build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
   5
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin.sh
   7
   8 COLUMNS=80
   9 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
  10
  11 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
  12 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  13
  14 Exit non-zero if any tests fail.
  15
  16 Syntax:
  17         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  18
  19 Options:
  20
  21 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  22 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  23 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  24                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  25 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  26                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  27                subsequent invocations.
  28 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  29 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  30 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
  31                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  32                from a previous invocation if you use this option.
  33 --only-install Run specific install step
  34 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  35 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  36 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  37                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  38 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  39                Restrict apiserver tests to the given file
  40 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
  41                Restrict Python SDK tests to the given class
  42 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  43                Restrict Workbench tests to the given file
  44 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  45                Show all log messages, even when tests pass (also works
  46                with services/keepstore_test etc.)
  47 ARVADOS_DEBUG=1
  48                Print more debug messages
  49 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  50                *_test, and other examples shown above.
  51
  52 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
  53 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  54 test suites depend on other components being installed, and installing
  55 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  56
  57 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  58 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  59
  60 More information and background:
  61
  62 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  63
  64 Available tests:
  65
  66 apps/workbench (*)
  67 apps/workbench_units (*)
  68 apps/workbench_functionals (*)
  69 apps/workbench_integration (*)
  70 apps/workbench_benchmark
  71 apps/workbench_profile
  72 doc
  73 services/api
  74 services/arv-git-httpd
  75 services/crunchstat
  76 services/dockercleaner
  77 services/fuse
  78 services/keep-web
  79 services/keepproxy
  80 services/keepstore
  81 services/keep-balance
  82 services/login-sync
  83 services/nodemanager
  84 services/nodemanager_integration
  85 services/crunch-run
  86 services/crunch-dispatch-local
  87 services/crunch-dispatch-slurm
  88 services/ws
  89 sdk/cli
  90 sdk/pam
  91 sdk/python
  92 sdk/python:py3
  93 sdk/ruby
  94 sdk/go/arvados
  95 sdk/go/arvadosclient
  96 sdk/go/dispatch
  97 sdk/go/keepclient
  98 sdk/go/health
  99 sdk/go/httpserver
 100 sdk/go/manifest
 101 sdk/go/blockdigest
 102 sdk/go/streamer
 103 sdk/go/stats
 104 sdk/go/crunchrunner
 105 sdk/cwl
 106 tools/crunchstat-summary
 107 tools/keep-exercise
 108 tools/keep-rsync
 109 tools/keep-block-check
 110
 111 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 112     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 113
 114 EOF
 115
 116 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 117 # environment that could interfere with the tests.
 118 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 119
 120 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 121 # accident.
 122 GITDIR=
 123 GOPATH=
 124 VENVDIR=
 125 VENV3DIR=
 126 PYTHONPATH=
 127 GEMHOME=
 128 PERLINSTALLBASE=
 129
 130 short=
 131 only_install=
 132 temp=
 133 temp_preserve=
 134
 135 clear_temp() {
 136     if [[ -z "$temp" ]]; then
 137         # we didn't even get as far as making a temp dir
 138         :
 139     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 140         rm -rf "$temp"
 141     else
 142         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 143     fi
 144 }
 145
 146 fatal() {
 147     clear_temp
 148     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 149     exit 1
 150 }
 151
 152 exit_cleanly() {
 153     trap - INT
 154     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 155     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 156     stop_services
 157     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 158     report_outcomes
 159     clear_temp
 160     exit ${#failures}
 161 }
 162
 163 sanity_checks() {
 164     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 165         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 166     echo Checking dependencies:
 167     echo -n 'virtualenv: '
 168     virtualenv --version \
 169         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 170     echo -n 'ruby: '
 171     ruby -v \
 172         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 173     echo -n 'go: '
 174     go version \
 175         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 176     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 8 ]] \
 177         || fatal "Go >= 1.8 required. See http://golang.org/doc/install"
 178     echo -n 'gcc: '
 179     gcc --version | egrep ^gcc \
 180         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 181     echo -n 'fuse.h: '
 182     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 183         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 184     echo -n 'gnutls.h: '
 185     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 186         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 187     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
 188     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 189         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
 190     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 191     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 192         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 193     echo -n 'nginx: '
 194     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 195         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 196     echo -n 'perl: '
 197     perl -v | grep version \
 198         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 199     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 200         echo -n "perl $mod: "
