build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
   5
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin.sh
   7
   8 COLUMNS=80
   9 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
  10
  11 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
  12 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  13
  14 Exit non-zero if any tests fail.
  15
  16 Syntax:
  17         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  18
  19 Options:
  20
  21 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  22 --skip sanity  Skip initial dev environment sanity checks.
  23 --skip install Do not run any install steps. Just run tests.
  24                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  25                from a previous invocation if you use this option.
  26 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  27 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  28                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  29 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  30                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  31                subsequent invocations.
  32 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  33 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  34 --only-install Run specific install step
  35 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  36 --interactive  Set up, then prompt for test/install steps to perform.
  37 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  38 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  39                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  40 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  41                Restrict apiserver tests to the given file
  42 sdk/python_test="--test-suite tests.test_keep_locator"
  43                Restrict Python SDK tests to the given class
  44 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  45                Restrict Workbench tests to the given file
  46 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  47                Show all log messages, even when tests pass (also works
  48                with services/keepstore_test etc.)
  49 ARVADOS_DEBUG=1
  50                Print more debug messages
  51 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  52                *_test, and other examples shown above.
  53
  54 Assuming "--skip install" is not given, all components are installed
  55 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  56 test suites depend on other components being installed, and installing
  57 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  58
  59 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  60 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  61
  62 More information and background:
  63
  64 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  65
  66 Available tests:
  67
  68 apps/workbench (*)
  69 apps/workbench_units (*)
  70 apps/workbench_functionals (*)
  71 apps/workbench_integration (*)
  72 apps/workbench_benchmark
  73 apps/workbench_profile
  74 cmd/arvados-client
  75 cmd/arvados-server
  76 doc
  77 lib/cli
  78 lib/cmd
  79 lib/controller
  80 lib/controller/federation
  81 lib/controller/railsproxy
  82 lib/controller/router
  83 lib/controller/rpc
  84 lib/crunchstat
  85 lib/cloud
  86 lib/cloud/azure
  87 lib/cloud/cloudtest
  88 lib/dispatchcloud
  89 lib/dispatchcloud/container
  90 lib/dispatchcloud/scheduler
  91 lib/dispatchcloud/ssh_executor
  92 lib/dispatchcloud/worker
  93 lib/service
  94 services/api
  95 services/arv-git-httpd
  96 services/crunchstat
  97 services/dockercleaner
  98 services/fuse
  99 services/health
 100 services/keep-web
 101 services/keepproxy
 102 services/keepstore
 103 services/keep-balance
 104 services/login-sync
 105 services/nodemanager
 106 services/nodemanager_integration
 107 services/crunch-run
 108 services/crunch-dispatch-local
 109 services/crunch-dispatch-slurm
 110 services/ws
 111 sdk/cli
 112 sdk/pam
 113 sdk/pam:py3
 114 sdk/python
 115 sdk/python:py3
 116 sdk/ruby
 117 sdk/go/arvados
 118 sdk/go/arvadosclient
 119 sdk/go/auth
 120 sdk/go/dispatch
 121 sdk/go/keepclient
 122 sdk/go/health
 123 sdk/go/httpserver
 124 sdk/go/manifest
 125 sdk/go/blockdigest
 126 sdk/go/asyncbuf
 127 sdk/go/stats
 128 sdk/go/crunchrunner
 129 sdk/cwl
 130 sdk/R
 131 sdk/java-v2
 132 tools/sync-groups
 133 tools/crunchstat-summary
 134 tools/crunchstat-summary:py3
 135 tools/keep-exercise
 136 tools/keep-rsync
 137 tools/keep-block-check
 138
 139 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 140     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 141
 142 EOF
 143
 144 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 145 # environment that could interfere with the tests.
 146 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 147
 148 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 149 # accident.
