services/api/app/models/pipeline_instance.rb

   1 class PipelineInstance < ArvadosModel
   2   include HasUuid
   3   include KindAndEtag
   4   include CommonApiTemplate
   5   serialize :components, Hash
   6   serialize :properties, Hash
   7   serialize :components_summary, Hash
   8   belongs_to :pipeline_template, :foreign_key => :pipeline_template_uuid, :primary_key => :uuid
   9
  10   before_validation :bootstrap_components
  11   before_validation :update_state
  12   before_validation :verify_status
  13   before_create :set_state_before_save
  14   before_save :set_state_before_save
  15
  16   api_accessible :user, extend: :common do |t|
  17     t.add :pipeline_template_uuid
  18     t.add :name
  19     t.add :components
  20     t.add :properties
  21     t.add :state
  22     t.add :components_summary
  23     t.add :description
  24     t.add :started_at
  25     t.add :finished_at
  26   end
  27
  28   # Supported states for a pipeline instance
  29   States =
  30     [
  31      (New = 'New'),
  32      (Ready = 'Ready'),
  33      (RunningOnServer = 'RunningOnServer'),
  34      (RunningOnClient = 'RunningOnClient'),
  35      (Paused = 'Paused'),
  36      (Failed = 'Failed'),
  37      (Complete = 'Complete'),
  38     ]
  39
  40   # if all components have input, the pipeline is Ready
  41   def components_look_ready?
  42     if !self.components || self.components.empty?
  43       return false
  44     end
  45
  46     all_components_have_input = true
  47     self.components.each do |name, component|
  48       component['script_parameters'].andand.each do |parametername, parameter|
  49         parameter = { 'value' => parameter } unless parameter.is_a? Hash
  50         if parameter['value'].nil? and parameter['required']
  51           if parameter['output_of']
  52             next
  53           end
  54           all_components_have_input = false
  55           break
  56         end
  57       end
  58     end
  59     return all_components_have_input
  60   end
  61
  62   def progress_table
  63     begin
  64       # v0 pipeline format
  65       nrow = -1
  66       components['steps'].collect do |step|
  67         nrow += 1
  68         row = [nrow, step['name']]
  69         if step['complete'] and step['complete'] != 0
  70           if step['output_data_locator']
  71             row << 1.0
  72           else
  73             row << 0.0
  74           end
  75         else
  76           row << 0.0
  77           if step['failed']
  78             self.state = Failed
  79           end
  80         end
  81         row << (step['warehousejob']['id'] rescue nil)
  82         row << (step['warehousejob']['revision'] rescue nil)
  83         row << step['output_data_locator']
  84         row << (Time.parse(step['warehousejob']['finishtime']) rescue nil)
  85         row
  86       end
  87     rescue
  88       []
  89     end
  90   end
  91
  92   def progress_ratio
  93     t = progress_table
  94     return 0 if t.size < 1
  95     t.collect { |r| r[2] }.inject(0.0) { |sum,a| sum += a } / t.size
  96   end
  97
  98   def self.queue
  99     self.where("state = 'RunningOnServer'")
 100   end
 101
 102   protected
 103   def bootstrap_components
 104     if pipeline_template and (!components or components.empty?)
 105       self.components = pipeline_template.components.deep_dup
 106     end
 107   end
 108
 109   def update_state
 110     if components and progress_ratio == 1.0
 111       self.state = Complete
 112     end
 113   end
 114
 115   def dependency_search(haystack)
 116     if haystack.is_a? String
 117       if (re = haystack.match /^([0-9a-f]{32}(\+[^,]+)*)+/)
 118         {re[1] => true}
 119       else
 120         {}
 121       end
 122     elsif haystack.is_a? Array
 123       deps = {}
 124       haystack.each do |value|
 125         deps.merge! dependency_search(value)
 126       end
 127       deps
 128     elsif haystack.respond_to? :keys
 129       deps = {}
 130       haystack.each do |key, value|
 131         deps.merge! dependency_search(value)
 132       end
 133       deps
 134     else
 135       {}
 136     end
 137   end
 138
 139   def verify_status
 140     changed_attributes = self.changed
 141
 142     if new_record? or 'components'.in? changed_attributes
 143       self.state ||= New
 144       if (self.state == New) and self.components_look_ready?
 145         self.state = Ready
 146       end
 147     end
 148
 149     if self.state.in?(States)
 150       true
 151     else
 152       errors.add :state, "'#{state.inspect} must be one of: [#{States.join ', '}]"
 153       false
 154     end
 155   end
 156
 157   def set_state_before_save
 158     if self.components_look_ready? && (!self.state || self.state == New)
 159       self.state = Ready
 160     end
 161   end
 162
 163 end