build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
   5
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin.sh
   7
   8 COLUMNS=80
   9 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
  10
  11 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
  12 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  13
  14 Exit non-zero if any tests fail.
  15
  16 Syntax:
  17         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  18
  19 Options:
  20
  21 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  22 --skip sanity  Skip initial dev environment sanity checks.
  23 --skip install Do not run any install steps. Just run tests.
  24                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  25                from a previous invocation if you use this option.
  26 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  27 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  28                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  29 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  30                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  31                subsequent invocations.
  32 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  33 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  34 --only-install Run specific install step
  35 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  36 --interactive  Set up, then prompt for test/install steps to perform.
  37 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  38 CONFIGSRC=path Dir with config.yml file containing PostgreSQL section for use by tests.
  39 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  40                Restrict apiserver tests to the given file
  41 sdk/python_test="--test-suite tests.test_keep_locator"
  42                Restrict Python SDK tests to the given class
  43 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  44                Restrict Workbench tests to the given file
  45 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  46                Show all log messages, even when tests pass (also works
  47                with services/keepstore_test etc.)
  48 ARVADOS_DEBUG=1
  49                Print more debug messages
  50 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  51                *_test, and other examples shown above.
  52
  53 Assuming "--skip install" is not given, all components are installed
  54 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  55 test suites depend on other components being installed, and installing
  56 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  57
  58 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  59 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  60
  61 More information and background:
  62
  63 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  64
  65 Available tests:
  66
  67 apps/workbench (*)
  68 apps/workbench_units (*)
  69 apps/workbench_functionals (*)
  70 apps/workbench_integration (*)
  71 apps/workbench_benchmark
  72 apps/workbench_profile
  73 cmd/arvados-client
  74 cmd/arvados-server
  75 doc
  76 lib/cli
  77 lib/cmd
  78 lib/controller
  79 lib/controller/federation
  80 lib/controller/railsproxy
  81 lib/controller/router
  82 lib/controller/rpc
  83 lib/crunchstat
  84 lib/crunch-run
  85 lib/cloud
  86 lib/cloud/azure
  87 lib/cloud/cloudtest
  88 lib/dispatchcloud
  89 lib/dispatchcloud/container
  90 lib/dispatchcloud/scheduler
  91 lib/dispatchcloud/ssh_executor
  92 lib/dispatchcloud/worker
  93 lib/mount
  94 lib/service
  95 services/api
  96 services/arv-git-httpd
  97 services/crunchstat
  98 services/dockercleaner
  99 services/fuse
 100 services/fuse:py3
 101 services/health
 102 services/keep-web
 103 services/keepproxy
 104 services/keepstore
 105 services/keep-balance
 106 services/login-sync
 107 services/nodemanager
 108 services/nodemanager_integration
 109 services/crunch-dispatch-local
 110 services/crunch-dispatch-slurm
 111 services/ws
 112 sdk/cli
 113 sdk/pam
 114 sdk/pam:py3
 115 sdk/python
 116 sdk/python:py3
 117 sdk/ruby
 118 sdk/go/arvados
 119 sdk/go/arvadosclient
 120 sdk/go/auth
 121 sdk/go/dispatch
 122 sdk/go/keepclient
 123 sdk/go/health
 124 sdk/go/httpserver
 125 sdk/go/manifest
 126 sdk/go/blockdigest
 127 sdk/go/asyncbuf
 128 sdk/go/stats
 129 sdk/go/crunchrunner
 130 sdk/cwl
 131 sdk/R
 132 sdk/java-v2
 133 tools/sync-groups
 134 tools/crunchstat-summary
 135 tools/crunchstat-summary:py3
 136 tools/keep-exercise
 137 tools/keep-rsync
 138 tools/keep-block-check
 139
 140 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 141     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 142
 143 EOF
 144
 145 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 146 # environment that could interfere with the tests.
 147 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 148
 149 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 150 # accident.
