build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
   5
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin.sh
   7
   8 COLUMNS=80
   9 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
  10
  11 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
  12 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  13
  14 Exit non-zero if any tests fail.
  15
  16 Syntax:
  17         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  18
  19 Options:
  20
  21 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  22 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  23 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  24                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  25 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  26                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  27                subsequent invocations.
  28 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  29 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  30 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
  31                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  32                from a previous invocation if you use this option.
  33 --only-install Run specific install step
  34 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  35 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  36 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  37                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  38 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  39                Restrict apiserver tests to the given file
  40 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
  41                Restrict Python SDK tests to the given class
  42 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  43                Restrict Workbench tests to the given file
  44 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  45                Show all log messages, even when tests pass (also works
  46                with services/keepstore_test etc.)
  47 ARVADOS_DEBUG=1
  48                Print more debug messages
  49 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  50                *_test, and other examples shown above.
  51
  52 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
  53 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  54 test suites depend on other components being installed, and installing
  55 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  56
  57 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  58 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  59
  60 More information and background:
  61
  62 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  63
  64 Available tests:
  65
  66 apps/workbench (*)
  67 apps/workbench_units (*)
  68 apps/workbench_functionals (*)
  69 apps/workbench_integration (*)
  70 apps/workbench_benchmark
  71 apps/workbench_profile
  72 doc
  73 services/api
  74 services/arv-git-httpd
  75 services/crunchstat
  76 services/dockercleaner
  77 services/fuse
  78 services/keep-web
  79 services/keepproxy
  80 services/keepstore
  81 services/keep-balance
  82 services/login-sync
  83 services/nodemanager
  84 services/nodemanager_integration
  85 services/crunch-run
  86 services/crunch-dispatch-local
  87 services/crunch-dispatch-slurm
  88 services/ws
  89 sdk/cli
  90 sdk/pam
  91 sdk/python
  92 sdk/python:py3
  93 sdk/ruby
  94 sdk/go/arvados
  95 sdk/go/arvadosclient
  96 sdk/go/dispatch
  97 sdk/go/keepclient
  98 sdk/go/health
  99 sdk/go/httpserver
 100 sdk/go/manifest
 101 sdk/go/blockdigest
 102 sdk/go/streamer
 103 sdk/go/stats
 104 sdk/go/crunchrunner
 105 sdk/cwl
 106 tools/crunchstat-summary
 107 tools/keep-exercise
 108 tools/keep-rsync
 109 tools/keep-block-check
 110
 111 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 112     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 113
 114 EOF
 115
 116 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 117 # environment that could interfere with the tests.
 118 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 119
 120 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 121 # accident.
 122 GITDIR=
 123 GOPATH=
 124 VENVDIR=
 125 VENV3DIR=
 126 PYTHONPATH=
 127 GEMHOME=
 128 PERLINSTALLBASE=
 129
 130 short=
 131 only_install=
 132 temp=
 133 temp_preserve=
 134
 135 clear_temp() {
 136     if [[ -z "$temp" ]]; then
 137         # we didn't even get as far as making a temp dir
 138         :
 139     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 140         rm -rf "$temp"
 141     else
 142         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 143     fi
 144 }
 145
 146 fatal() {
 147     clear_temp
 148     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 149     exit 1
 150 }
 151
 152 exit_cleanly() {
 153     trap - INT
 154     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 155     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 156     stop_services
 157     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 158     report_outcomes
 159     clear_temp
 160     exit ${#failures}
 161 }
 162
 163 sanity_checks() {
 164     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 165         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 166     echo Checking dependencies:
 167     echo -n 'virtualenv: '
 168     virtualenv --version \
 169         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 170     echo -n 'ruby: '
 171     ruby -v \
 172         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 173     echo -n 'go: '
 174     go version \
 175         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 176     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 8 ]] \
 177         || fatal "Go >= 1.8 required. See http://golang.org/doc/install"
 178     echo -n 'gcc: '
 179     gcc --version | egrep ^gcc \
 180         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 181     echo -n 'fuse.h: '
 182     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 183         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 184     echo -n 'gnutls.h: '
 185     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 186         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 187     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
 188     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 189         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
 190     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 191     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 192         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 193     echo -n 'nginx: '
 194     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 195         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 196     echo -n 'perl: '
 197     perl -v | grep version \
 198         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 199     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 200         echo -n "perl $mod: "