 201         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 202             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 203     done
 204     echo -n 'gitolite: '
 205     which gitolite \
 206         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 207     echo -n 'npm: '
 208     which npm \
 209           || fatal "No npm. Try: wget -O- https://nodejs.org/dist/v6.11.2/node-v6.11.2-linux-x64.tar.xz | sudo tar -C /usr/local -xJf - && sudo ln -s ../node-v6.11.2-linux-x64/bin/{node,npm} /usr/local/bin/"
 210 }
 211
 212 rotate_logfile() {
 213   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 214   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 215   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 216     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 217     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 218     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 219   fi
 220 }
 221
 222 declare -a failures
 223 declare -A skip
 224 declare -A testargs
 225 skip[apps/workbench_profile]=1
 226
 227 while [[ -n "$1" ]]
 228 do
 229     arg="$1"; shift
 230     case "$arg" in
 231         --help)
 232             echo >&2 "$helpmessage"
 233             echo >&2
 234             exit 1
 235             ;;
 236         --skip)
 237             skip[$1]=1; shift
 238             ;;
 239         --only)
 240             only="$1"; skip[$1]=""; shift
 241             ;;
 242         --short)
 243             short=1
 244             ;;
 245         --skip-install)
 246             only_install=nothing
 247             ;;
 248         --only-install)
 249             only_install="$1"; shift
 250             ;;
 251         --temp)
 252             temp="$1"; shift
 253             temp_preserve=1
 254             ;;
 255         --leave-temp)
 256             temp_preserve=1
 257             ;;
 258         --repeat)
 259             repeat=$((${1}+0)); shift
 260             ;;
 261         --retry)
 262             retry=1
 263             ;;
 264         *_test=*)
 265             suite="${arg%%_test=*}"
 266             args="${arg#*=}"
 267             testargs["$suite"]="$args"
 268             ;;
 269         *=*)
 270             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 271             ;;
 272         *)
 273             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 274             exit 1
 275             ;;
 276     esac
 277 done
 278
 279 start_api() {
 280     echo 'Starting API server...'
 281     cd "$WORKSPACE" \
 282         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 283         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 284         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 285         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 286         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 287         && (env | egrep ^ARVADOS)
 288 }
 289
 290 start_nginx_proxy_services() {
 291     echo 'Starting keepproxy, keep-web, ws, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
 292     cd "$WORKSPACE" \
 293         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 294         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 295         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 296         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 297         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 298         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1
 299 }
 300
 301 stop_services() {
 302     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES" ]]; then
 303         unset ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 304         cd "$WORKSPACE" \
 305             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 306             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 307             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 308             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 309             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy
 310     fi
 311     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 312         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 313         cd "$WORKSPACE" \
 314             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 315             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 316             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
 317     fi
 318 }
 319
 320 interrupt() {
 321     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 322     exit_cleanly
 323 }
 324 trap interrupt INT
 325
 326 sanity_checks
 327
 328 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 329
 330 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 331     # Jenkins expects us to use this by default.
 332     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 333 fi
 334
 335 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 336 cd "$WORKSPACE"
 337 find -name '*.pyc' -delete
 338
 339 if [[ -z "$temp" ]]; then
 340     temp="$(mktemp -d)"
 341 fi
 342
 343 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 344 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
 345 do
 346     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 347         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 348     fi
 349     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 350         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 351     fi
 352 done
 353
 354 setup_ruby_environment() {
 355     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 356         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 357         using_rvm=true
 358     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 359         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 360         using_rvm=true
 361     else
 362         using_rvm=false
 363     fi
 364
 365     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 366         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 367         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 368         # the environment to the "current gemset", which would lose
 369         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 370         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 371         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 372         # rvm gemset and use it for everything.
 373
 374         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 375             || fatal 'rvm check'
 376
 377         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 378         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 379         # complaint about not being in first place already.
 380         rvm use @default 2>/dev/null
 381
 382         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 383         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 384         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 385         # ruby to the caller.