 150 GITDIR=
 151 GOPATH=
 152 VENVDIR=
 153 VENV3DIR=
 154 PYTHONPATH=
 155 GEMHOME=
 156 PERLINSTALLBASE=
 157 R_LIBS=
 158 export LANG=en_US.UTF-8
 159
 160 short=
 161 only_install=
 162 temp=
 163 temp_preserve=
 164
 165 clear_temp() {
 166     if [[ -z "$temp" ]]; then
 167         # we didn't even get as far as making a temp dir
 168         :
 169     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 170         rm -rf "$temp"
 171     else
 172         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 173     fi
 174 }
 175
 176 fatal() {
 177     clear_temp
 178     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 179     exit 1
 180 }
 181
 182 exit_cleanly() {
 183     trap - INT
 184     if which create-plot-data-from-log.sh >/dev/null; then
 185         create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 186     fi
 187     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 188     stop_services
 189     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 190     report_outcomes
 191     clear_temp
 192     exit ${#failures}
 193 }
 194
 195 sanity_checks() {
 196     [[ -n "${skip[sanity]}" ]] && return 0
 197     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 198         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 199     echo Checking dependencies:
 200     echo "locale: ${LANG}"
 201     [[ "$(locale charmap)" = "UTF-8" ]] \
 202         || fatal "Locale '${LANG}' is broken/missing. Try: echo ${LANG} | sudo tee -a /etc/locale.gen && sudo locale-gen"
 203     echo -n 'virtualenv: '
 204     virtualenv --version \
 205         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 206     echo -n 'ruby: '
 207     ruby -v \
 208         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 209     echo -n 'go: '
 210     go version \
 211         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 212     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 12 ]] \
 213         || fatal "Go >= 1.12 required. See http://golang.org/doc/install"
 214     echo -n 'gcc: '
 215     gcc --version | egrep ^gcc \
 216         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 217     echo -n 'fuse.h: '
 218     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 219         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 220     echo -n 'gnutls.h: '
 221     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 222         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 223     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
 224     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 225         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
 226     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 227     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 228         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 229     echo -n 'nginx: '
 230     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 231         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 232     echo -n 'perl: '
 233     perl -v | grep version \
 234         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 235     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 236         echo -n "perl $mod: "
 237         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 238             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 239     done
 240     echo -n 'gitolite: '
 241     which gitolite \
 242         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 243     echo -n 'npm: '
 244     npm --version \
 245         || fatal "No npm. Try: wget -O- https://nodejs.org/dist/v6.11.2/node-v6.11.2-linux-x64.tar.xz | sudo tar -C /usr/local -xJf - && sudo ln -s ../node-v6.11.2-linux-x64/bin/{node,npm} /usr/local/bin/"
 246     echo -n 'cadaver: '
 247     cadaver --version | grep -w cadaver \
 248           || fatal "No cadaver. Try: apt-get install cadaver"
 249     echo -n 'libattr1 xattr.h: '
 250     find /usr/include -path '*/attr/xattr.h' | egrep --max-count=1 . \
 251         || fatal "No libattr1 xattr.h. Try: apt-get install libattr1-dev"
 252     echo -n 'libcurl curl.h: '
 253     find /usr/include -path '*/curl/curl.h' | egrep --max-count=1 . \
 254         || fatal "No libcurl curl.h. Try: apt-get install libcurl4-gnutls-dev"
 255     echo -n 'libpq libpq-fe.h: '
 256     find /usr/include -path '*/postgresql/libpq-fe.h' | egrep --max-count=1 . \
 257         || fatal "No libpq libpq-fe.h. Try: apt-get install libpq-dev"
 258     echo -n 'postgresql: '
 259     psql --version || fatal "No postgresql. Try: apt-get install postgresql postgresql-client-common"
 260     echo -n 'phantomjs: '
 261     phantomjs --version || fatal "No phantomjs. Try: apt-get install phantomjs"
 262     echo -n 'xvfb: '
 263     which Xvfb || fatal "No xvfb. Try: apt-get install xvfb"
 264     echo -n 'graphviz: '
 265     dot -V || fatal "No graphviz. Try: apt-get install graphviz"
 266     echo -n 'geckodriver: '
 267     geckodriver --version | grep ^geckodriver || echo "No geckodriver. Try: wget -O- https://github.com/mozilla/geckodriver/releases/download/v0.23.0/geckodriver-v0.23.0-linux64.tar.gz | sudo tar -C /usr/local/bin -xzf - geckodriver"
 268
 269     if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 270       # R SDK stuff
 271       echo -n 'R: '
 272       which Rscript || fatal "No Rscript. Try: apt-get install r-base"
 273       echo -n 'testthat: '
 274       Rscript -e "library('testthat')" || fatal "No testthat. Try: apt-get install r-cran-testthat"
 275       # needed for roxygen2, needed for devtools, needed for R sdk
 276       pkg-config --exists libxml-2.0 || fatal "No libxml2. Try: apt-get install libxml2-dev"
 277       # needed for pkgdown, builds R SDK doc pages
 278       which pandoc || fatal "No pandoc. Try: apt-get install pandoc"
 279     fi
 280 }
 281
 282 rotate_logfile() {
 283   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 284   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 285   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 286     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 287     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 288     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 289   fi
 290 }
 291
 292 declare -a failures
 293 declare -A skip
 294 declare -A only
 295 declare -A testargs
 296 skip[apps/workbench_profile]=1
 297 # nodemanager_integration tests are not reliable, see #12061.
