build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2
   3 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin
   4
   5 COLUMNS=80
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
   7
   8 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
   9 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  10
  11 Exit non-zero if any tests fail.
  12
  13 Syntax:
  14         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  15
  16 Options:
  17
  18 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  19 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  20 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  21                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  22 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  23                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  24                subsequent invocations.
  25 --skip-install Do not run any install steps. Just run tests.
  26                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  27                from a previous invocation if you use this option.
  28 --only-install Run specific install step
  29 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  30 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  31 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  32                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  33 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  34                Restrict apiserver tests to the given file
  35 sdk/python_test="--test-suite test.test_keep_locator"
  36                Restrict Python SDK tests to the given class
  37 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  38                Restrict Workbench tests to the given file
  39 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  40                Show all log messages, even when tests pass (also works
  41                with services/keepstore_test etc.)
  42 ARVADOS_DEBUG=1
  43                Print more debug messages
  44 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  45                *_test, and other examples shown above.
  46
  47 Assuming --skip-install is not given, all components are installed
  48 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  49 test suites depend on other components being installed, and installing
  50 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  51
  52 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  53 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  54
  55 More information and background:
  56
  57 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  58
  59 Available tests:
  60
  61 apps/workbench (*)
  62 apps/workbench_units (*)
  63 apps/workbench_functionals (*)
  64 apps/workbench_integration (*)
  65 apps/workbench_benchmark
  66 apps/workbench_profile
  67 doc
  68 services/api
  69 services/arv-git-httpd
  70 services/crunchstat
  71 services/dockercleaner
  72 services/fuse
  73 services/keep-web
  74 services/keepproxy
  75 services/keepstore
  76 services/keep-balance
  77 services/login-sync
  78 services/nodemanager
  79 services/crunch-run
  80 services/crunch-dispatch-local
  81 services/crunch-dispatch-slurm
  82 sdk/cli
  83 sdk/pam
  84 sdk/python
  85 sdk/ruby
  86 sdk/go/arvados
  87 sdk/go/arvadosclient
  88 sdk/go/keepclient
  89 sdk/go/httpserver
  90 sdk/go/manifest
  91 sdk/go/blockdigest
  92 sdk/go/streamer
  93 sdk/go/crunchrunner
  94 sdk/cwl
  95 tools/crunchstat-summary
  96 tools/keep-rsync
  97 tools/keep-block-check
  98
  99 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 100     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 101
 102 EOF
 103
 104 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 105 # environment that could interfere with the tests.
 106 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 107
 108 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 109 # accident.
 110 GITDIR=
 111 GOPATH=
 112 VENVDIR=
 113 VENV3DIR=
 114 PYTHONPATH=
 115 GEMHOME=
 116 PERLINSTALLBASE=
 117
 118 short=
 119 skip_install=
 120 temp=
 121 temp_preserve=
 122
 123 clear_temp() {
 124     if [[ -z "$temp" ]]; then
 125         # we didn't even get as far as making a temp dir
 126         :
 127     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 128         rm -rf "$temp"
 129     else
 130         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 131     fi
 132 }
 133
 134 fatal() {
 135     clear_temp
 136     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 137     exit 1
 138 }
 139
 140 exit_cleanly() {
 141     trap - INT
 142     create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 143     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 144     stop_services
 145     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 146     report_outcomes
 147     clear_temp
 148     exit ${#failures}
 149 }
 150
 151 sanity_checks() {
 152     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 153         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 154     echo Checking dependencies:
 155     echo -n 'virtualenv: '
 156     virtualenv --version \
 157         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 158     echo -n 'go: '
 159     go version \
 160         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 161     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 7 ]] \
 162         || fatal "Go >= 1.7 required. See http://golang.org/doc/install"
 163     echo -n 'gcc: '
 164     gcc --version | egrep ^gcc \
 165         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 166     echo -n 'fuse.h: '
 167     find /usr/include -wholename '*fuse/fuse.h' \
 168         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 169     echo -n 'pyconfig.h: '
 170     find /usr/include -name pyconfig.h | egrep --max-count=1 . \
 171         || fatal "No pyconfig.h. Try: apt-get install python-dev"
 172     echo -n 'nginx: '
 173     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 174         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 175     echo -n 'perl: '
 176     perl -v | grep version \
 177         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 178     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 179         echo -n "perl $mod: "
 180         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 181             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 182     done
 183     echo -n 'gitolite: '
 184     which gitolite \
 185         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 186 }
 187
 188 rotate_logfile() {
