Merge branch '17224-login-sync' refs #17224
[arvados.git] / tools / sync-groups / sync-groups.go
1 // Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
2 //
3 // SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
4
5 package main
6
7 import (
8         "bytes"
9         "encoding/csv"
10         "encoding/json"
11         "flag"
12         "fmt"
13         "io"
14         "log"
15         "net/url"
16         "os"
17         "strings"
18
19         "git.arvados.org/arvados.git/sdk/go/arvados"
20 )
21
22 var version = "dev"
23
24 type resourceList interface {
25         Len() int
26         GetItems() []interface{}
27 }
28
29 // GroupPermissions maps permission levels on groups (can_read, can_write, can_manage)
30 type GroupPermissions map[string]bool
31
32 // GroupInfo tracks previous and current member's permissions on a particular Group
33 type GroupInfo struct {
34         Group           arvados.Group
35         PreviousMembers map[string]GroupPermissions
36         CurrentMembers  map[string]GroupPermissions
37 }
38
39 // GetUserID returns the correct user id value depending on the selector
40 func GetUserID(u arvados.User, idSelector string) (string, error) {
41         switch idSelector {
42         case "email":
43                 return u.Email, nil
44         case "username":
45                 return u.Username, nil
46         default:
47                 return "", fmt.Errorf("cannot identify user by %q selector", idSelector)
48         }
49 }
50
51 // UserList implements resourceList interface
52 type UserList struct {
53         arvados.UserList
54 }
55
56 // Len returns the amount of items this list holds
57 func (l UserList) Len() int {
58         return len(l.Items)
59 }
60
61 // GetItems returns the list of items
62 func (l UserList) GetItems() (out []interface{}) {
63         for _, item := range l.Items {
64                 out = append(out, item)
65         }
66         return
67 }
68
69 // GroupList implements resourceList interface
70 type GroupList struct {
71         arvados.GroupList
72 }
73
74 // Len returns the amount of items this list holds
75 func (l GroupList) Len() int {
76         return len(l.Items)
77 }
78
79 // GetItems returns the list of items
80 func (l GroupList) GetItems() (out []interface{}) {
81         for _, item := range l.Items {
82                 out = append(out, item)
83         }
84         return
85 }
86
87 // LinkList implements resourceList interface
88 type LinkList struct {
89         arvados.LinkList
90 }
91
92 // Len returns the amount of items this list holds
93 func (l LinkList) Len() int {
94         return len(l.Items)
95 }
96
97 // GetItems returns the list of items
98 func (l LinkList) GetItems() (out []interface{}) {
99         for _, item := range l.Items {
100                 out = append(out, item)
101         }
102         return
103 }
104
105 func main() {
106         // Parse & validate arguments, set up arvados client.
107         cfg, err := GetConfig()
108         if err != nil {
109                 log.Fatalf("%v", err)
110         }
111
112         if err := doMain(&cfg); err != nil {
113                 log.Fatalf("%v", err)
114         }
115 }
116
117 // ConfigParams holds configuration data for this tool
118 type ConfigParams struct {
119         Path            string
120         UserID          string
121         Verbose         bool
122         ParentGroupUUID string
123         ParentGroupName string
124         SysUserUUID     string
125         Client          *arvados.Client
126 }
127
128 // ParseFlags parses and validates command line arguments
129 func ParseFlags(config *ConfigParams) error {
130         // Acceptable attributes to identify a user on the CSV file
131         userIDOpts := map[string]bool{
132                 "email":    true, // default
133                 "username": true,
134         }
135
136         flags := flag.NewFlagSet(os.Args[0], flag.ExitOnError)
137
138         // Set up usage message
139         flags.Usage = func() {
140                 usageStr := `Synchronize remote groups into Arvados from a CSV format file with 3 columns:
141   * 1st: Group name
142   * 2nd: User identifier
143   * 3rd (Optional): User permission on the group: can_read, can_write or can_manage. (Default: can_write)`
144                 fmt.Fprintf(os.Stderr, "%s\n\n", usageStr)
145                 fmt.Fprintf(os.Stderr, "Usage:\n%s [OPTIONS] <input-file.csv>\n\n", os.Args[0])
146                 fmt.Fprintf(os.Stderr, "Options:\n")
147                 flags.PrintDefaults()
148         }
149
150         // Set up option flags
151         userID := flags.String(
152                 "user-id",
153                 "email",
154                 "Attribute by which every user is identified. Valid values are: email and username.")
