sdk/cwl/tests/federation/framework/testcase.cwl

   1 #!/usr/bin/env cwl-runner
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
   5
   6 cwlVersion: v1.0
   7 class: Workflow
   8 $namespaces:
   9   arv: "http://arvados.org/cwl#"
  10   cwltool: "http://commonwl.org/cwltool#"
  11 hints:
  12   cwltool:Secrets:
  13     secrets: [arvados_api_token]
  14 requirements:
  15   StepInputExpressionRequirement: {}
  16   InlineJavascriptRequirement: {}
  17   SubworkflowFeatureRequirement: {}
  18 inputs:
  19   arvados_api_token: string
  20   arvado_api_host_insecure:
  21     type: boolean
  22     default: false
  23   arvados_api_hosts: string[]
  24   arvados_cluster_ids: string[]
  25   acr: string?
  26   wf: File
  27   obj: Any
  28   scrub_image: string
  29   scrub_collections: string[]
  30   runner_cluster: string?
  31 outputs:
  32   out:
  33     type: Any
  34     outputSource: run-acr/out
  35   success:
  36     type: boolean
  37     outputSource: check-result/success
  38 steps:
  39   dockerbuild:
  40     in:
  41       testcase: scrub_image
  42     out: [imagename]
  43     run: dockerbuild.cwl
  44   prepare:
  45     in:
  46       arvados_api_token: arvados_api_token
  47       arvado_api_host_insecure: arvado_api_host_insecure
  48       arvados_api_host: {source: arvados_api_hosts, valueFrom: "$(self[0])"}
  49       arvados_cluster_ids: arvados_cluster_ids
  50       wf: wf
  51       obj: obj
  52       scrub_image: scrub_image
  53       scrub_collections: scrub_collections
  54     out: [done]
  55     run: prepare.cwl
  56   run-acr:
  57     in:
  58       prepare: prepare/done
  59       image-ready: dockerbuild/imagename
  60       arvados_api_token: arvados_api_token
  61       arvado_api_host_insecure: arvado_api_host_insecure
  62       arvados_api_host: {source: arvados_api_hosts, valueFrom: "$(self[0])"}
  63       runner_cluster: runner_cluster
  64       acr: acr
  65       wf: wf
  66       obj: obj
  67     out: [out]
  68     run: run-acr.cwl
  69   check-result:
  70     in:
  71       acr-done: run-acr/out
  72       arvados_api_token: arvados_api_token
  73       arvado_api_host_insecure: arvado_api_host_insecure
  74       arvados_api_host: {source: arvados_api_hosts, valueFrom: "$(self[0])"}
  75       check_collections: scrub_collections
  76     out: [success]
  77     run: check-exist.cwl