build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
   5
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin.sh
   7
   8 COLUMNS=80
   9 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
  10
  11 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
  12 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  13
  14 Exit non-zero if any tests fail.
  15
  16 Syntax:
  17         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  18
  19 Options:
  20
  21 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  22 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  23 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  24                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  25 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  26                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  27                subsequent invocations.
  28 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  29 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  30 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
  31                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  32                from a previous invocation if you use this option.
  33 --only-install Run specific install step
  34 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  35 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  36 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  37                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  38 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  39                Restrict apiserver tests to the given file
  40 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
  41                Restrict Python SDK tests to the given class
  42 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  43                Restrict Workbench tests to the given file
  44 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  45                Show all log messages, even when tests pass (also works
  46                with services/keepstore_test etc.)
  47 ARVADOS_DEBUG=1
  48                Print more debug messages
  49 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  50                *_test, and other examples shown above.
  51
  52 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
  53 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  54 test suites depend on other components being installed, and installing
  55 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  56
  57 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  58 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  59
  60 More information and background:
  61
  62 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  63
  64 Available tests:
  65
  66 apps/workbench (*)
  67 apps/workbench_units (*)
  68 apps/workbench_functionals (*)
  69 apps/workbench_integration (*)
  70 apps/workbench_benchmark
  71 apps/workbench_profile
  72 doc
  73 services/api
  74 services/arv-git-httpd
  75 services/crunchstat
  76 services/dockercleaner
  77 services/fuse
  78 services/health
  79 services/keep-web
  80 services/keepproxy
  81 services/keepstore
  82 services/keep-balance
  83 services/login-sync
  84 services/nodemanager
  85 services/nodemanager_integration
  86 services/crunch-run
  87 services/crunch-dispatch-local
  88 services/crunch-dispatch-slurm
  89 services/ws
  90 sdk/cli
  91 sdk/pam
  92 sdk/python
  93 sdk/python:py3
  94 sdk/ruby
  95 sdk/go/arvados
  96 sdk/go/arvadosclient
  97 sdk/go/dispatch
  98 sdk/go/keepclient
  99 sdk/go/health
 100 sdk/go/httpserver
 101 sdk/go/manifest
 102 sdk/go/blockdigest
 103 sdk/go/streamer
 104 sdk/go/stats
 105 sdk/go/crunchrunner
 106 sdk/cwl
 107 tools/arv-sync-groups
 108 tools/crunchstat-summary
 109 tools/keep-exercise
 110 tools/keep-rsync
 111 tools/keep-block-check
 112
 113 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 114     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 115
 116 EOF
 117
 118 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 119 # environment that could interfere with the tests.
 120 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 121
 122 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 123 # accident.
 124 GITDIR=
 125 GOPATH=
 126 VENVDIR=
 127 VENV3DIR=
 128 PYTHONPATH=
 129 GEMHOME=
 130 PERLINSTALLBASE=
 131
 132 short=
 133 only_install=
 134 temp=
 135 temp_preserve=
 136
 137 clear_temp() {
 138     if [[ -z "$temp" ]]; then
 139         # we didn't even get as far as making a temp dir
 140         :
 141     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 142         rm -rf "$temp"
 143     else
 144         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 145     fi
 146 }
 147
 148 fatal() {
 149     clear_temp
 150     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 151     exit 1
 152 }
 153
 154 exit_cleanly() {
 155     trap - INT
 156     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 157     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 158     stop_services
 159     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 160     report_outcomes
 161     clear_temp
 162     exit ${#failures}
 163 }
 164
 165 sanity_checks() {
 166     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 167         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 168     echo Checking dependencies:
 169     echo -n 'virtualenv: '
 170     virtualenv --version \
 171         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 172     echo -n 'ruby: '
 173     ruby -v \
 174         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 175     echo -n 'go: '
 176     go version \
 177         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 178     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 8 ]] \
 179         || fatal "Go >= 1.8 required. See http://golang.org/doc/install"
 180     echo -n 'gcc: '
 181     gcc --version | egrep ^gcc \
 182         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 183     echo -n 'fuse.h: '
 184     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 185         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 186     echo -n 'gnutls.h: '
 187     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 188         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 189     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
 190     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 191         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
 192     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 193     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 194         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 195     echo -n 'nginx: '
 196     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 197         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 198     echo -n 'perl: '
 199     perl -v | grep version \
 200         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 201     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 202         echo -n "perl $mod: "
