build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
   5
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin.sh
   7
   8 COLUMNS=80
   9 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
  10
  11 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
  12 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  13
  14 Exit non-zero if any tests fail.
  15
  16 Syntax:
  17         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  18
  19 Options:
  20
  21 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  22 --skip sanity  Skip initial dev environment sanity checks.
  23 --skip install Do not run any install steps. Just run tests.
  24                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  25                from a previous invocation if you use this option.
  26 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  27 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  28                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  29 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  30                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  31                subsequent invocations.
  32 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  33 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  34 --only-install Run specific install step
  35 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  36 --interactive  Set up, then prompt for test/install steps to perform.
  37 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  38 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  39                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  40 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  41                Restrict apiserver tests to the given file
  42 sdk/python_test="--test-suite tests.test_keep_locator"
  43                Restrict Python SDK tests to the given class
  44 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  45                Restrict Workbench tests to the given file
  46 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  47                Show all log messages, even when tests pass (also works
  48                with services/keepstore_test etc.)
  49 ARVADOS_DEBUG=1
  50                Print more debug messages
  51 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  52                *_test, and other examples shown above.
  53
  54 Assuming "--skip install" is not given, all components are installed
  55 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  56 test suites depend on other components being installed, and installing
  57 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  58
  59 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  60 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  61
  62 More information and background:
  63
  64 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  65
  66 Available tests:
  67
  68 apps/workbench (*)
  69 apps/workbench_units (*)
  70 apps/workbench_functionals (*)
  71 apps/workbench_integration (*)
  72 apps/workbench_benchmark
  73 apps/workbench_profile
  74 cmd/arvados-client
  75 cmd/arvados-server
  76 doc
  77 lib/cli
  78 lib/cmd
  79 lib/controller
  80 lib/crunchstat
  81 lib/cloud
  82 lib/cloud/azure
  83 lib/dispatchcloud
  84 lib/dispatchcloud/container
  85 lib/dispatchcloud/scheduler
  86 lib/dispatchcloud/ssh_executor
  87 lib/dispatchcloud/worker
  88 lib/service
  89 services/api
  90 services/arv-git-httpd
  91 services/crunchstat
  92 services/dockercleaner
  93 services/fuse
  94 services/fuse:py3
  95 services/health
  96 services/keep-web
  97 services/keepproxy
  98 services/keepstore
  99 services/keep-balance
 100 services/login-sync
 101 services/nodemanager
 102 services/nodemanager_integration
 103 services/crunch-run
 104 services/crunch-dispatch-local
 105 services/crunch-dispatch-slurm
 106 services/ws
 107 sdk/cli
 108 sdk/pam
 109 sdk/pam:py3
 110 sdk/python
 111 sdk/python:py3
 112 sdk/ruby
 113 sdk/go/arvados
 114 sdk/go/arvadosclient
 115 sdk/go/auth
 116 sdk/go/dispatch
 117 sdk/go/keepclient
 118 sdk/go/health
 119 sdk/go/httpserver
 120 sdk/go/manifest
 121 sdk/go/blockdigest
 122 sdk/go/asyncbuf
 123 sdk/go/stats
 124 sdk/go/crunchrunner
 125 sdk/cwl
 126 sdk/R
 127 sdk/java-v2
 128 tools/sync-groups
 129 tools/crunchstat-summary
 130 tools/crunchstat-summary:py3
 131 tools/keep-exercise
 132 tools/keep-rsync
 133 tools/keep-block-check
 134
 135 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 136     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 137
 138 EOF
 139
 140 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 141 # environment that could interfere with the tests.
 142 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 143
 144 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 145 # accident.
