build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
   5
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin.sh
   7
   8 COLUMNS=80
   9 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
  10
  11 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
  12 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  13
  14 Exit non-zero if any tests fail.
  15
  16 Syntax:
  17         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  18
  19 Options:
  20
  21 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  22 --skip sanity  Skip initial dev environment sanity checks.
  23 --skip install Do not run any install steps. Just run tests.
  24                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  25                from a previous invocation if you use this option.
  26 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  27 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  28                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  29 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  30                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  31                subsequent invocations.
  32 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  33 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  34 --only-install Run specific install step
  35 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  36 --interactive  Set up, then prompt for test/install steps to perform.
  37 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  38 CONFIGSRC=path Dir with api server config files to copy into source tree.
  39                (If none given, leave config files alone in source tree.)
  40 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  41                Restrict apiserver tests to the given file
  42 sdk/python_test="--test-suite tests.test_keep_locator"
  43                Restrict Python SDK tests to the given class
  44 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  45                Restrict Workbench tests to the given file
  46 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  47                Show all log messages, even when tests pass (also works
  48                with services/keepstore_test etc.)
  49 ARVADOS_DEBUG=1
  50                Print more debug messages
  51 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  52                *_test, and other examples shown above.
  53
  54 Assuming "--skip install" is not given, all components are installed
  55 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  56 test suites depend on other components being installed, and installing
  57 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  58
  59 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  60 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  61
  62 More information and background:
  63
  64 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  65
  66 Available tests:
  67
  68 apps/workbench (*)
  69 apps/workbench_units (*)
  70 apps/workbench_functionals (*)
  71 apps/workbench_integration (*)
  72 apps/workbench_benchmark
  73 apps/workbench_profile
  74 cmd/arvados-client
  75 cmd/arvados-server
  76 doc
  77 lib/cli
  78 lib/cmd
  79 lib/controller
  80 lib/controller/federation
  81 lib/controller/railsproxy
  82 lib/controller/router
  83 lib/controller/rpc
  84 lib/crunchstat
  85 lib/cloud
  86 lib/cloud/azure
  87 lib/cloud/cloudtest
  88 lib/dispatchcloud
  89 lib/dispatchcloud/container
  90 lib/dispatchcloud/scheduler
  91 lib/dispatchcloud/ssh_executor
  92 lib/dispatchcloud/worker
  93 lib/service
  94 services/api
  95 services/arv-git-httpd
  96 services/crunchstat
  97 services/dockercleaner
  98 services/fuse
  99 services/fuse:py3
 100 services/health
 101 services/keep-web
 102 services/keepproxy
 103 services/keepstore
 104 services/keep-balance
 105 services/login-sync
 106 services/nodemanager
 107 services/nodemanager_integration
 108 services/crunch-run
 109 services/crunch-dispatch-local
 110 services/crunch-dispatch-slurm
 111 services/ws
 112 sdk/cli
 113 sdk/pam
 114 sdk/pam:py3
 115 sdk/python
 116 sdk/python:py3
 117 sdk/ruby
 118 sdk/go/arvados
 119 sdk/go/arvadosclient
 120 sdk/go/auth
 121 sdk/go/dispatch
 122 sdk/go/keepclient
 123 sdk/go/health
 124 sdk/go/httpserver
 125 sdk/go/manifest
 126 sdk/go/blockdigest
 127 sdk/go/asyncbuf
 128 sdk/go/stats
 129 sdk/go/crunchrunner
 130 sdk/cwl
 131 sdk/R
 132 sdk/java-v2
 133 tools/sync-groups
 134 tools/crunchstat-summary
 135 tools/crunchstat-summary:py3
 136 tools/keep-exercise
 137 tools/keep-rsync
 138 tools/keep-block-check
 139
 140 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 141     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 142
 143 EOF
 144
 145 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 146 # environment that could interfere with the tests.
 147 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 148
 149 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 150 # accident.