155         verbose := flags.Bool(
156                 "verbose",
157                 false,
158                 "Log informational messages. Off by default.")
159         getVersion := flags.Bool(
160                 "version",
161                 false,
162                 "Print version information and exit.")
163         parentGroupUUID := flags.String(
164                 "parent-group-uuid",
165                 "",
166                 "Use given group UUID as a parent for the remote groups. Should be owned by the system user. If not specified, a group named '"+config.ParentGroupName+"' will be used (and created if nonexistant).")
167
168         // Parse args; omit the first arg which is the command name
169         flags.Parse(os.Args[1:])
170
171         // Print version information if requested
172         if *getVersion {
173                 fmt.Printf("%s %s\n", os.Args[0], version)
174                 os.Exit(0)
175         }
176
177         // Input file as a required positional argument
178         if flags.NArg() == 0 {
179                 return fmt.Errorf("please provide a path to an input file")
180         }
181         srcPath := &os.Args[flags.NFlag()+1]
182
183         // Validations
184         if *srcPath == "" {
185                 return fmt.Errorf("input file path invalid")
186         }
187         if !userIDOpts[*userID] {
188                 var options []string
189                 for opt := range userIDOpts {
190                         options = append(options, opt)
191                 }
192                 return fmt.Errorf("user ID must be one of: %s", strings.Join(options, ", "))
193         }
194
195         config.Path = *srcPath
196         config.ParentGroupUUID = *parentGroupUUID
197         config.UserID = *userID
198         config.Verbose = *verbose
199
200         return nil
201 }
202
203 // SetParentGroup finds/create parent group of all remote groups
204 func SetParentGroup(cfg *ConfigParams) error {
205         var parentGroup arvados.Group
206         if cfg.ParentGroupUUID == "" {
207                 // UUID not provided, search for preexisting parent group
208                 var gl GroupList
209                 params := arvados.ResourceListParams{
210                         Filters: []arvados.Filter{{
211                                 Attr:     "name",
212                                 Operator: "=",
213                                 Operand:  cfg.ParentGroupName,
214                         }, {
215                                 Attr:     "owner_uuid",
216                                 Operator: "=",
217                                 Operand:  cfg.SysUserUUID,
218                         }},
219                 }
220                 if err := cfg.Client.RequestAndDecode(&gl, "GET", "/arvados/v1/groups", nil, params); err != nil {
221                         return fmt.Errorf("error searching for parent group: %s", err)
222                 }
223                 if len(gl.Items) == 0 {
224                         // Default parent group does not exist, create it.
225                         if cfg.Verbose {
226                                 log.Println("Default parent group not found, creating...")
227                         }
228                         groupData := map[string]string{
229                                 "name":        cfg.ParentGroupName,
230                                 "owner_uuid":  cfg.SysUserUUID,
231                                 "group_class": "role",
232                         }
233                         if err := CreateGroup(cfg, &parentGroup, groupData); err != nil {
234                                 return fmt.Errorf("error creating system user owned group named %q: %s", groupData["name"], err)
235                         }
236                 } else if len(gl.Items) == 1 {
237                         // Default parent group found.
238                         parentGroup = gl.Items[0]
239                 } else {
240                         // This should never happen, as there's an unique index for
241                         // (owner_uuid, name) on groups.
