).each do |k|
  25           collections << k
  26         end
  27
  28         uuid = j[:script_version].intern
  29         provenance[uuid] = {:uuid => uuid}
  30         pips[uuid] = 0 unless pips[uuid] != nil
  31         pips[uuid] |= n
  32       end
  33
  34       Collection.where(uuid: collections.compact).each do |c|
  35         uuid = c.uuid.intern
  36         provenance[uuid] = c
  37         pips[uuid] = 0 unless pips[uuid] != nil
  38         pips[uuid] |= n
  39       end
  40
  41       n = n << 1
  42     end
  43
  44     return provenance, pips
  45   end
  46
  47   def show
  48     if @object.components.empty? and @object.pipeline_template_uuid
  49       template = PipelineTemplate.find(@object.pipeline_template_uuid)
  50       @object.components= template.components
  51       @object.save
  52     end
  53
  54     @pipelines = [@object]
  55
  56     if params[:compare]
  57       PipelineInstance.where(uuid: params[:compare]).each do |p|
  58         @pipelines << p
  59       end
  60     end
  61
  62     provenance, pips = graph(@pipelines)
  63
  64     @prov_svg = ProvenanceHelper::create_provenance_graph provenance, "provenance_svg", {
  65       :all_script_parameters => true,
  66       :combine_jobs => :script_and_version,
  67       :script_version_nodes => true,
  68       :pips => pips }
  69     super
  70   end
  71
  72   def compare
  73     @breadcrumb_page_name = 'compare'
  74
  75     @rows = []          # each is {name: S, components: [...]}
  76
  77     # Build a table: x=pipeline y=component
  78     @objects.each_with_index do |pi, pi_index|
  79       pipeline_jobs(pi).each do |component|
  80         # Find a cell with the same name as this component but no
  81         # entry for this pipeline
  82         target_row = nil
  83         @rows.each_with_index do |row, row_index|
  84           if row[:name] == component[:name] and !row[:components][pi_index]
  85             target_row = row
  86           end
  87         end
  88         if !target_row
  89           target_row = {name: component[:name], components: []}
  90           @rows << target_row
  91         end
  92         target_row[:components][pi_index] = component
  93       end
  94     end
  95
  96     @rows.each do |row|
  97       # Build a "normal" pseudo-component for this row by picking the
  98       # most common value for each attribute. If all values are
  99       # equally common, there is no "normal".
 100       normal = {}              # attr => most common value
 101       highscore = {}           # attr => how common "normal" is
 102       score = {}               # attr => { value => how common }
 103       row[:components].each do |pj|
 104         next if pj.nil?
 105         pj.each do |k,v|
 106           vstr = for_comparison v
 107           score[k] ||= {}
 108           score[k][vstr] = (score[k][vstr] || 0) + 1
 109           highscore[k] ||= 0
 110           if score[k][vstr] == highscore[k]
 111             # tie for first place = no "normal"
 112             normal.delete k
 113           elsif score[k][vstr] == highscore[k] + 1
 114             # more pipelines have v than anything else
 115             highscore[k] = score[k][vstr]
 116             normal[k] = vstr
 117           end
 118         end
 119       end
 120
 121       # Add a hash in component[:is_normal]: { attr => is_the_value_normal? }
 122       row[:components].each do |pj|
 123         next if pj.nil?
 124         pj[:is_normal] = {}
 125         pj.each do |k,v|
 126           pj[:is_normal][k] = (normal.has_key?(k) && normal[k] == for_comparison(v))
 127         end
 128       end
 129     end
 130
 131     provenance, pips = graph(@objects)
 132
 133     @pipelines = @objects
 134
 135     @prov_svg = ProvenanceHelper::create_provenance_graph provenance, "provenance_svg", {
 136       :all_script_parameters => true,
 137       :combine_jobs => :script_and_version,
 138       :script_version_nodes => true,
 139       :pips => pips }
 140   end
 141
 142   def show_pane_list
 143     %w(Components Graph Attributes Metadata JSON API)
 144   end
 145
 146   def compare_pane_list
 147     %w(Compare Graph)
 148   end
 149
 150   protected
 151   def for_comparison v
 152     if v.is_a? Hash or v.is_a? Array
 153       v.to_json
 154     else
 155       v.to_s
 156     end
 157   end
 158
 159   def find_objects_by_uuid
 160     @objects = model_class.where(uuid: params[:uuids])
 161   end
 162
 163 end