 146 GITDIR=
 147 GOPATH=
 148 VENVDIR=
 149 VENV3DIR=
 150 PYTHONPATH=
 151 GEMHOME=
 152 PERLINSTALLBASE=
 153 R_LIBS=
 154 export LANG=en_US.UTF-8
 155
 156 short=
 157 only_install=
 158 temp=
 159 temp_preserve=
 160
 161 clear_temp() {
 162     if [[ -z "$temp" ]]; then
 163         # we didn't even get as far as making a temp dir
 164         :
 165     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 166         rm -rf "$temp"
 167     else
 168         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 169     fi
 170 }
 171
 172 fatal() {
 173     clear_temp
 174     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 175     exit 1
 176 }
 177
 178 exit_cleanly() {
 179     trap - INT
 180     if which create-plot-data-from-log.sh >/dev/null; then
 181         create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 182     fi
 183     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 184     stop_services
 185     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 186     report_outcomes
 187     clear_temp
 188     exit ${#failures}
 189 }
 190
 191 sanity_checks() {
 192     [[ -n "${skip[sanity]}" ]] && return 0
 193     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 194         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 195     echo Checking dependencies:
 196     echo "locale: ${LANG}"
 197     [[ "$(locale charmap)" = "UTF-8" ]] \
 198         || fatal "Locale '${LANG}' is broken/missing. Try: echo ${LANG} | sudo tee -a /etc/locale.gen && sudo locale-gen"
 199     echo -n 'virtualenv: '
 200     virtualenv --version \
 201         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 202     echo -n 'ruby: '
 203     ruby -v \
 204         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 205     echo -n 'go: '
 206     go version \
 207         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 208     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 10 ]] \
 209         || fatal "Go >= 1.10 required. See http://golang.org/doc/install"
 210     echo -n 'gcc: '
 211     gcc --version | egrep ^gcc \
 212         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 213     echo -n 'fuse.h: '
 214     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 215         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 216     echo -n 'gnutls.h: '
 217     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 218         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 219     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
 220     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 221         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
 222     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 223     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 224         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 225     which netstat \
 226         || fatal "No netstat. Try: apt-get install net-tools"
 227     echo -n 'nginx: '
 228     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 229         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 230     echo -n 'perl: '
 231     perl -v | grep version \
 232         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 233     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 234         echo -n "perl $mod: "
 235         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 236             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 237     done
 238     echo -n 'gitolite: '
 239     which gitolite \
 240         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 241     echo -n 'npm: '
 242     npm --version \
 243         || fatal "No npm. Try: wget -O- https://nodejs.org/dist/v6.11.2/node-v6.11.2-linux-x64.tar.xz | sudo tar -C /usr/local -xJf - && sudo ln -s ../node-v6.11.2-linux-x64/bin/{node,npm} /usr/local/bin/"
 244     echo -n 'cadaver: '
 245     cadaver --version | grep -w cadaver \
 246           || fatal "No cadaver. Try: apt-get install cadaver"
 247     echo -n 'libattr1 xattr.h: '
 248     find /usr/include -path '*/attr/xattr.h' | egrep --max-count=1 . \
 249         || fatal "No libattr1 xattr.h. Try: apt-get install libattr1-dev"
 250     echo -n 'libcurl curl.h: '
 251     find /usr/include -path '*/curl/curl.h' | egrep --max-count=1 . \
 252         || fatal "No libcurl curl.h. Try: apt-get install libcurl4-gnutls-dev"
 253     echo -n 'libpq libpq-fe.h: '
 254     find /usr/include -path '*/postgresql/libpq-fe.h' | egrep --max-count=1 . \
 255         || fatal "No libpq libpq-fe.h. Try: apt-get install libpq-dev"
 256     echo -n 'services/api/config/database.yml: '
 257     if [[ ! -f "$WORKSPACE/services/api/config/database.yml" ]]; then
 258             fatal "Please provide a database.yml file for the test suite"
 259     else
 260             echo "OK"
 261     fi
 262     echo -n 'postgresql: '
 263     psql --version || fatal "No postgresql. Try: apt-get install postgresql postgresql-client-common"
 264     echo -n 'phantomjs: '
 265     phantomjs --version || fatal "No phantomjs. Try: apt-get install phantomjs"
 266     echo -n 'xvfb: '
 267     which Xvfb || fatal "No xvfb. Try: apt-get install xvfb"
 268     echo -n 'graphviz: '
 269     dot -V || fatal "No graphviz. Try: apt-get install graphviz"
 270     echo -n 'geckodriver: '
 271     geckodriver --version | grep ^geckodriver || echo "No geckodriver. Try: wget -O- https://github.com/mozilla/geckodriver/releases/download/v0.23.0/geckodriver-v0.23.0-linux64.tar.gz | sudo tar -C /usr/local/bin -xzf - geckodriver"
 272
 273     if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 274       # R SDK stuff
 275       echo -n 'R: '
 276       which Rscript || fatal "No Rscript. Try: apt-get install r-base"
 277       echo -n 'testthat: '
 278       Rscript -e "library('testthat')" || fatal "No testthat. Try: apt-get install r-cran-testthat"
 279       # needed for roxygen2, needed for devtools, needed for R sdk
 280       pkg-config --exists libxml-2.0 || fatal "No libxml2. Try: apt-get install libxml2-dev"
 281       # needed for pkgdown, builds R SDK doc pages
 282       which pandoc || fatal "No pandoc. Try: apt-get install pandoc"
 283     fi
 284 }
 285
 286 rotate_logfile() {
 287   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 288   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 289   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 290     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 291     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 292     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 293   fi
 294 }
 295
 296 declare -a failures
 297 declare -A skip
 298 declare -A only
 299 declare -A testargs
 300 skip[apps/workbench_profile]=1
 301 # nodemanager_integration tests are not reliable, see #12061.