242                         return fmt.Errorf("bug: found %d groups owned by system user and named %q", len(gl.Items), cfg.ParentGroupName)
243                 }
244                 cfg.ParentGroupUUID = parentGroup.UUID
245         } else {
246                 // UUID provided. Check if exists and if it's owned by system user
247                 if err := GetGroup(cfg, &parentGroup, cfg.ParentGroupUUID); err != nil {
248                         return fmt.Errorf("error searching for parent group with UUID %q: %s", cfg.ParentGroupUUID, err)
249                 }
250                 if parentGroup.OwnerUUID != cfg.SysUserUUID {
251                         return fmt.Errorf("parent group %q (%s) must be owned by system user", parentGroup.Name, cfg.ParentGroupUUID)
252                 }
253         }
254         return nil
255 }
256
257 // GetConfig sets up a ConfigParams struct
258 func GetConfig() (config ConfigParams, err error) {
259         config.ParentGroupName = "Externally synchronized groups"
260
261         // Command arguments
262         err = ParseFlags(&config)
263         if err != nil {
264                 return config, err
265         }
266
267         // Arvados Client setup
268         config.Client = arvados.NewClientFromEnv()
269
270         // Check current user permissions & get System user's UUID
271         u, err := config.Client.CurrentUser()
272         if err != nil {
273                 return config, fmt.Errorf("error getting the current user: %s", err)
274         }
275         if !u.IsActive || !u.IsAdmin {
276                 return config, fmt.Errorf("current user (%s) is not an active admin user", u.UUID)
277         }
278
279         var ac struct{ ClusterID string }
280         err = config.Client.RequestAndDecode(&ac, "GET", "arvados/v1/config", nil, nil)
281         if err != nil {
282                 return config, fmt.Errorf("error getting the exported config: %s", err)
283         }
284         config.SysUserUUID = ac.ClusterID + "-tpzed-000000000000000"
285
286         // Set up remote groups' parent
287         if err = SetParentGroup(&config); err != nil {
288                 return config, err
289         }
290
291         return config, nil
292 }
293
294 func doMain(cfg *ConfigParams) error {
295         // Try opening the input file early, just in case there's a problem.
296         f, err := os.Open(cfg.Path)
297         if err != nil {
298                 return fmt.Errorf("%s", err)
299         }
300         defer f.Close()
301
302         log.Printf("%s %s started. Using %q as users id and parent group UUID %q", os.Args[0], version, cfg.UserID, cfg.ParentGroupUUID)
303
304         // Get the complete user list to minimize API Server requests
305         allUsers := make(map[string]arvados.User)
306         userIDToUUID := make(map[string]string) // Index by email or username
307         results, err := GetAll(cfg.Client, "users", arvados.ResourceListParams{}, &UserList{})
308         if err != nil {
309                 return fmt.Errorf("error getting user list: %s", err)
310         }
311         log.Printf("Found %d users", len(results))
312         for _, item := range results {
313                 u := item.(arvados.User)
314                 allUsers[u.UUID] = u
315                 uID, err := GetUserID(u, cfg.UserID)
316                 if err != nil {
317                         return err
318                 }
319                 userIDToUUID[uID] = u.UUID
320                 if cfg.Verbose {
321                         log.Printf("Seen user %q (%s)", u.Username, u.UUID)
322                 }
323         }
324
325         // Get remote groups and their members
326         remoteGroups, groupNameToUUID, err := GetRemoteGroups(cfg, allUsers)
327         if err != nil {
328                 return err
329         }
330         log.Printf("Found %d remote groups", len(remoteGroups))
331         if cfg.Verbose {
332                 for groupUUID := range remoteGroups {
333                         log.Printf("- Group %q: %d users", remoteGroups[groupUUID].Group.Name, len(remoteGroups[groupUUID].PreviousMembers))
334                 }
335         }
336
337         membershipsRemoved := 0
338
339         // Read the CSV file
340         groupsCreated, membershipsAdded, membershipsSkipped, err := ProcessFile(cfg, f, userIDToUUID, groupNameToUUID, remoteGroups, allUsers)
341         if err != nil {
342                 return err
343         }
344
345         // Remove previous members not listed on this run
346         for groupUUID := range remoteGroups {
347                 gi := remoteGroups[groupUUID]
348                 evictedMemberPerms := subtract(gi.PreviousMembers, gi.CurrentMembers)
349                 groupName := gi.Group.Name
350                 if len(evictedMemberPerms) > 0 {
351                         log.Printf("Removing permissions from %d users on group %q", len(evictedMemberPerms), groupName)
352                 }
353                 for member := range evictedMemberPerms {
354                         var perms []string
355                         completeMembershipRemoval := false
356                         if _, ok := gi.CurrentMembers[member]; !ok {
357                                 completeMembershipRemoval = true
358                                 membershipsRemoved++
359                         } else {
360                                 // Collect which user->group permission links should be removed
361                                 for p := range evictedMemberPerms[member] {
362                                         if evictedMemberPerms[member][p] {
363                                                 perms = append(perms, p)
364                                         }
365                                 }
366                                 membershipsRemoved += len(perms)
367                         }
368                         if err := RemoveMemberLinksFromGroup(cfg, allUsers[userIDToUUID[member]],
369                                 perms, completeMembershipRemoval, gi.Group); err != nil {
370                                 return err
371                         }
372                 }
373         }
374         log.Printf("Groups created: %d. Memberships added: %d, removed: %d, skipped: %d", groupsCreated, membershipsAdded, membershipsRemoved, membershipsSkipped)
375
376         return nil
377 }
378
379 // ProcessFile reads the CSV file and process every record
380 func ProcessFile(
381         cfg *ConfigParams,
382         f *os.File,
383         userIDToUUID map[string]string,
384         groupNameToUUID map[string]string,
385         remoteGroups map[string]*GroupInfo,
386         allUsers map[string]arvados.User,
387 ) (groupsCreated, membersAdded, membersSkipped int, err error) {
388         lineNo := 0
389         csvReader := csv.NewReader(f)
390         // Allow variable number of fields.