 298 skip[services/nodemanager_integration]=1
 299
 300 while [[ -n "$1" ]]
 301 do
 302     arg="$1"; shift
 303     case "$arg" in
 304         --help)
 305             echo >&2 "$helpmessage"
 306             echo >&2
 307             exit 1
 308             ;;
 309         --skip)
 310             skip[$1]=1; shift
 311             ;;
 312         --only)
 313             only[$1]=1; skip[$1]=""; shift
 314             ;;
 315         --short)
 316             short=1
 317             ;;
 318         --interactive)
 319             interactive=1
 320             ;;
 321         --skip-install)
 322             skip[install]=1
 323             ;;
 324         --only-install)
 325             only_install="$1"; shift
 326             ;;
 327         --temp)
 328             temp="$1"; shift
 329             temp_preserve=1
 330             ;;
 331         --leave-temp)
 332             temp_preserve=1
 333             ;;
 334         --repeat)
 335             repeat=$((${1}+0)); shift
 336             ;;
 337         --retry)
 338             retry=1
 339             ;;
 340         *_test=*)
 341             suite="${arg%%_test=*}"
 342             args="${arg#*=}"
 343             testargs["$suite"]="$args"
 344             ;;
 345         *=*)
 346             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 347             ;;
 348         *)
 349             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 350             exit 1
 351             ;;
 352     esac
 353 done
 354
 355 # R SDK installation is very slow (~360s in a clean environment) and only
 356 # required when testing it. Skip that step if it is not needed.
 357 NEED_SDK_R=true
 358
 359 if [[ ${#only[@]} -ne 0 ]] &&
 360    [[ -z "${only['sdk/R']}" && -z "${only['doc']}" ]]; then
 361   NEED_SDK_R=false
 362 fi
 363
 364 if [[ ${skip["sdk/R"]} == 1 && ${skip["doc"]} == 1 ]]; then
 365   NEED_SDK_R=false
 366 fi
 367
 368 if [[ $NEED_SDK_R == false ]]; then
 369         echo "R SDK not needed, it will not be installed."
 370 fi
 371
 372 checkpidfile() {
 373     svc="$1"
 374     pid="$(cat "$WORKSPACE/tmp/${svc}.pid")"
 375     if [[ -z "$pid" ]] || ! kill -0 "$pid"; then
 376         tail $WORKSPACE/tmp/${1}*.log
 377         echo "${svc} pid ${pid} not running"
 378         return 1
 379     fi
 380     echo "${svc} pid ${pid} ok"
 381 }
 382
 383 checkhealth() {
 384     svc="$1"
 385     port="$(cat "$WORKSPACE/tmp/${svc}.port")"
 386     scheme=http
 387     if [[ ${svc} =~ -ssl$ || ${svc} = wss ]]; then
 388         scheme=https
 389     fi
 390     url="$scheme://localhost:${port}/_health/ping"
 391     if ! curl -Ss -H "Authorization: Bearer e687950a23c3a9bceec28c6223a06c79" "${url}" | tee -a /dev/stderr | grep '"OK"'; then
 392         echo "${url} failed"
 393         return 1
 394     fi
 395 }
 396
 397 checkdiscoverydoc() {
 398     dd="https://${1}/discovery/v1/apis/arvados/v1/rest"
 399     if ! (set -o pipefail; curl -fsk "$dd" | grep -q ^{ ); then
 400         echo >&2 "ERROR: could not retrieve discovery doc from RailsAPI at $dd"
 401         tail -v $WORKSPACE/services/api/log/test.log
 402         return 1
 403     fi
 404     echo "${dd} ok"
 405 }
 406
 407 start_services() {
 408     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 409         return 0
 410     fi
 411     . "$VENVDIR/bin/activate"
 412     echo 'Starting API, controller, keepproxy, keep-web, arv-git-httpd, ws, and nginx ssl proxy...'
 413     if [[ ! -d "$WORKSPACE/services/api/log" ]]; then
 414         mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/log"
 415     fi
 416     # Remove empty api.pid file if it exists
 417     if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid" && ! -s "$WORKSPACE/tmp/api.pid" ]]; then
 418         rm -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid"
 419     fi
 420     all_services_stopped=
 421     fail=1
 422     cd "$WORKSPACE" \
 423         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 424         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 425         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 426         && checkpidfile api \
 427         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 428         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_controller \
 429         && checkpidfile controller \
 430         && checkhealth controller \
 431         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 432         && checkpidfile keepproxy \
 433         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 434         && checkpidfile keep-web \
 435         && checkhealth keep-web \
 436         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 437         && checkpidfile arv-git-httpd \
 438         && checkhealth arv-git-httpd \
 439         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 440         && checkpidfile ws \
 441         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx) \
 442         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 443         && checkpidfile nginx \
 444         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1 \
 445         && (env | egrep ^ARVADOS) \
 446         && fail=0
 447     deactivate
 448     if [[ $fail != 0 ]]; then
 449         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 450     fi
 451     return $fail
 452 }
 453
 454 stop_services() {
 455     if [[ -n "$all_services_stopped" ]]; then
 456         return
 457     fi
 458     unset ARVADOS_TEST_API_HOST ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 459     . "$VENVDIR/bin/activate" || return
 460     cd "$WORKSPACE" \
 461         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 462         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 463         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 464         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 465         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy \
 466         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_controller \
 467         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop \
 468         && all_services_stopped=1
 469     deactivate
 470 }
 471
 472 interrupt() {
 473     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 474     exit_cleanly
 475 }
 476 trap interrupt INT
 477
 478 setup_ruby_environment() {
 479     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 480         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 481         using_rvm=true
 482     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 483         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 484         using_rvm=true
 485     else
 486         using_rvm=false
 487     fi
 488
 489     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 490         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 491         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 492         # the environment to the "current gemset", which would lose
 493         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 494         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 495         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 496         # rvm gemset and use it for everything.