 201         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 202             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 203     done
 204     echo -n 'gitolite: '
 205     which gitolite \
 206         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 207     echo -n 'npm: '
 208     npm --version \
 209         || fatal "No npm. Try: wget -O- https://nodejs.org/dist/v6.11.2/node-v6.11.2-linux-x64.tar.xz | sudo tar -C /usr/local -xJf - && sudo ln -s ../node-v6.11.2-linux-x64/bin/{node,npm} /usr/local/bin/"
 210     echo -n 'cadaver: '
 211     cadaver --version | grep -w cadaver \
 212           || fatal "No cadaver. Try: apt-get install cadaver"
 213 }
 214
 215 rotate_logfile() {
 216   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 217   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 218   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 219     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 220     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 221     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 222   fi
 223 }
 224
 225 declare -a failures
 226 declare -A skip
 227 declare -A testargs
 228 skip[apps/workbench_profile]=1
 229
 230 while [[ -n "$1" ]]
 231 do
 232     arg="$1"; shift
 233     case "$arg" in
 234         --help)
 235             echo >&2 "$helpmessage"
 236             echo >&2
 237             exit 1
 238             ;;
 239         --skip)
 240             skip[$1]=1; shift
 241             ;;
 242         --only)
 243             only="$1"; skip[$1]=""; shift
 244             ;;
 245         --short)
 246             short=1
 247             ;;
 248         --skip-install)
 249             only_install=nothing
 250             ;;
 251         --only-install)
 252             only_install="$1"; shift
 253             ;;
 254         --temp)
 255             temp="$1"; shift
 256             temp_preserve=1
 257             ;;
 258         --leave-temp)
 259             temp_preserve=1
 260             ;;
 261         --repeat)
 262             repeat=$((${1}+0)); shift
 263             ;;
 264         --retry)
 265             retry=1
 266             ;;
 267         *_test=*)
 268             suite="${arg%%_test=*}"
 269             args="${arg#*=}"
 270             testargs["$suite"]="$args"
 271             ;;
 272         *=*)
 273             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 274             ;;
 275         *)
 276             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 277             exit 1
 278             ;;
 279     esac
 280 done
 281
 282 start_api() {
 283     echo 'Starting API server...'
 284     cd "$WORKSPACE" \
 285         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 286         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 287         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 288         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 289         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 290         && (env | egrep ^ARVADOS)
 291 }
 292
 293 start_nginx_proxy_services() {
 294     echo 'Starting keepproxy, keep-web, ws, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
 295     cd "$WORKSPACE" \
 296         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 297         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 298         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 299         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 300         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 301         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1
 302 }
 303
 304 stop_services() {
 305     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES" ]]; then
 306         unset ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 307         cd "$WORKSPACE" \
 308             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 309             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 310             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 311             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 312             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy
 313     fi
 314     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 315         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 316         cd "$WORKSPACE" \
 317             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 318             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 319             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
 320     fi
 321 }
 322
 323 interrupt() {
 324     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 325     exit_cleanly
 326 }
 327 trap interrupt INT
 328
 329 sanity_checks
 330
 331 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 332
 333 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 334     # Jenkins expects us to use this by default.
 335     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 336 fi
 337
 338 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 339 cd "$WORKSPACE"
 340 find -name '*.pyc' -delete
 341
 342 if [[ -z "$temp" ]]; then
 343     temp="$(mktemp -d)"
 344 fi
 345
 346 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 347 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
 348 do
 349     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 350         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 351     fi
 352     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 353         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 354     fi
 355 done
 356
 357 setup_ruby_environment() {
 358     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 359         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 360         using_rvm=true
 361     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 362         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 363         using_rvm=true
 364     else
 365         using_rvm=false
 366     fi
 367
 368     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 369         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 370         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 371         # the environment to the "current gemset", which would lose
 372         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 373         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 374         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 375         # rvm gemset and use it for everything.
 376
 377         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 378             || fatal 'rvm check'
 379
 380         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 381         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 382         # complaint about not being in first place already.
 383         rvm use @default 2>/dev/null
 384
 385         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 386         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 387         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 388         # ruby to the caller.