 302 skip[services/nodemanager_integration]=1
 303
 304 while [[ -n "$1" ]]
 305 do
 306     arg="$1"; shift
 307     case "$arg" in
 308         --help)
 309             echo >&2 "$helpmessage"
 310             echo >&2
 311             exit 1
 312             ;;
 313         --skip)
 314             skip[$1]=1; shift
 315             ;;
 316         --only)
 317             only[$1]=1; skip[$1]=""; shift
 318             ;;
 319         --short)
 320             short=1
 321             ;;
 322         --interactive)
 323             interactive=1
 324             ;;
 325         --skip-install)
 326             skip[install]=1
 327             ;;
 328         --only-install)
 329             only_install="$1"; shift
 330             ;;
 331         --temp)
 332             temp="$1"; shift
 333             temp_preserve=1
 334             ;;
 335         --leave-temp)
 336             temp_preserve=1
 337             ;;
 338         --repeat)
 339             repeat=$((${1}+0)); shift
 340             ;;
 341         --retry)
 342             retry=1
 343             ;;
 344         *_test=*)
 345             suite="${arg%%_test=*}"
 346             args="${arg#*=}"
 347             testargs["$suite"]="$args"
 348             ;;
 349         *=*)
 350             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 351             ;;
 352         *)
 353             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 354             exit 1
 355             ;;
 356     esac
 357 done
 358
 359 # R SDK installation is very slow (~360s in a clean environment) and only
 360 # required when testing it. Skip that step if it is not needed.
 361 NEED_SDK_R=true
 362
 363 if [[ ${#only[@]} -ne 0 ]] &&
 364    [[ -z "${only['sdk/R']}" && -z "${only['doc']}" ]]; then
 365   NEED_SDK_R=false
 366 fi
 367
 368 if [[ ${skip["sdk/R"]} == 1 && ${skip["doc"]} == 1 ]]; then
 369   NEED_SDK_R=false
 370 fi
 371
 372 if [[ $NEED_SDK_R == false ]]; then
 373         echo "R SDK not needed, it will not be installed."
 374 fi
 375
 376 checkpidfile() {
 377     svc="$1"
 378     pid="$(cat "$WORKSPACE/tmp/${svc}.pid")"
 379     if [[ -z "$pid" ]] || ! kill -0 "$pid"; then
 380         tail $WORKSPACE/tmp/${1}*.log
 381         echo "${svc} pid ${pid} not running"
 382         return 1
 383     fi
 384     echo "${svc} pid ${pid} ok"
 385 }
 386
 387 checkhealth() {
 388     svc="$1"
 389     port="$(cat "$WORKSPACE/tmp/${svc}.port")"
 390     scheme=http
 391     if [[ ${svc} =~ -ssl$ || ${svc} = wss ]]; then
 392         scheme=https
 393     fi
 394     url="$scheme://localhost:${port}/_health/ping"
 395     if ! curl -Ss -H "Authorization: Bearer e687950a23c3a9bceec28c6223a06c79" "${url}" | tee -a /dev/stderr | grep '"OK"'; then
 396         echo "${url} failed"
 397         return 1
 398     fi
 399 }
 400
 401 checkdiscoverydoc() {
 402     dd="https://${1}/discovery/v1/apis/arvados/v1/rest"
 403     if ! (set -o pipefail; curl -fsk "$dd" | grep -q ^{ ); then
 404         echo >&2 "ERROR: could not retrieve discovery doc from RailsAPI at $dd"
 405         tail -v $WORKSPACE/services/api/log/test.log
 406         return 1
 407     fi
 408     echo "${dd} ok"
 409 }
 410
 411 start_services() {
 412     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 413         return 0
 414     fi
 415     . "$VENVDIR/bin/activate"
 416     echo 'Starting API, controller, keepproxy, keep-web, arv-git-httpd, ws, and nginx ssl proxy...'