 151 GITDIR=
 152 GOPATH=
 153 VENVDIR=
 154 VENV3DIR=
 155 PYTHONPATH=
 156 GEMHOME=
 157 PERLINSTALLBASE=
 158 R_LIBS=
 159 export LANG=en_US.UTF-8
 160
 161 short=
 162 only_install=
 163 temp=
 164 temp_preserve=
 165
 166 clear_temp() {
 167     if [[ -z "$temp" ]]; then
 168         # we didn't even get as far as making a temp dir
 169         :
 170     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 171         rm -rf "$temp"
 172     else
 173         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 174     fi
 175 }
 176
 177 fatal() {
 178     clear_temp
 179     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 180     exit 1
 181 }
 182
 183 exit_cleanly() {
 184     trap - INT
 185     if which create-plot-data-from-log.sh >/dev/null; then
 186         create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 187     fi
 188     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 189     stop_services
 190     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 191     report_outcomes
 192     clear_temp
 193     exit ${#failures}
 194 }
 195
 196 sanity_checks() {
 197     [[ -n "${skip[sanity]}" ]] && return 0
 198     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 199         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 200     [[ -z "$CONFIGSRC" ]] || [[ -s "$CONFIGSRC/config.yml" ]] \
 201         || fatal "CONFIGSRC is $CONFIGSRC but '$CONFIGSRC/config.yml' is empty or not found (see: $0 --help)"
 202     echo Checking dependencies:
 203     echo "locale: ${LANG}"
 204     [[ "$(locale charmap)" = "UTF-8" ]] \
 205         || fatal "Locale '${LANG}' is broken/missing. Try: echo ${LANG} | sudo tee -a /etc/locale.gen && sudo locale-gen"
 206     echo -n 'virtualenv: '
 207     virtualenv --version \
 208         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 209     echo -n 'ruby: '
 210     ruby -v \
 211         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 212     echo -n 'go: '
 213     go version \
 214         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 215     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 12 ]] \
 216         || fatal "Go >= 1.12 required. See http://golang.org/doc/install"
 217     echo -n 'gcc: '
 218     gcc --version | egrep ^gcc \
 219         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 220     echo -n 'fuse.h: '
 221     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 222         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 223     echo -n 'gnutls.h: '
 224     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 225         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 226     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
 227     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 228         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
 229     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 230     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 231         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 232     which netstat \
 233         || fatal "No netstat. Try: apt-get install net-tools"
 234     echo -n 'nginx: '
 235     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 236         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 237     echo -n 'perl: '
 238     perl -v | grep version \
 239         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 240     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 241         echo -n "perl $mod: "
 242         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 243             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 244     done
 245     echo -n 'gitolite: '
 246     which gitolite \
 247         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 248     echo -n 'npm: '
 249     npm --version \
 250         || fatal "No npm. Try: wget -O- https://nodejs.org/dist/v6.11.2/node-v6.11.2-linux-x64.tar.xz | sudo tar -C /usr/local -xJf - && sudo ln -s ../node-v6.11.2-linux-x64/bin/{node,npm} /usr/local/bin/"
 251     echo -n 'cadaver: '
 252     cadaver --version | grep -w cadaver \
 253           || fatal "No cadaver. Try: apt-get install cadaver"
 254     echo -n 'libattr1 xattr.h: '
 255     find /usr/include -path '*/attr/xattr.h' | egrep --max-count=1 . \
 256         || fatal "No libattr1 xattr.h. Try: apt-get install libattr1-dev"
 257     echo -n 'libcurl curl.h: '
 258     find /usr/include -path '*/curl/curl.h' | egrep --max-count=1 . \
 259         || fatal "No libcurl curl.h. Try: apt-get install libcurl4-gnutls-dev"
 260     echo -n 'libpq libpq-fe.h: '
 261     find /usr/include -path '*/postgresql/libpq-fe.h' | egrep --max-count=1 . \
 262         || fatal "No libpq libpq-fe.h. Try: apt-get install libpq-dev"
 263     echo -n 'postgresql: '
 264     psql --version || fatal "No postgresql. Try: apt-get install postgresql postgresql-client-common"
 265     echo -n 'phantomjs: '
 266     phantomjs --version || fatal "No phantomjs. Try: apt-get install phantomjs"
 267     echo -n 'xvfb: '
 268     which Xvfb || fatal "No xvfb. Try: apt-get install xvfb"
 269     echo -n 'graphviz: '
 270     dot -V || fatal "No graphviz. Try: apt-get install graphviz"
 271     echo -n 'geckodriver: '
 272     geckodriver --version | grep ^geckodriver || echo "No geckodriver. Try: wget -O- https://github.com/mozilla/geckodriver/releases/download/v0.23.0/geckodriver-v0.23.0-linux64.tar.gz | sudo tar -C /usr/local/bin -xzf - geckodriver"
 273
 274     if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 275       # R SDK stuff
 276       echo -n 'R: '
 277       which Rscript || fatal "No Rscript. Try: apt-get install r-base"
 278       echo -n 'testthat: '
 279       Rscript -e "library('testthat')" || fatal "No testthat. Try: apt-get install r-cran-testthat"
 280       # needed for roxygen2, needed for devtools, needed for R sdk
 281       pkg-config --exists libxml-2.0 || fatal "No libxml2. Try: apt-get install libxml2-dev"
 282       # needed for pkgdown, builds R SDK doc pages
 283       which pandoc || fatal "No pandoc. Try: apt-get install pandoc"
 284     fi
 285     echo 'procs with /dev/fuse open:'
 286     find /proc/*/fd -lname /dev/fuse 2>/dev/null | cut -d/ -f3 | xargs --no-run-if-empty ps -lywww
 287     echo 'grep fuse /proc/self/mountinfo:'
 288     grep fuse /proc/self/mountinfo
 289 }
 290
 291 rotate_logfile() {
 292   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 293   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 294   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 295     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 296     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 297     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 298   fi
 299 }
 300
 301 declare -a failures
 302 declare -A skip
 303 declare -A only
 304 declare -A testargs
 305 skip[apps/workbench_profile]=1
 306 # nodemanager_integration tests are not reliable, see #12061.