 386         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 387         rvm use "@${gemset}" --create \
 388             || fatal 'rvm gemset setup'
 389
 390         rvm env
 391     else
 392         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 393         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 394         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 395         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 396         # should be installed, and we should leave it alone.)
 397
 398         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 399             user_gempath="$(gem env gempath)"
 400             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 401         fi
 402         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 403
 404         # When we build and install our own gems, we install them in our
 405         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 406         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 407         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 408
 409         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 410         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 411         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
 412
 413         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 414         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 415         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 416     fi
 417     bundle config || gem install bundler \
 418         || fatal 'install bundler'
 419 }
 420
 421 with_test_gemset() {
 422     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 423         "$@"
 424     else
 425         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 426     fi
 427 }
 428
 429 gem_uninstall_if_exists() {
 430     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 431         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 432     fi
 433 }
 434
 435 setup_virtualenv() {
 436     local venvdest="$1"; shift
 437     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 438         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 439     fi
 440     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 441         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 442         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 443     else
 444         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 445     fi
 446     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 447     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 448 }
 449
 450 export PERLINSTALLBASE
 451 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
 452
 453 export GOPATH
 454 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 455 ln -sfT "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
 456     || fatal "symlink failed"
 457 go get -v github.com/kardianos/govendor \
 458     || fatal "govendor install failed"
 459
 460 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 461 . "$VENVDIR/bin/activate"
 462
 463 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 464 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
 465     || pip install PyYAML >/dev/null \
 466     || fatal "pip install PyYAML failed"
 467
 468 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
 469 # won't pick it up by default.
 470 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 471     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
 472     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 473
 474 # We need an unreleased (as of 2017-08-17) llfuse bugfix, otherwise our fuse test suite deadlocks.
 475 pip freeze | grep -x llfuse==1.2.0 || (
 476     set -e
 477     yes | pip uninstall llfuse || true
 478     cython --version || fatal "no cython; try sudo apt-get install cython"
 479     cd "$temp"
 480     (cd python-llfuse || git clone https://github.com/curoverse/python-llfuse)
 481     cd python-llfuse
 482     git checkout 620722fd990ea642ddb8e7412676af482c090c0c
 483     git checkout setup.py
 484     sed -i -e "s:'1\\.2':'1.2.0':" setup.py
 485     python setup.py build_cython
 486     python setup.py install --force
 487 ) || fatal "llfuse fork failed"
 488 pip freeze | grep -x llfuse==1.2.0 || fatal "error: installed llfuse 1.2.0 but '$(pip freeze | grep llfuse)' ???"
 489
 490 # Deactivate Python 2 virtualenv
 491 deactivate
 492
 493 declare -a pythonstuff
 494 pythonstuff=(
 495     sdk/pam
 496     sdk/python
 497     sdk/python:py3
 498     sdk/cwl
 499     services/dockercleaner:py3
 500     services/fuse
 501     services/nodemanager
 502     tools/crunchstat-summary
 503     )
 504
 505 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 506 # Otherwise, skip dependent tests.
 507 PYTHON3=$(which python3)
 508 if [[ ${?} = 0 ]]; then
 509     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 510 else
 511     PYTHON3=
 512     cat >&2 <<EOF
 513
 514 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
 515
 516 EOF
 517 fi
 518
 519 # Reactivate Python 2 virtualenv
 520 . "$VENVDIR/bin/activate"
 521
 522 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 523 # whine a lot.
 524 setup_ruby_environment
 525
 526 echo "PATH is $PATH"
 527
 528 if ! which bundler >/dev/null
 529 then
 530     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 531 fi
 532
 533 retry() {
 534     remain="${repeat}"
 535     while :
 536     do
 537         if ${@}; then
 538             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 539                 remain=$((${remain}-1))
 540                 title "Repeating ${remain} more times"
 541             else
 542                 break
 543             fi
 544         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 545             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 546             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 547             then
 548                 break
 549             fi
 550         else
 551             break
 552         fi
 553     done
 554 }
 555
 556 do_test() {
 557     case "${1}" in
 558         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 559             suite=apps/workbench
 560             ;;
 561         services/nodemanager | services/nodemanager_integration)
 562             suite=services/nodemanager_suite
 563             ;;
 564         *)
 565             suite="${1}"
 566             ;;
 567     esac
 568     if [[ -z "${skip[$suite]}" && -z "${skip[$1]}" && \
 569                 (-z "${only}" || "${only}" == "${suite}" || \
 570                  "${only}" == "${1}") ]]; then
 571         retry do_test_once ${@}
 572     else
 573         title "Skipping ${1} tests"
 574     fi
 575 }
 576
 577 do_test_once() {
 578     unset result
 579
 580     title "Running $1 tests"
 581     timer_reset
 582     if [[ "$2" == "go" ]]
 583     then
 584         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 585         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 586         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 587         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 588         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 589         # compilation errors.