 189   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 190   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 191   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 192     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 193     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 194     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 195   fi
 196 }
 197
 198 declare -a failures
 199 declare -A skip
 200 declare -A testargs
 201 skip[apps/workbench_profile]=1
 202
 203 while [[ -n "$1" ]]
 204 do
 205     arg="$1"; shift
 206     case "$arg" in
 207         --help)
 208             echo >&2 "$helpmessage"
 209             echo >&2
 210             exit 1
 211             ;;
 212         --skip)
 213             skipwhat="$1"; shift
 214             if [[ "$skipwhat" == "apps/workbench" ]]; then
 215               skip["apps/workbench_units"]=1
 216               skip["apps/workbench_functionals"]=1
 217               skip["apps/workbench_integration"]=1
 218             else
 219               skip[$skipwhat]=1
 220             fi
 221             ;;
 222         --only)
 223             only="$1"; skip[$1]=""; shift
 224             ;;
 225         --short)
 226             short=1
 227             ;;
 228         --skip-install)
 229             skip_install=1
 230             ;;
 231         --only-install)
 232             skip_install=1
 233             only_install="$1"; shift
 234             ;;
 235         --temp)
 236             temp="$1"; shift
 237             temp_preserve=1
 238             ;;
 239         --leave-temp)
 240             temp_preserve=1
 241             ;;
 242         --retry)
 243             retry=1
 244             ;;
 245         *_test=*)
 246             suite="${arg%%_test=*}"
 247             args="${arg#*=}"
 248             testargs["$suite"]="$args"
 249             ;;
 250         *=*)
 251             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 252             ;;
 253         *)
 254             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 255             exit 1
 256             ;;
 257     esac
 258 done
 259
 260 start_api() {
 261     echo 'Starting API server...'
 262     cd "$WORKSPACE" \
 263         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 264         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 265         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 266         && (env | egrep ^ARVADOS)
 267 }
 268
 269 start_nginx_proxy_services() {
 270     echo 'Starting keepproxy, keep-web, arv-git-httpd, and nginx ssl proxy...'
 271     cd "$WORKSPACE" \
 272         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 273         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 274         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 275         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx \
 276         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1
 277 }
 278
 279 stop_services() {
 280     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES" ]]; then
 281         unset ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 282         cd "$WORKSPACE" \
 283             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 284             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 285             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 286             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy
 287     fi
 288     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 289         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 290         cd "$WORKSPACE" \
 291             && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop
 292     fi
 293 }
 294
 295 interrupt() {
 296     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 297     exit_cleanly
 298 }
 299 trap interrupt INT
 300
 301 sanity_checks
 302
 303 echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 304
 305 if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 306     # Jenkins expects us to use this by default.
 307     CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 308 fi
 309
 310 # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 311 cd "$WORKSPACE"
 312 find -name '*.pyc' -delete
 313
 314 if [[ -z "$temp" ]]; then
 315     temp="$(mktemp -d)"
 316 fi
 317
 318 # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 319 for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE
 320 do
 321     if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 322         eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 323     fi
 324     if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 325         mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 326     fi
 327 done
 328
 329 setup_ruby_environment() {
 330     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 331       source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 332       using_rvm=true
 333     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 334       source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 335       using_rvm=true
 336     else
 337       using_rvm=false
 338     fi
 339
 340     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 341         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 342         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 343         # the environment to the "current gemset", which would lose
 344         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 345         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 346         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 347         # rvm gemset and use it for everything.
 348
 349         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 350             || fatal 'rvm check'
 351
 352         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 353         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 354         # complaint about not being in first place already.
 355         rvm use @default 2>/dev/null
 356
 357         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 358         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 359         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 360         # ruby to the caller.
 361         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 362         rvm use "@${gemset}" --create \
 363             || fatal 'rvm gemset setup'
 364
 365         rvm env
 366     else
 367         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 368         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 369         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 370         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 371         # should be installed, and we should leave it alone.)