 151 GITDIR=
 152 GOPATH=
 153 VENVDIR=
 154 VENV3DIR=
 155 PYTHONPATH=
 156 GEMHOME=
 157 PERLINSTALLBASE=
 158 R_LIBS=
 159 export LANG=en_US.UTF-8
 160
 161 short=
 162 only_install=
 163 temp=
 164 temp_preserve=
 165
 166 clear_temp() {
 167     if [[ -z "$temp" ]]; then
 168         # we didn't even get as far as making a temp dir
 169         :
 170     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 171         rm -rf "$temp"
 172     else
 173         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 174     fi
 175 }
 176
 177 fatal() {
 178     clear_temp
 179     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 180     exit 1
 181 }
 182
 183 exit_cleanly() {
 184     trap - INT
 185     if which create-plot-data-from-log.sh >/dev/null; then
 186         create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 187     fi
 188     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 189     stop_services
 190     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 191     report_outcomes
 192     clear_temp
 193     exit ${#failures}
 194 }
 195
 196 sanity_checks() {
 197     [[ -n "${skip[sanity]}" ]] && return 0
 198     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 199         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 200     echo Checking dependencies:
 201     echo "locale: ${LANG}"
 202     [[ "$(locale charmap)" = "UTF-8" ]] \
 203         || fatal "Locale '${LANG}' is broken/missing. Try: echo ${LANG} | sudo tee -a /etc/locale.gen && sudo locale-gen"
 204     echo -n 'virtualenv: '
 205     virtualenv --version \
 206         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 207     echo -n 'ruby: '
 208     ruby -v \
 209         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 210     echo -n 'go: '
 211     go version \
 212         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 213     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 12 ]] \
 214         || fatal "Go >= 1.12 required. See http://golang.org/doc/install"
 215     echo -n 'gcc: '
 216     gcc --version | egrep ^gcc \
 217         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 218     echo -n 'fuse.h: '
 219     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 220         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 221     echo -n 'gnutls.h: '
 222     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 223         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 224     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
 225     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 226         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
 227     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 228     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 229         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 230     which netstat \
 231         || fatal "No netstat. Try: apt-get install net-tools"
 232     echo -n 'nginx: '
 233     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 234         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 235     echo -n 'perl: '
 236     perl -v | grep version \
 237         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 238     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 239         echo -n "perl $mod: "
 240         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 241             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 242     done
 243     echo -n 'gitolite: '
 244     which gitolite \
 245         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 246     echo -n 'npm: '
 247     npm --version \
 248         || fatal "No npm. Try: wget -O- https://nodejs.org/dist/v6.11.2/node-v6.11.2-linux-x64.tar.xz | sudo tar -C /usr/local -xJf - && sudo ln -s ../node-v6.11.2-linux-x64/bin/{node,npm} /usr/local/bin/"
 249     echo -n 'cadaver: '
 250     cadaver --version | grep -w cadaver \
 251           || fatal "No cadaver. Try: apt-get install cadaver"
 252     echo -n 'libattr1 xattr.h: '
 253     find /usr/include -path '*/attr/xattr.h' | egrep --max-count=1 . \
 254         || fatal "No libattr1 xattr.h. Try: apt-get install libattr1-dev"
 255     echo -n 'libcurl curl.h: '
 256     find /usr/include -path '*/curl/curl.h' | egrep --max-count=1 . \
 257         || fatal "No libcurl curl.h. Try: apt-get install libcurl4-gnutls-dev"
 258     echo -n 'libpq libpq-fe.h: '
 259     find /usr/include -path '*/postgresql/libpq-fe.h' | egrep --max-count=1 . \
 260         || fatal "No libpq libpq-fe.h. Try: apt-get install libpq-dev"
 261     echo -n 'postgresql: '
 262     psql --version || fatal "No postgresql. Try: apt-get install postgresql postgresql-client-common"
 263     echo -n 'phantomjs: '
 264     phantomjs --version || fatal "No phantomjs. Try: apt-get install phantomjs"
 265     echo -n 'xvfb: '
 266     which Xvfb || fatal "No xvfb. Try: apt-get install xvfb"
 267     echo -n 'graphviz: '
 268     dot -V || fatal "No graphviz. Try: apt-get install graphviz"
 269     echo -n 'geckodriver: '
 270     geckodriver --version | grep ^geckodriver || echo "No geckodriver. Try: wget -O- https://github.com/mozilla/geckodriver/releases/download/v0.23.0/geckodriver-v0.23.0-linux64.tar.gz | sudo tar -C /usr/local/bin -xzf - geckodriver"
 271
 272     if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 273       # R SDK stuff
 274       echo -n 'R: '
 275       which Rscript || fatal "No Rscript. Try: apt-get install r-base"
 276       echo -n 'testthat: '
 277       Rscript -e "library('testthat')" || fatal "No testthat. Try: apt-get install r-cran-testthat"
 278       # needed for roxygen2, needed for devtools, needed for R sdk
 279       pkg-config --exists libxml-2.0 || fatal "No libxml2. Try: apt-get install libxml2-dev"
 280       # needed for pkgdown, builds R SDK doc pages
 281       which pandoc || fatal "No pandoc. Try: apt-get install pandoc"
 282     fi
 283 }
 284
 285 rotate_logfile() {
 286   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 287   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 288   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 289     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 290     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 291     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 292   fi
 293 }
 294
 295 declare -a failures
 296 declare -A skip
 297 declare -A only
 298 declare -A testargs
 299 skip[apps/workbench_profile]=1
 300 # nodemanager_integration tests are not reliable, see #12061.