391         csvReader.FieldsPerRecord = -1
392         for {
393                 record, e := csvReader.Read()
394                 if e == io.EOF {
395                         break
396                 }
397                 lineNo++
398                 if e != nil {
399                         err = fmt.Errorf("error parsing %q, line %d", cfg.Path, lineNo)
400                         return
401                 }
402                 // Only allow 2 or 3 fields per record for backwards compatibility.
403                 if len(record) < 2 || len(record) > 3 {
404                         err = fmt.Errorf("error parsing %q, line %d: found %d fields but only 2 or 3 are allowed", cfg.Path, lineNo, len(record))
405                         return
406                 }
407                 groupName := strings.TrimSpace(record[0])
408                 groupMember := strings.TrimSpace(record[1]) // User ID (username or email)
409                 groupPermission := "can_write"
410                 if len(record) == 3 {
411                         groupPermission = strings.ToLower(record[2])
412                 }
413                 if groupName == "" || groupMember == "" || groupPermission == "" {
414                         log.Printf("Warning: CSV record has at least one empty field (%s, %s, %s). Skipping", groupName, groupMember, groupPermission)
415                         membersSkipped++
416                         continue
417                 }
418                 if !(groupPermission == "can_read" || groupPermission == "can_write" || groupPermission == "can_manage") {
419                         log.Printf("Warning: 3rd field should be 'can_read', 'can_write' or 'can_manage'. Found: %q at line %d, skipping.", groupPermission, lineNo)
420                         membersSkipped++
421                         continue
422                 }
423                 if _, found := userIDToUUID[groupMember]; !found {
424                         // User not present on the system, skip.
425                         log.Printf("Warning: there's no user with %s %q on the system, skipping.", cfg.UserID, groupMember)
426                         membersSkipped++
427                         continue
428                 }
429                 if _, found := groupNameToUUID[groupName]; !found {
430                         // Group doesn't exist, create it before continuing
431                         if cfg.Verbose {
432                                 log.Printf("Remote group %q not found, creating...", groupName)
433                         }
434                         var newGroup arvados.Group
435                         groupData := map[string]string{
436                                 "name":        groupName,
437                                 "owner_uuid":  cfg.ParentGroupUUID,
438                                 "group_class": "role",
439                         }
440                         if e := CreateGroup(cfg, &newGroup, groupData); e != nil {
441                                 err = fmt.Errorf("error creating group named %q: %s", groupName, e)
442                                 return
443                         }
444                         // Update cached group data
445                         groupNameToUUID[groupName] = newGroup.UUID
446                         remoteGroups[newGroup.UUID] = &GroupInfo{
447                                 Group:           newGroup,
448                                 PreviousMembers: make(map[string]GroupPermissions),
449                                 CurrentMembers:  make(map[string]GroupPermissions),
450                         }
451                         groupsCreated++
452                 }
453                 // Both group & user exist, check if user is a member
454                 groupUUID := groupNameToUUID[groupName]
455                 gi := remoteGroups[groupUUID]
456                 if !gi.PreviousMembers[groupMember][groupPermission] && !gi.CurrentMembers[groupMember][groupPermission] {
457                         if cfg.Verbose {
458                                 log.Printf("Adding %q to group %q", groupMember, groupName)
459                         }
460                         // User permissionwasn't there, but should be. Avoid duplicating the
461                         // group->user link when necessary.