 372
 373         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 374             user_gempath="$(gem env gempath)"
 375             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 376         fi
 377         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 378
 379         # When we build and install our own gems, we install them in our
 380         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 381         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 382         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 383
 384         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 385         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 386         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home:$(gem env gempath)"
 387
 388         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 389         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 390         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 391     fi
 392 }
 393
 394 with_test_gemset() {
 395     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 396         "$@"
 397     else
 398         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 399     fi
 400 }
 401
 402 gem_uninstall_if_exists() {
 403     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 404         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 405     fi
 406 }
 407
 408 setup_virtualenv() {
 409     local venvdest="$1"; shift
 410     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 411         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 412     fi
 413     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 414         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 415         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 416     else
 417         "$venvdest/bin/pip" install 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 418     fi
 419     # ubuntu1404 can't seem to install mock via tests_require, but it can do this.
 420     "$venvdest/bin/pip" install 'mock>=1.0' 'pbr<1.7.0'
 421 }
 422
 423 export PERLINSTALLBASE
 424 export PERLLIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5:${PERLLIB:+$PERLLIB}"
 425
 426 export GOPATH
 427 mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 428 ln -sfn "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" \
 429     || fatal "symlink failed"
 430
 431 setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 432 . "$VENVDIR/bin/activate"
 433
 434 # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 435 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^PyYAML= \
 436     || pip install PyYAML >/dev/null \
 437     || fatal "pip install PyYAML failed"
 438
 439 # Preinstall forked version of libcloud, because nodemanager "pip install"
 440 # won't pick it up by default.
 441 pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 442     || pip install --pre --ignore-installed https://github.com/curoverse/libcloud/archive/apache-libcloud-$LIBCLOUD_PIN.zip >/dev/null \
 443     || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 444
 445 # This will help people who reuse --temp dirs when we upgrade to llfuse 0.42
 446 if egrep -q 'llfuse.*>= *0\.42' "$WORKSPACE/services/fuse/setup.py"; then
 447     # Uninstall old llfuse, because services/fuse "pip install" won't
 448     # upgrade it by default.
 449     if pip freeze | egrep '^llfuse==0\.41\.'; then
 450         yes | pip uninstall 'llfuse<0.42'
 451     fi
 452 fi
 453
 454 # Deactivate Python 2 virtualenv
 455 deactivate
 456
 457 # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 458 # Otherwise, skip dependent tests.
 459 PYTHON3=$(which python3)
 460 if [ "0" = "$?" ]; then
 461     setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 462 else
 463     PYTHON3=
 464     skip[services/dockercleaner]=1
 465     cat >&2 <<EOF
 466
 467 Warning: python3 could not be found
 468 services/dockercleaner install and tests will be skipped
 469
 470 EOF
 471 fi
 472
 473 # Reactivate Python 2 virtualenv
 474 . "$VENVDIR/bin/activate"
 475
 476 # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 477 # whine a lot.
 478 setup_ruby_environment
 479
 480 echo "PATH is $PATH"
 481
 482 if ! which bundler >/dev/null
 483 then
 484     gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 485 fi
 486
 487 retry() {
 488     while ! ${@} && [[ "$retry" == 1 ]]
 489     do
 490         read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 491         if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 492         then
 493             break
 494         fi
 495     done
 496 }
 497
 498 do_test() {
 499     retry do_test_once ${@}
 500 }
 501
 502 do_test_once() {
 503     unset result
 504     to_test=$1
 505     if (( [[ "$only" == "apps/workbench" ]] ) &&
 506        ( [[ "$to_test" == "apps/workbench_units" ]] || [[ "$to_test" == "apps/workbench_functionals" ]] ||
 507          [[ "$to_test" == "apps/workbench_integration" ]])); then
 508       to_test="apps/workbench"
 509     fi
 510     if [[ -z "${skip[$1]}" ]] && ( [[ -z "$only" ]] || [[ "$only" == "$to_test" ]] )
 511     then
 512         title "Running $1 tests"
 513         timer_reset
 514         if [[ "$2" == "go" ]]
 515         then
 516             covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 517             coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 518             # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 519             # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 520             # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 521             # compilation errors.
 522             go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" || return 1
 523             cd "$WORKSPACE/$1" || return 1
 524             gofmt -e -d . | egrep . && result=1
 525             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 526             then
 527                 # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 528                 # does:
 529                 cd "$WORKSPACE/$1" && go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 530             else
 531                 # The above form gets verbose even when testargs is
 532                 # empty, so use this form in such cases:
 533                 go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 534             fi
 535             result=${result:-$?}
 536             if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 537             then
 538                 go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 539                 rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 540             fi
 541         elif [[ "$2" == "pip" ]]
 542         then
 543             tries=0
 544             cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 545             do
 546                 tries=$((${tries}+1))
 547                 # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 548                 # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 549                 "${3}python" setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 550                 result=$?