 307 skip[services/nodemanager_integration]=1
 308
 309 while [[ -n "$1" ]]
 310 do
 311     arg="$1"; shift
 312     case "$arg" in
 313         --help)
 314             echo >&2 "$helpmessage"
 315             echo >&2
 316             exit 1
 317             ;;
 318         --skip)
 319             skip[$1]=1; shift
 320             ;;
 321         --only)
 322             only[$1]=1; skip[$1]=""; shift
 323             ;;
 324         --short)
 325             short=1
 326             ;;
 327         --interactive)
 328             interactive=1
 329             ;;
 330         --skip-install)
 331             skip[install]=1
 332             ;;
 333         --only-install)
 334             only_install="$1"; shift
 335             ;;
 336         --temp)
 337             temp="$1"; shift
 338             temp_preserve=1
 339             ;;
 340         --leave-temp)
 341             temp_preserve=1
 342             ;;
 343         --repeat)
 344             repeat=$((${1}+0)); shift
 345             ;;
 346         --retry)
 347             retry=1
 348             ;;
 349         *_test=*)
 350             suite="${arg%%_test=*}"
 351             args="${arg#*=}"
 352             testargs["$suite"]="$args"
 353             ;;
 354         *=*)
 355             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 356             ;;
 357         *)
 358             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 359             exit 1
 360             ;;
 361     esac
 362 done
 363
 364 # R SDK installation is very slow (~360s in a clean environment) and only
 365 # required when testing it. Skip that step if it is not needed.
 366 NEED_SDK_R=true
 367
 368 if [[ ${#only[@]} -ne 0 ]] &&
 369    [[ -z "${only['sdk/R']}" && -z "${only['doc']}" ]]; then
 370   NEED_SDK_R=false
 371 fi
 372
 373 if [[ ${skip["sdk/R"]} == 1 && ${skip["doc"]} == 1 ]]; then
 374   NEED_SDK_R=false
 375 fi
 376
 377 if [[ $NEED_SDK_R == false ]]; then
 378         echo "R SDK not needed, it will not be installed."
 379 fi
 380
 381 checkpidfile() {
 382     svc="$1"
 383     pid="$(cat "$WORKSPACE/tmp/${svc}.pid")"
 384     if [[ -z "$pid" ]] || ! kill -0 "$pid"; then
 385         tail $WORKSPACE/tmp/${1}*.log
 386         echo "${svc} pid ${pid} not running"
 387         return 1
 388     fi
 389     echo "${svc} pid ${pid} ok"
 390 }
 391
 392 checkhealth() {
 393     svc="$1"
 394     base=$("${VENVDIR}/bin/python" -c "import yaml; print list(yaml.safe_load(file('$ARVADOS_CONFIG'))['Clusters']['zzzzz']['Services']['$1']['InternalURLs'].keys())[0]")
 395     url="$base/_health/ping"
 396     if ! curl -Ss -H "Authorization: Bearer e687950a23c3a9bceec28c6223a06c79" "${url}" | tee -a /dev/stderr | grep '"OK"'; then
 397         echo "${url} failed"
 398         return 1
 399     fi
 400 }
 401
 402 checkdiscoverydoc() {
 403     dd="https://${1}/discovery/v1/apis/arvados/v1/rest"
 404     if ! (set -o pipefail; curl -fsk "$dd" | grep -q ^{ ); then
 405         echo >&2 "ERROR: could not retrieve discovery doc from RailsAPI at $dd"
 406         tail -v $WORKSPACE/tmp/railsapi.log
 407         return 1
 408     fi
 409     echo "${dd} ok"
 410 }
 411
 412 start_services() {
 413     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 414         return 0
 415     fi
 416     . "$VENVDIR/bin/activate"
 417     echo 'Starting API, controller, keepproxy, keep-web, arv-git-httpd, ws, and nginx ssl proxy...'