 417     if [[ ! -d "$WORKSPACE/services/api/log" ]]; then
 418         mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/log"
 419     fi
 420     # Remove empty api.pid file if it exists
 421     if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid" && ! -s "$WORKSPACE/tmp/api.pid" ]]; then
 422         rm -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid"
 423     fi
 424     all_services_stopped=
 425     fail=1
 426     cd "$WORKSPACE" \
 427         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 428         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 429         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 430         && checkpidfile api \
 431         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 432         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_controller \
 433         && checkpidfile controller \
 434         && checkhealth controller \
 435         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 436         && checkpidfile keepproxy \
 437         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 438         && checkpidfile keep-web \
 439         && checkhealth keep-web \
 440         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 441         && checkpidfile arv-git-httpd \
 442         && checkhealth arv-git-httpd \
 443         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 444         && checkpidfile ws \
 445         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx) \
 446         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 447         && checkpidfile nginx \
 448         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1 \
 449         && (env | egrep ^ARVADOS) \
 450         && fail=0
 451     deactivate
 452     if [[ $fail != 0 ]]; then
 453         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 454     fi
 455     return $fail
 456 }
 457
 458 stop_services() {
 459     if [[ -n "$all_services_stopped" ]]; then
 460         return
 461     fi
 462     unset ARVADOS_TEST_API_HOST ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 463     . "$VENVDIR/bin/activate" || return
 464     cd "$WORKSPACE" \
 465         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 466         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 467         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 468         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 469         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy \
 470         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_controller \
 471         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop \
 472         && all_services_stopped=1
 473     deactivate
 474 }
 475
 476 interrupt() {
 477     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 478     exit_cleanly
 479 }
 480 trap interrupt INT
 481
 482 setup_ruby_environment() {
 483     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 484         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 485         using_rvm=true
 486     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 487         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 488         using_rvm=true
 489     else
 490         using_rvm=false
 491     fi
 492
 493     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 494         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 495         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 496         # the environment to the "current gemset", which would lose
 497         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 498         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 499         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 500         # rvm gemset and use it for everything.
 501
 502         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 503             || fatal 'rvm check'
 504
 505         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 506         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 507         # complaint about not being in first place already.
 508         rvm use @default 2>/dev/null
 509
 510         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 511         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 512         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 513         # ruby to the caller.
 514         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 515         rvm use "@${gemset}" --create \
 516             || fatal 'rvm gemset setup'
 517
 518         rvm env
 519     else
 520         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 521         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 522         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 523         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 524         # should be installed, and we should leave it alone.)
 525
 526         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 527             user_gempath="$(gem env gempath)"
 528             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 529         fi
 530         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 531
 532         # When we build and install our own gems, we install them in our
 533         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 534         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 535         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 536
 537         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 538         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 539         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
 540
 541         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 542         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 543         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 544     fi
 545     bundle config || gem install bundler \
 546         || fatal 'install bundler'
 547 }
 548
 549 with_test_gemset() {
 550     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 551         "$@"
 552     else
 553         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 554     fi
 555 }
 556
 557 gem_uninstall_if_exists() {
 558     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 559         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 560     fi
 561 }
 562
 563 setup_virtualenv() {
 564     local venvdest="$1"; shift
 565     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 566         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 567     elif [[ -n "$short" ]]; then
 568         return
 569     fi
 570     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 571         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 572         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 573     else
 574         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 575     fi
 576     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 577     "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 578 }
 579
 580 initialize() {
 581     sanity_checks
 582
 583     echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 584
 585     if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 586         # Jenkins expects us to use this by default.
 587         CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 588     fi
 589
 590     # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 591     cd "$WORKSPACE"
 592     find -name '*.pyc' -delete
 593
 594     if [[ -z "$temp" ]]; then
 595         temp="$(mktemp -d)"
 596     fi
 597
 598     # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 599     for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE R_LIBS
 600     do
 601         if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 602             eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 603         fi
 604         if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 605             mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 606         fi
 607     done
 608
 609     rm -vf "${WORKSPACE}/tmp/*.log"
 610
 611     export PERLINSTALLBASE
 612     export PERL5LIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5${PERL5LIB:+:$PERL5LIB}"
 613
 614     export R_LIBS
 615
 616     export GOPATH
 617
 618     # Jenkins config requires that glob tmp/*.log match something. Ensure
 619     # that happens even if we don't end up running services that set up
 620     # logging.
 621     mkdir -p "${WORKSPACE}/tmp/" || fatal "could not mkdir ${WORKSPACE}/tmp"
 622     touch "${WORKSPACE}/tmp/controller.log" || fatal "could not touch ${WORKSPACE}/tmp/controller.log"
 623
 624     unset http_proxy https_proxy no_proxy
 625
 626
 627     # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 628     # whine a lot.
 629     setup_ruby_environment
 630
 631     echo "PATH is $PATH"
 632 }
 633
 634 install_env() {
 635     (
 636         set -e
 637         mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 638         if [[ ! -h "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" ]]; then
 639             for d in \
 640                 "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/tmp/GOPATH" \
 641                     "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/tmp" \
 642                     "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"; do
 643                 [[ -d "$d" ]] && rmdir "$d"
 644             done
 645         fi
 646         for d in \
 647             "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/arvados" \
 648                 "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"; do
 649             [[ -h "$d" ]] && rm "$d"
 650         done
 651         ln -vsfT "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
 652         go get -v github.com/kardianos/govendor
 653         cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
 654         go get -v -d ...