 497
 498         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 499             || fatal 'rvm check'
 500
 501         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 502         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 503         # complaint about not being in first place already.
 504         rvm use @default 2>/dev/null
 505
 506         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 507         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 508         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 509         # ruby to the caller.
 510         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 511         rvm use "@${gemset}" --create \
 512             || fatal 'rvm gemset setup'
 513
 514         rvm env
 515     else
 516         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 517         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 518         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 519         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 520         # should be installed, and we should leave it alone.)
 521
 522         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 523             user_gempath="$(gem env gempath)"
 524             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 525         fi
 526         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 527
 528         # When we build and install our own gems, we install them in our
 529         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 530         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 531         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 532
 533         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 534         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 535         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
 536
 537         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 538         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 539         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 540     fi
 541     bundle config || gem install bundler \
 542         || fatal 'install bundler'
 543 }
 544
 545 with_test_gemset() {
 546     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 547         "$@"
 548     else
 549         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 550     fi
 551 }
 552
 553 gem_uninstall_if_exists() {
 554     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 555         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 556     fi
 557 }
 558
 559 setup_virtualenv() {
 560     local venvdest="$1"; shift
 561     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 562         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 563     elif [[ -n "$short" ]]; then
 564         return
 565     fi
 566     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 567         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 568         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 569     else
 570         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 571     fi
 572 }
 573
 574 initialize() {
 575     sanity_checks
 576
 577     echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 578
 579     if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 580         # Jenkins expects us to use this by default.
 581         CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 582     fi
 583
 584     # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 585     cd "$WORKSPACE"
 586     find -name '*.pyc' -delete
 587
 588     if [[ -z "$temp" ]]; then
 589         temp="$(mktemp -d)"
 590     fi
 591
 592     # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 593     for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE R_LIBS
 594     do
 595         if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 596             eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 597         fi
 598         if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 599             mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 600         fi
 601     done
 602
 603     rm -vf "${WORKSPACE}/tmp/*.log"
 604
 605     export PERLINSTALLBASE
 606     export PERL5LIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5${PERL5LIB:+:$PERL5LIB}"
 607
 608     export R_LIBS
 609
 610     export GOPATH
 611     # Make sure our compiled binaries under test override anything
 612     # else that might be in the environment.
 613     export PATH=$GOPATH/bin:$PATH
 614
 615     # Jenkins config requires that glob tmp/*.log match something. Ensure
 616     # that happens even if we don't end up running services that set up
 617     # logging.
 618     mkdir -p "${WORKSPACE}/tmp/" || fatal "could not mkdir ${WORKSPACE}/tmp"
 619     touch "${WORKSPACE}/tmp/controller.log" || fatal "could not touch ${WORKSPACE}/tmp/controller.log"
 620
 621     unset http_proxy https_proxy no_proxy
 622
 623     # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 624     # whine a lot.
 625     setup_ruby_environment
 626
 627     if [[ -s "$CONFIGSRC/config.yml" ]] ; then
 628         cp "$CONFIGSRC/config.yml" "$temp/test-config.yml"
 629         export ARVADOS_CONFIG="$temp/test-config.yml"
 630     else
 631         if [[ -s /etc/arvados/config.yml ]] ; then
 632             python > "$temp/test-config.yml" <<EOF
 633 import yaml
 634 import json
 635 v = list(yaml.safe_load(open('/etc/arvados/config.yml'))['Clusters'].values())[0]['PostgreSQL']
 636 v['Connection']['dbname'] = 'arvados_test'
 637 print(json.dumps({"Clusters": { "zzzzz": {'PostgreSQL': v}}}))
 638 EOF
 639             export ARVADOS_CONFIG="$temp/test-config.yml"
 640         else
 641             if [[ ! -f "$WORKSPACE/services/api/config/database.yml" ]]; then
 642                 fatal "Please provide a database.yml file for the test suite"
 643             fi
 644         fi
 645     fi
 646
 647     echo "PATH is $PATH"
 648 }
 649
 650 install_env() {
 651     (
 652         set -e
 653         mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 654         if [[ ! -h "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" ]]; then
 655             for d in \
 656                 "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/tmp/GOPATH" \
 657                     "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/tmp" \
 658                     "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"; do
 659                 [[ -d "$d" ]] && rmdir "$d"
 660             done
 661         fi
 662         for d in \
 663             "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/arvados" \
 664                 "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"; do
 665             [[ -h "$d" ]] && rm "$d"
 666         done
 667         ln -vsfT "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
 668         go get -v github.com/kardianos/govendor
 669         cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
 670         go get -v -d ...
