sdk/python/arvados/crunch.py

   1 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   2 #
   3 # SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
   4
   5 import json
   6 import os
   7
   8 from . import util
   9
  10 class TaskOutputDir(object):
  11     """Keep-backed directory for staging outputs of Crunch tasks.
  12
  13     Example, in a crunch task whose output is a file called "out.txt"
  14     containing "42":
  15
  16         import arvados
  17         import arvados.crunch
  18         import os
  19
  20         out = arvados.crunch.TaskOutputDir()
  21         with open(os.path.join(out.path, 'out.txt'), 'w') as f:
  22             f.write('42')
  23         arvados.current_task().set_output(out.manifest_text())
  24     """
  25     @util._deprecated('3.0', 'arvados-cwl-runner or the containers API')
  26     def __init__(self):
  27         self.path = os.environ['TASK_KEEPMOUNT_TMP']
  28
  29     def __str__(self):
  30         return self.path
  31
  32     def manifest_text(self):
  33         snapshot = os.path.join(self.path, '.arvados#collection')
  34         return json.load(open(snapshot))['manifest_text']