462                         createG2ULink := true
463                         if _, ok := gi.PreviousMembers[groupMember]; ok {
464                                 createG2ULink = false // User is already member of the group
465                         }
466                         if e := AddMemberToGroup(cfg, allUsers[userIDToUUID[groupMember]], gi.Group, groupPermission, createG2ULink); e != nil {
467                                 err = e
468                                 return
469                         }
470                         membersAdded++
471                 }
472                 if _, ok := gi.CurrentMembers[groupMember]; ok {
473                         gi.CurrentMembers[groupMember][groupPermission] = true
474                 } else {
475                         gi.CurrentMembers[groupMember] = GroupPermissions{groupPermission: true}
476                 }
477
478         }
479         return
480 }
481
482 // GetAll : Adds all objects of type 'resource' to the 'allItems' list
483 func GetAll(c *arvados.Client, res string, params arvados.ResourceListParams, page resourceList) (allItems []interface{}, err error) {
484         // Use the maximum page size the server allows
485         limit := 1<<31 - 1
486         params.Limit = &limit
487         params.Offset = 0
488         params.Order = "uuid"
489         for {
490                 if err = GetResourceList(c, &page, res, params); err != nil {
491                         return allItems, err
492                 }
493                 // Have we finished paging?
494                 if page.Len() == 0 {
495                         break
496                 }
497                 for _, i := range page.GetItems() {
498                         allItems = append(allItems, i)
499                 }
500                 params.Offset += page.Len()
501         }
502         return allItems, nil
503 }
504
505 func subtract(setA map[string]GroupPermissions, setB map[string]GroupPermissions) map[string]GroupPermissions {
506         result := make(map[string]GroupPermissions)
507         for element := range setA {
508                 if _, ok := setB[element]; !ok {
509                         result[element] = setA[element]
510                 } else {
511                         for perm := range setA[element] {
512                                 if _, ok := setB[element][perm]; !ok {
513                                         result[element] = GroupPermissions{perm: true}
514                                 }
515                         }
516                 }
517         }
518         return result
519 }
520
521 func jsonReader(rscName string, ob interface{}) io.Reader {
522         j, err := json.Marshal(ob)
523         if err != nil {
524                 panic(err)
525         }
526         v := url.Values{}
527         v[rscName] = []string{string(j)}
528         return bytes.NewBufferString(v.Encode())
529 }
530
531 // GetRemoteGroups fetches all remote groups with their members
532 func GetRemoteGroups(cfg *ConfigParams, allUsers map[string]arvados.User) (remoteGroups map[string]*GroupInfo, groupNameToUUID map[string]string, err error) {
533         remoteGroups = make(map[string]*GroupInfo)
534         groupNameToUUID = make(map[string]string) // Index by group name
535
536         params := arvados.ResourceListParams{
537                 Filters: []arvados.Filter{{
538                         Attr:     "tail_uuid",
539                         Operator: "=",
540                         Operand:  cfg.ParentGroupUUID,
541                 }},
542         }
543         results, err := GetAll(cfg.Client, "links", params, &LinkList{})
544         if err != nil {
545                 return remoteGroups, groupNameToUUID, fmt.Errorf("error getting remote groups: %s", err)
546         }
547         for _, item := range results {
548                 var group arvados.Group
549                 err = GetGroup(cfg, &group, item.(arvados.Link).HeadUUID)
550                 if err != nil {
551                         return remoteGroups, groupNameToUUID, fmt.Errorf("error getting remote group: %s", err)
552                 }
553                 // Group -> User filter
554                 g2uFilter := arvados.ResourceListParams{
555                         Filters: []arvados.Filter{{
556                                 Attr:     "owner_uuid",
557                                 Operator: "=",
558                                 Operand:  cfg.SysUserUUID,
559                         }, {
560                                 Attr:     "link_class",
561                                 Operator: "=",
562                                 Operand:  "permission",
563                         }, {
564                                 Attr:     "name",
565                                 Operator: "=",
566                                 Operand:  "can_read",
567                         }, {
568                                 Attr:     "tail_uuid",
569                                 Operator: "=",
570                                 Operand:  group.UUID,
571                         }, {
572                                 Attr:     "head_uuid",
573                                 Operator: "is_a",
574                                 Operand:  "arvados#user",
575                         }},
576                 }
577                 // User -> Group filter
578                 u2gFilter := arvados.ResourceListParams{
579                         Filters: []arvados.Filter{{
580                                 Attr:     "owner_uuid",
581                                 Operator: "=",
582                                 Operand:  cfg.SysUserUUID,
583                         }, {
584                                 Attr:     "link_class",
585                                 Operator: "=",
586                                 Operand:  "permission",
587                         }, {
588                                 Attr:     "name",
589                                 Operator: "in",
590                                 Operand:  []string{"can_read", "can_write", "can_manage"},
591                         }, {
592                                 Attr:     "head_uuid",
593                                 Operator: "=",
594                                 Operand:  group.UUID,
595                         }, {
596                                 Attr:     "tail_uuid",
597                                 Operator: "is_a",
598                                 Operand:  "arvados#user",
599                         }},
600                 }
601                 g2uLinks, err := GetAll(cfg.Client, "links", g2uFilter, &LinkList{})
602                 if err != nil {
603                         return remoteGroups, groupNameToUUID, fmt.Errorf("error getting group->user 'can_read' links for group %q: %s", group.Name, err)
604                 }
605                 u2gLinks, err := GetAll(cfg.Client, "links", u2gFilter, &LinkList{})
606                 if err != nil {
607                         return remoteGroups, groupNameToUUID, fmt.Errorf("error getting user->group links for group %q: %s", group.Name, err)
608                 }
609                 // Build a list of user ids (email or username) belonging to this group.