 301 skip[services/nodemanager_integration]=1
 302
 303 while [[ -n "$1" ]]
 304 do
 305     arg="$1"; shift
 306     case "$arg" in
 307         --help)
 308             echo >&2 "$helpmessage"
 309             echo >&2
 310             exit 1
 311             ;;
 312         --skip)
 313             skip[$1]=1; shift
 314             ;;
 315         --only)
 316             only[$1]=1; skip[$1]=""; shift
 317             ;;
 318         --short)
 319             short=1
 320             ;;
 321         --interactive)
 322             interactive=1
 323             ;;
 324         --skip-install)
 325             skip[install]=1
 326             ;;
 327         --only-install)
 328             only_install="$1"; shift
 329             ;;
 330         --temp)
 331             temp="$1"; shift
 332             temp_preserve=1
 333             ;;
 334         --leave-temp)
 335             temp_preserve=1
 336             ;;
 337         --repeat)
 338             repeat=$((${1}+0)); shift
 339             ;;
 340         --retry)
 341             retry=1
 342             ;;
 343         *_test=*)
 344             suite="${arg%%_test=*}"
 345             args="${arg#*=}"
 346             testargs["$suite"]="$args"
 347             ;;
 348         *=*)
 349             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 350             ;;
 351         *)
 352             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 353             exit 1
 354             ;;
 355     esac
 356 done
 357
 358 # R SDK installation is very slow (~360s in a clean environment) and only
 359 # required when testing it. Skip that step if it is not needed.
 360 NEED_SDK_R=true
 361
 362 if [[ ${#only[@]} -ne 0 ]] &&
 363    [[ -z "${only['sdk/R']}" && -z "${only['doc']}" ]]; then
 364   NEED_SDK_R=false
 365 fi
 366
 367 if [[ ${skip["sdk/R"]} == 1 && ${skip["doc"]} == 1 ]]; then
 368   NEED_SDK_R=false
 369 fi
 370
 371 if [[ $NEED_SDK_R == false ]]; then
 372         echo "R SDK not needed, it will not be installed."
 373 fi
 374
 375 checkpidfile() {
 376     svc="$1"
 377     pid="$(cat "$WORKSPACE/tmp/${svc}.pid")"
 378     if [[ -z "$pid" ]] || ! kill -0 "$pid"; then
 379         tail $WORKSPACE/tmp/${1}*.log
 380         echo "${svc} pid ${pid} not running"
 381         return 1
 382     fi
 383     echo "${svc} pid ${pid} ok"
 384 }
 385
 386 checkhealth() {
 387     svc="$1"
 388     port="$(cat "$WORKSPACE/tmp/${svc}.port")"
 389     scheme=http
 390     if [[ ${svc} =~ -ssl$ || ${svc} = wss ]]; then
 391         scheme=https
 392     fi
 393     url="$scheme://localhost:${port}/_health/ping"
 394     if ! curl -Ss -H "Authorization: Bearer e687950a23c3a9bceec28c6223a06c79" "${url}" | tee -a /dev/stderr | grep '"OK"'; then
 395         echo "${url} failed"
 396         return 1
 397     fi
 398 }
 399
 400 checkdiscoverydoc() {
 401     dd="https://${1}/discovery/v1/apis/arvados/v1/rest"
 402     if ! (set -o pipefail; curl -fsk "$dd" | grep -q ^{ ); then
 403         echo >&2 "ERROR: could not retrieve discovery doc from RailsAPI at $dd"
 404         tail -v $WORKSPACE/services/api/log/test.log
 405         return 1
 406     fi
 407     echo "${dd} ok"
 408 }
 409
 410 start_services() {
 411     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 412         return 0
 413     fi
 414     . "$VENVDIR/bin/activate"
 415     echo 'Starting API, controller, keepproxy, keep-web, arv-git-httpd, ws, and nginx ssl proxy...'
 416     if [[ ! -d "$WORKSPACE/services/api/log" ]]; then
 417         mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/log"
 418     fi
 419     # Remove empty api.pid file if it exists
 420     if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid" && ! -s "$WORKSPACE/tmp/api.pid" ]]; then
 421         rm -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid"
 422     fi
 423     all_services_stopped=
 424     fail=1
 425     cd "$WORKSPACE" \
 426         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 427         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 428         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 429         && checkpidfile api \
 430         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 431         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_controller \
 432         && checkpidfile controller \
 433         && checkhealth controller \
 434         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 435         && checkpidfile keepproxy \
 436         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 437         && checkpidfile keep-web \
 438         && checkhealth keep-web \
 439         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 440         && checkpidfile arv-git-httpd \
 441         && checkhealth arv-git-httpd \
 442         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 443         && checkpidfile ws \
 444         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx) \
 445         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 446         && checkpidfile nginx \
 447         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1 \
 448         && (env | egrep ^ARVADOS) \
 449         && fail=0
 450     deactivate
 451     if [[ $fail != 0 ]]; then
 452         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 453     fi
 454     return $fail
 455 }
 456
 457 stop_services() {
 458     if [[ -n "$all_services_stopped" ]]; then
 459         return
 460     fi
 461     unset ARVADOS_TEST_API_HOST ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 462     . "$VENVDIR/bin/activate" || return
 463     cd "$WORKSPACE" \
 464         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 465         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 466         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 467         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 468         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy \
 469         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_controller \
 470         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop \
 471         && all_services_stopped=1
 472     deactivate
 473 }
 474
 475 interrupt() {
 476     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 477     exit_cleanly
 478 }
 479 trap interrupt INT
 480
 481 setup_ruby_environment() {
 482     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 483         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 484         using_rvm=true
 485     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 486         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 487         using_rvm=true
 488     else
 489         using_rvm=false
 490     fi
 491
 492     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 493         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 494         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 495         # the environment to the "current gemset", which would lose
 496         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 497         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 498         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 499         # rvm gemset and use it for everything.