 389         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 390         rvm use "@${gemset}" --create \
 391             || fatal 'rvm gemset setup'
 392
 393         rvm env
 394     else
 395         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 396         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 397         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 398         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 399         # should be installed, and we should leave it alone.)
 400
 401         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 402             user_gempath="$(gem env gempath)"
 403             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 404         fi
 405         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 406
 407         # When we build and install our own gems, we install them in our
 408         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 409         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 410         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 411
 412         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 413         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 414         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
 415
 416         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 417         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 418         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 419     fi
 420     bundle config || gem install bundler \
 421         || fatal 'install bundler'
 422 }
 423
 424 with_test_gemset() {
 425     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 426         "$@"
 427     else
 428         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 429     fi
 430 }
 431
 432 gem_uninstall_if_exists() {
 433     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 434         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 435     fi
 436 }
 437
 438 setup_virtualenv() {
 439     local venvdest="$1"; shift
 440     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 441         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 442     fi
 443     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 444         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 445         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 446     else
 447         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 448     fi
 449     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 450     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 451 }
 452
 453 export PERLINSTALLBASE
 454 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
 455
 456 export GOPATH
 457 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 458 ln -sfT "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
 459     || fatal "symlink failed"
 460 go get -v github.com/kardianos/govendor \
 461     || fatal "govendor install failed"
 462
 463 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 464 . "$VENVDIR/bin/activate"
 465
 466 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 467 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
 468     || pip install PyYAML >/dev/null \
 469     || fatal "pip install PyYAML failed"
 470
 471 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
 472 # won't pick it up by default.
 473 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 474     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
 475     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 476
 477 # We need an unreleased (as of 2017-08-17) llfuse bugfix, otherwise our fuse test suite deadlocks.
 478 pip freeze | grep -x llfuse==1.2.0 || (
 479     set -e
 480     yes | pip uninstall llfuse || true
 481     cython --version || fatal "no cython; try sudo apt-get install cython"
 482     cd "$temp"
 483     (cd python-llfuse 2>/dev/null || git clone https://github.com/curoverse/python-llfuse)
 484     cd python-llfuse
 485     git checkout 620722fd990ea642ddb8e7412676af482c090c0c
 486     git checkout setup.py
 487     sed -i -e "s:'1\\.2':'1.2.0':" setup.py
 488     python setup.py build_cython
 489     python setup.py install --force
 490 ) || fatal "llfuse fork failed"
 491 pip freeze | grep -x llfuse==1.2.0 || fatal "error: installed llfuse 1.2.0 but '$(pip freeze | grep llfuse)' ???"
 492
 493 # Deactivate Python 2 virtualenv
 494 deactivate
 495
 496 declare -a pythonstuff
 497 pythonstuff=(
 498     sdk/pam
 499     sdk/python
 500     sdk/python:py3
 501     sdk/cwl
 502     services/dockercleaner:py3
 503     services/fuse
 504     services/nodemanager
 505     tools/crunchstat-summary
 506     )
 507
 508 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 509 # Otherwise, skip dependent tests.
 510 PYTHON3=$(which python3)
 511 if [[ ${?} = 0 ]]; then
 512     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 513 else
 514     PYTHON3=
 515     cat >&2 <<EOF
 516
 517 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
 518
 519 EOF
 520 fi
 521
 522 # Reactivate Python 2 virtualenv
 523 . "$VENVDIR/bin/activate"
 524
 525 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 526 # whine a lot.
 527 setup_ruby_environment
 528
 529 echo "PATH is $PATH"
 530
 531 if ! which bundler >/dev/null
 532 then
 533     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 534 fi
 535
 536 retry() {
 537     remain="${repeat}"
 538     while :
 539     do
 540         if ${@}; then
 541             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 542                 remain=$((${remain}-1))
 543                 title "Repeating ${remain} more times"
 544             else
 545                 break
 546             fi
 547         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 548             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 549             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 550             then
 551                 break
 552             fi
 553         else
 554             break
 555         fi
 556     done
 557 }
 558
 559 do_test() {
 560     case "${1}" in
 561         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 562             suite=apps/workbench
 563             ;;
 564         services/nodemanager | services/nodemanager_integration)
 565             suite=services/nodemanager_suite
 566             ;;
 567         *)
 568             suite="${1}"
 569             ;;
 570     esac
 571     if [[ -z "${skip[$suite]}" && -z "${skip[$1]}" && \
 572                 (-z "${only}" || "${only}" == "${suite}" || \
 573                  "${only}" == "${1}") ]]; then
 574         retry do_test_once ${@}
 575     else
 576         title "Skipping ${1} tests"
 577     fi
 578 }
 579
 580 do_test_once() {
 581     unset result
 582
 583     title "Running $1 tests"
 584     timer_reset
 585     if [[ "$2" == "go" ]]
 586     then
 587         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 588         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 589         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 590         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 591         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 592         # compilation errors.