 671         "$GOPATH/bin/govendor" sync
 672     ) || fatal "Go setup failed"
 673
 674     setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 675     . "$VENVDIR/bin/activate"
 676
 677     # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 678     pip install --no-cache-dir PyYAML \
 679         || fatal "pip install PyYAML failed"
 680
 681     # Preinstall libcloud if using a fork; otherwise nodemanager "pip
 682     # install" won't pick it up by default.
 683     if [[ -n "$LIBCLOUD_PIN_SRC" ]]; then
 684         pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 685             || pip install --pre --ignore-installed --no-cache-dir "$LIBCLOUD_PIN_SRC" >/dev/null \
 686             || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 687     fi
 688
 689     # Deactivate Python 2 virtualenv
 690     deactivate
 691
 692     # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 693     # Otherwise, skip dependent tests.
 694     PYTHON3=$(which python3)
 695     if [[ ${?} = 0 ]]; then
 696         setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 697     else
 698         PYTHON3=
 699         cat >&2 <<EOF
 700
 701 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
 702
 703 EOF
 704     fi
 705
 706     if ! which bundler >/dev/null
 707     then
 708         gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 709     fi
 710 }
 711
 712 retry() {
 713     remain="${repeat}"
 714     while :
 715     do
 716         if ${@}; then
 717             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 718                 remain=$((${remain}-1))
 719                 title "(repeating ${remain} more times)"
 720             else
 721                 break
 722             fi
 723         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 724             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 725             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 726             then
 727                 break
 728             fi
 729         else
 730             break
 731         fi
 732     done
 733 }
 734
 735 do_test() {
 736     case "${1}" in
 737         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 738             suite=apps/workbench
 739             ;;
 740         services/nodemanager | services/nodemanager_integration)
 741             suite=services/nodemanager_suite
 742             ;;
 743         *)
 744             suite="${1}"
 745             ;;
 746     esac
 747     if [[ -n "${skip[$suite]}" || \
 748               -n "${skip[$1]}" || \
 749               (${#only[@]} -ne 0 && ${only[$suite]} -eq 0 && ${only[$1]} -eq 0) ]]; then
 750         return 0
 751     fi
 752     case "${1}" in
 753         services/api)
 754             stop_services
 755             ;;
 756         gofmt | govendor | doc | lib/cli | lib/cloud/azure | lib/cloud/ec2 | lib/cloud/cloudtest | lib/cmd | lib/dispatchcloud/ssh_executor | lib/dispatchcloud/worker)
 757             # don't care whether services are running
 758             ;;
 759         *)
 760             if ! start_services; then
 761                 title "test $1 -- failed to start services"
 762                 return 1
 763             fi
 764             ;;
 765     esac
 766     retry do_test_once ${@}
 767 }
 768
 769 do_test_once() {
 770     unset result
 771
 772     title "test $1"
 773     timer_reset
 774
 775     result=
 776     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 777     if ! . "$VENVDIR/bin/activate"
 778     then
 779         result=1
 780     elif [[ "$2" == "go" ]]
 781     then
 782         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 783         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 784         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 785         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 786         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 787         # compilation errors.
 788         go get -ldflags "-X git.curoverse.com/arvados.git/lib/cmd.version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}" -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 789             cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 790             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 791         then
 792             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 793             # does:
 794             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 795         else
 796             # The above form gets verbose even when testargs is
 797             # empty, so use this form in such cases:
 798             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 799         fi
 800         result=${result:-$?}
 801         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 802         then
 803             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 804             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 805         fi
 806         [[ $result = 0 ]] && gofmt -e -d *.go
 807     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 808     then
 809         tries=0
 810         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 811         do
 812             tries=$((${tries}+1))
 813             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 814             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 815             "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 816             result=$?