 500
 501         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 502             || fatal 'rvm check'
 503
 504         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 505         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 506         # complaint about not being in first place already.
 507         rvm use @default 2>/dev/null
 508
 509         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 510         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 511         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 512         # ruby to the caller.
 513         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 514         rvm use "@${gemset}" --create \
 515             || fatal 'rvm gemset setup'
 516
 517         rvm env
 518     else
 519         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 520         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 521         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 522         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 523         # should be installed, and we should leave it alone.)
 524
 525         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 526             user_gempath="$(gem env gempath)"
 527             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 528         fi
 529         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 530
 531         # When we build and install our own gems, we install them in our
 532         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 533         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 534         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 535
 536         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 537         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 538         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
 539
 540         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 541         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 542         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 543     fi
 544     bundle config || gem install bundler \
 545         || fatal 'install bundler'
 546 }
 547
 548 with_test_gemset() {
 549     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 550         "$@"
 551     else
 552         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 553     fi
 554 }
 555
 556 gem_uninstall_if_exists() {
 557     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 558         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 559     fi
 560 }
 561
 562 setup_virtualenv() {
 563     local venvdest="$1"; shift
 564     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 565         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 566     elif [[ -n "$short" ]]; then
 567         return
 568     fi
 569     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 570         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 571         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 572     else
 573         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 574     fi
 575 }
 576
 577 initialize() {
 578     sanity_checks
 579
 580     echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 581
 582     if [[ -z "$CONFIGSRC" ]] && [[ -d "$HOME/arvados-api-server" ]]; then
 583         # Jenkins expects us to use this by default.
 584         CONFIGSRC="$HOME/arvados-api-server"
 585     fi
 586
 587     # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 588     cd "$WORKSPACE"
 589     find -name '*.pyc' -delete
 590
 591     if [[ -z "$temp" ]]; then
 592         temp="$(mktemp -d)"
 593     fi
 594
 595     # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 596     for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE R_LIBS
 597     do
 598         if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 599             eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 600         fi
 601         if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 602             mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 603         fi
 604     done
 605
 606     rm -vf "${WORKSPACE}/tmp/*.log"
 607
 608     export PERLINSTALLBASE
 609     export PERL5LIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5${PERL5LIB:+:$PERL5LIB}"
 610
 611     export R_LIBS
 612
 613     export GOPATH
 614     # Make sure our compiled binaries under test override anything
 615     # else that might be in the environment.
 616     export PATH=$GOPATH/bin:$PATH
 617
 618     # Jenkins config requires that glob tmp/*.log match something. Ensure
 619     # that happens even if we don't end up running services that set up
 620     # logging.
 621     mkdir -p "${WORKSPACE}/tmp/" || fatal "could not mkdir ${WORKSPACE}/tmp"
 622     touch "${WORKSPACE}/tmp/controller.log" || fatal "could not touch ${WORKSPACE}/tmp/controller.log"
 623
 624     unset http_proxy https_proxy no_proxy
 625
 626     # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 627     # whine a lot.
 628     setup_ruby_environment
 629
 630     if [[ -s "$CONFIGSRC/config.yml" ]] ; then
 631         cp "$CONFIGSRC/config.yml" "$temp/test-config.yml"
 632         export ARVADOS_CONFIG="$temp/test-config.yml"
 633     else
 634         if [[ -s /etc/arvados/config.yml ]] ; then
 635             python > "$temp/test-config.yml" <<EOF
 636 import yaml
 637 import json
 638 v = list(yaml.safe_load(open('/etc/arvados/config.yml'))['Clusters'].values())[0]['PostgreSQL']
 639 v['Connection']['dbname'] = 'arvados_test'
 640 print(json.dumps({"Clusters": { "zzzzz": {'PostgreSQL': v}}}))
 641 EOF
 642             export ARVADOS_CONFIG="$temp/test-config.yml"
 643         else
 644             if [[ ! -f "$WORKSPACE/services/api/config/database.yml" ]]; then
 645                 fatal "Please provide a database.yml file for the test suite"
 646             fi
 647         fi
 648     fi
 649
 650     echo "PATH is $PATH"
 651 }
 652
 653 install_env() {
 654     (
 655         set -e
 656         mkdir -p "$GOPATH/src/git.curoverse.com"
 657         if [[ ! -h "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git" ]]; then
 658             for d in \
 659                 "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/tmp/GOPATH" \
 660                     "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/tmp" \
 661                     "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"; do
 662                 [[ -d "$d" ]] && rmdir "$d"
 663             done
 664         fi
 665         for d in \
 666             "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/arvados" \
 667                 "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"; do
 668             [[ -h "$d" ]] && rm "$d"
 669         done
 670         ln -vsfT "$WORKSPACE" "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
 671         go get -v github.com/kardianos/govendor
 672         cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
 673         go get -v -d ...