 203         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 204             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 205     done
 206     echo -n 'gitolite: '
 207     which gitolite \
 208         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 209     echo -n 'npm: '
 210     npm --version \
 211         || fatal "No npm. Try: wget -O- https://nodejs.org/dist/v6.11.2/node-v6.11.2-linux-x64.tar.xz | sudo tar -C /usr/local -xJf - && sudo ln -s ../node-v6.11.2-linux-x64/bin/{node,npm} /usr/local/bin/"
 212     echo -n 'cadaver: '
 213     cadaver --version | grep -w cadaver \
 214           || fatal "No cadaver. Try: apt-get install cadaver"
 215 }
 216
 217 rotate_logfile() {
 218   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 219   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 220   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 221     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 222     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 223     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 224   fi
 225 }
 226
 227 declare -a failures
 228 declare -A skip
 229 declare -A testargs
 230 skip[apps/workbench_profile]=1
 231
 232 while [[ -n "$1" ]]
 233 do
 234     arg="$1"; shift
 235     case "$arg" in
 236         --help)
 237             echo >&2 "$helpmessage"
 238             echo >&2
 239             exit 1
 240             ;;
 241         --skip)
 242             skip[$1]=1; shift
 243             ;;
 244         --only)
 245             only="$1"; skip[$1]=""; shift
 246             ;;
 247         --short)
 248             short=1
 249             ;;
 250         --skip-install)
 251             only_install=nothing
 252             ;;
 253         --only-install)
 254             only_install="$1"; shift
 255             ;;
 256         --temp)
 257             temp="$1"; shift
 258             temp_preserve=1
 259             ;;
 260         --leave-temp)
 261             temp_preserve=1
 262             ;;
 263         --repeat)
 264             repeat=$((${1}+0)); shift
 265             ;;
 266         --retry)
 267             retry=1
 268             ;;
 269         *_test=*)
 270             suite="${arg%%_test=*}"
 271             args="${arg#*=}"
 272             testargs["$suite"]="$args"
 273             ;;
 274         *=*)
 275             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 276             ;;
 277         *)
 278             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 279             exit 1
 280             ;;
 281     esac
 282 done
 283
 284 start_api() {
 285     echo 'Starting API server...'
 286     cd "$WORKSPACE" \
 287         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 288         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 289         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 290         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 291         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 292         && (env | egrep ^ARVADOS)
 293 }
 294
 295 start_nginx_proxy_services() {
 296     echo 'Starting keepproxy, keep-web, ws, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
 297     cd "$WORKSPACE" \
 298         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 299         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 300         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 301         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 302         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 303         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1
 304 }
 305
 306 stop_services() {
 307     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES" ]]; then
 308         unset ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 309         cd "$WORKSPACE" \
 310             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 311             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 312             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 313             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 314             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy
 315     fi
 316     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 317         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 318         cd "$WORKSPACE" \
 319             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 320             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 321             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
 322     fi
 323 }
 324
 325 interrupt() {
 326     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 327     exit_cleanly
 328 }
 329 trap interrupt INT
 330
 331 sanity_checks
 332
 333 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 334
 335 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 336     # Jenkins expects us to use this by default.
 337     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 338 fi
 339
 340 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 341 cd "$WORKSPACE"
 342 find -name '*.pyc' -delete
 343
 344 if [[ -z "$temp" ]]; then
 345     temp="$(mktemp -d)"
 346 fi
 347
 348 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 349 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
 350 do
 351     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 352         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 353     fi
 354     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 355         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 356     fi
 357 done
 358
 359 setup_ruby_environment() {
 360     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 361         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 362         using_rvm=true
 363     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 364         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 365         using_rvm=true
 366     else
 367         using_rvm=false
 368     fi
 369
 370     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 371         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 372         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 373         # the environment to the "current gemset", which would lose
 374         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 375         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 376         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 377         # rvm gemset and use it for everything.
 378
 379         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 380             || fatal 'rvm check'
 381
 382         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 383         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 384         # complaint about not being in first place already.
 385         rvm use @default 2>/dev/null
 386
 387         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 388         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 389         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 390         # ruby to the caller.