 593         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 594             cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 595             [[ -z "$(gofmt -e -d . | tee /dev/stderr)" ]] && \
 596             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 597         then
 598             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 599             # does:
 600             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 601         else
 602             # The above form gets verbose even when testargs is
 603             # empty, so use this form in such cases:
 604             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 605         fi
 606         result=${result:-$?}
 607         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 608         then
 609             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 610             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 611         fi
 612     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 613     then
 614         tries=0
 615         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 616         do
 617             tries=$((${tries}+1))
 618             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 619             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 620             "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 621             result=$?
 622             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 623             then
 624                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 625                 continue
 626             else
 627                 break
 628             fi
 629         done
 630     elif [[ "$2" != "" ]]
 631     then
 632         "test_$2"
 633     else
 634         "test_$1"
 635     fi
 636     result=${result:-$?}
 637     checkexit $result "$1 tests"
 638     title "End of $1 tests (`timer`)"
 639     return $result
 640 }
 641
 642 do_install() {
 643     if [[ -z "${only_install}" || "${only_install}" == "${1}" ]]; then
 644         retry do_install_once ${@}
 645     else
 646         title "Skipping $1 install"
 647     fi
 648 }
 649
 650 do_install_once() {
 651     title "Running $1 install"
 652     timer_reset
 653     if [[ "$2" == "go" ]]
 654     then
 655         go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 656     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 657     then
 658         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 659         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 660
 661         # Need to change to a different directory after creating
 662         # the source dist package to avoid a pip bug.
 663         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 664
 665         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 666         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 667         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 668         # install" ensures that we've actually installed the local package
 669         # we just built.
 670         cd "$WORKSPACE/$1" \
 671             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 672             && cd "$WORKSPACE" \
 673             && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 674             && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 675     elif [[ "$2" != "" ]]
 676     then
 677         "install_$2"
 678     else
 679         "install_$1"
 680     fi
 681     result=$?
 682     checkexit $result "$1 install"
 683     title "End of $1 install (`timer`)"
 684     return $result
 685 }
 686
 687 bundle_install_trylocal() {
 688     (
 689         set -e
 690         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 691         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 692             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 693             bundle install --no-deployment
 694         fi
 695         bundle package --all
 696     )
 697 }
 698
 699 install_doc() {
 700     cd "$WORKSPACE/doc" \
 701         && bundle_install_trylocal \
 702         && rm -rf .site
 703 }
 704 do_install doc
 705
 706 install_gem() {
 707     gemname=$1
 708     srcpath=$2
 709     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 710         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 711         && bundle_install_trylocal \
 712         && gem build "$gemname.gemspec" \
 713         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 714 }
 715
 716 install_ruby_sdk() {
 717     install_gem arvados sdk/ruby
 718 }
 719 do_install sdk/ruby ruby_sdk
 720
 721 install_perl_sdk() {
 722     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 723         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 724         && make install INSTALLDIRS=perl
 725 }
 726 do_install sdk/perl perl_sdk
 727
 728 install_cli() {
 729     install_gem arvados-cli sdk/cli
 730 }
 731 do_install sdk/cli cli
 732
 733 install_login-sync() {
 734     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 735 }
 736 do_install services/login-sync login-sync
 737
 738 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
 739 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
 740 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
 741 # its own test suite brings up some of those other programs (like
 742 # keepproxy).