 418     if [[ ! -d "$WORKSPACE/services/api/log" ]]; then
 419         mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/log"
 420     fi
 421     # Remove empty api.pid file if it exists
 422     if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid" && ! -s "$WORKSPACE/tmp/api.pid" ]]; then
 423         rm -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid"
 424     fi
 425     all_services_stopped=
 426     fail=1
 427
 428     cd "$WORKSPACE" \
 429         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 430         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 431         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 432         && checkpidfile api \
 433         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 434         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx) \
 435         && checkpidfile nginx \
 436         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_controller \
 437         && checkpidfile controller \
 438         && checkhealth Controller \
 439         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 440         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 441         && checkpidfile keepproxy \
 442         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 443         && checkpidfile keep-web \
 444         && checkhealth WebDAV \
 445         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 446         && checkpidfile arv-git-httpd \
 447         && checkhealth GitHTTP \
 448         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 449         && checkpidfile ws \
 450         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1 \
 451         && (env | egrep ^ARVADOS) \
 452         && fail=0
 453     deactivate
 454     if [[ $fail != 0 ]]; then
 455         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 456     fi
 457     return $fail
 458 }
 459
 460 stop_services() {
 461     if [[ -n "$all_services_stopped" ]]; then
 462         return
 463     fi
 464     unset ARVADOS_TEST_API_HOST ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 465     . "$VENVDIR/bin/activate" || return
 466     cd "$WORKSPACE" \
 467         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 468         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 469         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 470         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 471         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy \
 472         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_controller \
 473         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop \
 474         && all_services_stopped=1
 475     deactivate
 476     unset ARVADOS_CONFIG
 477 }
 478
 479 interrupt() {
 480     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 481     exit_cleanly
 482 }
 483 trap interrupt INT
 484
 485 setup_ruby_environment() {
 486     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 487         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 488         using_rvm=true
 489     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 490         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 491         using_rvm=true
 492     else
 493         using_rvm=false
 494     fi
 495
 496     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 497         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 498         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 499         # the environment to the "current gemset", which would lose
 500         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 501         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 502         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 503         # rvm gemset and use it for everything.
 504
 505         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 506             || fatal 'rvm check'
 507
 508         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 509         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 510         # complaint about not being in first place already.
 511         rvm use @default 2>/dev/null
 512
 513         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 514         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 515         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 516         # ruby to the caller.
 517         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 518         rvm use "@${gemset}" --create \
 519             || fatal 'rvm gemset setup'
 520
 521         rvm env
 522         (bundle version | grep -q 2.0.2) || gem install bundler -v 2.0.2
 523         bundle="$(which bundle)"
 524         echo "$bundle"
 525         "$bundle" version | grep 2.0.2 || fatal 'install bundler'
 526     else
 527         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 528         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 529         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 530         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 531         # should be installed, and we should leave it alone.)
 532
 533         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 534             user_gempath="$(gem env gempath)"
 535             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 536         fi
 537         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 538
 539         # When we build and install our own gems, we install them in our
 540         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 541         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 542         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 543
 544         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 545         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 546         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
 547
 548         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 549         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 550         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 551         bundle="$(gem env gempath | cut -f1 -d:)/bin/bundle"
 552         (
 553             export HOME=$GEMHOME
 554             ("$bundle" version | grep -q 2.0.2) \
 555                 || gem install --user bundler -v 2.0.2
 556             "$bundle" version | tee /dev/stderr | grep -q 'version 2'
 557         ) || fatal 'install bundler'
 558     fi
 559 }
 560
 561 with_test_gemset() {
 562     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 563         "$@"
 564     else
 565         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 566     fi
 567 }
 568
 569 gem_uninstall_if_exists() {
 570     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 571         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 572     fi
 573 }
 574
 575 setup_virtualenv() {
 576     local venvdest="$1"; shift
 577     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 578         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 579     elif [[ -n "$short" ]]; then
 580         return
 581     fi
 582     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 583         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 584         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 585     else
 586         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 587     fi
 588 }
 589
 590 initialize() {
 591     # If dependencies like ruby, go, etc. are installed in
 592     # /var/lib/arvados -- presumably by "arvados-server install" --
 593     # then we want to use those versions, instead of whatever happens
 594     # to be installed in /usr.
 595     PATH="/var/lib/arvados/bin:${PATH}"
 596     sanity_checks
 597
 598     echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 599
 600     # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 601     cd "$WORKSPACE"
 602     find -name '*.pyc' -delete
 603
 604     if [[ -z "$temp" ]]; then
 605         temp="$(mktemp -d)"
 606     fi
 607
 608     # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 609     for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE R_LIBS
 610     do
 611         if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 612             eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 613         fi
 614         if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 615             mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 616         fi
 617     done
 618
 619     rm -vf "${WORKSPACE}/tmp/*.log"
 620
 621     export PERLINSTALLBASE
 622     export PERL5LIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5${PERL5LIB:+:$PERL5LIB}"
 623
 624     export R_LIBS
 625
 626     export GOPATH
 627     # Make sure our compiled binaries under test override anything
 628     # else that might be in the environment.
 629     export PATH=$GOPATH/bin:$PATH
 630
 631     # Jenkins config requires that glob tmp/*.log match something. Ensure
 632     # that happens even if we don't end up running services that set up
 633     # logging.
 634     mkdir -p "${WORKSPACE}/tmp/" || fatal "could not mkdir ${WORKSPACE}/tmp"
 635     touch "${WORKSPACE}/tmp/controller.log" || fatal "could not touch ${WORKSPACE}/tmp/controller.log"
 636
 637     unset http_proxy https_proxy no_proxy
 638
 639     # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 640     # whine a lot.