 391         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 392         rvm use "@${gemset}" --create \
 393             || fatal 'rvm gemset setup'
 394
 395         rvm env
 396     else
 397         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 398         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 399         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 400         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 401         # should be installed, and we should leave it alone.)
 402
 403         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 404             user_gempath="$(gem env gempath)"
 405             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 406         fi
 407         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 408
 409         # When we build and install our own gems, we install them in our
 410         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 411         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 412         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 413
 414         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 415         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 416         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
 417
 418         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 419         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 420         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 421     fi
 422     bundle config || gem install bundler \
 423         || fatal 'install bundler'
 424 }
 425
 426 with_test_gemset() {
 427     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 428         "$@"
 429     else
 430         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 431     fi
 432 }
 433
 434 gem_uninstall_if_exists() {
 435     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 436         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 437     fi
 438 }
 439
 440 setup_virtualenv() {
 441     local venvdest="$1"; shift
 442     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 443         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 444     fi
 445     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 446         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 447         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 448     else
 449         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 450     fi
 451     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 452     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 453 }
 454
 455 export PERLINSTALLBASE
 456 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
 457
 458 export GOPATH
 459 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 460 rmdir --parents "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/tmp/GOPATH"
 461 ln -sfT "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
 462     || fatal "symlink failed"
 463 go get -v github.com/kardianos/govendor \
 464     || fatal "govendor install failed"
 465
 466 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 467 . "$VENVDIR/bin/activate"
 468
 469 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 470 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
 471     || pip install PyYAML >/dev/null \
 472     || fatal "pip install PyYAML failed"
 473
 474 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
 475 # won't pick it up by default.
 476 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 477     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
 478     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 479
 480 # We need an unreleased (as of 2017-08-17) llfuse bugfix, otherwise our fuse test suite deadlocks.
 481 pip freeze | grep -x llfuse==1.2.0 || (
 482     set -e
 483     yes | pip uninstall llfuse || true
 484     cython --version || fatal "no cython; try sudo apt-get install cython"
 485     cd "$temp"
 486     (cd python-llfuse 2>/dev/null || git clone https://github.com/curoverse/python-llfuse)
 487     cd python-llfuse
 488     git checkout 620722fd990ea642ddb8e7412676af482c090c0c
 489     git checkout setup.py
 490     sed -i -e "s:'1\\.2':'1.2.0':" setup.py
 491     python setup.py build_cython
 492     python setup.py install --force
 493 ) || fatal "llfuse fork failed"
 494 pip freeze | grep -x llfuse==1.2.0 || fatal "error: installed llfuse 1.2.0 but '$(pip freeze | grep llfuse)' ???"
 495
 496 # Deactivate Python 2 virtualenv
 497 deactivate
 498
 499 declare -a pythonstuff
 500 pythonstuff=(
 501     sdk/pam
 502     sdk/python
 503     sdk/python:py3
 504     sdk/cwl
 505     services/dockercleaner:py3
 506     services/fuse
 507     services/nodemanager
 508     tools/crunchstat-summary
 509     )
 510
 511 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 512 # Otherwise, skip dependent tests.
 513 PYTHON3=$(which python3)
 514 if [[ ${?} = 0 ]]; then
 515     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 516 else
 517     PYTHON3=
 518     cat >&2 <<EOF
 519
 520 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
 521
 522 EOF
 523 fi
 524
 525 # Reactivate Python 2 virtualenv
 526 . "$VENVDIR/bin/activate"
 527
 528 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 529 # whine a lot.
 530 setup_ruby_environment
 531
 532 echo "PATH is $PATH"
 533
 534 if ! which bundler >/dev/null
 535 then
 536     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 537 fi
 538
 539 retry() {
 540     remain="${repeat}"
 541     while :
 542     do
 543         if ${@}; then
 544             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 545                 remain=$((${remain}-1))
 546                 title "Repeating ${remain} more times"
 547             else
 548                 break
 549             fi
 550         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 551             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 552             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 553             then
 554                 break
 555             fi
 556         else
 557             break
 558         fi
 559     done
 560 }
 561
 562 do_test() {
 563     case "${1}" in
 564         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 565             suite=apps/workbench
 566             ;;
 567         services/nodemanager | services/nodemanager_integration)
 568             suite=services/nodemanager_suite
 569             ;;
 570         *)
 571             suite="${1}"
 572             ;;
 573     esac
 574     if [[ -z "${skip[$suite]}" && -z "${skip[$1]}" && \
 575                 (-z "${only}" || "${only}" == "${suite}" || \
 576                  "${only}" == "${1}") ]]; then
 577         retry do_test_once ${@}
 578     else
 579         title "Skipping ${1} tests"
 580     fi
 581 }
 582
 583 do_test_once() {
 584     unset result
 585
 586     title "Running $1 tests"
 587     timer_reset
 588     if [[ "$2" == "go" ]]
 589     then
 590         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 591         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 592         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 593         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 594         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 595         # compilation errors.