 674         "$GOPATH/bin/govendor" sync
 675         which goimports >/dev/null || go get golang.org/x/tools/cmd/goimports
 676     ) || fatal "Go setup failed"
 677
 678     setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 679     . "$VENVDIR/bin/activate"
 680
 681     # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 682     pip install --no-cache-dir PyYAML \
 683         || fatal "pip install PyYAML failed"
 684
 685     # Preinstall libcloud if using a fork; otherwise nodemanager "pip
 686     # install" won't pick it up by default.
 687     if [[ -n "$LIBCLOUD_PIN_SRC" ]]; then
 688         pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 689             || pip install --pre --ignore-installed --no-cache-dir "$LIBCLOUD_PIN_SRC" >/dev/null \
 690             || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 691     fi
 692
 693     # Deactivate Python 2 virtualenv
 694     deactivate
 695
 696     # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 697     # Otherwise, skip dependent tests.
 698     PYTHON3=$(which python3)
 699     if [[ ${?} = 0 ]]; then
 700         setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 701     else
 702         PYTHON3=
 703         cat >&2 <<EOF
 704
 705 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
 706
 707 EOF
 708     fi
 709
 710     if ! which bundler >/dev/null
 711     then
 712         gem install --user-install bundler || fatal 'Could not install bundler'
 713     fi
 714 }
 715
 716 retry() {
 717     remain="${repeat}"
 718     while :
 719     do
 720         if ${@}; then
 721             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 722                 remain=$((${remain}-1))
 723                 title "(repeating ${remain} more times)"
 724             else
 725                 break
 726             fi
 727         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 728             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 729             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 730             then
 731                 break
 732             fi
 733         else
 734             break
 735         fi
 736     done
 737 }
 738
 739 do_test() {
 740     case "${1}" in
 741         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 742             suite=apps/workbench
 743             ;;
 744         services/nodemanager | services/nodemanager_integration)
 745             suite=services/nodemanager_suite
 746             ;;
 747         *)
 748             suite="${1}"
 749             ;;
 750     esac
 751     if [[ -n "${skip[$suite]}" || \
 752               -n "${skip[$1]}" || \
 753               (${#only[@]} -ne 0 && ${only[$suite]} -eq 0 && ${only[$1]} -eq 0) ]]; then
 754         return 0
 755     fi
 756     case "${1}" in
 757         services/api)
 758             stop_services
 759             ;;
 760         gofmt | govendor | doc | lib/cli | lib/cloud/azure | lib/cloud/ec2 | lib/cloud/cloudtest | lib/cmd | lib/dispatchcloud/ssh_executor | lib/dispatchcloud/worker)
 761             # don't care whether services are running
 762             ;;
 763         *)
 764             if ! start_services; then
 765                 title "test $1 -- failed to start services"
 766                 return 1
 767             fi
 768             ;;
 769     esac
 770     retry do_test_once ${@}
 771 }
 772
 773 do_test_once() {
 774     unset result
 775
 776     title "test $1"
 777     timer_reset
 778
 779     result=
 780     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 781     if ! . "$VENVDIR/bin/activate"
 782     then
 783         result=1
 784     elif [[ "$2" == "go" ]]
 785     then
 786         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 787         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 788         # We do "go get -t" here to catch compilation errors
 789         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 790         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 791         # compilation errors.
 792         go get -ldflags "-X git.curoverse.com/arvados.git/lib/cmd.version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}" -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 793             cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git/$1" && \
 794             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 795         then
 796             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 797             # does:
 798             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 799         else
 800             # The above form gets verbose even when testargs is
 801             # empty, so use this form in such cases:
 802             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 803         fi
 804         result=${result:-$?}
 805         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 806         then
 807             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 808             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 809         fi
 810         [[ $result = 0 ]] && gofmt -e -d *.go
 811     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 812     then
 813         tries=0
 814         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 815         do
 816             tries=$((${tries}+1))
 817             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 818             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 819             if [[ -e "${3}activate" ]]; then
 820                 . "${3}activate"
 821             fi
 822             python setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 823             result=$?
 824             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 825             then
 826                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 827                 continue
 828             else
 829                 break
 830             fi
 831         done
 832     elif [[ "$2" != "" ]]
 833     then
 834         "test_$2"
 835     else
 836         "test_$1"
 837     fi
 838     result=${result:-$?}
 839     checkexit $result "$1 tests"
 840     title "test $1 -- `timer`"
 841     return $result
 842 }
 843
 844 do_install() {
 845     if [[ -n "${skip[install]}" || ( -n "${only_install}" && "${only_install}" != "${1}" && "${only_install}" != "${2}" ) ]]; then
 846         return 0
 847     fi
 848     retry do_install_once ${@}
 849 }
 850
 851 do_install_once() {
 852     title "install $1"
 853     timer_reset
 854
 855     result=
 856     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 857     if [[ "$1" != "env" ]] && ! . "$VENVDIR/bin/activate"; then
 858         result=1
 859     elif [[ "$2" == "go" ]]
 860     then
 861         go get -ldflags "-X git.curoverse.com/arvados.git/lib/cmd.version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}" -t "git.curoverse.com/arvados.git/$1"
 862     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 863     then
 864         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 865         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 866
 867         # Need to change to a different directory after creating
 868         # the source dist package to avoid a pip bug.