 817             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 818             then
 819                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 820                 continue
 821             else
 822                 break
 823             fi
 824         done
 825     elif [[ "$2" != "" ]]
 826     then
 827         "test_$2"
 828     else
 829         "test_$1"
 830     fi
 831     result=${result:-$?}
 832     checkexit $result "$1 tests"
 833     title "test $1 -- `timer`"
 834     return $result
 835 }
 836
 837 do_install() {
 838     if [[ -n "${skip[install]}" || ( -n "${only_install}" && "${only_install}" != "${1}" && "${only_install}" != "${2}" ) ]]; then
 839         return 0
 840     fi
 841     retry do_install_once ${@}
 842 }
 843
 844 do_install_once() {
 845     title "install $1"
 846     timer_reset
 847
 848     result=
 849     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 850     if [[ "$1" != "env" ]] && ! . "$VENVDIR/bin/activate"; then
 851         result=1
 852     elif [[ "$2" == "go" ]]
 853     then
 854         go get -ldflags "-X git.curoverse.com/arvados.git/lib/cmd.version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}" -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 855     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 856     then
 857         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 858         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 859
 860         # Need to change to a different directory after creating
 861         # the source dist package to avoid a pip bug.
 862         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 863
 864         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 865         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 866         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 867         # install" ensures that we've actually installed the local package
 868         # we just built.
 869         cd "$WORKSPACE/$1" \
 870             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 871             && cd "$WORKSPACE" \
 872             && "${3}pip" install --no-cache-dir --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 873             && "${3}pip" install --no-cache-dir --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 874     elif [[ "$2" != "" ]]
 875     then
 876         "install_$2"
 877     else
 878         "install_$1"
 879     fi
 880     result=${result:-$?}
 881     checkexit $result "$1 install"
 882     title "install $1 -- `timer`"
 883     return $result
 884 }
 885
 886 bundle_install_trylocal() {
 887     (
 888         set -e
 889         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 890         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 891             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 892             bundle install --no-deployment
 893         fi
 894         bundle package --all
 895     )
 896 }
 897
 898 install_doc() {
 899     cd "$WORKSPACE/doc" \
 900         && bundle_install_trylocal \
 901         && rm -rf .site
 902 }
 903
 904 install_gem() {
 905     gemname=$1
 906     srcpath=$2
 907     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 908         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 909         && bundle_install_trylocal \
 910         && gem build "$gemname.gemspec" \
 911         && with_test_gemset gem install --no-document $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 912 }
 913
 914 install_sdk/ruby() {
 915     install_gem arvados sdk/ruby
 916 }
 917
 918 install_sdk/R() {
 919   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 920     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
 921        && Rscript --vanilla install_deps.R
 922   fi
 923 }
 924
 925 install_sdk/perl() {
 926     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 927         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 928         && make install INSTALLDIRS=perl
 929 }
 930
 931 install_sdk/cli() {
 932     install_gem arvados-cli sdk/cli
 933 }
 934
 935 install_services/login-sync() {
 936     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 937 }
 938
 939 install_services/api() {
 940     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 941         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 942
 943     rm -f config/environments/test.rb
 944     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 945
 946     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 947     then
 948         for f in database.yml
 949         do
 950             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 951         done
 952     fi
 953
 954     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 955     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 956     # is a postgresql superuser.
 957     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 958         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.safe_load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 959         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.pid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 960
 961     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 962
 963     cert="$WORKSPACE/services/api/tmp/self-signed"
 964     if [[ ! -e "$cert.pem" || "$(date -r "$cert.pem" +%s)" -lt 1512659226 ]]; then
 965         (
 966             dir="$WORKSPACE/services/api/tmp"
 967             set -ex
 968             openssl req -newkey rsa:2048 -nodes -subj '/C=US/ST=State/L=City/CN=localhost' -out "$cert.csr" -keyout "$cert.key" </dev/null
 969             openssl x509 -req -in "$cert.csr" -signkey "$cert.key" -out "$cert.pem" -days 3650 -extfile <(printf 'subjectAltName=DNS:localhost,DNS:::1,DNS:0.0.0.0,DNS:127.0.0.1,IP:::1,IP:0.0.0.0,IP:127.0.0.1')
 970         ) || return 1
 971     fi
 972
 973     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 974         && rm -rf tmp/git \
 975         && mkdir -p tmp/git \
 976         && cd tmp/git \
 977         && tar xf ../../test/test.git.tar \
 978         && mkdir -p internal.git \
 979         && git --git-dir internal.git init \
 980             || return 1
 981
 982     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 983         && RAILS_ENV=test bundle exec rails db:environment:set \
 984         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 985         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 986         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 987 }
 988
 989 declare -a pythonstuff
 990 pythonstuff=(
 991     sdk/pam
 992     sdk/python
 993     sdk/python:py3
 994     sdk/cwl
 995     sdk/cwl:py3
 996     services/dockercleaner:py3
 997     services/fuse
 998     services/nodemanager
 999     tools/crunchstat-summary
1000     tools/crunchstat-summary:py3
1001 )
1002
1003 declare -a gostuff
1004 gostuff=($(cd "$WORKSPACE" && git grep -lw func | grep \\.go | sed -e 's/\/[^\/]*$//' | sort -u))
1005
1006 install_apps/workbench() {
1007     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1008         && mkdir -p tmp/cache \
1009         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
1010         && RAILS_ENV=test RAILS_GROUPS=assets bundle exec rake npm:install
1011 }
1012
1013 test_doc() {
1014     (
1015         set -e
1016         cd "$WORKSPACE/doc"
1017         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
1018         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
1019         # do much good!