 590         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 591             cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 592             [[ -z "$(gofmt -e -d . | tee /dev/stderr)" ]] && \
 593             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 594         then
 595             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 596             # does:
 597             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 598         else
 599             # The above form gets verbose even when testargs is
 600             # empty, so use this form in such cases:
 601             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 602         fi
 603         result=${result:-$?}
 604         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 605         then
 606             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 607             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 608         fi
 609     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 610     then
 611         tries=0
 612         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 613         do
 614             tries=$((${tries}+1))
 615             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 616             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 617             "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 618             result=$?
 619             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 620             then
 621                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 622                 continue
 623             else
 624                 break
 625             fi
 626         done
 627     elif [[ "$2" != "" ]]
 628     then
 629         "test_$2"
 630     else
 631         "test_$1"
 632     fi
 633     result=${result:-$?}
 634     checkexit $result "$1 tests"
 635     title "End of $1 tests (`timer`)"
 636     return $result
 637 }
 638
 639 do_install() {
 640     if [[ -z "${only_install}" || "${only_install}" == "${1}" ]]; then
 641         retry do_install_once ${@}
 642     else
 643         title "Skipping $1 install"
 644     fi
 645 }
 646
 647 do_install_once() {
 648     title "Running $1 install"
 649     timer_reset
 650     if [[ "$2" == "go" ]]
 651     then
 652         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 653     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 654     then
 655         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 656         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 657
 658         # Need to change to a different directory after creating
 659         # the source dist package to avoid a pip bug.
 660         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 661
 662         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 663         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 664         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 665         # install" ensures that we've actually installed the local package
 666         # we just built.
 667         cd "$WORKSPACE/$1" \
 668             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 669             && cd "$WORKSPACE" \
 670             && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 671             && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 672     elif [[ "$2" != "" ]]
 673     then
 674         "install_$2"
 675     else
 676         "install_$1"
 677     fi
 678     result=$?
 679     checkexit $result "$1 install"
 680     title "End of $1 install (`timer`)"
 681     return $result
 682 }
 683
 684 bundle_install_trylocal() {
 685     (
 686         set -e
 687         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 688         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 689             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 690             bundle install --no-deployment
 691         fi
 692         bundle package --all
 693     )
 694 }
 695
 696 install_doc() {
 697     cd "$WORKSPACE/doc" \
 698         && bundle_install_trylocal \
 699         && rm -rf .site
 700 }
 701 do_install doc
 702
 703 install_gem() {
 704     gemname=$1
 705     srcpath=$2
 706     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 707         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 708         && bundle_install_trylocal \
 709         && gem build "$gemname.gemspec" \
 710         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 711 }
 712
 713 install_ruby_sdk() {
 714     install_gem arvados sdk/ruby
 715 }
 716 do_install sdk/ruby ruby_sdk
 717
 718 install_perl_sdk() {
 719     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 720         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 721         && make install INSTALLDIRS=perl
 722 }
 723 do_install sdk/perl perl_sdk
 724
 725 install_cli() {
 726     install_gem arvados-cli sdk/cli
 727 }
 728 do_install sdk/cli cli
 729
 730 install_login-sync() {
 731     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 732 }
 733 do_install services/login-sync login-sync
 734
 735 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
 736 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
 737 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
 738 # its own test suite brings up some of those other programs (like
 739 # keepproxy).