 869         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 870
 871         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 872         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 873         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 874         # install" ensures that we've actually installed the local package
 875         # we just built.
 876         cd "$WORKSPACE/$1" \
 877             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 878             && cd "$WORKSPACE" \
 879             && "${3}pip" install --no-cache-dir --quiet "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 880             && "${3}pip" install --no-cache-dir --quiet --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 881     elif [[ "$2" != "" ]]
 882     then
 883         "install_$2"
 884     else
 885         "install_$1"
 886     fi
 887     result=${result:-$?}
 888     checkexit $result "$1 install"
 889     title "install $1 -- `timer`"
 890     return $result
 891 }
 892
 893 bundle_install_trylocal() {
 894     (
 895         set -e
 896         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 897         if ! bundle install --local --no-deployment; then
 898             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 899             bundle install --no-deployment
 900         fi
 901         bundle package --all
 902     )
 903 }
 904
 905 install_doc() {
 906     cd "$WORKSPACE/doc" \
 907         && bundle_install_trylocal \
 908         && rm -rf .site
 909 }
 910
 911 install_gem() {
 912     gemname=$1
 913     srcpath=$2
 914     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 915         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 916         && bundle_install_trylocal \
 917         && gem build "$gemname.gemspec" \
 918         && with_test_gemset gem install --no-document $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 919 }
 920
 921 install_sdk/ruby() {
 922     install_gem arvados sdk/ruby
 923 }
 924
 925 install_sdk/R() {
 926   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 927     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
 928        && Rscript --vanilla install_deps.R
 929   fi
 930 }
 931
 932 install_sdk/perl() {
 933     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 934         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 935         && make install INSTALLDIRS=perl
 936 }
 937
 938 install_sdk/cli() {
 939     install_gem arvados-cli sdk/cli
 940 }
 941
 942 install_services/login-sync() {
 943     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 944 }
 945
 946 install_services/api() {
 947     stop_services
 948     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 949         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal
 950
 951     rm -f config/environments/test.rb
 952     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 953
 954     if [ -n "$CONFIGSRC" ]
 955     then
 956         for f in database.yml
 957         do
 958             cp "$CONFIGSRC/$f" config/ || fatal "$f"
 959         done
 960     fi
 961
 962     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 963     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 964     # is a postgresql superuser.
 965     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 966         && test_database=$(python -c "import yaml; print yaml.safe_load(file('config/database.yml'))['test']['database']") \
 967         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.pid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 968
 969     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 970
 971     cert="$WORKSPACE/services/api/tmp/self-signed"
 972     if [[ ! -e "$cert.pem" || "$(date -r "$cert.pem" +%s)" -lt 1512659226 ]]; then
 973         (
 974             dir="$WORKSPACE/services/api/tmp"
 975             set -ex
 976             openssl req -newkey rsa:2048 -nodes -subj '/C=US/ST=State/L=City/CN=localhost' -out "$cert.csr" -keyout "$cert.key" </dev/null
 977             openssl x509 -req -in "$cert.csr" -signkey "$cert.key" -out "$cert.pem" -days 3650 -extfile <(printf 'subjectAltName=DNS:localhost,DNS:::1,DNS:0.0.0.0,DNS:127.0.0.1,IP:::1,IP:0.0.0.0,IP:127.0.0.1')
 978         ) || return 1
 979     fi
 980
 981     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 982         && rm -rf tmp/git \
 983         && mkdir -p tmp/git \
 984         && cd tmp/git \
 985         && tar xf ../../test/test.git.tar \
 986         && mkdir -p internal.git \
 987         && git --git-dir internal.git init \
 988             || return 1
 989
 990     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 991         && RAILS_ENV=test bundle exec rails db:environment:set \
 992         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:drop \
 993         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:setup \
 994         && RAILS_ENV=test bundle exec rake db:fixtures:load
 995 }
 996
 997 declare -a pythonstuff
 998 pythonstuff=(
 999     sdk/pam
1000     sdk/python
1001     sdk/python:py3
1002     sdk/cwl
1003     sdk/cwl:py3
1004     services/dockercleaner:py3
1005     services/fuse
1006     services/fuse:py3
1007     services/nodemanager
1008     tools/crunchstat-summary
1009     tools/crunchstat-summary:py3
1010 )
1011
1012 declare -a gostuff
1013 gostuff=($(cd "$WORKSPACE" && git grep -lw func | grep \\.go | sed -e 's/\/[^\/]*$//' | sort -u))
1014
1015 install_apps/workbench() {
1016     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1017         && mkdir -p tmp/cache \
1018         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
1019         && RAILS_ENV=test RAILS_GROUPS=assets bundle exec rake npm:install
1020 }
1021
1022 test_doc() {
1023     (
1024         set -e
1025         cd "$WORKSPACE/doc"
1026         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
1027         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
1028         # do much good!