 743 for p in "${pythonstuff[@]}"
 744 do
 745     dir=${p%:py3}
 746     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
 747         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
 748             do_install ${dir} pip
 749         fi
 750     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
 751         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
 752             do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
 753         fi
 754     fi
 755 done
 756
 757 install_apiserver() {
 758     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 759         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 760
 761     rm -f config/environments/test.rb
 762     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 763
 764     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 765     then
 766         for f in database.yml
 767         do
 768             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 769         done
 770     fi
 771
 772     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 773     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 774     # is a postgresql superuser.
 775     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 776         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 777         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 778
 779     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 780
 781     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 782         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 783         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 784         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 785 }
 786 do_install services/api apiserver
 787
 788 cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" && \
 789     "$GOPATH/bin/govendor" sync -v || \
 790         fatal "govendor sync failed"
 791 declare -a gostuff
 792 gostuff=(
 793     sdk/go/arvados
 794     sdk/go/arvadosclient
 795     sdk/go/blockdigest
 796     sdk/go/dispatch
 797     sdk/go/health
 798     sdk/go/httpserver
 799     sdk/go/manifest
 800     sdk/go/streamer
 801     sdk/go/crunchrunner
 802     sdk/go/stats
 803     lib/crunchstat
 804     services/arv-git-httpd
 805     services/crunchstat
 806     services/keep-web
 807     services/keepstore
 808     sdk/go/keepclient
 809     services/keep-balance
 810     services/keepproxy
 811     services/crunch-dispatch-local
 812     services/crunch-dispatch-slurm
 813     services/crunch-run
 814     services/ws
 815     tools/keep-block-check
 816     tools/keep-exercise
 817     tools/keep-rsync
 818 )
 819 for g in "${gostuff[@]}"
 820 do
 821     do_install "$g" go
 822 done
 823
 824 install_workbench() {
 825     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 826         && mkdir -p tmp/cache \
 827         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
 828         && RAILS_ENV=test RAILS_GROUPS=assets bundle exec rake npm:install
 829 }
 830 do_install apps/workbench workbench
 831
 832 unset http_proxy https_proxy no_proxy
 833
 834 test_doclinkchecker() {
 835     (
 836         set -e
 837         cd "$WORKSPACE/doc"
 838         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
 839         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
 840         # do much good!
 841         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
 842     )
 843 }
 844 do_test doc doclinkchecker
 845
 846 stop_services
 847
 848 test_apiserver() {
 849     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
 850     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 851         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
 852 }
 853 do_test services/api apiserver
 854
 855 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
 856 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
 857 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
 858   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 859   exit_cleanly
 860 fi
 861
 862 start_api || { stop_services; fatal "start_api"; }
 863
 864 test_ruby_sdk() {
 865     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
 866         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
 867 }
 868 do_test sdk/ruby ruby_sdk
 869
 870 test_cli() {
 871     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
 872         && mkdir -p /tmp/keep \
 873         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
 874 }
 875 do_test sdk/cli cli
 876
 877 test_login-sync() {
 878     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
 879         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
 880 }
 881 do_test services/login-sync login-sync
 882
 883 test_nodemanager_integration() {
 884     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
 885         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager_integration]}
 886 }
 887 do_test services/nodemanager_integration nodemanager_integration
 888
 889 for p in "${pythonstuff[@]}"
 890 do
 891     dir=${p%:py3}
 892     if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
 893         if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
 894             do_test ${dir} pip
 895         fi
 896     elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
 897         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
 898             do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
 899         fi
 900     fi
 901 done
 902
 903 for g in "${gostuff[@]}"
 904 do
 905     do_test "$g" go
 906 done
 907
 908 test_workbench_units() {
 909     start_nginx_proxy_services \
 910         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 911         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 912 }
 913 do_test apps/workbench_units workbench_units
 914
 915 test_workbench_functionals() {
 916     start_nginx_proxy_services \
 917         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 918         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 919 }
 920 do_test apps/workbench_functionals workbench_functionals
 921
 922 test_workbench_integration() {
 923     start_nginx_proxy_services \
 924         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 925         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 926 }
 927 do_test apps/workbench_integration workbench_integration
 928
 929
 930 test_workbench_benchmark() {
 931     start_nginx_proxy_services \
 932         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 933         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
 934 }
 935 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
 936
 937 test_workbench_profile() {
 938     start_nginx_proxy_services \
 939         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 940         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
 941 }
 942 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
 943
 944 exit_cleanly