 655         "$GOPATH/bin/govendor" sync
 656     ) || fatal "Go setup failed"
 657
 658     setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 659     . "$VENVDIR/bin/activate"
 660
 661     # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 662     pip install --no-cache-dir PyYAML \
 663         || fatal "pip install PyYAML failed"
 664
 665     # Preinstall libcloud if using a fork; otherwise nodemanager "pip
 666     # install" won't pick it up by default.
 667     if [[ -n "$LIBCLOUD_PIN_SRC" ]]; then
 668         pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 669             || pip install --pre --ignore-installed --no-cache-dir "$LIBCLOUD_PIN_SRC" >/dev/null \
 670             || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 671     fi
 672
 673     # Deactivate Python 2 virtualenv
 674     deactivate
 675
 676     # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 677     # Otherwise, skip dependent tests.
 678     PYTHON3=$(which python3)
 679     if [[ ${?} = 0 ]]; then
 680         setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 681     else
 682         PYTHON3=
 683         cat >&2 <<EOF
 684
 685 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
 686
 687 EOF
 688     fi
 689
 690     if ! which bundler >/dev/null
 691     then
 692         gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 693     fi
 694 }
 695
 696 retry() {
 697     remain="${repeat}"
 698     while :
 699     do
 700         if ${@}; then
 701             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 702                 remain=$((${remain}-1))
 703                 title "(repeating ${remain} more times)"
 704             else
 705                 break
 706             fi
 707         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 708             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 709             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 710             then
 711                 break
 712             fi
 713         else
 714             break
 715         fi
 716     done
 717 }
 718
 719 do_test() {
 720     case "${1}" in
 721         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 722             suite=apps/workbench
 723             ;;
 724         services/nodemanager | services/nodemanager_integration)
 725             suite=services/nodemanager_suite
 726             ;;
 727         *)
 728             suite="${1}"
 729             ;;
 730     esac
 731     if [[ -n "${skip[$suite]}" || \
 732               -n "${skip[$1]}" || \
 733               (${#only[@]} -ne 0 && ${only[$suite]} -eq 0 && ${only[$1]} -eq 0) ]]; then
 734         return 0
 735     fi
 736     case "${1}" in
 737         services/api)
 738             stop_services
 739             ;;
 740         gofmt | govendor | doc | lib/cli | lib/cloud/azure | lib/cloud/ec2 | lib/cmd | lib/dispatchcloud/ssh_executor | lib/dispatchcloud/worker)
 741             # don't care whether services are running
 742             ;;
 743         *)
 744             if ! start_services; then
 745                 title "test $1 -- failed to start services"
 746                 return 1
 747             fi
 748             ;;
 749     esac
 750     retry do_test_once ${@}
 751 }
 752
 753 do_test_once() {
 754     unset result
 755
 756     title "test $1"
 757     timer_reset
 758
 759     result=
 760     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 761     if ! . "$VENVDIR/bin/activate"
 762     then
 763         result=1
 764     elif [[ "$2" == "go" ]]
 765     then
 766         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 767         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 768         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 769         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 770         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 771         # compilation errors.
 772         go get -ldflags "-X main.version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}" -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 773             cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 774             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 775         then
 776             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 777             # does:
 778             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 779         else
 780             # The above form gets verbose even when testargs is
 781             # empty, so use this form in such cases:
 782             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 783         fi
 784         result=${result:-$?}
 785         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 786         then
 787             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 788             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 789         fi
 790         [[ $result = 0 ]] && gofmt -e -d *.go
 791     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 792     then
 793         tries=0
 794         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 795         do
 796             tries=$((${tries}+1))
 797             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 798             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 799             if [[ -e "${3}activate" ]]; then
 800                 . "${3}activate"
 801             fi
 802             python setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 803             result=$?
 804             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 805             then
 806                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 807                 continue
 808             else
 809                 break
 810             fi
 811         done
 812     elif [[ "$2" != "" ]]
 813     then
 814         "test_$2"
 815     else
 816         "test_$1"
 817     fi
 818     result=${result:-$?}
 819     checkexit $result "$1 tests"
 820     title "test $1 -- `timer`"
 821     return $result
 822 }
 823
 824 do_install() {
 825     if [[ -n "${skip[install]}" || ( -n "${only_install}" && "${only_install}" != "${1}" && "${only_install}" != "${2}" ) ]]; then
 826         return 0
 827     fi
 828     retry do_install_once ${@}
 829 }
 830
 831 do_install_once() {
 832     title "install $1"
 833     timer_reset
 834
 835     result=
 836     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 837     if [[ "$1" != "env" ]] && ! . "$VENVDIR/bin/activate"; then
 838         result=1
 839     elif [[ "$2" == "go" ]]
 840     then
 841         go get -ldflags "-X main.version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}" -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 842     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 843     then
 844         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 845         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 846
 847         # Need to change to a different directory after creating
 848         # the source dist package to avoid a pip bug.