1020         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
1021     )
1022 }
1023
1024 test_gofmt() {
1025     cd "$WORKSPACE" || return 1
1026     dirs=$(ls -d */ | egrep -v 'vendor|tmp')
1027     [[ -z "$(gofmt -e -d $dirs | tee -a /dev/stderr)" ]]
1028 }
1029
1030 test_govendor() {
1031     (
1032         set -e
1033         cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
1034         # Remove cached source dirs in workdir. Otherwise, they will
1035         # not qualify as +missing or +external below, and we won't be
1036         # able to detect that they're missing from vendor/vendor.json.
1037         rm -rf vendor/*/
1038         go get -v -d ...
1039         "$GOPATH/bin/govendor" sync
1040         if [[ -n $("$GOPATH/bin/govendor" list +unused +missing +external | tee /dev/stderr) ]]; then
1041             echo >&2 "vendor/vendor.json has unused or missing dependencies -- try:
1042
1043 (export GOPATH=\"${GOPATH}\"; cd \$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git && \$GOPATH/bin/govendor add +missing +external && \$GOPATH/bin/govendor remove +unused)
1044
1045 "
1046             return 1
1047         fi
1048     )
1049 }
1050
1051 test_services/api() {
1052     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
1053     cd "$WORKSPACE/services/api" \
1054         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS='-v -d' ${testargs[services/api]}
1055 }
1056
1057 test_sdk/ruby() {
1058     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
1059         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
1060 }
1061
1062 test_sdk/R() {
1063   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
1064     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
1065         && Rscript --vanilla run_test.R
1066   fi
1067 }
1068
1069 test_sdk/cli() {
1070     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
1071         && mkdir -p /tmp/keep \
1072         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
1073 }
1074
1075 test_sdk/java-v2() {
1076     cd "$WORKSPACE/sdk/java-v2" && gradle test
1077 }
1078
1079 test_services/login-sync() {
1080     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
1081         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
1082 }
1083
1084 test_services/nodemanager_integration() {
1085     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
1086         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager_integration]}
1087 }
1088
1089 test_apps/workbench_units() {
1090     local TASK="test:units"
1091     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_units]}" ]]; then
1092         TASK="test"
1093     fi
1094     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1095         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} TESTOPTS='-v -d' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_units]}
1096 }
1097
1098 test_apps/workbench_functionals() {
1099     local TASK="test:functionals"
1100     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_functionals]}" ]]; then
1101         TASK="test"
1102     fi
1103     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1104         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} TESTOPTS='-v -d' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_functionals]}
1105 }
1106
1107 test_apps/workbench_integration() {
1108     local TASK="test:integration"
1109     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_integration]}" ]]; then
1110         TASK="test"
1111     fi
1112     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1113         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} TESTOPTS='-v -d' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_integration]}
1114 }
1115
1116 test_apps/workbench_benchmark() {
1117     local TASK="test:benchmark"
1118     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_benchmark]}" ]]; then
1119         TASK="test"
1120     fi
1121     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1122         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
1123 }
1124
1125 test_apps/workbench_profile() {
1126     local TASK="test:profile"
1127     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_profile]}" ]]; then
1128         TASK="test"
1129     fi
1130     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1131         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} ${testargs[apps/workbench_profile]}
1132 }
1133
1134 install_deps() {
1135     # Install parts needed by test suites
1136     do_install env
1137     do_install cmd/arvados-server go
1138     do_install sdk/cli
1139     do_install sdk/perl
1140     do_install sdk/python pip
1141     do_install sdk/ruby
1142     do_install services/api
1143     do_install services/arv-git-httpd go
1144     do_install services/keepproxy go
1145     do_install services/keepstore go
1146     do_install services/keep-web go
1147     do_install services/ws go
1148 }
1149
1150 install_all() {
1151     do_install env
1152     do_install doc
1153     do_install sdk/ruby
1154     do_install sdk/R
1155     do_install sdk/perl
1156     do_install sdk/cli
1157     do_install services/login-sync
1158     for p in "${pythonstuff[@]}"
1159     do
1160         dir=${p%:py3}
1161         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1162             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1163                 do_install ${dir} pip
1164             fi
1165         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1166             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1167                 do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1168             fi