 740 for p in "${pythonstuff[@]}"
 741 do
 742     dir=${p%:py3}
 743     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
 744         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
 745             do_install ${dir} pip
 746         fi
 747     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
 748         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
 749             do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
 750         fi
 751     fi
 752 done
 753
 754 install_apiserver() {
 755     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 756         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 757
 758     rm -f config/environments/test.rb
 759     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 760
 761     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 762     then
 763         for f in database.yml
 764         do
 765             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 766         done
 767     fi
 768
 769     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 770     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 771     # is a postgresql superuser.
 772     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 773         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 774         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 775
 776     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 777
 778     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 779         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 780         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 781         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 782 }
 783 do_install services/api apiserver
 784
 785 cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" && \
 786     "$GOPATH/bin/govendor" sync -v || \
 787         fatal "govendor sync failed"
 788 declare -a gostuff
 789 gostuff=(
 790     sdk/go/arvados
 791     sdk/go/arvadosclient
 792     sdk/go/blockdigest
 793     sdk/go/dispatch
 794     sdk/go/health
 795     sdk/go/httpserver
 796     sdk/go/manifest
 797     sdk/go/streamer
 798     sdk/go/crunchrunner
 799     sdk/go/stats
 800     lib/crunchstat
 801     services/arv-git-httpd
 802     services/crunchstat
 803     services/keep-web
 804     services/keepstore
 805     sdk/go/keepclient
 806     services/keep-balance
 807     services/keepproxy
 808     services/crunch-dispatch-local
 809     services/crunch-dispatch-slurm
 810     services/crunch-run
 811     services/ws
 812     tools/keep-block-check
 813     tools/keep-exercise
 814     tools/keep-rsync
 815 )
 816 for g in "${gostuff[@]}"
 817 do
 818     do_install "$g" go
 819 done
 820
 821 install_workbench() {
 822     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 823         && mkdir -p tmp/cache \
 824         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
 825         && RAILS_ENV=test RAILS_GROUPS=assets bundle exec rake npm:install
 826 }
 827 do_install apps/workbench workbench
 828
 829 unset http_proxy https_proxy no_proxy
 830
 831 test_doclinkchecker() {
 832     (
 833         set -e
 834         cd "$WORKSPACE/doc"
 835         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
 836         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
 837         # do much good!
 838         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
 839     )
 840 }
 841 do_test doc doclinkchecker
 842
 843 stop_services
 844
 845 test_apiserver() {
 846     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
 847     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 848         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
 849 }
 850 do_test services/api apiserver
 851
 852 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
 853 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
 854 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
 855   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 856   exit_cleanly
 857 fi
 858
 859 start_api || { stop_services; fatal "start_api"; }
 860
 861 test_ruby_sdk() {
 862     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
 863         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
 864 }
 865 do_test sdk/ruby ruby_sdk
 866
 867 test_cli() {
 868     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
 869         && mkdir -p /tmp/keep \
 870         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
 871 }
 872 do_test sdk/cli cli
 873
 874 test_login-sync() {
 875     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
 876         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
 877 }
 878 do_test services/login-sync login-sync
 879
 880 test_nodemanager_integration() {
 881     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
 882         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager_integration]}
 883 }
 884 do_test services/nodemanager_integration nodemanager_integration
 885
 886 for p in "${pythonstuff[@]}"
 887 do
 888     dir=${p%:py3}
 889     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
 890         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
 891             do_test ${dir} pip
 892         fi
 893     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
 894         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
 895             do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
 896         fi
 897     fi
 898 done
 899
 900 for g in "${gostuff[@]}"
 901 do
 902     do_test "$g" go
 903 done
 904
 905 test_workbench_units() {
 906     start_nginx_proxy_services \
 907         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 908         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 909 }
 910 do_test apps/workbench_units workbench_units
 911
 912 test_workbench_functionals() {
 913     start_nginx_proxy_services \
 914         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 915         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 916 }
 917 do_test apps/workbench_functionals workbench_functionals
 918
 919 test_workbench_integration() {
 920     start_nginx_proxy_services \
 921         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 922         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 923 }
 924 do_test apps/workbench_integration workbench_integration
 925
 926
 927 test_workbench_benchmark() {
 928     start_nginx_proxy_services \
 929         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 930         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
 931 }
 932 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
 933
 934 test_workbench_profile() {
 935     start_nginx_proxy_services \
 936         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 937         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
 938 }
 939 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
 940
 941 exit_cleanly