 849         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 850
 851         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 852         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 853         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 854         # install" ensures that we've actually installed the local package
 855         # we just built.
 856         cd "$WORKSPACE/$1" \
 857             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 858             && cd "$WORKSPACE" \
 859             && "${3}pip" install --no-cache-dir --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 860             && "${3}pip" install --no-cache-dir --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 861     elif [[ "$2" != "" ]]
 862     then
 863         "install_$2"
 864     else
 865         "install_$1"
 866     fi
 867     result=${result:-$?}
 868     checkexit $result "$1 install"
 869     title "install $1 -- `timer`"
 870     return $result
 871 }
 872
 873 bundle_install_trylocal() {
 874     (
 875         set -e
 876         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 877         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 878             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 879             bundle install --no-deployment
 880         fi
 881         bundle package --all
 882     )
 883 }
 884
 885 install_doc() {
 886     cd "$WORKSPACE/doc" \
 887         && bundle_install_trylocal \
 888         && rm -rf .site
 889 }
 890
 891 install_gem() {
 892     gemname=$1
 893     srcpath=$2
 894     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 895         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 896         && bundle_install_trylocal \
 897         && gem build "$gemname.gemspec" \
 898         && with_test_gemset gem install --no-document $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 899 }
 900
 901 install_sdk/ruby() {
 902     install_gem arvados sdk/ruby
 903 }
 904
 905 install_sdk/R() {
 906   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 907     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
 908        && Rscript --vanilla install_deps.R
 909   fi
 910 }
 911
 912 install_sdk/perl() {
 913     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 914         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 915         && make install INSTALLDIRS=perl
 916 }
 917
 918 install_sdk/cli() {
 919     install_gem arvados-cli sdk/cli
 920 }
 921
 922 install_services/login-sync() {
 923     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 924 }
 925
 926 install_services/api() {
 927     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 928         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 929
 930     rm -f config/environments/test.rb
 931     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 932
 933     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 934     then
 935         for f in database.yml
 936         do
 937             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 938         done
 939     fi
 940
 941     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 942     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 943     # is a postgresql superuser.
 944     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 945         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.safe_load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 946         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.pid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 947
 948     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 949
 950     cert="$WORKSPACE/services/api/tmp/self-signed"
 951     if [[ ! -e "$cert.pem" || "$(date -r "$cert.pem" +%s)" -lt 1512659226 ]]; then
 952         (
 953             dir="$WORKSPACE/services/api/tmp"
 954             set -ex
 955             openssl req -newkey rsa:2048 -nodes -subj '/C=US/ST=State/L=City/CN=localhost' -out "$cert.csr" -keyout "$cert.key" </dev/null
 956             openssl x509 -req -in "$cert.csr" -signkey "$cert.key" -out "$cert.pem" -days 3650 -extfile <(printf 'subjectAltName=DNS:localhost,DNS:::1,DNS:0.0.0.0,DNS:127.0.0.1,IP:::1,IP:0.0.0.0,IP:127.0.0.1')
 957         ) || return 1
 958     fi
 959
 960     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 961         && rm -rf tmp/git \
 962         && mkdir -p tmp/git \
 963         && cd tmp/git \
 964         && tar xf ../../test/test.git.tar \
 965         && mkdir -p internal.git \
 966         && git --git-dir internal.git init \
 967             || return 1
 968
 969     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 970         && RAILS_ENV=test bundle exec rails db:environment:set \
 971         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 972         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 973         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 974 }
 975
 976 declare -a pythonstuff
 977 pythonstuff=(
 978     sdk/pam
 979     sdk/python
 980     sdk/python:py3
 981     sdk/cwl
 982     sdk/cwl:py3
 983     services/dockercleaner:py3
 984     services/fuse
 985     services/fuse:py3
 986     services/nodemanager
 987     tools/crunchstat-summary
 988     tools/crunchstat-summary:py3
 989 )
 990
 991 declare -a gostuff
 992 gostuff=(
 993     cmd/arvados-client
 994     cmd/arvados-server
 995     lib/cli
 996     lib/cmd
 997     lib/controller
 998     lib/crunchstat
 999     lib/cloud
1000     lib/cloud/azure
1001     lib/cloud/ec2
1002     lib/config
1003     lib/dispatchcloud
1004     lib/dispatchcloud/container
1005     lib/dispatchcloud/scheduler
1006     lib/dispatchcloud/ssh_executor
1007     lib/dispatchcloud/worker
1008     lib/service
1009     sdk/go/arvados
1010     sdk/go/arvadosclient
1011     sdk/go/auth
1012     sdk/go/blockdigest
1013     sdk/go/dispatch
1014     sdk/go/health
1015     sdk/go/httpserver
1016     sdk/go/manifest
1017     sdk/go/asyncbuf
1018     sdk/go/crunchrunner
1019     sdk/go/stats
1020     services/arv-git-httpd
1021     services/crunchstat
1022     services/health
1023     services/keep-web
1024     services/keepstore
1025     sdk/go/keepclient
1026     services/keep-balance
1027     services/keepproxy
1028     services/crunch-dispatch-local
1029     services/crunch-dispatch-slurm
1030     services/crunch-run
1031     services/ws
1032     tools/keep-block-check
1033     tools/keep-exercise
1034     tools/keep-rsync
1035     tools/sync-groups
1036 )
1037
1038 install_apps/workbench() {
1039     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1040         && mkdir -p tmp/cache \
1041         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
1042         && RAILS_ENV=test RAILS_GROUPS=assets bundle exec rake npm:install
1043 }
1044
1045 test_doc() {
1046     (
1047         set -e
1048         cd "$WORKSPACE/doc"
1049         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
1050         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
1051         # do much good!