1169         fi
1170     done
1171     for g in "${gostuff[@]}"
1172     do
1173         do_install "$g" go
1174     done
1175     do_install services/api
1176     do_install apps/workbench
1177 }
1178
1179 test_all() {
1180     stop_services
1181     do_test services/api
1182
1183     # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
1184     # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
1185     if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
1186         rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
1187         exit_cleanly
1188     fi
1189
1190     do_test gofmt
1191     do_test govendor
1192     do_test doc
1193     do_test sdk/ruby
1194     do_test sdk/R
1195     do_test sdk/cli
1196     do_test services/login-sync
1197     do_test sdk/java-v2
1198     do_test services/nodemanager_integration
1199     for p in "${pythonstuff[@]}"
1200     do
1201         dir=${p%:py3}
1202         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1203             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1204                 do_test ${dir} pip
1205             fi
1206         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1207             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1208                 do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1209             fi
1210         fi
1211     done
1212
1213     for g in "${gostuff[@]}"
1214     do
1215         do_test "$g" go
1216     done
1217     do_test apps/workbench_units
1218     do_test apps/workbench_functionals
1219     do_test apps/workbench_integration
1220     do_test apps/workbench_benchmark
1221     do_test apps/workbench_profile
1222 }
1223
1224 help_interactive() {
1225     echo "== Interactive commands:"
1226     echo "TARGET                 (short for 'test DIR')"
1227     echo "test TARGET"
1228     echo "test TARGET:py3        (test with python3)"
1229     echo "test TARGET -check.vv  (pass arguments to test)"
1230     echo "install TARGET"
1231     echo "install env            (go/python libs)"
1232     echo "install deps           (go/python libs + arvados components needed for integration tests)"
1233     echo "reset                  (...services used by integration tests)"
1234     echo "exit"
1235     echo "== Test targets:"
1236     echo "${!testfuncargs[@]}" | tr ' ' '\n' | sort | column
1237 }
1238
1239 initialize
1240
1241 declare -A testfuncargs=()
1242 for g in "${gostuff[@]}"; do
1243     testfuncargs[$g]="$g go"
1244 done
1245 for p in "${pythonstuff[@]}"; do
1246     dir=${p%:py3}
1247     testfuncargs[$dir]="$dir pip $VENVDIR/bin/"
1248     testfuncargs[$dir:py3]="$dir pip $VENV3DIR/bin/"
1249 done
1250
1251 testfuncargs["sdk/cli"]="sdk/cli"
1252 testfuncargs["sdk/R"]="sdk/R"
1253 testfuncargs["sdk/java-v2"]="sdk/java-v2"
1254 testfuncargs["apps/workbench_units"]="apps/workbench_units"
1255 testfuncargs["apps/workbench_functionals"]="apps/workbench_functionals"
1256 testfuncargs["apps/workbench_integration"]="apps/workbench_integration"
1257 testfuncargs["apps/workbench_benchmark"]="apps/workbench_benchmark"
1258 testfuncargs["apps/workbench_profile"]="apps/workbench_profile"
1259
1260 if [[ -z ${interactive} ]]; then
1261     install_all
1262     test_all
1263 else
1264     skip=()
1265     only=()
1266     only_install=()
1267     if [[ -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then stop_services; fi
1268     setnextcmd() {
1269         if [[ "$TERM" = dumb ]]; then
1270             # assume emacs, or something, is offering a history buffer
1271             # and pre-populating the command will only cause trouble
1272             nextcmd=
1273         elif [[ ! -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then
1274             nextcmd="install deps"
1275         else
1276             nextcmd=""
1277         fi
1278     }
1279     echo
1280     help_interactive
1281     nextcmd="install deps"
1282     setnextcmd
1283     HISTFILE="$WORKSPACE/tmp/.history"
1284     history -r
1285     while read -p 'What next? ' -e -i "$nextcmd" nextcmd; do
1286         history -s "$nextcmd"
1287         history -w
1288         read verb target opts <<<"${nextcmd}"
1289         target="${target%/}"
1290         target="${target/\/:/:}"
1291         case "${verb}" in
1292             "exit" | "quit")
1293                 exit_cleanly
1294                 ;;
1295             "reset")
1296                 stop_services
1297                 ;;
1298             "test" | "install")
1299                 case "$target" in
1300                     "")
1301                         help_interactive
1302                         ;;
1303                     all | deps)
1304                         ${verb}_${target}
1305                         ;;
1306                     *)
1307                         testargs["$target"]="${opts}"
1308                         tt="${testfuncargs[${target}]}"
1309                         tt="${tt:-$target}"
1310                         do_$verb $tt
1311                         ;;
1312                 esac
1313                 ;;
1314             "" | "help" | *)
1315                 help_interactive
1316                 ;;
1317         esac
1318         if [[ ${#successes[@]} -gt 0 || ${#failures[@]} -gt 0 ]]; then
1319             report_outcomes
1320             successes=()
1321             failures=()
1322         fi
1323         cd "$WORKSPACE"
1324         setnextcmd
1325     done
1326     echo
1327 fi
1328 exit_cleanly