1029         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ bundle exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
1030     )
1031 }
1032
1033 test_gofmt() {
1034     cd "$WORKSPACE" || return 1
1035     dirs=$(ls -d */ | egrep -v 'vendor|tmp')
1036     [[ -z "$(gofmt -e -d $dirs | tee -a /dev/stderr)" ]]
1037 }
1038
1039 test_govendor() {
1040     (
1041         set -e
1042         cd "$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git"
1043         # Remove cached source dirs in workdir. Otherwise, they will
1044         # not qualify as +missing or +external below, and we won't be
1045         # able to detect that they're missing from vendor/vendor.json.
1046         rm -rf vendor/*/
1047         go get -v -d ...
1048         "$GOPATH/bin/govendor" sync
1049         if [[ -n $("$GOPATH/bin/govendor" list +unused +missing +external | tee /dev/stderr) ]]; then
1050             echo >&2 "vendor/vendor.json has unused or missing dependencies -- try:
1051
1052 (export GOPATH=\"${GOPATH}\"; cd \$GOPATH/src/git.curoverse.com/arvados.git && \$GOPATH/bin/govendor add +missing +external && \$GOPATH/bin/govendor remove +unused)
1053
1054 "
1055             return 1
1056         fi
1057     )
1058 }
1059
1060 test_services/api() {
1061     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
1062     cd "$WORKSPACE/services/api" \
1063         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake test TESTOPTS='-v -d' ${testargs[services/api]}
1064 }
1065
1066 test_sdk/ruby() {
1067     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
1068         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
1069 }
1070
1071 test_sdk/R() {
1072   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
1073     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
1074         && Rscript --vanilla run_test.R
1075   fi
1076 }
1077
1078 test_sdk/cli() {
1079     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
1080         && mkdir -p /tmp/keep \
1081         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
1082 }
1083
1084 test_sdk/java-v2() {
1085     cd "$WORKSPACE/sdk/java-v2" && gradle test
1086 }
1087
1088 test_services/login-sync() {
1089     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
1090         && bundle exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
1091 }
1092
1093 test_services/nodemanager_integration() {
1094     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
1095         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager_integration]}
1096 }
1097
1098 test_apps/workbench_units() {
1099     local TASK="test:units"
1100     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_units]}" ]]; then
1101         TASK="test"
1102     fi
1103     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1104         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} TESTOPTS='-v -d' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_units]}
1105 }
1106
1107 test_apps/workbench_functionals() {
1108     local TASK="test:functionals"
1109     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_functionals]}" ]]; then
1110         TASK="test"
1111     fi
1112     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1113         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} TESTOPTS='-v -d' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_functionals]}
1114 }
1115
1116 test_apps/workbench_integration() {
1117     local TASK="test:integration"
1118     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_integration]}" ]]; then
1119         TASK="test"
1120     fi
1121     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1122         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} TESTOPTS='-v -d' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_integration]}
1123 }
1124
1125 test_apps/workbench_benchmark() {
1126     local TASK="test:benchmark"
1127     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_benchmark]}" ]]; then
1128         TASK="test"
1129     fi
1130     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1131         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
1132 }
1133
1134 test_apps/workbench_profile() {
1135     local TASK="test:profile"
1136     if [[ -n "${testargs[apps/workbench]}" ]] || [[ -n "${testargs[apps/workbench_profile]}" ]]; then
1137         TASK="test"
1138     fi
1139     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1140         && env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} bundle exec rake ${TASK} ${testargs[apps/workbench_profile]}
1141 }
1142
1143 install_deps() {
1144     # Install parts needed by test suites
1145     do_install env
1146     do_install cmd/arvados-server go
1147     do_install sdk/cli
1148     do_install sdk/perl
1149     do_install sdk/python pip
1150     do_install sdk/ruby
1151     do_install services/api
1152     do_install services/arv-git-httpd go
1153     do_install services/keepproxy go
1154     do_install services/keepstore go
1155     do_install services/keep-web go
1156     do_install services/ws go
1157 }
1158
1159 install_all() {
1160     do_install env
1161     do_install doc
1162     do_install sdk/ruby
1163     do_install sdk/R
1164     do_install sdk/perl
1165     do_install sdk/cli
1166     do_install services/login-sync
1167     for p in "${pythonstuff[@]}"
1168     do
1169         dir=${p%:py3}
1170         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1171             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1172                 do_install ${dir} pip
1173             fi