 641     setup_ruby_environment
 642
 643     echo "PATH is $PATH"
 644 }
 645
 646 install_env() {
 647     go mod download || fatal "Go deps failed"
 648     which goimports >/dev/null || go get golang.org/x/tools/cmd/goimports || fatal "Go setup failed"
 649
 650     setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 651     . "$VENVDIR/bin/activate"
 652
 653     # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 654     (
 655         set -e
 656         "${VENVDIR}/bin/pip" install PyYAML
 657         "${VENV3DIR}/bin/pip" install PyYAML
 658         cd "$WORKSPACE/sdk/python"
 659         python setup.py install
 660     ) || fatal "installing PyYAML and sdk/python failed"
 661
 662     # Preinstall libcloud if using a fork; otherwise nodemanager "pip
 663     # install" won't pick it up by default.
 664     if [[ -n "$LIBCLOUD_PIN_SRC" ]]; then
 665         pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 666             || pip install --pre --ignore-installed --no-cache-dir "$LIBCLOUD_PIN_SRC" >/dev/null \
 667             || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 668     fi
 669
 670     # Deactivate Python 2 virtualenv
 671     deactivate
 672
 673     # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 674     # Otherwise, skip dependent tests.
 675     PYTHON3=$(which python3)
 676     if [[ ${?} = 0 ]]; then
 677         setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 678     else
 679         PYTHON3=
 680         cat >&2 <<EOF
 681
 682 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
 683
 684 EOF
 685     fi
 686 }
 687
 688 retry() {
 689     remain="${repeat}"
 690     while :
 691     do
 692         if ${@}; then
 693             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 694                 remain=$((${remain}-1))
 695                 title "(repeating ${remain} more times)"
 696             else
 697                 break
 698             fi
 699         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 700             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 701             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 702             then
 703                 break
 704             fi
 705         else
 706             break
 707         fi
 708     done
 709 }
 710
 711 do_test() {
 712     case "${1}" in
 713         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 714             suite=apps/workbench
 715             ;;
 716         services/nodemanager | services/nodemanager_integration)
 717             suite=services/nodemanager_suite
 718             ;;
 719         *)
 720             suite="${1}"
 721             ;;
 722     esac
 723     if [[ -n "${skip[$suite]}" || \
 724               -n "${skip[$1]}" || \
 725               (${#only[@]} -ne 0 && ${only[$suite]} -eq 0 && ${only[$1]} -eq 0) ]]; then
 726         return 0
 727     fi
 728     case "${1}" in
 729         services/api)
 730             stop_services
 731             check_arvados_config "$1"
 732             ;;
 733         gofmt | doc | lib/cli | lib/cloud/azure | lib/cloud/ec2 | lib/cloud/cloudtest | lib/cmd | lib/dispatchcloud/ssh_executor | lib/dispatchcloud/worker)
 734             check_arvados_config "$1"
 735             # don't care whether services are running
 736             ;;
 737         *)
 738             check_arvados_config "$1"
 739             if ! start_services; then
 740                 checkexit 1 "$1 tests"
 741                 title "test $1 -- failed to start services"
 742                 return 1
 743             fi
 744             ;;
 745     esac
 746     retry do_test_once ${@}
 747 }
 748
 749 go_ldflags() {
 750     version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}
 751     echo "-X git.arvados.org/arvados.git/lib/cmd.version=${version} -X main.version=${version}"
 752 }
 753
 754 do_test_once() {
 755     unset result
 756
 757     title "test $1"
 758     timer_reset
 759
 760     result=
 761     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 762     if ! . "$VENVDIR/bin/activate"
 763     then
 764         result=1
 765     elif [[ "$2" == "go" ]]
 766     then
 767         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 768         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 769         # We do "go install" here to catch compilation errors
 770         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 771         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 772         # compilation errors.
 773         go install -ldflags "$(go_ldflags)" "$WORKSPACE/$1" && \
 774             cd "$WORKSPACE/$1" && \
 775             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 776         then
 777             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 778             # does:
 779             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 780         else
 781             # The above form gets verbose even when testargs is
 782             # empty, so use this form in such cases:
 783             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.arvados.org/arvados.git/$1"
 784         fi
 785         result=${result:-$?}
 786         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 787         then
 788             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 789             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 790         fi
 791         [[ $result = 0 ]] && gofmt -e -d *.go
 792     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 793     then
 794         tries=0
 795         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 796         do
 797             tries=$((${tries}+1))
 798             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 799             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 800             if [[ -e "${3}activate" ]]; then
 801                 . "${3}activate"
 802             fi
 803             python setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 804             result=$?
 805             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 806             then
 807                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 808                 continue
 809             else
 810                 break
 811             fi
 812         done
 813     elif [[ "$2" != "" ]]
 814     then
 815         "test_$2"
 816     else
 817         "test_$1"
 818     fi
 819     result=${result:-$?}
 820     checkexit $result "$1 tests"
 821     title "test $1 -- `timer`"
 822     return $result
 823 }
 824
 825 check_arvados_config() {
 826     if [[ "$1" = "env" ]] ; then
 827         return
 828     fi
 829     if [[ -z "$ARVADOS_CONFIG" ]] ; then
 830         # Create config file.  The run_test_server script requires PyYAML,
 831         # so virtualenv needs to be active.  Downstream steps like
 832         # workbench install which require a valid config.yml.