 596         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 597             cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 598             [[ -z "$(gofmt -e -d . | tee /dev/stderr)" ]] && \
 599             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 600         then
 601             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 602             # does:
 603             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 604         else
 605             # The above form gets verbose even when testargs is
 606             # empty, so use this form in such cases:
 607             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 608         fi
 609         result=${result:-$?}
 610         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 611         then
 612             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 613             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 614         fi
 615     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 616     then
 617         tries=0
 618         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 619         do
 620             tries=$((${tries}+1))
 621             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 622             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 623             "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 624             result=$?
 625             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 626             then
 627                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 628                 continue
 629             else
 630                 break
 631             fi
 632         done
 633     elif [[ "$2" != "" ]]
 634     then
 635         "test_$2"
 636     else
 637         "test_$1"
 638     fi
 639     result=${result:-$?}
 640     checkexit $result "$1 tests"
 641     title "End of $1 tests (`timer`)"
 642     return $result
 643 }
 644
 645 do_install() {
 646     if [[ -z "${only_install}" || "${only_install}" == "${1}" ]]; then
 647         retry do_install_once ${@}
 648     else
 649         title "Skipping $1 install"
 650     fi
 651 }
 652
 653 do_install_once() {
 654     title "Running $1 install"
 655     timer_reset
 656     if [[ "$2" == "go" ]]
 657     then
 658         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 659     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 660     then
 661         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 662         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 663
 664         # Need to change to a different directory after creating
 665         # the source dist package to avoid a pip bug.
 666         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 667
 668         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 669         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 670         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 671         # install" ensures that we've actually installed the local package
 672         # we just built.
 673         cd "$WORKSPACE/$1" \
 674             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 675             && cd "$WORKSPACE" \
 676             && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 677             && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 678     elif [[ "$2" != "" ]]
 679     then
 680         "install_$2"
 681     else
 682         "install_$1"
 683     fi
 684     result=$?
 685     checkexit $result "$1 install"
 686     title "End of $1 install (`timer`)"
 687     return $result
 688 }
 689
 690 bundle_install_trylocal() {
 691     (
 692         set -e
 693         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 694         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 695             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 696             bundle install --no-deployment
 697         fi
 698         bundle package --all
 699     )
 700 }
 701
 702 install_doc() {
 703     cd "$WORKSPACE/doc" \
 704         && bundle_install_trylocal \
 705         && rm -rf .site
 706 }
 707 do_install doc
 708
 709 install_gem() {
 710     gemname=$1
 711     srcpath=$2
 712     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 713         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 714         && bundle_install_trylocal \
 715         && gem build "$gemname.gemspec" \
 716         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 717 }
 718
 719 install_ruby_sdk() {
 720     install_gem arvados sdk/ruby
 721 }
 722 do_install sdk/ruby ruby_sdk
 723
 724 install_perl_sdk() {
 725     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 726         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 727         && make install INSTALLDIRS=perl
 728 }
 729 do_install sdk/perl perl_sdk
 730
 731 install_cli() {
 732     install_gem arvados-cli sdk/cli
 733 }
 734 do_install sdk/cli cli
 735
 736 install_login-sync() {
 737     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 738 }
 739 do_install services/login-sync login-sync
 740
 741 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
 742 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
 743 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
 744 # its own test suite brings up some of those other programs (like
 745 # keepproxy).