1174         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1175             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1176                 do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1177             fi
1178         fi
1179     done
1180     for g in "${gostuff[@]}"
1181     do
1182         do_install "$g" go
1183     done
1184     do_install services/api
1185     do_install apps/workbench
1186 }
1187
1188 test_all() {
1189     stop_services
1190     do_test services/api
1191
1192     # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
1193     # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
1194     if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
1195         rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
1196         exit_cleanly
1197     fi
1198
1199     do_test gofmt
1200     do_test govendor
1201     do_test doc
1202     do_test sdk/ruby
1203     do_test sdk/R
1204     do_test sdk/cli
1205     do_test services/login-sync
1206     do_test sdk/java-v2
1207     do_test services/nodemanager_integration
1208     for p in "${pythonstuff[@]}"
1209     do
1210         dir=${p%:py3}
1211         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1212             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1213                 do_test ${dir} pip
1214             fi
1215         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1216             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1217                 do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1218             fi
1219         fi
1220     done
1221
1222     for g in "${gostuff[@]}"
1223     do
1224         do_test "$g" go
1225     done
1226     do_test apps/workbench_units
1227     do_test apps/workbench_functionals
1228     do_test apps/workbench_integration
1229     do_test apps/workbench_benchmark
1230     do_test apps/workbench_profile
1231 }
1232
1233 help_interactive() {
1234     echo "== Interactive commands:"
1235     echo "TARGET                 (short for 'test DIR')"
1236     echo "test TARGET"
1237     echo "test TARGET:py3        (test with python3)"
1238     echo "test TARGET -check.vv  (pass arguments to test)"
1239     echo "install TARGET"
1240     echo "install env            (go/python libs)"
1241     echo "install deps           (go/python libs + arvados components needed for integration tests)"
1242     echo "reset                  (...services used by integration tests)"
1243     echo "exit"
1244     echo "== Test targets:"
1245     echo "${!testfuncargs[@]}" | tr ' ' '\n' | sort | column
1246 }
1247
1248 initialize
1249
1250 declare -A testfuncargs=()
1251 for g in "${gostuff[@]}"; do
1252     testfuncargs[$g]="$g go"
1253 done
1254 for p in "${pythonstuff[@]}"; do
1255     dir=${p%:py3}
1256     testfuncargs[$dir]="$dir pip $VENVDIR/bin/"
1257     testfuncargs[$dir:py3]="$dir pip $VENV3DIR/bin/"
1258 done
1259
1260 testfuncargs["sdk/cli"]="sdk/cli"
1261 testfuncargs["sdk/R"]="sdk/R"
1262 testfuncargs["sdk/java-v2"]="sdk/java-v2"
1263 testfuncargs["apps/workbench_units"]="apps/workbench_units"
1264 testfuncargs["apps/workbench_functionals"]="apps/workbench_functionals"
1265 testfuncargs["apps/workbench_integration"]="apps/workbench_integration"
1266 testfuncargs["apps/workbench_benchmark"]="apps/workbench_benchmark"
1267 testfuncargs["apps/workbench_profile"]="apps/workbench_profile"
1268
1269 if [[ -z ${interactive} ]]; then
1270     install_all
1271     test_all
1272 else
1273     skip=()
1274     only=()
1275     only_install=()
1276     if [[ -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then stop_services; fi
1277     setnextcmd() {
1278         if [[ "$TERM" = dumb ]]; then
1279             # assume emacs, or something, is offering a history buffer
1280             # and pre-populating the command will only cause trouble
1281             nextcmd=
1282         elif [[ ! -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then
1283             nextcmd="install deps"
1284         else
1285             nextcmd=""
1286         fi
1287     }
1288     echo
1289     help_interactive
1290     nextcmd="install deps"
1291     setnextcmd
1292     HISTFILE="$WORKSPACE/tmp/.history"
1293     history -r
1294     while read -p 'What next? ' -e -i "$nextcmd" nextcmd; do
1295         history -s "$nextcmd"
1296         history -w
1297         read verb target opts <<<"${nextcmd}"
1298         target="${target%/}"
1299         target="${target/\/:/:}"
1300         case "${verb}" in
1301             "exit" | "quit")
1302                 exit_cleanly
1303                 ;;
1304             "reset")
1305                 stop_services
1306                 ;;
1307             "test" | "install")
1308                 case "$target" in
1309                     "")
1310                         help_interactive
1311                         ;;
1312                     all | deps)
1313                         ${verb}_${target}
1314                         ;;
1315                     *)
1316                         testargs["$target"]="${opts}"
1317                         tt="${testfuncargs[${target}]}"
1318                         tt="${tt:-$target}"
1319                         do_$verb $tt
1320                         ;;
1321                 esac
1322                 ;;
1323             "" | "help" | *)
1324                 help_interactive
1325                 ;;
1326         esac
1327         if [[ ${#successes[@]} -gt 0 || ${#failures[@]} -gt 0 ]]; then
1328             report_outcomes
1329             successes=()
1330             failures=()
1331         fi
1332         cd "$WORKSPACE"
1333         setnextcmd
1334     done
1335     echo
1336 fi
1337 exit_cleanly