610                 membersSet := make(map[string]GroupPermissions)
611                 u2gLinkSet := make(map[string]GroupPermissions)
612                 for _, l := range u2gLinks {
613                         link := l.(arvados.Link)
614                         // Also save the member's group access level.
615                         if _, ok := u2gLinkSet[link.TailUUID]; ok {
616                                 u2gLinkSet[link.TailUUID][link.Name] = true
617                         } else {
618                                 u2gLinkSet[link.TailUUID] = GroupPermissions{link.Name: true}
619                         }
620                 }
621                 for _, item := range g2uLinks {
622                         link := item.(arvados.Link)
623                         // We may have received an old link pointing to a removed account.
624                         if _, found := allUsers[link.HeadUUID]; !found {
625                                 continue
626                         }
627                         // The matching User -> Group link may not exist if the link
628                         // creation failed on a previous run. If that's the case, don't
629                         // include this account on the "previous members" list.
630                         if _, found := u2gLinkSet[link.HeadUUID]; !found {
631                                 continue
632                         }
633                         memberID, err := GetUserID(allUsers[link.HeadUUID], cfg.UserID)
634                         if err != nil {
635                                 return remoteGroups, groupNameToUUID, err
636                         }
637                         membersSet[memberID] = u2gLinkSet[link.HeadUUID]
638                 }
639                 remoteGroups[group.UUID] = &GroupInfo{
640                         Group:           group,
641                         PreviousMembers: membersSet,
642                         CurrentMembers:  make(map[string]GroupPermissions),
643                 }
644                 groupNameToUUID[group.Name] = group.UUID
645         }
646         return remoteGroups, groupNameToUUID, nil
647 }
648
649 // RemoveMemberLinksFromGroup remove all links related to the membership
650 func RemoveMemberLinksFromGroup(cfg *ConfigParams, user arvados.User, linkNames []string, completeRemoval bool, group arvados.Group) error {
651         if cfg.Verbose {
652                 log.Printf("Getting group membership links for user %q (%s) on group %q (%s)", user.Username, user.UUID, group.Name, group.UUID)
653         }
654         var links []interface{}
655         var filters [][]arvados.Filter
656         if completeRemoval {
657                 // Search for all group<->user links (both ways)
658                 filters = [][]arvados.Filter{
659                         // Group -> User
660                         {{
661                                 Attr:     "link_class",
662                                 Operator: "=",
663                                 Operand:  "permission",
664                         }, {
665                                 Attr:     "tail_uuid",
666                                 Operator: "=",
667                                 Operand:  group.UUID,
668                         }, {
669                                 Attr:     "head_uuid",
670                                 Operator: "=",
671                                 Operand:  user.UUID,
672                         }},
673                         // Group <- User
674                         {{
675                                 Attr:     "link_class",
676                                 Operator: "=",
677                                 Operand:  "permission",
678                         }, {
679                                 Attr:     "tail_uuid",
680                                 Operator: "=",
681                                 Operand:  user.UUID,
682                         }, {
683                                 Attr:     "head_uuid",
684                                 Operator: "=",
685                                 Operand:  group.UUID,
686                         }},
687                 }
688         } else {
689                 // Search only for the requested Group <- User permission links
690                 filters = [][]arvados.Filter{
691                         {{
692                                 Attr:     "link_class",
693                                 Operator: "=",
694                                 Operand:  "permission",
695                         }, {
696                                 Attr:     "tail_uuid",
697                                 Operator: "=",