 833         if [[ ! -s "$VENVDIR/bin/activate" ]] ; then
 834             install_env
 835         fi
 836         . "$VENVDIR/bin/activate"
 837         cd "$WORKSPACE"
 838         eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py setup_config)
 839         deactivate
 840     fi
 841 }
 842
 843 do_install() {
 844     if [[ -n "${skip[install]}" || ( -n "${only_install}" && "${only_install}" != "${1}" && "${only_install}" != "${2}" ) ]]; then
 845         return 0
 846     fi
 847     check_arvados_config "$1"
 848     retry do_install_once ${@}
 849 }
 850
 851 do_install_once() {
 852     title "install $1"
 853     timer_reset
 854
 855     result=
 856     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 857     if [[ "$1" != "env" ]] && ! . "$VENVDIR/bin/activate"; then
 858         result=1
 859     elif [[ "$2" == "go" ]]
 860     then
 861         go install -ldflags "$(go_ldflags)" "$WORKSPACE/$1"
 862     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 863     then
 864         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 865         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 866
 867         # Need to change to a different directory after creating
 868         # the source dist package to avoid a pip bug.
 869         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 870
 871         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 872         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 873         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 874         # install" ensures that we've actually installed the local package
 875         # we just built.
 876         cd "$WORKSPACE/$1" \
 877             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 878             && cd "$WORKSPACE" \
 879             && "${3}pip" install --no-cache-dir "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 880             && "${3}pip" install --no-cache-dir --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 881     elif [[ "$2" != "" ]]
 882     then
 883         "install_$2"
 884     else
 885         "install_$1"
 886     fi
 887     result=${result:-$?}
 888     checkexit $result "$1 install"
 889     title "install $1 -- `timer`"
 890     return $result
 891 }
 892
 893 bundle_install_trylocal() {
 894     (
 895         set -e
 896         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 897         if ! "$bundle" install --local --no-deployment; then
 898             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 899             "$bundle" install --no-deployment
 900         fi
 901         "$bundle" package
 902     )
 903 }
 904
 905 install_doc() {
 906     cd "$WORKSPACE/doc" \
 907         && bundle_install_trylocal \
 908         && rm -rf .site
 909 }
 910
 911 install_gem() {
 912     gemname=$1
 913     srcpath=$2
 914     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 915         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 916         && bundle_install_trylocal \
 917         && gem build "$gemname.gemspec" \
 918         && with_test_gemset gem install --no-document $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 919 }
 920
 921 install_sdk/ruby() {
 922     install_gem arvados sdk/ruby
 923 }
 924
 925 install_sdk/R() {
 926   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 927     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
 928        && Rscript --vanilla install_deps.R
 929   fi
 930 }
 931
 932 install_sdk/perl() {
 933     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 934         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 935         && make install INSTALLDIRS=perl
 936 }
 937
 938 install_sdk/cli() {
 939     install_gem arvados-cli sdk/cli
 940 }
 941
 942 install_services/login-sync() {
 943     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 944 }
 945
 946 install_services/api() {
 947     stop_services
 948     check_arvados_config "services/api"
 949     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 950         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
 951             || return 1
 952
 953     rm -f config/environments/test.rb
 954     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 955
 956     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 957     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 958     # is a postgresql superuser.