1052         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
1053     )
1054 }
1055
1056 test_gofmt() {
1057     cd "$WORKSPACE" || return 1
1058     dirs=$(ls -d */ | egrep -v 'vendor|tmp')
1059     [[ -z "$(gofmt -e -d $dirs | tee -a /dev/stderr)" ]]
1060 }
1061
1062 test_govendor() {
1063     (
1064         set -e
1065         cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
1066         # Remove cached source dirs in workdir. Otherwise, they will
1067         # not qualify as +missing or +external below, and we won't be
1068         # able to detect that they're missing from vendor/vendor.json.
1069         rm -rf vendor/*/
1070         go get -v -d ...
1071         "$GOPATH/bin/govendor" sync
1072         if [[ -n $("$GOPATH/bin/govendor" list +unused +missing +external | tee /dev/stderr) ]]; then
1073             echo >&2 "vendor/vendor.json has unused or missing dependencies -- try:
1074
1075 (export GOPATH=\"${GOPATH}\"; cd \$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git && \$GOPATH/bin/govendor add +missing +external && \$GOPATH/bin/govendor remove +unused)
1076
1077 "
1078             return 1
1079         fi
1080     )
1081 }
1082
1083 test_services/api() {
1084     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
1085     cd "$WORKSPACE/services/api" \
1086         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS='-v -d' ${testargs[services/api]}
1087 }
1088
1089 test_sdk/ruby() {
1090     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
1091         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
1092 }
1093
1094 test_sdk/R() {
1095   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
1096     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
1097         && Rscript --vanilla run_test.R
1098   fi
1099 }
1100
1101 test_sdk/cli() {
1102     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
1103         && mkdir -p /tmp/keep \
1104         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
1105 }
1106
1107 test_sdk/java-v2() {
1108     cd "$WORKSPACE/sdk/java-v2" && gradle test
1109 }
1110
1111 test_services/login-sync() {
1112     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
1113         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
1114 }
1115
1116 test_services/nodemanager_integration() {
1117     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
1118         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager_integration]}
1119 }
1120
1121 test_apps/workbench_units() {
1122     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1123         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS='-v -d' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_units]}
1124 }
1125
1126 test_apps/workbench_functionals() {
1127     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1128         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS='-v -d' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_functionals]}
1129 }
1130
1131 test_apps/workbench_integration() {
1132     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1133         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS='-v -d' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_integration]}
1134 }
1135
1136 test_apps/workbench_benchmark() {
1137     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1138         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
1139 }
1140
1141 test_apps/workbench_profile() {
1142     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1143         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
1144 }
1145
1146 install_deps() {
1147     # Install parts needed by test suites
1148     do_install env
1149     do_install cmd/arvados-server go
1150     do_install sdk/cli
1151     do_install sdk/perl
1152     do_install sdk/python pip
1153     do_install sdk/ruby
1154     do_install services/api
1155     do_install services/arv-git-httpd go
1156     do_install services/keepproxy go
1157     do_install services/keepstore go
1158     do_install services/keep-web go
1159     do_install services/ws go
1160 }
1161
1162 install_all() {
1163     do_install env
1164     do_install doc
1165     do_install sdk/ruby
1166     do_install sdk/R
1167     do_install sdk/perl
1168     do_install sdk/cli
1169     do_install services/login-sync
1170     for p in "${pythonstuff[@]}"
1171     do
1172         dir=${p%:py3}
1173         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1174             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1175                 do_install ${dir} pip
1176             fi
1177         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1178             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1179                 do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1180             fi
1181         fi
1182     done
1183     do_install services/api
1184     for g in "${gostuff[@]}"
