doc/_includes/_run_md5sum_py.liquid

   1 #!/usr/bin/env python
   2
   3 import arvados
   4
   5 # Automatically parallelize this job by running one task per file.
   6 arvados.job_setup.one_task_per_input_file(if_sequence=0, and_end_task=True,
   7                                           input_as_path=True)
   8
   9 # Get the input file for the task
  10 input_file = arvados.get_task_param_mount('input')
  11
  12 # Run the external 'md5sum' program on the input file
  13 stdoutdata, stderrdata = arvados.util.run_command(['md5sum', input_file])
  14
  15 # Save the standard output (stdoutdata) to "md5sum.txt" in the output collection
  16 out = arvados.CollectionWriter()
  17 with out.open('md5sum.txt') as out_file:
  18     out_file.write(stdoutdata)
  19 arvados.current_task().set_output(out.finish())