 959     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 960         && test_database=$("${VENVDIR}/bin/python" -c "import yaml; print yaml.safe_load(file('$ARVADOS_CONFIG'))['Clusters']['zzzzz']['PostgreSQL']['Connection']['dbname']") \
 961         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.pid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 962
 963     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 964
 965     cert="$WORKSPACE/services/api/tmp/self-signed"
 966     if [[ ! -e "$cert.pem" || "$(date -r "$cert.pem" +%s)" -lt 1512659226 ]]; then
 967         (
 968             dir="$WORKSPACE/services/api/tmp"
 969             set -ex
 970             openssl req -newkey rsa:2048 -nodes -subj '/C=US/ST=State/L=City/CN=localhost' -out "$cert.csr" -keyout "$cert.key" </dev/null
 971             openssl x509 -req -in "$cert.csr" -signkey "$cert.key" -out "$cert.pem" -days 3650 -extfile <(printf 'subjectAltName=DNS:localhost,DNS:::1,DNS:0.0.0.0,DNS:127.0.0.1,IP:::1,IP:0.0.0.0,IP:127.0.0.1')
 972         ) || return 1
 973     fi
 974
 975     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 976         && rm -rf tmp/git \
 977         && mkdir -p tmp/git \
 978         && cd tmp/git \
 979         && tar xf ../../test/test.git.tar \
 980         && mkdir -p internal.git \
 981         && git --git-dir internal.git init \
 982             || return 1
 983
 984     (
 985         set -e
 986         cd "$WORKSPACE/services/api"
 987         export RAILS_ENV=test
 988         if "$bundle" exec rails db:environment:set ; then
 989             "$bundle" exec rake db:drop
 990         fi
 991         "$bundle" exec rake db:setup
 992         "$bundle" exec rake db:fixtures:load
 993     ) || return 1
 994 }
 995
 996 declare -a pythonstuff
 997 pythonstuff=(
 998     sdk/pam
 999     sdk/python
1000     sdk/python:py3
1001     sdk/cwl
1002     sdk/cwl:py3
1003     services/dockercleaner:py3
1004     services/fuse
1005     services/fuse:py3
1006     services/nodemanager
1007     tools/crunchstat-summary
1008     tools/crunchstat-summary:py3
1009 )
1010
1011 declare -a gostuff
1012 gostuff=($(cd "$WORKSPACE" && git grep -lw func | grep \\.go | sed -e 's/\/[^\/]*$//' | sort -u))
1013
1014 install_apps/workbench() {
1015     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1016         && mkdir -p tmp/cache \
1017         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
1018         && RAILS_ENV=test RAILS_GROUPS=assets "$bundle" exec rake npm:install
1019 }
1020
1021 test_doc() {
1022     (
1023         set -e
1024         cd "$WORKSPACE/doc"
1025         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
1026         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
1027         # do much good!
1028         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ "$bundle" exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
1029     )
1030 }
1031
1032 test_gofmt() {
1033     cd "$WORKSPACE" || return 1
1034     dirs=$(ls -d */ | egrep -v 'vendor|tmp')
1035     [[ -z "$(gofmt -e -d $dirs | tee -a /dev/stderr)" ]]
1036 }
1037
1038 test_services/api() {
1039     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
1040     cd "$WORKSPACE/services/api" \
1041         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake test TESTOPTS=\'-v -d\' ${testargs[services/api]}
1042 }
1043
1044 test_sdk/ruby() {
1045     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
1046         && "$bundle" exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
1047 }
1048
1049 test_sdk/R() {
1050   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
1051     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
1052         && Rscript --vanilla run_test.R
1053   fi
1054 }
1055
1056 test_sdk/cli() {
1057     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
1058         && mkdir -p /tmp/keep \
1059         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep "$bundle" exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
1060 }
1061
1062 test_sdk/java-v2() {
1063     cd "$WORKSPACE/sdk/java-v2" && gradle test
1064 }
1065
1066 test_services/login-sync() {
1067     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
1068         && "$bundle" exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
1069 }
1070
1071 test_services/nodemanager_integration() {
1072     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
1073         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager_integration]}
1074 }
1075
1076 test_apps/workbench_units() {
1077     local TASK="test:units"
1078     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1079         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake ${TASK} TESTOPTS=\'-v -d\' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_units]}
1080 }
1081
1082 test_apps/workbench_functionals() {
1083     local TASK="test:functionals"
1084     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1085         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake ${TASK} TESTOPTS=\'-v -d\' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_functionals]}
1086 }
1087
1088 test_apps/workbench_integration() {
1089     local TASK="test:integration"
1090     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1091         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake ${TASK} TESTOPTS=\'-v -d\' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_integration]}
1092 }
1093
1094 test_apps/workbench_benchmark() {
1095     local TASK="test:benchmark"
1096     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1097         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake ${TASK} ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
1098 }
1099
1100 test_apps/workbench_profile() {
1101     local TASK="test:profile"
1102     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1103         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake ${TASK} ${testargs[apps/workbench_profile]}
1104 }
1105
1106 install_deps() {
1107     # Install parts needed by test suites
1108     do_install env
1109     do_install cmd/arvados-server go
1110     do_install sdk/cli
1111     do_install sdk/perl
1112     do_install sdk/python pip
1113     do_install sdk/python pip "${VENV3DIR}/bin/"
1114     do_install sdk/ruby
1115     do_install services/api
1116     do_install services/arv-git-httpd go