 551                 if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 552                 then
 553                     printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 554                     continue
 555                 else
 556                     break
 557                 fi
 558             done
 559         elif [[ "$2" != "" ]]
 560         then
 561             "test_$2"
 562         else
 563             "test_$1"
 564         fi
 565         result=${result:-$?}
 566         checkexit $result "$1 tests"
 567         title "End of $1 tests (`timer`)"
 568         return $result
 569     else
 570         title "Skipping $1 tests"
 571     fi
 572 }
 573
 574 do_install() {
 575     retry do_install_once ${@}
 576 }
 577
 578 do_install_once() {
 579     if [[ -z "$skip_install" || (-n "$only_install" && "$only_install" == "$1") ]]
 580     then
 581         title "Running $1 install"
 582         timer_reset
 583         if [[ "$2" == "go" ]]
 584         then
 585             go get -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 586         elif [[ "$2" == "pip" ]]
 587         then
 588             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 589             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 590
 591             # Need to change to a different directory after creating
 592             # the source dist package to avoid a pip bug.
 593             # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 594
 595             # Also need to install twice, because if it believes the package is
 596             # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 597             # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 598             # install" ensures that we've actually installed the local package
 599             # we just built.
 600             cd "$WORKSPACE/$1" \
 601                 && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 602                 && cd "$WORKSPACE" \
 603                 && "${3}pip" install --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 604                 && "${3}pip" install --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 605         elif [[ "$2" != "" ]]
 606         then
 607             "install_$2"
 608         else
 609             "install_$1"
 610         fi
 611         result=$?
 612         checkexit $result "$1 install"
 613         title "End of $1 install (`timer`)"
 614         return $result
 615     else
 616         title "Skipping $1 install"
 617     fi
 618 }
 619
 620 bundle_install_trylocal() {
 621     (
 622         set -e
 623         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 624         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 625             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 626             bundle install --no-deployment
 627         fi
 628         bundle package --all
 629     )
 630 }
 631
 632 install_doc() {
 633     cd "$WORKSPACE/doc" \
 634         && bundle_install_trylocal \
 635         && rm -rf .site
 636 }
 637 do_install doc
 638
 639 install_gem() {
 640     gemname=$1
 641     srcpath=$2
 642     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 643         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 644         && bundle_install_trylocal \
 645         && gem build "$gemname.gemspec" \
 646         && with_test_gemset gem install --no-ri --no-rdoc $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 647 }
 648
 649 install_ruby_sdk() {
 650     install_gem arvados sdk/ruby
 651 }
 652 do_install sdk/ruby ruby_sdk
 653
 654 install_perl_sdk() {
 655     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 656         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 657         && make install INSTALLDIRS=perl
 658 }
 659 do_install sdk/perl perl_sdk
 660
 661 install_cli() {
 662     install_gem arvados-cli sdk/cli
 663 }
 664 do_install sdk/cli cli
 665
 666 install_login-sync() {
 667     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 668 }
 669 do_install services/login-sync login-sync
 670
 671 # Install the Python SDK early. Various other test suites (like
 672 # keepproxy) bring up run_test_server.py, which imports the arvados
 673 # module. We can't actually *test* the Python SDK yet though, because
 674 # its own test suite brings up some of those other programs (like
 675 # keepproxy).
 676 declare -a pythonstuff
 677 pythonstuff=(
 678     sdk/pam
 679     sdk/python
 680     sdk/cwl
 681     services/fuse
 682     services/nodemanager
 683     tools/crunchstat-summary
 684     )
 685 for p in "${pythonstuff[@]}"
 686 do
 687     do_install "$p" pip
 688 done
 689 if [ -n "$PYTHON3" ]; then
 690     do_install services/dockercleaner pip "$VENV3DIR/bin/"
 691 fi
 692
 693 install_apiserver() {
 694     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 695         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 696
 697     rm -f config/environments/test.rb
 698     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 699
 700     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 701     then
 702         for f in database.yml application.yml
 703         do
 704             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 705         done
 706     fi
 707
 708     # Fill in a random secret_token and blob_signing_key for testing
 709     SECRET_TOKEN=`echo 'puts rand(2**512).to_s(36)' |ruby`
 710     BLOB_SIGNING_KEY=`echo 'puts rand(2**512).to_s(36)' |ruby`
 711
 712     sed -i'' -e "s:SECRET_TOKEN:$SECRET_TOKEN:" config/application.yml
 713     sed -i'' -e "s:BLOB_SIGNING_KEY:$BLOB_SIGNING_KEY:" config/application.yml
 714
 715     # Set up empty git repo (for git tests)
 716     GITDIR=$(mktemp -d)
 717     sed -i'' -e "s:/var/cache/git:$GITDIR:" config/application.default.yml
 718
 719     rm -rf $GITDIR
 720     mkdir -p $GITDIR/test
 721     cd $GITDIR/test \
 722         && git init \
 723         && git config user.email "jenkins@ci.curoverse.com" \
 724         && git config user.name "Jenkins, CI" \
 725         && touch tmp \
 726         && git add tmp \
 727         && git commit -m 'initial commit'
 728
 729     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 730     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 731     # is a postgresql superuser.