698                                 Operand:  user.UUID,
699                         }, {
700                                 Attr:     "head_uuid",
701                                 Operator: "=",
702                                 Operand:  group.UUID,
703                         }, {
704                                 Attr:     "name",
705                                 Operator: "in",
706                                 Operand:  linkNames,
707                         }},
708                 }
709         }
710
711         for _, filterset := range filters {
712                 l, err := GetAll(cfg.Client, "links", arvados.ResourceListParams{Filters: filterset}, &LinkList{})
713                 if err != nil {
714                         userID, _ := GetUserID(user, cfg.UserID)
715                         return fmt.Errorf("error getting links needed to remove user %q from group %q: %s", userID, group.Name, err)
716                 }
717                 for _, link := range l {
718                         links = append(links, link)
719                 }
720         }
721         for _, item := range links {
722                 link := item.(arvados.Link)
723                 userID, _ := GetUserID(user, cfg.UserID)
724                 if cfg.Verbose {
725                         log.Printf("Removing %q permission link for %q on group %q", link.Name, userID, group.Name)
726                 }
727                 if err := DeleteLink(cfg, link.UUID); err != nil {
728                         return fmt.Errorf("error removing user %q from group %q: %s", userID, group.Name, err)
729                 }
730         }
731         return nil
732 }
733
734 // AddMemberToGroup create membership links
735 func AddMemberToGroup(cfg *ConfigParams, user arvados.User, group arvados.Group, perm string, createG2ULink bool) error {
736         var newLink arvados.Link
737         var linkData map[string]string
738         if createG2ULink {
739                 linkData = map[string]string{
740                         "owner_uuid": cfg.SysUserUUID,
741                         "link_class": "permission",
742                         "name":       "can_read",
743                         "tail_uuid":  group.UUID,
744                         "head_uuid":  user.UUID,
745                 }
746                 if err := CreateLink(cfg, &newLink, linkData); err != nil {
747                         userID, _ := GetUserID(user, cfg.UserID)
748                         return fmt.Errorf("error adding group %q -> user %q read permission: %s", group.Name, userID, err)
749                 }
750         }
751         linkData = map[string]string{
752                 "owner_uuid": cfg.SysUserUUID,
753                 "link_class": "permission",
754                 "name":       perm,
755                 "tail_uuid":  user.UUID,
756                 "head_uuid":  group.UUID,
757         }
758         if err := CreateLink(cfg, &newLink, linkData); err != nil {
759                 userID, _ := GetUserID(user, cfg.UserID)
760                 return fmt.Errorf("error adding user %q -> group %q %s permission: %s", userID, group.Name, perm, err)
761         }
762         return nil
763 }
764
765 // CreateGroup creates a group with groupData parameters, assigns it to dst
766 func CreateGroup(cfg *ConfigParams, dst *arvados.Group, groupData map[string]string) error {
767         return cfg.Client.RequestAndDecode(dst, "POST", "/arvados/v1/groups", jsonReader("group", groupData), nil)
768 }
769
770 // GetGroup fetches a group by its UUID
771 func GetGroup(cfg *ConfigParams, dst *arvados.Group, groupUUID string) error {
772         return cfg.Client.RequestAndDecode(&dst, "GET", "/arvados/v1/groups/"+groupUUID, nil, nil)
773 }
774
775 // CreateLink creates a link with linkData parameters, assigns it to dst
776 func CreateLink(cfg *ConfigParams, dst *arvados.Link, linkData map[string]string) error {
777         return cfg.Client.RequestAndDecode(dst, "POST", "/arvados/v1/links", jsonReader("link", linkData), nil)
778 }
779
780 // DeleteLink deletes a link by its UUID
781 func DeleteLink(cfg *ConfigParams, linkUUID string) error {
782         if linkUUID == "" {
783                 return fmt.Errorf("cannot delete link with invalid UUID: %q", linkUUID)
784         }
785         return cfg.Client.RequestAndDecode(&arvados.Link{}, "DELETE", "/arvados/v1/links/"+linkUUID, nil, nil)
786 }
787
788 // GetResourceList fetches res list using params
789 func GetResourceList(c *arvados.Client, dst *resourceList, res string, params interface{}) error {
790         return c.RequestAndDecode(dst, "GET", "/arvados/v1/"+res, nil, params)
791 }