sdk/cwl/tests/wf/revsort/revtool.cwl

   1 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   2 #
   3 # SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
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   5 #
   6 # Simplest example command line program wrapper for the Unix tool "rev".
   7 #
   8 class: CommandLineTool
   9 cwlVersion: v1.0
  10 doc: "Reverse each line using the `rev` command"
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  12 hints:
  13   ResourceRequirement:
  14     ramMin: 8
  15
  16 # The "inputs" array defines the structure of the input object that describes
  17 # the inputs to the underlying program.  Here, there is one input field
  18 # defined that will be called "input" and will contain a "File" object.
  19 #
  20 # The input binding indicates that the input value should be turned into a
  21 # command line argument.  In this example inputBinding is an empty object,
  22 # which indicates that the file name should be added to the command line at
  23 # a default location.
  24 inputs:
  25   input:
  26     type: File
  27     inputBinding: {}
  28
  29 # The "outputs" array defines the structure of the output object that
  30 # describes the outputs of the underlying program.  Here, there is one
  31 # output field defined that will be called "output", must be a "File" type,
  32 # and after the program executes, the output value will be the file
  33 # output.txt in the designated output directory.
  34 outputs:
  35   output:
  36     type: File
  37     outputBinding:
  38       glob: output.txt
  39
  40 # The actual program to execute.
  41 baseCommand: rev
  42
  43 # Specify that the standard output stream must be redirected to a file called
  44 # output.txt in the designated output directory.
  45 stdout: output.txt