 732     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 733         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 734         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.procpid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 735
 736     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 737         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 738         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 739         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 740 }
 741 do_install services/api apiserver
 742
 743 declare -a gostuff
 744 gostuff=(
 745     sdk/go/arvados
 746     sdk/go/arvadosclient
 747     sdk/go/blockdigest
 748     sdk/go/httpserver
 749     sdk/go/manifest
 750     sdk/go/streamer
 751     sdk/go/crunchrunner
 752     lib/crunchstat
 753     services/arv-git-httpd
 754     services/crunchstat
 755     services/keep-web
 756     services/keepstore
 757     sdk/go/keepclient
 758     services/keep-balance
 759     services/keepproxy
 760     services/datamanager/summary
 761     services/datamanager/collection
 762     services/datamanager/keep
 763     services/datamanager
 764     services/crunch-dispatch-local
 765     services/crunch-dispatch-slurm
 766     services/crunch-run
 767     tools/keep-rsync
 768     tools/keep-block-check
 769     )
 770 for g in "${gostuff[@]}"
 771 do
 772     do_install "$g" go
 773 done
 774
 775 install_workbench() {
 776     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 777         && mkdir -p tmp/cache \
 778         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 779 }
 780 do_install apps/workbench workbench
 781
 782 test_doclinkchecker() {
 783     (
 784         set -e
 785         cd "$WORKSPACE/doc"
 786         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
 787         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
 788         # do much good!
 789         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
 790     )
 791 }
 792 do_test doc doclinkchecker
 793
 794 stop_services
 795
 796 test_apiserver() {
 797     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
 798     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 799         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/api]}
 800 }
 801 do_test services/api apiserver
 802
 803 # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
 804 # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
 805 if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
 806   rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 807   exit_cleanly
 808 fi
 809
 810 start_api
 811
 812 test_ruby_sdk() {
 813     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
 814         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
 815 }
 816 do_test sdk/ruby ruby_sdk
 817
 818 test_cli() {
 819     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
 820         && mkdir -p /tmp/keep \
 821         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
 822 }
 823 do_test sdk/cli cli
 824
 825 test_login-sync() {
 826     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
 827         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
 828 }
 829 do_test services/login-sync login-sync
 830
 831 for p in "${pythonstuff[@]}"
 832 do
 833     do_test "$p" pip
 834 done
 835 do_test services/dockercleaner pip "$VENV3DIR/bin/"
 836
 837 for g in "${gostuff[@]}"
 838 do
 839     do_test "$g" go
 840 done
 841
 842 test_workbench_units() {
 843     start_nginx_proxy_services \
 844         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 845         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:units TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 846 }
 847 do_test apps/workbench_units workbench_units
 848
 849 test_workbench_functionals() {
 850     start_nginx_proxy_services \
 851         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 852         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:functionals TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 853 }
 854 do_test apps/workbench_functionals workbench_functionals
 855
 856 test_workbench_integration() {
 857     start_nginx_proxy_services \
 858         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 859         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:integration TESTOPTS=-v ${testargs[apps/workbench]}
 860 }
 861 do_test apps/workbench_integration workbench_integration
 862
 863
 864 test_workbench_benchmark() {
 865     start_nginx_proxy_services \
 866         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 867         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:benchmark ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
 868 }
 869 do_test apps/workbench_benchmark workbench_benchmark
 870
 871 test_workbench_profile() {
 872     start_nginx_proxy_services \
 873         && cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
 874         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test:profile ${testargs[apps/workbench_profile]}
 875 }
 876 do_test apps/workbench_profile workbench_profile
 877
 878 exit_cleanly