1185     do
1186         do_install "$g" go
1187     done
1188     do_install apps/workbench
1189 }
1190
1191 test_all() {
1192     stop_services
1193     do_test services/api
1194
1195     # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
1196     # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
1197     if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
1198         rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
1199         exit_cleanly
1200     fi
1201
1202     do_test gofmt
1203     do_test govendor
1204     do_test doc
1205     do_test sdk/ruby
1206     do_test sdk/R
1207     do_test sdk/cli
1208     do_test services/login-sync
1209     do_test sdk/java-v2
1210     do_test services/nodemanager_integration
1211     for p in "${pythonstuff[@]}"
1212     do
1213         dir=${p%:py3}
1214         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1215             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1216                 do_test ${dir} pip
1217             fi
1218         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1219             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1220                 do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1221             fi
1222         fi
1223     done
1224
1225     for g in "${gostuff[@]}"
1226     do
1227         do_test "$g" go
1228     done
1229     do_test apps/workbench_units
1230     do_test apps/workbench_functionals
1231     do_test apps/workbench_integration
1232     do_test apps/workbench_benchmark
1233     do_test apps/workbench_profile
1234 }
1235
1236 help_interactive() {
1237     echo "== Interactive commands:"
1238     echo "TARGET                 (short for 'test DIR')"
1239     echo "test TARGET"
1240     echo "test TARGET:py3        (test with python3)"
1241     echo "test TARGET -check.vv  (pass arguments to test)"
1242     echo "install TARGET"
1243     echo "install env            (go/python libs)"
1244     echo "install deps           (go/python libs + arvados components needed for integration tests)"
1245     echo "reset                  (...services used by integration tests)"
1246     echo "exit"
1247     echo "== Test targets:"
1248     echo "${!testfuncargs[@]}" | tr ' ' '\n' | sort | column
1249 }
1250
1251 initialize
1252
1253 declare -A testfuncargs=()
1254 for g in "${gostuff[@]}"; do
1255     testfuncargs[$g]="$g go"
1256 done
1257 for p in "${pythonstuff[@]}"; do
1258     dir=${p%:py3}
1259     testfuncargs[$dir]="$dir pip $VENVDIR/bin/"
1260     testfuncargs[$dir:py3]="$dir pip $VENV3DIR/bin/"
1261 done
1262
1263 testfuncargs["sdk/cli"]="sdk/cli"
1264
1265 if [[ -z ${interactive} ]]; then
1266     install_all
1267     test_all
1268 else
1269     skip=()
1270     only=()
1271     only_install=()
1272     if [[ -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then stop_services; fi
1273     setnextcmd() {
1274         if [[ "$TERM" = dumb ]]; then
1275             # assume emacs, or something, is offering a history buffer
1276             # and pre-populating the command will only cause trouble
1277             nextcmd=
1278         elif [[ "$nextcmd" != "install deps" ]]; then
1279             :
1280         elif [[ -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then
1281             nextcmd="test lib/cmd"
1282         else
1283             nextcmd="install deps"
1284         fi
1285     }
1286     echo
1287     help_interactive
1288     nextcmd="install deps"
1289     setnextcmd
1290     while read -p 'What next? ' -e -i "${nextcmd}" nextcmd; do
1291         read verb target opts <<<"${nextcmd}"
1292         target="${target%/}"
1293         target="${target/\/:/:}"
1294         case "${verb}" in
1295             "exit" | "quit")
1296                 exit_cleanly
1297                 ;;
1298             "reset")
1299                 stop_services
1300                 ;;
1301             "test" | "install")
1302                 case "$target" in
1303                     "")
1304                         help_interactive
1305                         ;;
1306                     all | deps)
1307                         ${verb}_${target}
1308                         ;;
1309                     *)
1310                         testargs["$target"]="${opts}"
1311                         tt="${testfuncargs[${target}]}"
1312                         tt="${tt:-$target}"
1313                         do_$verb $tt
1314                         ;;
1315                 esac
1316                 ;;
1317             "" | "help" | *)
1318                 help_interactive
1319                 ;;
1320         esac
1321         if [[ ${#successes[@]} -gt 0 || ${#failures[@]} -gt 0 ]]; then
1322             report_outcomes
1323             successes=()
1324             failures=()
1325         fi
1326         cd "$WORKSPACE"
1327         setnextcmd
1328     done
1329     echo
1330 fi
1331 exit_cleanly