1117     do_install services/keepproxy go
1118     do_install services/keepstore go
1119     do_install services/keep-web go
1120     do_install services/ws go
1121 }
1122
1123 install_all() {
1124     do_install env
1125     do_install doc
1126     do_install sdk/ruby
1127     do_install sdk/R
1128     do_install sdk/perl
1129     do_install sdk/cli
1130     do_install services/login-sync
1131     for p in "${pythonstuff[@]}"
1132     do
1133         dir=${p%:py3}
1134         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1135             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1136                 do_install ${dir} pip
1137             fi
1138         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1139             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1140                 do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1141             fi
1142         fi
1143     done
1144     for g in "${gostuff[@]}"
1145     do
1146         do_install "$g" go
1147     done
1148     do_install services/api
1149     do_install apps/workbench
1150 }
1151
1152 test_all() {
1153     stop_services
1154     do_test services/api
1155
1156     # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
1157     # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
1158     if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
1159         rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
1160         exit_cleanly
1161     fi
1162
1163     do_test gofmt
1164     do_test doc
1165     do_test sdk/ruby
1166     do_test sdk/R
1167     do_test sdk/cli
1168     do_test services/login-sync
1169     do_test sdk/java-v2
1170     do_test services/nodemanager_integration
1171     for p in "${pythonstuff[@]}"
1172     do
1173         dir=${p%:py3}
1174         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1175             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1176                 do_test ${dir} pip
1177             fi
1178         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1179             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1180                 do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1181             fi
1182         fi
1183     done
1184
1185     for g in "${gostuff[@]}"
1186     do
1187         do_test "$g" go
1188     done
1189     do_test apps/workbench_units
1190     do_test apps/workbench_functionals
1191     do_test apps/workbench_integration
1192     do_test apps/workbench_benchmark
1193     do_test apps/workbench_profile
1194 }
1195
1196 help_interactive() {
1197     echo "== Interactive commands:"
1198     echo "TARGET                 (short for 'test DIR')"
1199     echo "test TARGET"
1200     echo "test TARGET:py3        (test with python3)"
1201     echo "test TARGET -check.vv  (pass arguments to test)"
1202     echo "install TARGET"
1203     echo "install env            (go/python libs)"
1204     echo "install deps           (go/python libs + arvados components needed for integration tests)"
1205     echo "reset                  (...services used by integration tests)"
1206     echo "exit"
1207     echo "== Test targets:"
1208     echo "${!testfuncargs[@]}" | tr ' ' '\n' | sort | column
1209 }
1210
1211 initialize
1212
1213 declare -A testfuncargs=()
1214 for g in "${gostuff[@]}"; do
1215     testfuncargs[$g]="$g go"
1216 done
1217 for p in "${pythonstuff[@]}"; do
1218     dir=${p%:py3}
1219     testfuncargs[$dir]="$dir pip $VENVDIR/bin/"
1220     testfuncargs[$dir:py3]="$dir pip $VENV3DIR/bin/"
1221 done
1222
1223 testfuncargs["sdk/cli"]="sdk/cli"
1224 testfuncargs["sdk/R"]="sdk/R"
1225 testfuncargs["sdk/java-v2"]="sdk/java-v2"
1226 testfuncargs["apps/workbench_units"]="apps/workbench_units"
1227 testfuncargs["apps/workbench_functionals"]="apps/workbench_functionals"
1228 testfuncargs["apps/workbench_integration"]="apps/workbench_integration"
1229 testfuncargs["apps/workbench_benchmark"]="apps/workbench_benchmark"
1230 testfuncargs["apps/workbench_profile"]="apps/workbench_profile"
1231
1232 if [[ -z ${interactive} ]]; then
1233     install_all
1234     test_all
1235 else
1236     skip=()
1237     only=()
1238     only_install=()
1239     if [[ -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then stop_services; fi
1240     setnextcmd() {
1241         if [[ "$TERM" = dumb ]]; then
1242             # assume emacs, or something, is offering a history buffer
1243             # and pre-populating the command will only cause trouble
1244             nextcmd=
1245         elif [[ ! -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then
1246             nextcmd="install deps"
1247         else
1248             nextcmd=""
1249         fi
1250     }
1251     echo
1252     help_interactive
1253     nextcmd="install deps"
1254     setnextcmd
1255     HISTFILE="$WORKSPACE/tmp/.history"
1256     history -r
1257     while read -p 'What next? ' -e -i "$nextcmd" nextcmd; do
1258         history -s "$nextcmd"
1259         history -w
1260         read verb target opts <<<"${nextcmd}"
1261         target="${target%/}"
1262         target="${target/\/:/:}"
1263         case "${verb}" in
1264             "exit" | "quit")
1265                 exit_cleanly
1266                 ;;
1267             "reset")
1268                 stop_services
1269                 ;;
1270             "test" | "install")
1271                 case "$target" in
1272                     "")
1273                         help_interactive
1274                         ;;
1275                     all | deps)
1276                         ${verb}_${target}
1277                         ;;
1278                     *)
1279                         testargs["$target"]="${opts}"
1280                         tt="${testfuncargs[${target}]}"
1281                         tt="${tt:-$target}"
1282                         do_$verb $tt
1283                         ;;
1284                 esac
1285                 ;;
1286             "" | "help" | *)
1287                 help_interactive
1288                 ;;
1289         esac
1290         if [[ ${#successes[@]} -gt 0 || ${#failures[@]} -gt 0 ]]; then
1291             report_outcomes
1292             successes=()
1293             failures=()
1294         fi
1295         cd "$WORKSPACE"
1296         setnextcmd
1297     done
1298     echo
1299 fi
1300 exit_cleanly