 746 for p in "${pythonstuff[@]}"
 747 do
 748     dir=${p%:py3}
 749     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
 750         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
 751             do_install ${dir} pip
 752         fi
 753     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
 754         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
 755             do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
 756         fi
 757     fi
 758 done
 759
 760 install_apiserver() {
 761     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 762         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 763
 764     rm -f config/environments/test.rb
 765     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 766
 767     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 768     then
 769         for f in database.yml
 770         do
 771             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 772         done
 773     fi
 774
 775     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 776     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 777     # is a postgresql superuser.
 778     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 779         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 780         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 781
 782     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 783
 784     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 785         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 786         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 787         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 788 }
 789 do_install services/api apiserver
 790
 791 cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" && \
 792     "$GOPATH/bin/govendor" sync -v || \
 793         fatal "govendor sync failed"
 794 declare -a gostuff
 795 gostuff=(
 796     sdk/go/arvados
 797     sdk/go/arvadosclient
 798     sdk/go/blockdigest
 799     sdk/go/dispatch
 800     sdk/go/health
 801     sdk/go/httpserver
 802     sdk/go/manifest
 803     sdk/go/streamer
 804     sdk/go/crunchrunner
 805     sdk/go/stats
 806     lib/crunchstat
 807     services/arv-git-httpd
 808     services/crunchstat
 809     services/health
 810     services/keep-web
 811     services/keepstore
 812     sdk/go/keepclient
 813     services/keep-balance
 814     services/keepproxy
 815     services/crunch-dispatch-local
 816     services/crunch-dispatch-slurm
 817     services/crunch-run
 818     services/ws
 819     tools/keep-block-check
 820     tools/keep-exercise
 821     tools/keep-rsync
 822     tools/arv-sync-groups
 823 )
 824 for g in "${gostuff[@]}"
 825 do
 826     do_install "$g" go
 827 done
 828
 829 install_workbench() {
 830     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 831         && mkdir -p tmp/cache \
 832         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
 833         && RAILS_ENV=test RAILS_GROUPS=assets bundle exec rake npm:install
 834 }
 835 do_install apps/workbench workbench
 836
 837 unset http_proxy https_proxy no_proxy
 838
 839 test_doclinkchecker() {
 840     (
 841         set -e
 842         cd "$WORKSPACE/doc"
 843         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
 844         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
 845         # do much good!
 846         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
 847     )
 848 }
 849 do_test doc doclinkchecker
 850
 851 stop_services
 852
 853 test_apiserver() {
 854     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
 855     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 856         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
 857 }
 858 do_test services/api apiserver
 859
 860 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
 861 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
 862 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
 863   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 864   exit_cleanly
 865 fi
 866
 867 start_api || { stop_services; fatal "start_api"; }
 868
 869 test_ruby_sdk() {
 870     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
 871         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
 872 }
 873 do_test sdk/ruby ruby_sdk
 874
 875 test_cli() {
 876     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
 877         && mkdir -p /tmp/keep \
 878         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
 879 }
 880 do_test sdk/cli cli
 881
 882 test_login-sync() {
 883     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
 884         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
 885 }
 886 do_test services/login-sync login-sync
 887
 888 test_nodemanager_integration() {
 889     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
 890         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager_integration]}
 891 }
 892 do_test services/nodemanager_integration nodemanager_integration
 893
 894 for p in "${pythonstuff[@]}"
 895 do
 896     dir=${p%:py3}
 897     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
 898         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
 899             do_test ${dir} pip
 900         fi
 901     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
 902         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
 903             do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
 904         fi
 905     fi
 906 done
 907
 908 for g in "${gostuff[@]}"
 909 do
 910     do_test "$g" go
 911 done
 912
 913 test_workbench_units() {
 914     start_nginx_proxy_services \
 915         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 916         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 917 }
 918 do_test apps/workbench_units workbench_units
 919
 920 test_workbench_functionals() {
 921     start_nginx_proxy_services \
 922         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 923         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 924 }
 925 do_test apps/workbench_functionals workbench_functionals
 926
 927 test_workbench_integration() {
 928     start_nginx_proxy_services \
 929         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 930         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 931 }
 932 do_test apps/workbench_integration workbench_integration
 933
 934
 935 test_workbench_benchmark() {
 936     start_nginx_proxy_services \
 937         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 938         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
 939 }
 940 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
 941
 942 test_workbench_profile() {
 943     start_nginx_proxy_services \
 944         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 945         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
 946 }
 947 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
 948
 949 exit_cleanly